PROSITE entry PS51700

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51700
Entry name [info]	SEPARIN
Accession [info]	PS51700
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JAN-2014 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51700
Associated ProRule [info]	PRU01037

Name and characterization of the entry

Description [info]

SEPARIN core domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=96;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=91;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5120753; R2=0.0072149; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=15290.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1108; H_SCORE=15290; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=692; H_SCORE=15290; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='P';  M=  0,-40, -4,  2,-26, -5,-22, -3, 18, -8,-12,-17, 49,-10,  9,  3, -4,-17,-18,-30;
/M: SY='C';  M=-13, 21, 15,  2,-25, -6, -3,-33, 20, -5,-17, 10,-22, 10, 21, 20, -1,-29,-28,-21;
/M: SY='N';  M=-12,-37, 17, -7,-39,-15,-15,-27, 21,-26,-13, 44,-32, 15, 32, 25, -7,-33,-46,-30;
/M: SY='G';  M= 11,-13,-31,-29,-10, 39,-34,  4,-28, -6,-20,-12,-20,-29, -7, -4, 23, 14,-41,-29;
/M: SY='F';  M=-10,  4,-35,-33, 58,-29,  3, -5,-24,-11, -5,-19,-39,-27, -2, 11, 13,-18,-11, 49;
/M: SY='Y';  M=-26, 31,-27,-36, 41,-39,-11,-16,-30, -8,  8,-33,-45,-28,-18, -6,-18,-23,  3, 89;
/M: SY='V';  M=-22,-20,-47,-41,-12,-49,-42, 45,-38, 32, 16,-41,-42,-37,-28,-29,-15, 49,-42,-21;
/M: SY='L';  M=-28,-24,-46,-40, -8,-48,-27, 36,-28, 55,  3,-42,-44,-34,-38,-22,-19, 17,-36, -5;
/M: SY='N';  M=-27, -4, 36, -7,-41,-18,-10,-36, -9,-41,-34, 88,-29,-14, -3,-11,-13,-41,-59,-35;
/M: SY='P';  M=-25,-52,-14,-18,-34,-31,-23,-28,-22,-44,-22,-33,105,-13,-36,-11,-22,-38,-43,-42;
/M: SY='S';  M= -3,-35, 26, 16,-40, 19, 25,-38,-12,-29,-31, 10,-20,  3,-22, 40,  2,-27,-47,-27;
/M: SY='G';  M=  4,-37, -7,-24,-40, 63,-14,-40, -1,-37,-33, 23,-32,-17,-16, 10,-13,-38,-40,-18;
/M: SY='D';  M=-16,-21, 82, -3,-46,-20,-16,-42,-18,-45,-40, 48,-33,-18,-20, -9,-18,-25,-63,-34;
/I:         I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
/M: SY='L';  M=-24,-33,-48,-40,  3,-49,-32, 10,-41, 67, 17,-46,-35,-34,-38,-40,-27, -3,-33, -8;
/M: SY='P';  M=  0,-22,-14, -6,-30, -5,-12,-11, 23,-23, -3,-10, 32, 11,  4, 15, 11, -1,-42,-30;
/M: SY='R';  M=-15,-38,  9,  0,-35,  3, 26,-41, 20,-35,-20, 33,-25,  6, 38, 19, -2,-37,-46,-28;
/M: SY='T';  M=-12,-17,-22,-24,-27,-10,-28,-23,-18,-23, 13, -1,-26,-10,-22, 23, 74,-14,-49,-28;
/M: SY='Q';  M= -8,-43,-11, 48,-46,-15,-17,-40,  9,-31,-28, -7,-11, 67,  9,  1,-19,-34,-40,-30;
/M: SY='K';  M=  2,-33,  9, 23,-29, -9,  4,-26, 25,-18,-27, 16,-30,  9, 14, 13,  6,-24,-43,-23;
/M: SY='R';  M= -2,-18,-24,  2,-20,-30,-11,-29,  8,-15,  4, -4,-13,  6, 55, -7, 27,-16,-41,-16;
/M: SY='F';  M=-29,-18,-49,-43, 75,-46,-32, 19,-39, 25, 35,-40,-45,-41,-33,-31,-19,  0, -7,  3;
/M: SY='E';  M= -7,-39, -9, 31,-27,  0,-16,-24, 23, -2,-17,-11,-16, 22, 16,  7, -7,-18,-39,-15;
/M: SY='P';  M= -3,-41, 23, 15,-40, -1,  1,-38, 17,-31,-31, -6, 57, -2,-13,  8, -5,-32,-43,-21;
/M: SY='W';  M=-24,-41,-23,-19, 42,-37, -2,  4,-14, 17,-10,-17, -1,-14,-18,-19,-15,-10, 86, 24;
/M: SY='F';  M=-24,  8,-48,-43, 65,-46,-33, 22,-40, 37, 12,-30,-46,-35,-39,-36,-23,  1,-21,  5;
/I:         I=-17; MD=-42;
/M: SY='E';  M= -9, -2,  9, 26,-31,-34,-23,-32, 17,-28,-31, -9,-36, 10,  1,  1, -1,-37,-48,-14; D=-17;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='W';  M= -9,-38, -7, -9,-25,-14, -4,-17, 24,-17,-22, 15,-21,  8, 19, 27, -1,-28, 65,-10;
/M: SY='K';  M=-16,  3, -5, 10,  1, -9,  6, -9, 14,  3, -7, 11,-14, 12, 14, -4,-15,-10,-15,  4;
/M: SY='P';  M= -2,-19, -6,  2, -7,  6, -9,-25, 12,-16,-22,-16, 44, 11, -5,  8, -7,-15, 15, -1;
/M: SY='G';  M=-11,-21,  2,  0,-25, 36, 25,-19, -5,-32,-25, 32, -9,  4,-16, 21,  4,-33,-44,-25;
/M: SY='W';  M=-22,-48,-52,-31,  8,-35,-51,-27,-11,-26,-32,-46,-40,-20,-33,-12,-27,-36,151, 11;
/M: SY='E';  M=-16,-22, 26, 30,-39,-13, -8,-21, 26,-31,-29, 20,-17, 10, 16,  8, 11,-23,-20,-27;
/I:         I=-38; MI=0; MD=-97; IM=0; DM=-97;
/M: SY='G';  M=-11,-38,-15,-32,-27, 71,  8,-29,-15,-14,-28, -5,-33,-10,-22, -2,-26,-21,-39,-32;
/M: SY='I';  M=-14,  6,-37,-24,-12,-42,-19, 45, -1, 14,  8,-11,-38,-29,-15,-14, -7, 33,-38,  3;
/M: SY='V';  M=  0, 12,-34,-18, 17,-38, -3, 30,-18, -7, -4,-21,-21,-25,-25, -5, 22, 34,-36,  6;
/M: SY='G';  M= -8,-33, -5, -2,-41, 68,-25,-47,-18,-40,-35, 34,-31,-15,-19,  5,-23,-42,-40,-17;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-16, 14,-26,-20,-20,-17, 22,-30,-25, -9,-22, 26, 47,  7, 13, -6,-41,-25;
/M: SY='P';  M= 27,-32,-14,  5,-34,-25,-22, -1, 15,-17, -6,-13, 33, -6, -1, -3,  2, 12,-42,-31;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
/M: SY='P';  M=-26,-52,-14,-17,-27,-32,-32,-27,-26,-32,-31,-31,106,-29,-31,-24,-22,-30,-42,-41;
/I:         I=-36; MD=-90;
/M: SY='T';  M=-14, -7, 12, -2,-36,-22,-20,-27, -8,-17, -3, 18,  0, -1,-24, 35, 45,-22,-49,-31; D=-36;
/I:         I=-36; MI=0; MD=-90; IM=0; DM=-90;
/M: SY='E';  M=  4,-13, -3, 54,-38,-24,-14,-29,  0,-20, -6, -4, 24, -2,-10, 10, -2,-14,-22,-28;
/M: SY='E';  M= -1,-39, 32, 46,-39,-10,-12,-32, 14,-20,-14,  4, -8, 20,  0,  4,-10,-31,-44,-31;
/M: SY='E';  M=-21,-41,  8, 57,  1,-31,  8,-20, -1, -9,-15,-19,-17, 44, -2,-15, -4,-20,-39,-24;
/M: SY='F';  M=-29, 15,-37,-24, 54,-26,-14, 17,-36, 30, 30,-37,-43,-30,-36,-33,-14,  8, 16, 19;
/M: SY='Q';  M=  2, -7,-21, 16,-12,-32,-15,  8,  7, 12,  3,-19,-21, 17, 10, -9,  2, 12,-39,-15;
/M: SY='D';  M=  0,-36, 25, 21,-28,-13, -2,-32, 17, -5,-20, 14,-29, 20,  4, 15,  7,-26,-43,-25;
/M: SY='A';  M= 41,-10,-19, -8,-21, -4,  0,-16, -2,-13, 18, -1,-18,  5,-19, 11, -8, -6,-37,  2;
/I:         I=-19; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49;
/M: SY='L';  M= -4,-14,-38,-14,  0,-35,-31, 13,-33, 53,  2,-30,-41,-29,-18, -7, -7,  5,-36,-15;
/M: SY='E';  M=  3,  3,  4, 19,  1,-25,-11,-17,  6, -3, -3, -9,-31, 13, 10,  8, 19,-17,  1, -3;
/M: SY='N';  M=-14,-10, 19, 25,-40, -7,  4,-37, 17,-27,-29, 34,-29, 20, 12, 21,  9,-34,-46,-30;
/M: SY='H';  M=  4,  5,  7,-13,-20,-16, 51,-23, 20,-34,-26, 17,-25, -1,  8, 28,  0,-24,-42,  2;
/M: SY='D';  M=-21,-27, 77, 17,-46,-17,  2,-44,  0,-44,-39, 22,-25,  2, -4,  7,-18,-34,-17,-31;
/M: SY='L';  M= -7, 22,-44,-39,  3,-30,-35, 25,-38, 46, 15,-39,-42,-31,-38,-27, -8, 27,-37, -9;
/M: SY='F';  M=-32,-13,-44,-34, 73,-44,-23,  0,-37, 17, 13,-38,-46,-37,-35,-17,-26,  2, -9, 55;
/M: SY='L';  M=-18,-14,-46,-40,  9,-47,-38, 40,-37, 40, 22,-40,-31,-35,-22,-23,-19, 29,-37,-18;
/M: SY='Y';  M=-35,-21,-36,-38, 35,-42, -4,-20,-30,-17,-15,-36,-47,-27,-22,-30,-15,-25,  6,104;
/M: SY='C';  M=  9, 68,-42,-39, 59,-29,-21,  4,-37,  0, 10,-17,-27,-39,-39,-20,-18,  4,-28, -8;
/M: SY='G';  M=-13,-41,-28,-33,-47, 86,-35,-55,-33,-50,-39,-14,-32,-31,-41, -9,-32,-48,-38,-42;
/M: SY='H';  M=-33,-45,-17,-12,-32,-29,124,-42,-16,-32,-18, -7,-34,-11,-16,-23,-32,-48,-66, -2;
/M: SY='G';  M=-10,-41,-27,-35,-47, 82,-33,-53,-18,-49,-38,-10,-32,  2,-35, -9,-31,-47,-38,-40;
/M: SY='S';  M= 14, -8, -7,-25,-41, 41,-10,-41,-13,-42,-34, 12,-30,-19,-23, 50,  1,-33,-45,-34;
/M: SY='G';  M=  5, 15,-29,-35,-45, 79,-35,-49,-33,-41,-37,-16,-33,-31,-40, -5,-29,-36,-39,-41;
/M: SY='E';  M= 25,-24,  5, 49,-38,-13,-24,-20, -8,-12,-26,-11,-28,  5,-13, 11, -9,-13,-43,-33;
/M: SY='Q';  M= -8,-44, -8,  8,-46,-31, 22,-36, 23,-31,-24, -6,-31, 80, 20, -8,-20,-29,-40,-25;
/M: SY='Y';  M=-31, -1,-38,-39, 49,-35, 10, -9,-24, -3,-11,-36,-47,-30,-30,-32,-29, -8, -1, 90;
/M: SY='I';  M=-14,-12,-48,-43, 20,-39,-41, 51,-41, 31, 15,-41,-42,-38,-42,-35,-20, 29,-16,-13;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='R';  M=-21,-25, 18,-19,-33, -6,  3,-34,  3,-24,-34, -3, 24, -9, 31, 14,-15,-36,-50,-35; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='W';  M= -9,-38,-10,-18,-35, 31,-18,-41,  6,-22,-21,-11,-21, -5, 12, 10, -3,-36, 33,-12; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='Q';  M=-15,-13, 14,  7,-29,-23, 12,-24, 14,-30,-32, -3,-18, 22, 17,  8,  1,-31,-48,-26; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='T';  M= -2,-25,  3,  9,-21,-21,-21,  2, -2,-18,-18, -3,-10,-15,  4,  0, 14, -5,-23,-32; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='I';  M=-16,-43,-30,-33,-15,-43,-35, 48,-20, 13, -2,-22,-37,-16,  6,-26,-24, 18,-44,-27; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='R';  M= -2,  5, -7, 11,-37,-30,-18,-27, 22, -8,-20,-11,-12, 28, 28,-11,-21,-23,-43,-13; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='R';  M=-15,-42, -1, -3,-38,-17, -1,-30, 31, -5,-23, -1,-26, 24, 38,  3, -8,-29,-44,-29; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='L';  M=-10,  8,-17, -2,-23,-16,-11,-12, -8, 29, 21, -7, -6,  1, -8, -3, -9,-13,-23,-20; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='D';  M=-14,-32, 32,  5,-26, -3,  2,-23, 12,-33,-31, 18,  9,  1, 10,  1,  6,-26,-27, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='C';  M=-14, 72,-22,-15,-21,-19, -3, -2,  8,-13,-10, 10,-14, -8, 21,-12, -5, -6,-47,-27; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-16;
/M: SY='C';  M=-20, 76,-22,-22,-16,-23,-21,-20,  9, -7,-25,  1, 13,-15, 42, -4,-17,-20,-45,-31;
/M: SY='A';  M= 48,-14,-28,-15,-40,  3,-30,-34, -2,-36,-29,-22, 34,-17,-19, 23, -2,-21,-41,-20;
/M: SY='V';  M= 30,-24,-24,-20,-20,-31,-37, 13,-23, -5,-16,-30, 25,-29,-30, -1, 13, 35,-44,-29;
/M: SY='T';  M= 27,  9,-19,-23,-30,-26,-32, -2,-21,-12,  8,-17,-14,-25,-31, 28, 31, 22,-46,-30;
/M: SY='L';  M=-28,-29,-49,-42, 48,-48,-20,  9,-41, 51, 29,-44,-36,-38,-39,-39,-27,  6,  9, -4;
/M: SY='L';  M=-31,-33,-47,-40, -1,-49,-22,  5,-35, 69,  9,-46,-48,-31,-38,-32,-27, -2,-35,-17;
/M: SY='M';  M=-26,-36,-48,-40, 55,-31,-27,  9,-27, 15, 81,-30,-41,-32,-28,-32,-27, -7, 47, -1;
/M: SY='G';  M=-10,-41,-28,-29,-47, 85,-35,-54,-33,-50,-39,-15,-32,-31,-41,-13,-32,-48,-38,-42;
/M: SY='C';  M=-25,136,-45,-45,-35,-26,-45,-42,-41,-30,-33,-31,-55,-48,-45,-28,-26,-30,-64,-46;
/M: SY='S';  M= -3,-20,  5,-11,-40,  1,-23,-39,-19,-42,-29,  1,-21,-11,-17, 73, -4,-32,-47,-31;
/M: SY='S';  M= -5,-28,-20,-21,-38,-14,-23,-38,-14,-42,-35, -8,-28,-12,-24, 82,  0,-30,-47,-30;
/M: SY='G';  M= 35,-17,-33,-34,-36, 52,-36,-19,-32,-21,-19,-19,-34,-30,-37, -8, -6, 19,-42,-35;
/M: SY='R';  M= 20,-31,-24,  0,-30,-23, 16,-31, 26,-27, -7,-17,-32, -5, 46, 12, -5,-18,-39, -8;
/M: SY='L';  M=-29,-11,-44,-28, -1,-46,-11, 11,-37, 55, 47,-41,-13,-27,-36,-33,-10,  4,-37,-14;
/M: SY='T';  M=  9,-16, -6,  2,-17,-24,  2,  5, 15, -8,-13, -7,-31,  9, 10,  9, 23,-17,-13,-21;
/M: SY='E';  M= -1, 18, 21, 24,-31, -5,  0,-18,-14,-10,-13, -5,  7, -4, -4,  3, -7,  2,-24,  1;
/M: SY='N';  M=  5,  7,-12,  4, -5,-15, 18,-10, -6,-17,  8, 19,-19, 18, 13,  3, -1,-16,-19, 12;
/M: SY='G';  M=  0,-40,-12,-12,-44, 74,-31,-48,-22,-39,-36, -5,-12,  1,-34,-10,-29,-43,-38,-23;
/M: SY='N';  M=-16, -6, 21, 25,-28, -6, 14, -3, -4, -2, -9, 26, -2,  3, -6, -6, -8,-20,-44,-11;
/M: SY='F';  M=-25,-31,-38,-35, 57,-17, 17,-14,-19, 18,  0,-20,-20,-14, -3,-28,-18,-15,-14, 53;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	7 in 7 different sequences
Number of true positive hits	7 in 7 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase C50
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

7 sequences

BIMB_EMENI  (P33144), CUT1_SCHPO  (P18296), ESP1_ARATH  (Q5IBC5),

ESP1_YEAST  (Q03018), ESPL1_HUMAN (Q14674), ESPL1_MOUSE (P60330), 
SEP1_CAEEL  (G5ED39)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

5 PDB

5MZ6; 5U1S; 5U1T; 7NJ0; 7NJ1