PROSITE entry PS51447

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51447
Entry name [info]	FDX_ACB
Accession [info]	PS51447
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2009 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51447
Associated ProRule [info]	PRU00778

Name and characterization of the entry

Description [info]

Ferredoxin-fold anticodon binding (FDX-ACB) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=95;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0351992; R2=0.0180323; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5440.7348633; R2=2.7469387; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=414; H_SCORE=6578; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=248; H_SCORE=6122; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M=  5, -5,-17, -3,-10,-30, -6,-12,-27, -4,-28,-19,  2,  6, -3,-14, 29, 10,-20,-38,-21, -4;
/M: SY='K';  M=-10, -7,-28,-13, -1,-28,-23, -4,-22, 24,-22,-13, -5,-16,  7, 19, -3, -5,-19,-29,-13,  0;
/M: SY='F';  M=-21,-31,-24,-36,-22, 43,-33,  1, -4,-26,  0,  2,-27,-29,-20,-20,-21,-17, -9,  4, 40,-25;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-38, -9, -5,-39,-20,-14,-30, -6,-36,-25,-16, 80,  2,-24, -8,-10,-29,-35,-26, -2;
/M: SY='A';  M=  8,-11,-18, -9, -4,-28,-10,-13,-20, -3,-24,-15, -7,  2, -2,-14,  8,  0,-15,-32,-19, -2;
/M: SY='V';  M=  0,-27, -9,-29,-24,-11,-27,-27, 16,-21,  1,  5,-17,-25,-19,-24, -6,  2, 20,-29,-10,-21;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-25,-10,  1,-18,-24, -6,-21,  4,-18,-11, -7,-20,  3,  8, -2,  0,-15,-24, -7,  1;
/M: SY='R';  M=-19,-10,-38,-19,  0,-28,-29,  3,-36, 28,-27,-17, -9,-28, 11, 58,-10,-10,-29,-28, -9,  1;
/M: SY='D';  M=-20, 49,-40, 79, 20,-50,-10, -9,-40,-10,-40,-40, 20,-10,  0,-20,  0,-10,-40,-50,-30, 10;
/M: SY='L';  M=-15,-39,-19,-40,-32, 10,-39,-30, 28,-30, 30, 23,-34,-35,-24,-32,-28,-10, 21,-19, -4,-29;
/M: SY='S';  M= 27, -9, -9,-10,-10,-29, -2,-15,-19, -6,-24,-14,  1,-10, -6,-15, 28, 13, -9,-35,-20, -6;
/M: SY='F';  M=-18,-39,-18,-43,-31, 30,-39,-25, 20,-33, 23, 15,-36,-36,-30,-31,-28,-12, 13,-12,  9,-33;
/M: SY='V';  M= -9,-36,-20,-37,-27, -2,-36,-31, 21,-26, 13, 11,-30,-31,-21,-28,-23, -6, 22, -6, -5,-24;
/M: SY='I';  M= -5,-38,-14,-38,-30, -3,-37,-34, 32,-28, 19, 18,-30,-31,-25,-31,-23, -6, 32,-26, -9,-27;
/M: SY='D';  M= -8, 14,-32, 24,  5,-41, -9,-11,-33, -3,-36,-29,  8, 18, -2,-16,  3, -6,-31,-41,-26,  2;
/M: SY='E';  M= -6,  4,-25,  4, 11,-31,-18, -5,-26, 10,-24,-16,  4,-12,  8,  1,  0, -5,-22,-32,-19, 10;
/M: SY='D';  M= -5, 14,-25, 18,  9,-36, -7, -3,-32,  3,-32,-23, 12,-12,  4, -7,  8, -2,-27,-37,-21,  8;
/M: SY='V';  M= -7,-30,-15,-32,-24,  0,-34,-26, 20,-23,  8,  8,-24,-28,-21,-25,-17, -2, 21,-23, -4,-22;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='P';  M= -5, -7,-15, -5, -5,-14,-11,-11, -9, -7,-10, -8, -8, 18, -5,-12, -3,  2, -8,-17,-12, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='E';  M= -1,  4,-14,  5,  6,-17, -8, -1,-16,  3,-15, -9,  3, -8,  5, -2,  3, -2,-13,-18, -9,  6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='A';  M=  2,-21,-18,-22,-12, -3,-22,-12, -3,-16, -8, -4,-15,-21,-13,-19, -8, -5,  0,-17, -1,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N';  M=  1,  2,-23,  3,  2,-32,  0, -7,-26, -2,-26,-16,  7,-16,  4,-10,  4, -6,-23,-31,-18,  4;
/M: SY='D';  M= -9, 13,-28, 21, 16,-33,-17, -7,-28,  1,-26,-20,  5,-13,  7, -7,  0, -4,-24,-35,-20, 13;
/M: SY='I';  M=-12,-39,-18,-41,-33,  9,-39,-32, 32,-30, 25, 20,-33,-33,-27,-33,-27, -9, 27,-22, -4,-30;
/M: SY='M';  M= -8,-23,-19,-25,-13, -8,-26,-16,  3,-11,  4,  7,-19,-25, -8,-15,-14, -7,  2,-23, -8,-11;
/M: SY='D';  M= -5, 10,-27, 13, 10,-35,-13, -5,-29,  9,-28,-19,  8,-14,  9,  1,  3, -4,-25,-34,-20, 10;
/M: SY='V';  M=  3,-23,-12,-24,-17,-14,-24,-21,  6,-16,  0,  2,-17,-23,-14,-20, -8, -1,  9,-29,-12,-16;
/M: SY='I';  M= -4,-36,-10,-37,-32, -3,-34,-33, 31,-27, 15, 16,-28,-29,-25,-33,-21, -7, 28,-28,-10,-27;
/M: SY='R';  M=-10, -6,-29,-12,  1,-26,-21, -1,-26, 17,-21,-12, -3,-21,  7, 21, -5, -8,-22,-28,-12,  2;
/M: SY='K';  M= -1,  2,-25,  2,  9,-33, -8, -5,-29, 10,-26,-16,  4,-14,  7, -1,  5, -3,-24,-32,-19, 10;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='A';  M=  4,-18,-14,-20,-14,-13,-18,-16, -1,-14, -6, -2,-11,-21,-11,-19, -3,  0,  2,-26, -9,-12; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='A';  M=  6, -5,-20, -5, -9,-28,  6,-13,-21, -6,-22,-15,  0,-15, -5,-13,  3, -5,-18,-30,-19, -6; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='G';  M= -2, -9,-21,-10,-10,-25,  6,-13,-17, -5,-19,-12, -4,-15, -5,-13, -2, -7,-15,-27,-17, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='D';  M= -8,  8,-29, 13, 10,-35,-13, -6,-30,  5,-31,-23,  6,  3,  4, -8,  0, -5,-27,-35,-22,  8;
/M: SY='L';  M=-15,-25,-21,-26,-17, -1,-32,-18,  4,-17, 13, 10,-22,-30,-12,-19,-19, -8,  1,-15, -2,-16;
/M: SY='L';  M=-12,-38,-18,-39,-31,  2,-39,-33, 28,-28, 30, 22,-33,-34,-23,-31,-26, -8, 23,-22, -9,-28;
/M: SY='E';  M= -8, -3,-26, -2, 21,-28,-26, -7,-23, 12,-22,-13, -5,-15, 12,  5, -6, -5,-17,-29,-16, 19;
/M: SY='D';  M= -4, 13,-25, 16, 11,-35, -9, -2,-31,  4,-31,-21, 13,-13,  7, -6, 10, -1,-27,-35,-20, 12;
/M: SY='I';  M= -5,-36,-14,-38,-29,  1,-34,-30, 27,-28, 12, 11,-28,-30,-26,-30,-21, -6, 27,-23, -5,-28;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-23, -5,  7,-19,-21, -5,-24,  4,-20,-12, -2,-19,  6,  1, -3, -4,-19,-22, -8,  7;
/M: SY='L';  M=-13,-38,-16,-38,-30,  3,-38,-32, 26,-28, 27, 18,-34,-29,-24,-31,-26, -8, 21,-24, -9,-29;
/M: SY='F';  M=-20,-36,-19,-42,-28, 41,-37,-18, 10,-32, 12,  6,-33,-35,-30,-28,-24,-13,  5, -6, 19,-32;
/M: SY='D';  M=-16, 43,-36, 68, 17,-47,-10,-10,-38, -9,-38,-37, 18,-10,  0,-18,  4, -6,-37,-48,-29,  9;
/M: SY='V';  M= -7,-28,-16,-28,-17,-12,-35,-27, 17,-17,  3,  5,-22,-27,-16,-19,-17, -4, 20,-26,-11,-15;
/M: SY='Y';  M=-21,-31,-27,-34,-22, 46,-32, 11, -8,-24, -5, -1,-24,-32,-17,-15,-20,-17,-10, 15, 64,-24;
/M: SY='Q';  M= -7, -4,-25, -6,  8,-26,-22, -4,-24,  9,-22,-13, -3,-13, 11,  8,  1,  0,-18,-27,-12, 10;
/M: SY='G';  M= -5, -1,-28,  0,-15,-35, 35, -8,-35,-12,-34,-25,  3,-14, -9,-21,  0,-14,-34,-30,-22,-10;
/M: SY='E';  M= -5,  3,-29,  6, 13,-36,-13, -7,-29, 11,-30,-20,  1,  1,  9, -3, -1, -7,-26,-33,-21, 12;
/M: SY='N';  M= -6,  5,-26,  2,  1,-35,  2, -1,-32,  9,-31,-19, 10, -9,  8, -4,  5, -7,-30,-31,-19,  5;
/M: SY='I';  M=-10,-28,-19,-30,-24, -7,-31,-27, 18,-20, 15, 13,-22,-28,-18,-25,-18, -3, 16,-27,-12,-21;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='P';  M= -4, -3,-26,  2, -1,-30, -1,-12,-24, -4,-27,-19, -4, 18, -3,-15, -3, -7,-22,-29,-20, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='E';  M= -2,  0,-20,  3, 13,-24,-15, -6,-21,  3,-21,-14, -1, -1,  5, -6, -1, -4,-16,-25,-14, 11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='G';  M= -4,  6,-27,  7,-10,-36, 35,-10,-34,-10,-34,-25, 10,-16, -8,-18,  2,-11,-32,-31,-24, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='K';  M=-11, -5,-27,-10,  7,-23,-22,  4,-25, 23,-21,-11, -3,-14, 14, 13, -4, -9,-23,-23, -7,  8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='K';  M= -9, -9,-25,-16,  0,-27,-24, -4,-19, 30,-19,-11, -6,-17,  9, 18, -4, -6,-17,-27,-12,  1;
/M: SY='S';  M=  9,  2,-12,  0, -9,-30, -1, -8,-29,  0,-30,-19, 13,-11,  0, -9, 43, 16,-20,-39,-19, -1;
/M: SY='L';  M=-14,-37,-18,-38,-28,  5,-38,-27, 23,-27, 26, 20,-32,-34,-20,-27,-25, -9, 18,-19, -2,-26;
/M: SY='A';  M= 22,-15,  3,-18,-14,-25, -5,-21,-13,-13,-16,-11, -8,-15,-12,-20, 12, 10, -5,-33,-21,-13;
/M: SY='F';  M=-18,-38,-21,-40,-30, 30,-38,-17, 17,-30, 16, 13,-32,-35,-26,-28,-27,-14, 11, -7, 22,-30;
/M: SY='R';  M= -7, -7,-28,-13, -3,-29,-16, -4,-33, 16,-28,-18, -3,-22,  5, 31,  4, -2,-24,-30,-13, -1;
/M: SY='L';  M=-15,-39,-14,-41,-31, 17,-38,-28, 22,-31, 27, 19,-35,-36,-26,-31,-27,-10, 16,-17,  0,-30;
/M: SY='T';  M= -5,-16,-18,-21,-15,-13,-27,-19,  1,-12, -5, -2,-11,-22,-12,-11, -4,  9,  5,-24,-10,-14;
/M: SY='F';  M=-22,-37,-23,-41,-28, 40,-37,-10,  7,-30, 16, 12,-33,-36,-24,-25,-27,-16,  0,  3, 32,-30;
/M: SY='Q';  M=-12, -5,-30,-11,  5,-31,-20,  2,-30, 17,-22, -9, -3,-20, 28, 26, -4, -9,-26,-22,-11, 13;
/M: SY='D';  M=  2, 12,-21, 18,  0,-35, -5, -1,-30, -5,-32,-23, 12, -7,  0,-14, 16,  1,-26,-40,-20,  1;
/M:         M= -7,-12,-24,-11, -8,-18,-19,-10,-16, -6,-13, -7,-10, -1, -4,-14, -6, -5,-15,-26,-10, -7;
/M: SY='D';  M= -9, 18,-28, 27, 24,-34,-16, -5,-33,  2,-30,-23,  9,-12,  8, -8,  2, -2,-28,-36,-21, 19;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-31,-12,  3,-32,-17,  4,-33, 28,-29,-18, -2,-19, 11, 32, -2, -8,-28,-29,-13,  4;
/M: SY='T';  M=  1,  1,-12, -8, -9,-23,-16,-17,-13, -9,-14,-10,  4, -9, -7,-11, 18, 38, -5,-31,-20, -8;
/M: SY='L';  M=-20,-40,-20,-40,-30, 12,-40,-28, 20,-30, 46, 29,-39,-39,-20,-30,-29,-10, 10,-19, -7,-30;
/M: SY='T';  M= -2,  1,-18, -3,  0,-27,-16,-12,-19,  2,-19,-13,  3,-11,  2, -5, 13, 21,-12,-31,-19,  2;
/M: SY='D';  M=-12, 27,-32, 40, 22,-39,-14, -4,-35, -1,-33,-27, 14,-12,  7,-10,  1, -6,-31,-39,-23, 17;
/M: SY='E';  M= -2,  5,-24, 10, 20,-32,-17, -7,-29,  6,-25,-17,  2,-12, 11, -4,  2, -3,-23,-32,-20, 19;
/M: SY='E';  M=-11,  9,-30, 18, 33,-30,-25, -4,-32,  4,-26,-18,  0,-13, 14, -1, -7, -8,-25,-31,-18, 28;
/M: SY='V';  M= -1,-38,-15,-38,-32, -6,-37,-37, 38,-28, 14, 13,-29,-29,-28,-33,-22, -5, 39,-29,-10,-28;
/M: SY='N';  M= -7, 22,-25, 20, 10,-37,-10,  0,-29,  3,-32,-20, 29,-15,  5, -7,  6, -1,-26,-37,-21,  8;
/M: SY='Q';  M=  0, -4,-24, -3,  4,-29,-17, -9,-19,  3,-20,-12, -2,-11,  6, -5,  0, -3,-15,-30,-17,  6;
/M: SY='I';  M=  1,-27,-15,-28,-21, -9,-27,-26, 14,-19,  7,  8,-21,-25,-17,-25,-14, -5, 13,-26,-12,-18;
/M: SY='M';  M=-11,-20,-23,-24,-14, -5,-28,  2, -2,-11, -2,  8,-14,-25, -4,-10,-11, -7, -2,-21,  0,-10;
/M: SY='D';  M= -7, 15,-26, 19, 17,-35,-14, -3,-30,  4,-28,-18, 13,-13, 14, -6,  2, -4,-27,-32,-20, 17;
/M: SY='K';  M= -5, -1,-27, -5,  9,-34,-17, -1,-29, 23,-27,-16,  1,-14, 16, 15,  1, -6,-25,-29,-17, 11;
/M: SY='I';  M= -7,-38,-12,-39,-33, -1,-38,-36, 35,-29, 19, 16,-30,-31,-27,-34,-24, -6, 32,-28,-10,-29;
/M: SY='I';  M= -8,-27,-21,-28,-20, -9,-30,-23, 13,-14,  7,  8,-21,-27,-13,-17,-17, -6, 13,-25, -8,-17;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-24,  6,  8,-33,-13, -6,-27,  8,-25,-17,  5,-14,  7, -1,  2, -4,-23,-33,-19,  8;
/M: SY='A';  M=  5,-10,-19,-13, -5,-24,-14,-11,-15, -1,-15, -7, -4,-18, -1, -6,  2, -2,-11,-29,-14, -3;
/M: SY='L';  M= -9,-37,-16,-38,-28,  3,-35,-30, 21,-28, 32, 22,-33,-34,-21,-29,-23, -7, 16,-23,-10,-27;
/M: SY='K';  M= -3, -5,-24, -8,  5,-28,-17, -5,-20, 10,-21,-11, -2,-16,  7,  0, -1, -3,-15,-29,-15,  7;
/M: SY='Q';  M= -6,  4,-26,  3, 16,-33,-17, -1,-29, 16,-26,-15,  3,-13, 18,  5,  2, -3,-25,-28,-17, 17;
/M: SY='K';  M= -7, -2,-26, -6,  6,-30,-15, -2,-26, 18,-23,-13,  1,-16, 12,  9, -2, -8,-24,-28,-15,  8;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='F';  M=-17,-28,-14,-32,-22, 25,-30,-11,  3,-23, 13,  7,-26,-28,-20,-21,-18, -8, -2, -8, 11,-24; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='G';  M= -3,  1,-27, -2,-12,-36, 30, -7,-33, -5,-34,-22, 11,-15, -2,-15,  3,-12,-32,-30,-21, -6;
/M: SY='A';  M= 16,-26,-15,-27,-21,-16,-11,-24,  5,-19, -6, -1,-17,-21,-18,-25, -6, -4,  9,-24,-12,-19;
/M: SY='Q';  M= -5, -8,-23, -9,  3,-25,-22,-10,-14,  4,-15, -8, -6,-17,  5, -1, -2,  0,-10,-28,-15,  5;
/M: SY='L';  M=-15,-38,-21,-38,-30,  5,-37,-31, 24,-28, 33, 23,-35,-33,-21,-30,-27,-10, 16,-20, -9,-27;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-39,-19,  0,-30,-29, -1,-38, 29,-30,-20, -8,-28,  9, 64, -9,-10,-29,-30,-11,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	273 in 273 different sequences
Number of true positive hits	273 in 273 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	FDX-ACB
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

273 sequences

FDXA1_HUMAN (Q9BRP7), FDXA1_MOUSE (Q3UY23), SYFB_ACIAD  (Q6F873),

SYFB_AGRFC  (Q8UIN4), SYFB_ALIF1  (Q5E5G5), SYFB_ANADE  (Q2IJB3), 
SYFB_ANAMM  (Q5PA83), SYFB_AQUAE  (O67620), SYFB_AROAE  (Q5P7Y0), 
SYFB_AYWBP  (Q2NJZ2), SYFB_BACAN  (Q81L31), SYFB_BACC1  (Q72ZI2), 
SYFB_BACCR  (Q817I7), SYFB_BACCZ  (Q633N5), SYFB_BACFN  (Q5LC76), 
SYFB_BACFR  (Q64T65), SYFB_BACHK  (Q6HCW8), SYFB_BACLD  (Q65GD3), 
SYFB_BACSU  (P17922), SYFB_BACTN  (Q8AA39), SYFB_BARHE  (Q6G5I2), 
SYFB_BARQU  (Q6G0Y3), SYFB_BDEBA  (Q6MMJ1), SYFB_BIFLO  (Q8G5E8), 
SYFB_BLOFL  (Q7VR66), SYFB_BLOPB  (Q492V0), SYFB_BORBR  (Q7WKR4), 
SYFB_BORPA  (Q7W7C6), SYFB_BORPE  (Q7VVR5), SYFB_BRADU  (Q89WI2), 
SYFB_BRUA2  (Q2YQV4), SYFB_BRUAB  (Q57AD9), SYFB_BRUME  (Q8YE74), 
SYFB_BRUSU  (Q8FXX4), SYFB_BUCAI  (P57230), SYFB_BUCAP  (P59057), 
SYFB_BUCBP  (P59505), SYFB_BURL3  (Q39H50), SYFB_BURMA  (Q62KI7), 
SYFB_BURP1  (Q3JT07), SYFB_BURPS  (Q63TM7), SYFB_BURTA  (Q2SVE3), 
SYFB_CALS4  (Q8R9C7), SYFB_CAMJE  (Q9PP35), SYFB_CAMJR  (Q5HUR2), 
SYFB_CARHZ  (Q3ABT5), SYFB_CAUVC  (Q9A9E5), SYFB_CERS4  (Q3J5M6), 
SYFB_CHLAB  (Q5L6W7), SYFB_CHLCH  (Q3AQC6), SYFB_CHLCV  (Q824J8), 
SYFB_CHLL3  (Q3B4Z2), SYFB_CHLMU  (Q9PJR8), SYFB_CHLPN  (Q9Z7W0), 
SYFB_CHLTA  (Q3KLM3), SYFB_CHLTE  (Q8KEF9), SYFB_CHLTR  (O84481), 
SYFB_CHRVO  (Q7NYC1), SYFB_CLOAB  (Q97GL0), SYFB_CLOPE  (Q8XJ76), 
SYFB_CLOTE  (Q891T8), SYFB_COLP3  (Q47ZS5), SYFB_CORDI  (Q6NHH1), 
SYFB_COREF  (Q8FTP0), SYFB_CORGL  (Q8NQN6), SYFB_CORJK  (Q4JW05), 
SYFB_COXBU  (Q83C15), SYFB_CUPPJ  (Q472N3), SYFB_CUTAK  (Q6A7V6), 
SYFB_DECAR  (Q47CM9), SYFB_DEHM1  (Q3Z9I7), SYFB_DEHMC  (Q3ZZD2), 
SYFB_DEIRA  (Q9RRX5), SYFB_DESPS  (Q6ANC2), SYFB_DICD3  (P37984), 
SYFB_ECO57  (Q8XE32), SYFB_ECOL6  (P59664), SYFB_ECOLI  (P07395), 
SYFB_EHRCJ  (Q3YRN4), SYFB_EHRRG  (Q5FFS3), SYFB_EHRRW  (Q5HAU7), 
SYFB_ENTFA  (Q836J5), SYFB_FRATT  (Q5NG54), SYFB_FUSNN  (Q8RHB5), 
SYFB_GEOKA  (Q5KWE5), SYFB_GEOMG  (Q39VS4), SYFB_GEOSL  (Q74CZ9), 
SYFB_GLOVI  (Q7NCQ2), SYFB_GLUOX  (Q5FUA2), SYFB_GRATL  (Q6B8Z8), 
SYFB_HAEDU  (Q7VLG3), SYFB_HAEI8  (Q4QKM3), SYFB_HAEIN  (P43820), 
SYFB_HAHCH  (Q2SDJ7), SYFB_HALH5  (Q9K896), SYFB_HELHP  (Q7VK65), 
SYFB_HELPJ  (Q9ZKF8), SYFB_HELPY  (P56145), SYFB_HYDCU  (Q31F19), 
SYFB_IDILO  (Q5QXL8), SYFB_LACAC  (Q5FIY7), SYFB_LACJO  (Q74IE2), 
SYFB_LACLA  (Q9CEB5), SYFB_LACPL  (Q88WR2), SYFB_LATSS  (Q38VV4), 
SYFB_LEGPA  (Q5X1H8), SYFB_LEGPH  (Q5ZS09), SYFB_LEGPL  (Q5WT87), 
SYFB_LEIXX  (Q6AGD6), SYFB_LEPBA  (B0SAR6), SYFB_LEPBJ  (Q04VV0), 
SYFB_LEPBL  (Q04XL9), SYFB_LEPBP  (B0SJF2), SYFB_LEPIC  (Q72MG8), 
SYFB_LEPIN  (Q8EZ26), SYFB_LISIN  (Q92CI6), SYFB_LISMF  (Q720K7), 
SYFB_LISMO  (Q8Y7Q1), SYFB_MANSM  (Q65TL3), SYFB_MESFL  (Q6F166), 
SYFB_METCA  (Q60AY9), SYFB_MOOTA  (Q2RHN8), SYFB_MYCBO  (Q7VEV3), 
SYFB_MYCCT  (Q2SS99), SYFB_MYCGA  (Q7NBB7), SYFB_MYCLE  (Q9CC16), 
SYFB_MYCMS  (Q6MT18), SYFB_MYCPA  (Q740J0), SYFB_MYCTO  (P9WFU0), 
SYFB_MYCTU  (P9WFU1), SYFB_NEIG1  (Q5F9T6), SYFB_NEIMA  (Q9JVA0), 
SYFB_NEIMB  (Q9K089), SYFB_NEOYE  (Q1XDE1), SYFB_NITEU  (Q82VV6), 
SYFB_NITMU  (Q2YBS1), SYFB_NITOC  (Q3JBZ7), SYFB_NITV2  (Q728S0), 
SYFB_NITWN  (Q3SWK8), SYFB_NOCFA  (Q5YYH6), SYFB_NOSS1  (Q8YMH5), 
SYFB_NOVAD  (Q2GAI7), SYFB_OCEIH  (Q8EPH5), SYFB_OLEA2  (Q30Y16), 
SYFB_ONYPE  (Q6YPX7), SYFB_PARM1  (Q2VYZ1), SYFB_PARMW  (Q7U6V9), 
SYFB_PARUW  (Q6MEA6), SYFB_PASMU  (P57859), SYFB_PECAS  (Q6D4H3), 
SYFB_PELUB  (Q4FNH4), SYFB_PHATC  (A0T0H4), SYFB_PHOLL  (Q7N3Q1), 
SYFB_PHOPR  (Q6LQ73), SYFB_PORGI  (Q7MXR4), SYFB_PORPU  (P51346), 
SYFB_PROM9  (Q31AV5), SYFB_PROMA  (Q7VBX6), SYFB_PROMM  (Q7V7K5), 
SYFB_PROMP  (Q7V1J8), SYFB_PROMT  (Q46KZ8), SYFB_PSE14  (Q48JR8), 
SYFB_PSEAE  (Q9I0A4), SYFB_PSEF5  (Q4KEV9), SYFB_PSEPF  (Q3KEX7), 
SYFB_PSEPK  (Q88K22), SYFB_PSESM  (Q883H7), SYFB_PSET1  (Q3IIL2), 
SYFB_PSEU2  (Q4ZUG2), SYFB_PSYA2  (Q4FQ66), SYFB_RALN1  (Q8XZ24), 
SYFB_RHILO  (Q98CQ1), SYFB_RHIME  (Q92SS9), SYFB_RHOBA  (Q7UP77), 
SYFB_RHOPA  (Q6NDR9), SYFB_RHORT  (Q2RNH7), SYFB_RICBR  (Q1RIS8), 
SYFB_RICCN  (Q92I38), SYFB_RICFE  (Q4ULS4), SYFB_RICPR  (Q9ZDB4), 
SYFB_RICTY  (Q68WW1), SYFB_RUEPO  (Q5LMS3), SYFB_SALCH  (Q57PU8), 
SYFB_SALPA  (Q5PH85), SYFB_SALRD  (Q2RYT3), SYFB_SALTI  (Q8Z6I4), 
SYFB_SALTY  (P15434), SYFB_SHEON  (Q8EF99), SYFB_SHIBS  (Q321K5), 
SYFB_SHIDS  (Q32FI6), SYFB_SHIFL  (Q83L36), SYFB_SHISS  (Q3Z261), 
SYFB_SHOC1  (Q5WEJ6), SYFB_SODGM  (Q2NT27), SYFB_SOLUE  (Q01SP7), 
SYFB_STAA3  (Q2FHU2), SYFB_STAAB  (Q2YX86), SYFB_STAAC  (Q5HGU5), 
SYFB_STAAM  (P67040), SYFB_STAAN  (P67041), SYFB_STAAR  (Q6GHU6), 
SYFB_STAAS  (Q6GA75), SYFB_STAAU  (Q9AGR3), SYFB_STAAW  (Q8NX60), 
SYFB_STAEQ  (Q5HQ35), SYFB_STAES  (Q8CSY8), SYFB_STAHJ  (Q4L5E4), 
SYFB_STAS1  (Q49WQ6), SYFB_STRA1  (Q3K1I7), SYFB_STRA3  (Q8E5U1), 
SYFB_STRA5  (Q8E064), SYFB_STRAW  (Q828C6), SYFB_STRCO  (O88054), 
SYFB_STRMU  (Q8CWX2), SYFB_STRP1  (Q9A0I0), SYFB_STRP3  (P0DG52), 
SYFB_STRP6  (Q5XCX3), SYFB_STRP8  (Q8P1K0), SYFB_STRPM  (Q48UC5), 
SYFB_STRPN  (Q97S34), SYFB_STRPQ  (P0DG53), SYFB_STRR6  (Q8DQT6), 
SYFB_STRT1  (Q5LZ72), SYFB_STRT2  (Q5M3S7), SYFB_SULDN  (Q30S83), 
SYFB_SYMTH  (Q67QF2), SYFB_SYNAS  (Q2LR26), SYFB_SYNC1  (Q3A4N8), 
SYFB_SYNE7  (P74764), SYFB_SYNJA  (Q2JXF6), SYFB_SYNJB  (Q2JHU3), 
SYFB_SYNP6  (Q5N5G8), SYFB_SYNS9  (Q3AVJ1), SYFB_SYNSC  (Q3AJY9), 
SYFB_SYNY3  (P74296), SYFB_THEFY  (Q47N76), SYFB_THEMA  (Q9WZS9), 
SYFB_THET2  (Q72HA0), SYFB_THET8  (Q5SGX1), SYFB_THETH  (P27002), 
SYFB_THEVB  (Q8DL37), SYFB_THIDA  (Q3SK29), SYFB_TRIV2  (Q3MAZ7), 
SYFB_TROW8  (Q83HH4), SYFB_TROWT  (Q83GS8), SYFB_UREPA  (Q9PQ33), 
SYFB_VIBCH  (Q9KSN6), SYFB_VIBPA  (Q87Q59), SYFB_VIBVU  (Q8DA39), 
SYFB_VIBVY  (Q7MK40), SYFB_WIGBR  (Q8D3B5), SYFB_WOLPM  (Q73HW5), 
SYFB_WOLSU  (Q7M8Y8), SYFB_WOLTR  (Q5GSH5), SYFB_XANAC  (Q8PJE5), 
SYFB_XANC8  (Q4UW52), SYFB_XANCP  (Q8P7Z6), SYFB_XANE5  (Q3BRU2), 
SYFB_XANOM  (Q2P100), SYFB_XANOR  (Q5GXY5), SYFB_XYLFA  (Q9PFD6), 
SYFB_XYLFT  (Q87AB6), SYFB_YERPE  (Q8ZDX1), SYFB_YERPS  (Q669Z6), 
SYFB_ZYMMO  (Q5NMC3), SYFM_ARATH  (Q94K73), SYFM_DICDI  (Q86A68), 
SYFM_DROME  (O16129), SYFM_HUMAN  (O95363), SYFM_MOUSE  (Q99M01), 
SYFM_RAT(Q6AYQ3), SYFM_SCHPO  (O74952), SYFM_YEAST  (P08425)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

39 PDB

1B70; 1B7Y; 1EIY; 1JJC; 1PYS; 2AKW; 2ALY; 2AMC; 2IY5; 2RHQ; 2RHS; 3CMQ;
» more