PROSITE entry PS51673

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	SUZ
Accession [info]	PS51673
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2013 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51673
Associated ProRule [info]	PRU01009

Name and characterization of the entry

Description [info]

SUZ domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=78;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=73;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2311988; R2=0.0049936; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8426.0830078; R2=4.5747733; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1256; H_SCORE=14172; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=855; H_SCORE=12338; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-16; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-380; BD=-380;
/M: SY='R';  M=-11,-55, -5,-10,-51,-47,-33,-51, 25,-33,-41,  4, 13,  9, 74,  4, -8,-28,-54,-20;
/M: SY='I';  M= -2,-26,-48,-35,-18,-25,-46, 49,-22,  6, 34, -5,-11, 17,-35, -6, 21, 13,-54,-27;
/M: SY='P';  M=-36,-66,-31,-20,-61,-20,-12,-51,-17,-43,-46,-22,111,-22,-39,-26,-27,-55,-57,-57;
/M: SY='E';  M=  6, -4, 22, 26,-14,-22,-39,-11,-13, -9,-11, -7, 23, 18,-30, 24, -2, -5,-57,-43;
/M: SY='Q';  M=  2,-51,-31, -8,-26,-49, -9, 25, 10,  2,  3,-20, 17, 35,-12,  4, -7, 19,-53,-16;
/M: SY='R';  M=-14, -1,-39,  1,-42,-43,-38,-11, 13, 14,  4, 23, -5,-17, 45, -6, 13, -2,  5,-40;
/M: SY='F';  M= -4,-24,-52,-40, 45,-38,-46, 21,-46, 34,-22,-16,-11, -9,-28,  1,  8, 13,-46,-27;
/M: SY='S';  M=  6, -5,-17, -8,-18,-16,-39,-12, -6,-12, -9,  5,-32, 11,  9, 55, -1, -8,-56,-41;
/M: SY='E';  M=-18,-54, 46, 48,-52,-29, -3,-22, -2,-24, -7,  9,  2,  5, -5,  9,  6,-31,-13,-33;
/M: SY='H';  M= -5,-27,-11,-30,-40,-20, 56,  1,-10, 12,  1, 16, 23,-20,-13,  2, -2, 11, -4,-24;
/M: SY='P';  M=  1,-17,-15, -6,-41,-18,-11, 20,-27, 11,-16,  9, 32, -8,-19, 22,-22, 19,-58,-42;
/M: SY='P';  M= 19,-29, -1,-11,-48,-20,-16,-17, 14,-35,-17,-10, 48,-21,  2, 20, -1,  6, 30,-29;
/M: SY='D';  M= 10,-50, 36,  2,-53,-18,-19,-39, 17,-26,-26, 19, 12, 22,  3, 14, 19,-23,-60,-45;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='Q';  M=  4,-23, 17, 24,-38, -6,-25,-37,-22,-20,-11,  3,  4, 31,-13, 17,  2, -5,-57, -4; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='P';  M=  7,-56, -3,  0,-21,-21,-26,-35,  6,-27,-30, -2, 31, 30, -5, 18, -9,-18,-58,-19; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='P';  M=  4,-18,  8, -1,-54,  7,-22,-35,-23,-37,-30,  2, 33, -3, -5, 20, 12,-38,-60, -6; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='P';  M= -9,-30,-11, 19,-59, -3,-18,-24,-32,-40,-17,-16, 29,  0,-16, 17,  9,-11,-67,-54; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='A';  M= 15,-36,-12, -8,-37,-35,-53,-60,-23,-39,-34,  8, -3,  7,-31,  7, -5,-40,-72,-42; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-35;
/M: SY='P';  M=-16,-42,-70,-42,-51, -9,-23,-58,-41,-45,-42,-40, 13,-26,-35, -9,-20,-49, -6,-71; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-35; IM=0; DM=-35;
/M: SY='P';  M= -2,-54, -3, 32,  1, -2,-13,-22,  2,-25,-40,-18, 54, 14,-38,  1,  4,-22,-50,  6;
/M: SY='P';  M=  9,-51,-17,  7,  2,-24,-10,-40, 27,-15, 10,-15, 35, 22,  3,  7,  9,-10,-53,-39;
/M: SY='P';  M=-12,-59,-16,-13,-56,-28,  4,-40, 13,-23,-15,-28, 83, 38, 18, -2,-36,-44,-56,-47;
/M: SY='K';  M=  7,-52,-34,  6,-56,-18,-20,-50, 46,-46,-42,-14, 31, 39, 19, 11, 19,-32,-55,-45;
/M: SY='M';  M=-41,-52,-35,-43, 33,-45,-25, 25,  4,  5, 55,-45, -1,-11, 36,-30,-37, 27,-48,-29;
/M: SY='K';  M=-20,-51,-29,-30,  5,-49,-37,-17, 54,-19,  5,-33,-47, 26, 35,  1, 15,  0,-48,  1;
/M: SY='I';  M=-41,-53,-62,-58,-10,-49,-59, 84,-54, 19,-14,-53,-53,-34,-38,-49,-23, 25,-52,-34;
/M: SY='M';  M=-22,-24,-58,-49,-25,-57,-41, -5,-18, 62, 80,-53,-56,-41, -5,-34,-39,-17,-51,-32;
/M: SY='K';  M=-40,-57,-36,-16,-55,-35,-21,-48, 71,-53,-42,-29, -5, 29, 61, -8,-15,-51,-52,-27;
/M: SY='R';  M=-44,-60,-26,-18,-53,-54,-30,-59, -3,-42,-42,-34,-53,-18,105,-23,-42,-53,-54,-40;
/M: SY='P';  M=-11,-56, 42,-15,-57, 15,-38,-32, -9,-45,-28, 28, 70, -4,-21,  4,-11,-35,-61,-51;
/M: SY='P';  M=  3,-51, 26, 12,-55, -3,-36,-48,  5,-35,-44, 31, 31, 19, -1, 19, 19,-24,-60,-47;
/M: SY='S';  M=  9,-50, 29,  5,-37, 12,  4,-35,  6,-22, -1, -1,  8, -2,-15, 39,  3,-44,-58,-44;
/M: SY='S';  M=  2, -8, 26, -1,-40, 21,-22,-32,-12,-45,-23, 15, -8, 16, -2, 46,  1,-38,-59,-45;
/M: SY='S';  M=  6,-17, 11, -4,  8, 14,-40,-13,-10,-17,  1, -3, 12, -5,  5, 34,-20,-18,-53,-23;
/M: SY='D';  M= -6,-52, 45, 17,-56, 21,-35,-53,-19,-41,-47, 18,  2, 20,  8, 31, -2,-37,-60,-36;
/M: SY='Q';  M= 12,-51, 12, 14,-40, 17,-23,-41, 10,-38,-43, 20,-15, 34, 19, 25,-21,-28,-56,-30;
/M: SY='S';  M= -3,-51, 23, 21,-50, -1, -8,-50,  4,-36, -2, 21, 18,  7, -1, 35,  1,-40,-56, -1;
/M: SY='D';  M=  0,-29, 43, -9,-41,  4, -2,-43,  5,-38,-45, 38,  7, -6, 11, 24,  7,-48,-21,-30;
/M: SY='N';  M=  0,-49,  8,  2,-22, 14,  7,-28,  2,-28,-41, 39,  4,  3, -6, 27, 12,-22,-58,-29;
/M: SY='Q';  M= 11,-50,  5,  9,-25,  6,-12,-36,-12,-47,  1, 10, 24, 38,-22, 32, 15,-21,-57,-44;
/M: SY='S';  M= -1,-50,  4,  4,-50, 19,-37,-35, -6,-18,  6, 27, 19, 21,-27, 34,  4,-20,-57,-29;
/M: SY='S';  M=  8,-22,-16,  5,-48, 15, -4,-24, -2,-26,  9,  5, -9, 10,  9, 33,  3, -2,-11,-31;
/M: SY='S';  M= 10, -1, 15, -9,-39, -5,-38,-18,  2,-31,-41, 13, 26, 18,  3, 29, 10,-12,-57,-27;
/M: SY='N';  M= -9,-29,  9,  2,-40,  8, -5,-40, 12,-37,-18, 41, 25, 22,  1, 28,  2,-40,-59,-45;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='P';  M=  7,-53, -1, 14,-52,  9,-12,-31,  7,-20,-21, -1, 38, 11, 14, 25,-26,-28,-56,-28; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='S';  M= -7,-54,  9,  3,-37,  2,-42,-22,  7,-17,-14, -9, 22,  8,-27, 39,-14,-34,-58,-17; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='S';  M= -3,-57,  3,-15,-23, -1,-46,-41,  6,-20, -2,  1, -1,-30, -2, 24, 13,-39,-17,-34; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='D';  M= -2,-60, 25, 15,-64,-16,-24,-58, -4,-37,-35,  8, 15,-17,-22, 20, -1,-40,-70,-56; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='D';  M=-30,-25, 30,  1,-20, -2,-49,-60,-14,-39,-22,  0,  9,  1,-20, 13,-19,-37,-70,-55; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='E';  M=  1,-64,  3,  9,-64,-12,-33,-18,  5,-52,-33,-10, -9,-12,-24,  7,-10,-25,-71,-41; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='R';  M=-18,  1,  1,  4,-66, -7,-54,-65,-12,-32,-58,-37,-43, -9, 14,  5,  7,-51,-73,-36; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='K';  M=-13,-74,-13,-27,-72,  4,-14,-40,  6,-28,-26,-23,-69,-23,-14,-16,-41,-52,-79,-66; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-20;
/M: SY='S';  M=-11,-78,-47,-13,-82,-20,-34,-79,-16,-56,-37,-19,-50,-33,-24, 17,-30,-74,-87,-74; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-20; IM=0; DM=-20;
/M: SY='R';  M=-37,-27,-33,-47,-78,-34,-64,-37,  5,-45,-66,-24, -9,-16, 29,-17,-45,-70,-82,-71; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-20;
/M: SY='Q';  M= -4,-65,-48,-20,-30,-47, -1,-24,  6,-35,-23, -6, 38, 44,  9,-14,-27,-31,-64,-51; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-20;
/M: SY='Q';  M= 11, 19,-12,  9,-49,-10,  7,-18, 21,-27,-24, -7,-14, 44,-12, 14,-12,  6,-15,-25;
/M: SY='K';  M=-28,-53,-39,-13,-45,-49,-19,-41, 59,  6, 35,-12,-19,  4, 48, -3,-16,-29,-52,-27;
/M: SY='S';  M=-26,-44,-14, 23,-51,-29,-39,-32,-19,-49,-44,-13,-22,-20,-38, 67, 61,-39,-62,-45;
/M: SY='L';  M=-42,-50,-54,-32, 10,-59,-20, 14,-40, 53, 25,-50,-37,-41, 29,-28, -7,  9,-47,  7;
/M: SY='E';  M= -4,-57,  0, 82,-59,-49, 24,-47, 16,-52,-46,-31,-37, 38,-18,-21,-24,-51,-57,-46;
/M: SY='E';  M=-31,-58, 15, 86,-61,-50,-31,-58,  1,-39,-46,-16,-37, 52,-27,-24,-38,-53,-57,-48;
/M: SY='R';  M=-32,-60,-40,-27,-54,-53,-31,-60, 42,-53,-42,-33,-51,-18, 98,-38,-42,-53,-53,-41;
/M: SY='E';  M=-26,-59, -8, 82,-60,-51,-31,-47,  9,-51,-24,-32,-37, 59, 10,-32,-22,-52,-56,-47;
/M: SY='Q';  M= 43,-52,-30, 46,-57,-42,-35,-51, 17,-43,-41,-34,-43, 49, 38,-20,-36,-29,-54,-45;
/M: SY='E';  M= 39,-51,-11, 60,-53,-43,-13,-21,  8,-27,  0,-14,-42, -2, 28,-19,-35,-41,-56,-45;
/M: SY='Y';  M=-49,-59,-49,-52, 27,-56,-16,-34,-44,-30,-28,-50,-61,-40,-41,-44,-43,-39, -6,122;
/M: SY='Q';  M= 28,-52, 20, 35,-54,-42,-13,-48, 12,-17, -9, 28,-44, 44, 27,-25,-35,-39,-57,-44;
/M: SY='E';  M= 16,-54,-26, 64,-53,-15,-36,-34, 39,-12,-41,-34,-41,  6, 24,-23,-37,-45,-54,-46;
/M: SY='A';  M= 80,-41,-45,-39,-50,-31,-46, -9,-39,-35,-36, -1,-46,-37,-12,-14,-23, -3,-55,-47;
/M: SY='R';  M=-30,-60,-41,-29,-54,-54,-31,-60,  5,-53,-42,-34,-53,-18,105,-38,-27,-53,-54,-41;
/M: SY='E';  M= 42,-49,  0, 58,-52,-41,-36,-47, -8, -3,-39,  5,-42, 12, -1,  4,-33,-41,-56,-46;
/M: SY='R';  M=-43,-60,-39,-19,-54,-33,-31,-60, 31,-53,-42,-33,-51,-18, 99,-21,-41,-54,-53,-41;
/M: SY='I';  M=-42,-54,-62,-60,-26,-66,-61, 92,-56, 14,-13,-53,-52,-52,-59,-31,-17,  1,-52,-34;
/M: SY='F';  M=-49,-49,-63,-59,101,-13,-45,-18,-55, 16, 13,-52,-61,-60,-53,-30,-43,-30,-24,  2;
/M: SY='G';  M=  4,-50,-37,-25,-56, 69,-41,-57,  3,-45,-11,  9,-45, -3, -6, 30,-26,-51,-54,-49;
/M: SY='D';  M= 12,-27, 40, 30,-56,  5,-25,-51, -9,-52,-30, 16,-10,  5,-30, 34, 17,-31,-62,-47;
/M: SY='S';  M= 13,-27, 32, 18, 14,-11,  6,-45,-35,-30,-30, -9, 10,-32,-12, 46, -3,-20,-56,-39;
/M: SY='N';  M=  8,-28, 12, 30,-52,  8,  2,-42,  2,-44,-44, 32,  7, 13,-10, 23,  2,-32,-57, -8;
/I:         E1=0; IE=-380; DE=-380;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	17 in 17 different sequences
Number of true positive hits	17 in 17 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	SUZ
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

17 sequences

ARP21_HUMAN (Q9UBL0), ARP21_MOUSE (Q9DCB4), ENC_DROME   (Q8MSX1),

R3HD1_HUMAN (Q15032), R3HD2_BOVIN (A0JNC2), R3HD2_HUMAN (Q9Y2K5), 
R3HD2_MOUSE (Q80TM6), SZRD1_BOVIN (Q2KI04), SZRD1_CHICK (Q5ZK25), 
SZRD1_DANRE (Q504E7), SZRD1_HUMAN (Q7Z422), SZRD1_MOUSE (Q6NXN1), 
SZRD1_PONAB (Q5RE12), SZRD1_RAT   (Q5XIA2), SZRD1_XENLA (Q6GR00), 
SZRD1_XENTR (Q6P320), SZY20_CAEEL (G5EGU9)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

1WHR