PROSITE entry PS51672

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ACT_LIKE
Accession [info]	PS51672
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2013 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51671
Associated ProRule [info]	PRU01008

Name and characterization of the entry

Description [info]

ACT-like domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=75;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2555554; R2=0.0258224; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=242; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M=  9,-15,-18,-17, -4,-19,-15, -4,-12, -4,-15, -6,-12,-17, -2,  5, -3, -7, -9,-27,-14, -5;
/M: SY='F';  M=-15,-31,-14,-34,-26, 18,-32,-17,  7,-25, 12,  5,-28,-29,-22,-23,-19, -5,  3, -9, 10,-25;
/M: SY='F';  M=-17,-32,-16,-36,-28, 20,-27,-18,  7,-28, 14,  5,-31,-32,-24,-24,-22,-15,  0, -8,  8,-28;
/M: SY='R';  M=  2,-13,-24,-16, -5,-24, -8,-12,-15,  0,-18,-14, -9,-17, -2, 11, -3, -6,-11,-30,-19, -4;
/M: SY='V';  M= -8,-24,-14,-25,-19,  0,-29,-22, 11,-19,  6,  3,-23,-23,-17,-22,-14,  3, 12,-21, -6,-16;
/M:         M=-14, -3,-28, -4,  0, -6,-22, -4,-15, -8,-17,-13, -2,-23, -6, -5, -7, -7,-16,-20, -2, -3;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-17,-35,-28, 30,-33,-18, 14,-28, 10, 15,-28,-35,-24,-28,-20,-15,  6, -5, 10,-28;
/M: SY='P';  M=-11,-23,-25,-23,-15,-23,-25,-16,-15,-15,-19,-20,-22, 46,-15,-22,-13,-11,-10,-28,-13,-15;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-37, 11, 33,-31,-11, -3,-31,  5,-30,-20, -3, -3, 17, -3, -1,-11,-28,-30,-22, 27;
/M: SY='R';  M= -8, -3,-35, -7, 13,-29,-18,  0,-29, 18,-23,-16,  1,-15, 21, 31, -2, -8,-26,-28,-20, 13;
/M: SY='P';  M= -5,-14,-27,-17, -4,-35,-18,-17,-28,  7,-29,-25,-14, 46, -4, -8, -5, -9,-18,-36,-26, -4;
/M: SY='G';  M=  4,-11,-27,-11,-19,-29, 54,-20,-37,-19,-38,-28,-11,-19,-19,-19,  1,-18,-27,-30,-29,-19;
/M: SY='A';  M= 17, -9,  3, -8, -8,-22, -6,-17,-15, -9,-23,-16, -8,-13, -8,-14, 16,  6,-10,-31,-21, -9;
/M: SY='L';  M=-19,-36,-14,-39,-29, 16,-36,-23, 13,-29, 26, 20,-34,-33,-20,-23,-26,-13,  5,-12,  1,-29;
/M: SY='K';  M=-13,-13,-23,-19, -5,-17,-24, -2,-14, 10, -8, -8,-10,-18,  0,  7, -8,-10,-14,-26,-11, -5;
/M: SY='T';  M=  7, -7,-18, -8,  5,-24,-14,-13,-19,  6,-21,-14, -6,-11,  1,  2,  5, 10,-11,-30,-20,  4;
/M: SY='F';  M=-19,-31,-19,-39,-29, 45,-31,-14,  4,-29,  8, 10,-30,-37,-25,-27,-21,-17, -5,  2, 20,-29;
/M: SY='L';  M= -5,-34,  0,-35,-27, -6,-31,-28, 13,-25, 21, 10,-34,-25,-19,-21,-20, -7, 10,-23,-13,-26;
/M: SY='D';  M= -4,  8,-29,  9,  9,-30,  2, -6,-29,  0,-33,-20,  8,-15,  4, -6,  3, -9,-24,-34,-23,  7;
/M: SY='T';  M= -2,-16,-16,-16,-13,-17,-22,-20, -3,-12, -1, -4,-16,-19,-10, -6, -7,  6, -1,-29,-17,-13;
/M: SY='L';  M=-12,-29,  2,-33,-29, -2,-33,-25, 14,-26, 15,  6,-26,-28,-22,-25,-20, -8, 10,-21, -9,-27;
/M:         M= -7,-17,-10,-21,-20, -5, -5, -9,-10,-20,-12,-11,-14,-24,-17,-20, -3,-11,-11,-20, -8,-20;
/M: SY='G';  M=  2,-13,-25,-15,-10,-29,  8,-15,-28, -6,-28,-23, -9,  2, -8,  1,  1, -5,-21,-32,-25,-10;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D';  M= -8,  3,-19,  6,  1,-16, -5, -4,-16, -4,-17,-14, -2, -2, -3, -4, -3, -7,-14,-19, -8, -2; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='N';  M= -4,  4,-15,  2,  5,-13, -1,  6,-15, -1,-18,-11,  8, -8,  2, -3,  5, -4,-15,-16, -8,  4; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='W';  M= -5,-23,-17,-24,-17,-10,-22,-20, -6,-17, -8, -4,-24,-25,-12,-16,-14,-12, -6,  4, -7,-17;
/M: SY='N';  M= -8, 19,-23, 11,  2,-27, -6,  0,-26, -1,-36,-21, 34,-16,  0, -6, 21,  3,-26,-37,-21,  1;
/M: SY='I';  M=-10,-31,-11,-32,-30,  5,-37,-28, 31,-28, 17, 10,-31,-29,-27,-29,-21, -9, 26,-19, -5,-28;
/M: SY='T';  M=  6,-15,  5,-17,-15,-19,-18,-21, -7,-13,-11,-10, -9,-14,-13,-16,  7, 27,  0,-29,-19,-14;
/M: SY='E';  M=-16,-10,-28, -5,  4,-10,-26, -5,-12, -9, -8, -9,-13,-22, -3, -6,-13,-12,-15,-19,  1,  0;
/M: SY='F';  M=-15,-30, -8,-37,-30, 38,-31,-13,  5,-28,  1, -1,-29,-35,-28,-30,-19,-16, -2,  2, 21,-29;
/M: SY='N';  M=-12,  6,-29, -1,  6,-27,-17,  7,-26,  4,-26,-15, 19,-16, 11, 11,  2,  4,-23,-31,-17,  7;
/M: SY='Y';  M=-20,-30,-20,-30,-20, 30,-30, 20,-10,-20,-10,-10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-10, 20, 70,-20;
/M: SY='R';  M= -9, -9,-35,-17, -6,-27,-10, -5,-24,  7,-20,-18,  0,-21,  1, 34, -8,-11,-24,-30,-20, -6;
/M: SY='K';  M=-14, -4,-26, -9, -3, -1,-20, -3,-20,  3,-21,-12, -2,-22,  1, -6, -3,-11,-18,-16,  0, -2;
/M: SY='Q';  M= -1, -5,-20, -7,  3,-24,-16,  1,-22,  1,-19,-10,  1,-12, 18,  5,  7,  9,-15,-26,-17,  6;
/M: SY='G';  M=  3, -5,-25, -5, -9,-28, 25,-14,-31, -9,-33,-25, -4,-17, -9, -6,  7,-10,-25,-32,-26,-10;
/M: SY='D';  M=-11, 17,-32, 23, 20,-29,-14,  4,-27, -3,-32,-22,  9,-15,  6, -8,  1, -5,-25,-36,-19, 14;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-18, -5,  0,-14,-12, -5,-11,  7, -8, -8, -3,-11,  2, 14, -5, -5,-11,-17,-11, -1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='R';  M=-10, -2,-32, -4,  2,-27,-13,-11,-20, 10,-22,-18, -5,-18,  0, 11, -6,-11,-18,-31,-21,  0;
/M: SY='S';  M=  1, -5,-18, -7, -3,-18,-10, -9,-13, -8,-20,-13,  1,-16, -7,-11,  4,  1, -9,-27,-12, -4;
/M: SY='G';  M=  5,-17,-19,-18,-17,-20, 15,-20,-19,-16,-23,-18,-15,-20,-16,-13, -2, -8,-14,-19,-20,-17;
/M:         M=-10,-20,-15,-25,-16,-19,-25,-16,-10,-11, -8,-11,-15, -6,-10, -2,-13,-10,-11,-21,-16,-16;
/M: SY='V';  M=  1,-29,-10,-29,-26,-11,-27,-28, 19,-20,  8,  6,-29,-14,-19,-25,-16, -3, 24,-28,-13,-20;
/M: SY='L';  M=-17,-36,-12,-38,-29,  9,-37,-26, 18,-28, 29, 19,-35,-31,-20,-23,-26,-11, 10,-16, -4,-28;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-13,-27,-24, -2,-23,-21, 14,-22,  4,  8,-24,-24,-19,-24,-14, -4, 16,-20, -4,-22;
/M: SY='G';  M=  1,-19,-19,-20,-19,-20, 12,-21,-14,-17,-13,-12,-17,-21,-16,-13, -6, -9,-11,-27,-22,-19;
/M: SY='F';  M= -3,-19,-15,-21,-17,  3,-22,-18,  2,-12, -5, -3,-20,-23,-16,-18, -8, -8,  2,-20, -5,-16;
/M: SY='D';  M= -2, -1,-22,  3,  3,-19,-14,-11,-17, -6,-19,-13, -6,-17,  2, -7,  3, -6,-16,-30,-18,  1;
/M: SY='F';  M=-11,-21,-19,-21,-14,  2,-27,-19,  2,-20,  2,  0,-25,-19,-15,-21,-16,-10,  0,-20, -5,-15;
/M: SY='P';  M= -6, -1,-27,  5, -4,-31, -1,-17,-25,-13,-27,-23, -9,  8, -9,-18, -2, -9,-20,-38,-27, -7;
/M: SY='D';  M= -8,  3,-17,  7,  3,-25,-16,-11,-23, -8,-26,-20, -5,-19,  1,-10,  0, -6,-22,-20,-19,  0;
/M: SY='K';  M=  3, -5,-23, -7,  6,-25, -8, -4,-24,  8,-26,-18, -3,-13,  3,  5,  5, -3,-19,-29,-18,  4;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E';  M=  1,  1,-14,  4, 13,-14, -8, -4,-12,  1,-14, -9, -1, -6,  4, -3,  5,  3,-11,-17,-11, 10; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='E';  M= -9, -1,-24,  3,  5,-16,-17, -5,-12, -3,-16,-12, -5,-15, -1, -3, -6, -3,-10,-23, -7,  3; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='L';  M=-12,-24,-20,-27,-17, -6,-29,-13,  4,-11,  8,  5,-19,-25,-10,  3,-18,-10, -1,-17, -4,-17; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='D';  M=-13, 14,-32, 21, 13,-32,-16,-10,-22, -2,-29,-21,  4, -9,  1,-11, -1, -2,-19,-39,-24,  9;
/M: SY='E';  M=  7, -5,-20, -2, 11,-24,-14,-11,-16,  2,-21,-12, -9,-13,  6, -5,  2, -6,-11,-30,-20,  9;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-20,-35,-25, 27,-31,-15,  5,-23,  9, 13,-27,-34,-19,-18,-21,-15, -2, -6,  9,-25;
/M: SY='I';  M=-12,-20,-21,-22,-11,-16,-30,-20,  2, -5,  1, -4,-20, -8,-10, -7,-15,-10,  0,-26,-16,-12;
/M: SY='S';  M=  2,  0,-22, -1,  7,-26, -1, -8,-25,  2,-29,-18,  3,-12,  4, -5, 11, -1,-20,-30,-21,  6;
/M: SY='R';  M= -1,-12,-25,-16, -1,-22,-17, -6,-19,  7,-14,  0, -6,-17, 14, 17, -2, -7,-15,-26,-18,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-34,-10,-34,-27, -3,-34,-28, 22,-26, 25, 19,-33,-27,-19,-22,-22, -8, 16,-22,-11,-26;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='D';  M=-18, 24,-35, 27, 15,-31,-14,  8,-30,  1,-36,-24, 19,-18,  5, -6,  1, -9,-29,-39,-19,  9;
/M: SY='D';  M= -1, -1,-25,  4,  3,-22,  4, -9,-25, -9,-29,-21, -5,-16, -6,-13,  3, -6,-20,-28,-14,  0;
/M:         M= -7,-17,-20,-17,-11, -9, -6,-18, -9,-16, -7, -7,-16,-21,-12,-17, -4, -9,-10,-23,-14,-11;
/M: SY='G';  M= -5, -4,-29, -4,-15,-29, 39,-17,-33,-18,-33,-25, -5,-21,-16,-18, -2,-17,-27,-32,-28,-16;
/M: SY='Y';  M=-15,-27,-22,-28,-18, 11,-28,  5, -8,-16, -8, -5,-19,-17,-15,-15,-18,-15, -5,  1, 37,-17;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-29, -4,  6,-23,-19, -8,-24,  3,-24,-18, -5,  2,  6,  1, -1, -2,-20,-29,-18,  5;
/M: SY='Y';  M= -5,-25, -6,-27,-20,  1,-23,-10, -5,-18,-11,-10,-20,-24,-16,-22, -7, -6, -3,  4, 14,-19;
/M:         M=-10,-13,-10,-14,  0,-12,-27, -9, -7, -8, -9, -8,-16,-21, -5,-14,-11,-11, -9,-23,-10, -2;
/M: SY='B';  M=-17, 15,-30, 15,  6,-27,-18, -7,-19, -1,-25,-16, 14,-20, -2, -8, -2, -7,-19,-37,-21,  2;
/M: SY='L';  M=-17,-17,-21,-13,-12,-11,-29,-21,  1,-20,  5, -2,-23,-12,-14,-20,-17,-11, -4,-27,-14,-14;
/M: SY='S';  M= -1, -4,-16, -6, -5,-19,-13, -2,-14, -5,-20,-12,  6,-13,  2, -9, 13, 11, -9,-29,-14, -2;
/M: SY='H';  M=-12,  6,-30,  8,  4,-23, -5, 10,-29, -9,-33,-24,  5,-11, -2,-12,  0,-12,-26,-29, -8,  1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	49 in 35 different sequences
Number of true positive hits	49 in 35 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	2
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	ACT-like
Version [info]	1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

35 sequences

ILVA_BACSU  (P37946), ILVA_BURM1  (P53607), ILVA_CORGL  (Q04513),

ILVA_ECOLI  (P04968), ILVA_HAEIN  (P46493), ILVA_HALH5  (Q9KC63), 
ILVA_LACLA  (Q02145), ILVA_MYCBO  (P66898), ILVA_MYCLE  (Q9X7F1), 
ILVA_MYCTO  (P9WG94), ILVA_MYCTU  (P9WG95), ILVA_PASMU  (Q9CKJ2), 
ILVA_SALTY  (P20506), ILVA_STAA3  (Q2FF63), ILVA_STAA8  (Q2FWJ9), 
ILVA_STAAB  (Q2YUE8), ILVA_STAAC  (Q5HEE0), ILVA_STAAM  (Q99SJ1), 
ILVA_STAAN  (Q7A4H2), ILVA_STAAR  (Q3V7T5), ILVA_STAAS  (Q3V7T4), 
ILVA_STAAW  (Q8NVI8), ILVA_STAEQ  (Q5HMF5), ILVA_STAES  (Q8CNK9), 
ILVA_STAHJ  (Q4L7U4), ILVA_STAS1  (Q49Z16), TD1_SOLLC   (A0FKE6), 
TD2_SOLLC   (P25306), TD_NICAT(Q9AXU4), TD_SOLTU(P31212), 
THD1_ARATH  (Q9ZSS6), THD1_CICAR  (Q39469), THDH_BLAAD  (O42615), 
THDH_SCHPO  (O94634), THDH_YEAST  (P00927)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

1TDJ