PROSITE entry PS51737

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51737
Entry name [info]	RECOMBINASE_DNA_BIND
Accession [info]	PS51737
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-2014 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51737
Associated ProRule [info]	PRU01073

Name and characterization of the entry

Description [info]

DNA-binding recombinase domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=113;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=108;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1355354; R2=0.0072692; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=16440.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1014; H_SCORE=16440; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=738; H_SCORE=16440; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-13; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='P';  M= 14,-40,-23,-17,-42,-23,-27,-31,-21,-39,-28,  7, 93,-24,-32,-15,  9,-30,-41,-39;
/M: SY='Y';  M=-32,-38,-39,-35, 61,-40,-17,  8, -4,  5,-10,-34,-41,-30,-25,-31,-27,-14, 68, 68;
/M: SY='G';  M= -9,-37,-25,-36,-43, 85,-31,-51,-30,-46,-36,-10,-28,-28,-37,-10,-29,-44,-34,-38;
/M: SY='Y';  M=-30,-38,-32,-34, 36,-38, -3,-14,-27,  4, -8,-31,-42,-24,-25,-25,  2,-18,  6, 95;
/M: SY='E';  M=-22,-36, 14, 25,-20,  0,-19,  4,  8, 14,-12,  9,-30, 16,-18,-20,-20,  3,-32, 14;
/M: SY='P';  M=-22,-36,  7,-21,-16,-34, 25,  8,-22, 14,-10,-24, 44,-22,  2,  3,-17, 17,-34, 18;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='T';  M=-20,-33,-24,  1,-27,  3,-32,  9, -1, -4,-17,  8,-32,-24,-27,-16, 35, 21,-46,-29; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='P';  M=-30,-48, 43,-13,-50,-31,-24,-47,-16,-49,-40, 11, 55,-20, 24,  4,-22,-45,-54,-39; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-35; IM=0; DM=-35;
/M: SY='W';  M=-22,-38, 29,-10,-33,  0,-22,-28, 32,-33,-27, 20, 23, 14,-11,-15,  8, -6, 62,-23;
/M: SY='H';  M=-19,-34,-23,-18,-26,  5, 49,  1, 32, -1,-15,-14,-29,-13, 17,  6,  5,  1,-40,-18;
/M: SY='L';  M=-25,-31,-38,-32, -5,-40,-23,  1,-31, 50, 47,-35, 20,-27,-31,-28,  9, -5,-28, 17;
/M: SY='V';  M=-16,-33, 12, 24,-21,  4,-24, -5,-19,-17,-16,-20,-30, 18,-24,-17,  8, 40,-35, 18;
/M: SY='P';  M= -2,-39,-35,-26,-24,-34,-36, 33,-29,  0,-11,-35, 76,-30,-37,-25,-17, 21,-38,-29;
/M: SY='D';  M=-24,-34, 63, -6, 13,-25,-16,-21,  8,-28,-27, 45,-32,-17,-19,-16,-15,  9,-45,-21;
/I:         I=-45; MD=-115;
/M: SY='P';  M=-30,-51,-18, 38,-49,-39,-29,-43,-16,-46,-37,-30, 73,-17,  5,-25,  3,-42,-47,-43; D=-45;
/I:         I=-45; MI=-115; IM=-115; DM=-115;
/M: SY='H';  M=  0,-34, 14, 23, 16,-34, 26,-10,-14, -2,-14,-20,-31, 17, 13,-20,-19, 25,-37,-15;
/M: SY='E';  M= 12,-34, -8, 40,-36,-26,-17, -2, 22,-28,-22, 17,-23, 38, -9,-10, 12,-22,-38,-27;
/M: SY='A';  M= 52,-29,-25,-15,-38,-16,-23,-30,-10,-31,-23,-20, 23, 18, 30,  8,-15,-21,-36,-30;
/M: SY='D';  M= -3,-38, 57, 48,-43,-28,-17,-40, 11,-38,-33, -8, 25, -7,-16,-14,  5,-34,-46,-32;
/M: SY='V';  M=  1,-33,-25,  8,-21,-36, 26, 22,-17,  6, -8,-23,-31, 16, 11,-19,  8, 30,-41,-20;
/M: SY='V';  M=-18,-31,-45,-40,-11,-47,-44, 52,-37, 15,  1,-38,-38,-36,-39,-30,-15, 58,-41,-19;
/M: SY='R';  M=-25,-40,-15, 27,-33,-36,-16,-34, 46, -7,-21,-16,-28, -1, 62,-21,-22,-31,-35,-24;
/M: SY='W';  M=-23,-38, 13, 36,-23,-35,-20,-21,-11, 19,-14,-20,-28, 37,  7,-19,  7,-23, 65,-18;
/M: SY='W';  M=  3,-34,-43,-38,-11, -2,-38, 47,-34, 21, 28,-35,-35,-31,-37,-27,-21, 18, 66,-15;
/M: SY='F';  M= -7,-36,-42,-38, 77,-37,-19,-14,-33, -8,-13,-36,-43,-35,-31,-29,-27,-19, 70, 63;
/M: SY='H';  M= 16,-33, 32, 12,-34,-24, 34,-31, 10,-11,-22,-10,-27, 17, 16, 10,  6,-26,-43,-23;
/M: SY='M';  M=-24,-35, 30, 11,-15,-37,-19, 24,-18, 14, 44,-20,-31,-17, 10,-23,  6, -8,-33, 16;
/M: SY='Y';  M= -5,-34,-40,-38, 40,-40,-22, 39,-33, -3, -5,-35,-39,-32,-33,-27,-20, 27,-11, 61;
/M: SY='L';  M= 15,-31,-23,  8,-21,-30,-22,-10, 10, 29, -7,  6,-33, 14, 11,-19,-18,  6,-36,-22;
/M: SY='E';  M=  5,-34, 37, 53,-40,-27,-17,-36, -9,-34,-29,-10,-21, 22,-17,  8, 25,-29,-44,-30;
/M: SY='G';  M=-16,-35,-14,  7,-38, 50, 35,-40,  7,-38,-28, 19, 17,-16,-20,-10, 21,-35,-41,-28;
/M: SY='W';  M=  4,-38,-21,  8,-30, 19, 32, -5, 34,-25, 18,-16,-27, 20, -9,-17,-22,-25, 58,-18;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='S';  M= -5,-28,-13, 10,-35,  8, 36,-37,-16,-37,-29, -6,-24, -8,-20, 67, -2,-30,-44,-24;
/I:         I=-20; MI=0; MD=-51; IM=0; DM=-51;
/M: SY='I';  M= -2, 33,-42,-36, 17,-40,-33, 39,-35, 36, 28,-36, 10,-32,-36,-30,-21,  2,-31,-14;
/M: SY='C';  M=-17, 37,-23,-23,-30, 22, 32,-28,-15, -6,-20,-14, 14,-19, 21,  8, 36,-24,-43,-24;
/M: SY='D';  M= 31,-30, 45,-12, 10, 10,-24,-26,  1, -4,-22,-12,-29,-20,-23,-11,  5,-21,-37,-21;
/M: SY='V';  M=-19, 42,-42,-38,-11,-44,-39, 38,-35, 29,  0,-35,-39,-35,-37,-27,  6, 44,-41,-20;
/M: SY='C';  M= 34, 70,-31,-23,-29,-26,-31,-11,-20,-19,-17,-24,-34, 14,  3,-12,  8, 28,-44,-29;
/M: SY='R';  M=-25,-41, 11, 12,-38,-33, 35,-42, 49,-36,-26,-10,-28, -1, 61,-19,-22,-37,-38,-22;
/M: SY='R';  M=-26,-41, 16, 15,-20,-34, 30,-31, 13,-10,-18,-15,-31, 39, 45,-19,-23,-31,-26, 38;
/M: SY='W';  M=-29,-34,-48,-38, 22,-43,-31,  1,-36, 54, 36,-44,-42,-31,-34,-38,-27, -7, 90, -4;
/M: SY='N';  M=-22,-34, 25, 36,-40,-23,-10,-38, 15,-38,-29, 58,-26, 20, 15,-10,  6,-36,-46,-30;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M=  1,-41, 22, 49,-46,  1,-20,-46, 11,-42,-35, 11,-27, -7, 14,-18,-23,-39,-45,-36; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='H';  M=  1,-40, 16, 22,-33,-33, 49,-31,-15,  6,-20,-18,-33, 15, 11,  0,-23,-29,-46,-23; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='G';  M=  3,-40,  7,-22,  5, 45,-26,-41, 28,-37,-31,-17,-33,-22,-18,-18,-26,-37,-30, 13; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='V';  M=-28,-41,-44,-39, 13,-48, 20, 23, -8,  2,-14,-36,-44,-35,-34, -8,-24, 30,-44,-20; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -6,-57,-53,-55,-60, 17,-58,-18,-53,-54,-50,-41,-54,-50,-59, -6,  0,-43,-66,-57; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='M';  M=-54,-64,-64,-56,  9,-69,-54, 15,-12,-31, 15,-55,-62,-48,  1,-57,-50,-29,-54,-35; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -5,-45,-31,  4, -1, 20,-36,-10, -2,-36,-32,-27,-38, 14,-29,-23,  4,-31,-43,-32; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='K';  M= -7,-46,-40,-33,-36, -7,-41, 17, 18, -5,-23,-33, 18,-31,-28,-29, -2,-19,-47,-37; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='K';  M=-30,-48,  3,-21,-40, 17,-29,-47, 32,-46,-37,-21,-38, 16,-16,-23,  5,-44,-40, 10; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='G';  M=-28,-49, 41,-25,-54, 44,-36,-54,-34,-54,-47,-17, 10,-34,-42,-22,  4,-49,-56,-46; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='R';  M= -3,-47,-37,-26,-34,-43,-31, -6, 32,-33,-28,-30,-42,-21, 32,-30,-30, -4,-40,  8; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='P';  M=-28,-47,-31,  4,-41, -2,-35,-36,  1,  0,-30,-30, 39,-26,-31, 16,-26,-37,-49,-40; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-29;
/M: SY='W';  M=-27,-44,-43,-31, 19,-32,-32,-22,  2,-18, 38,-35,-36,-23,-24,  1,-29,-30,132, 32;
/M: SY='S';  M=  8,-27, 16,-19,  7,  4,-21,-22,-19,-27,-24, 32,-28,-18,-25, 33, 28,  1,-41,-22;
/I:         I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
/M: SY='W';  M= 16,-35,-29,-21,-18,-30, 30,-24, -8, -3, 18,-22,-33,-13, 47,-17,  9,-22, 66, 18;
/M: SY='T';  M=-17,-30, 33,-12,-35,-24,-19,-31, -9,-34,-27, 21, 16,-14, 25, 22, 48,-25,-48,-28;
/M: SY='W';  M=  2,-34,-27,-23, 14,  2,-21,-26,  8,-25,-21,-20, 23,-20,  9,-13, 33,-24, 56, 39;
/M: SY='L';  M=  3,-29,-31,-28,-13,-34,-27, 15,-27, 40,  0,  9,-36,  9,-29,-21,  6, 23,-37,-19;
/M: SY='R';  M=-16,-32,-20,-14,-32,  1,-20,-31, 38, -9,-22,-11,-27, -8, 41, 31, 14,-27,-37,-25;
/I:         I=-42; MI=0; MD=-106; IM=0; DM=-106;
/M: SY='Q';  M=  4,-35,-25,-13,-24, -2,-19,-13, 26,-21,-16,-19,-31, 46, 18,-16,-18, 25,-30, 18;
/M: SY='M';  M=-21,-32,-27,-26, 18,-33, 26, 21,-16,  4, 30, 13,-34,-19, 26,  5,  6,  8,-35,-12;
/M: SY='L';  M=-26,-33,-31,-25,-11,-39,-23, 15,  2, 49,  2,  9,-38, 12, 13,-27,-21, -6,-34,-17;
/M: SY='W';  M=-24,-38,  5,-21,-21,-35, 29, 31,-11,-14, 21,-19,-32,-15, 41, -1,  6,-10, 60,-14;
/M: SY='N';  M=-20,-29,-15,-20,-21,-23,-15,-17, 11, 28,-11, 53,-34,-14,  8, 21,-12,-20,-41,-23;
/M: SY='P';  M=-19,-38,-18, 12,-39,-28,-23,-32,-12,-36,-27,-18, 74, 13, 12,  9, 34,-29,-41,-32;
/M: SY='N';  M=  2,-32, 19,  6,-31,-27,-17,-15, -6,-25,-21, 42,-33,-12, 42,-15,-15, 24,-46,-27;
/M: SY='Y';  M=-28,-40, 11,-21,  1,-32, -5,-22,-14,-20, 25, 15, 21,-16, 23,-22,-22,-26, -8, 77;
/I:         I=-6; MD=-16;
/M: SY='C';  M= 25, 32,-36,-27,-25,-33,-31,-16,  3, 20,-13,-31,-39,-23, 27,-22,-23,  2,-41,-28; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-16;
/M: SY='G';  M=-19,-42,-32,-35,-22, 57,-27,  2,-31,-29,-24,-22,-36,  9,-35,-20,-29, -5,-26, 35; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='Y';  M= 14, 38,-34,-31,-11,-35, 24,  0,-25,  0,-15,-28,-40,-25,  5,-22,  1,-18,-23, 51; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='G';  M=  3,-37,-26,  0,  7, 43,-30, -8,-22,-32,-28,-20,-32,-23,  9,  5,  1,-27,-36,-26; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='F';  M= 16,-34,-27,  1, 33,-31,-26,-22, 15,-23,-23,-24,-34,-22,-21,  4,  9, -3,-26, 21; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='Y';  M= -4,-41,-46,-43, 34,-45,-26,  7,-40, 13,-12,-43,-48,-38,-39,-34,-29,  5,-16, 55; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='K';  M=  0,-40,-27,-24,  3,  1,-28,-35, 31,-12,-28, 14,-38,-20,  8,  2,-23,-33,-40,-27; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='G';  M=-21,-42,  7,  6,-28, 53,-27, -7, -3,-12,-26,-18,-33,-23,-29,-20,-28,-30,-32, 15; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='R';  M=  4,-36,-24,  7,-35,-32,-26,-21, 26,-29,-24,-21,-33,-12, 38, 14,-17, 16,-43,-29; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-26,-37, 40,-19,-26,-37,-27, 11,-22, 11,-15, 10,-37,-24,  9,-23,  8, 15,-49,-27; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='Y';  M=-23,-36,-31,-30, 15,-37, 25, -6,  1,-16,-15,  6,-40,-26,-24, -3,-19, 36,-26, 45; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='K';  M=-28,-47,-29,  1,-48, 19,-33,-38, 22,-42,-35,-24,-38, 17, 12,-24, -3,-10,-48,-39; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-35,-52, 31,  6,-52, -5, 29,-54,  8,-51,-42,  9, 20,-20, 10,-28,-31,-51,-57,-37; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='V';  M=-41,-53, 24,-35, -1,-57,-49,-22, -3,-35,-36,-38,-54,-44,-41,-43,-36, 24,-61,-38; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-35,-52, 43,-14,-55,  1,-31,-54, 37,-54,-45,-17, 21,-22,-17,-28,-31,-51,-54,-43; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-32,-49, 41,-24,-49, 34,-31,-49,-26,-23,-40, 10,-42,-29,  6,-26,-33,-48,-55,-42; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='H';  M=-12,-64,  8,  0,-67, -2, 17,-70,-37,-64,-56,-37,-54,-37, -4,-40,-49,-62,-71,-53; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='C';  M= -9, 31,-44, -2,-64,-54,-54,-59,-12,-60,-54,-46, 15,-42,-46,-38,  0,-52,-70,-61; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-47,-60,  7,  4,-39,-58,-38,-10,  2,-12,-35,-39,-51,-31,  3,-44,-42,-38,-50,  5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='A';  M= 23,-42,-34,  1,-42,-36,-40,-29,-36, -9,-31,  0,-45,-32,-41, -1,-27, -3,-56,-43; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-25,-39, 46, -8,  6,-32,-19, 16,-13,-18, 19,-13, 16, 37, 12,-18,  3,-17,-38,-19;
/M: SY='W';  M=-25, 63, 13,  4,-22,-30, 74,-40,-22,-32,-27,-16,-33,-17,-24,  3,-25,-40,104, -6;
/M: SY='E';  M=-18,-39, -5, 52,-43,  7,-17,-40,  9,-39,-31, 12, 43, 22,-14,  9,-17,-37,-40,-33;
/M: SY='P';  M= -1,-43,-27,-17,-41,-26,-30,-25,-23,-37,-27,-29, 97,-25,-34,  5,-15, -5,-40,-39;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
/M: SY='I';  M=-25,-36,-36,  1, -7,-47,-33, 61,-33, 24,  2,-35,-35,-28,-35,-32,-20, 21,-28, 20;
/M: SY='I';  M=-24,-36,-37,  0,-10,-48,-39, 65,-34, 24,  3,-36,-34,-29,-37,-32,-19, 26,-35,-18;
/M: SY='D';  M=-16,-32, 46, 17,-39,-21,-18,-35, 10,-38,-31, 18, 16,-11,-17, 32, 26,-30,-47,-30;
/M: SY='W';  M=-22,-44,-11, 47,-29,-32,-17,-38, -5,-35,-28,-21, 43, 18, 28,  2,-21,-36, 59, 14;
/M: SY='E';  M= 29,-34, 45, 53,-42,-22,-16,-38,-10,-36,-31, 19,-23, -6,-19,-11,-16,-30,-45,-32;
/M: SY='E';  M=-17,-33,-10, 47,-31,-34,-20,-16,-11, -6,-17,-17,-23, 39,-17,-11, 35, 14,-41,-26;
/M: SY='W';  M=-34,-40,-46,-40, 68,-40,-24,-14,-34,  7,-12,-41,-44,-35,-33,-35,-31,-21,104, 58;
/M: SY='W';  M=-26,-41, 13, 52, -7,-37,-13,-24,-15,  7,-17,-25,-29, -9,-20,-24,-24,-26, 67, 55;
/M: SY='R';  M= 18,-33,-21, 12, 12,  3,-21,-29, 23, -9,-21,-18,-29,-10, 41,  3,-19,-25,-31,-19;
/M: SY='V';  M= 20, 36,-34,-32,-17,-32,-34,  6,-30, 20, -6,  7,-38,-30,-33,-20,-14, 48,-44,-24;
/M: SY='Q';  M=-20,-43,-15, 20,-43,-31,-11,-29,  1,-29,-18,-14,-28, 84, 34,-13,-22, -7,-35,-22;
/I:         I=-45; MI=0; MD=-115; IM=0; DM=-115;
/M: SY='A';  M= 44,-31,-12, 38,-40,-20,-21,-33, 31,-32,-25,-17,-23, 19, -8, -9,-16,-24,-36,-30;
/M: SY='W';  M= -1,-36,-27, 21,-17,-38,-31, 34,  3, 13, -8,-30,-31,-18,  5,-25,-21, 13, 65,-17;
/M: SY='L';  M=-24,-29,-37,-30, 21,-39,-27,  0, -5, 55,  4,-31,-38,-26,-27, -3,  9, -5,-30,-12;
/M: SY='D';  M=-20,-34, 39, 26,-35,-25,-15,-25, 30,-28, 17, 36,-26, -8,-10,  7,-13, -2,-45,-27;
/M: SY='R';  M= 17,-34,-14,  8,-39, 10,-16,-38, 16,-36,-26, 31,-28, 21, 42,  7,-16,-31,-39,-28;
/M: SY='P';  M= -4,-37,-21,-18,-32,-27,-19, -2, -8,-25, 22, 30, 57,-15, 38,-16, 10,-22,-41,-28;
/M: SY='G';  M=  2,-35, 32,-11,-41, 39,-19,-40, 12,-38,-30, 15,-28, 15, 25,-10,  5,-34,-41,-30;
/M: SY='R';  M=-20,-36,-22,-12,-34,-30,-17,-31, 19,-28, 17,-14, 14, 18, 61,  8, 23,-27,-38,-24;
/M: SY='N';  M=  4,-30,-17,-21, 28, 25,-18,-29,-14,-28,-23, 43,-31, 12, 11, -9, 23,-26,-32,-17;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	6 in 6 different sequences
Number of true positive hits	6 in 6 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Bacteriophages, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DNA_BIND
Feature description [info]	recombinase
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

6 sequences

CISA_BACSU  (P17867), Y4BA_SINFN  (P55368), YBCK_ECOLI  (P77698),

YEFB_BACSU  (O34574), YIM5_BPPH1  (P10429), YOKA_BACSU  (O32006)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment