PROSITE entry PS51354

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51354
Entry name [info]	GLUTAREDOXIN_2
Accession [info]	PS51354
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2007 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00173
Associated ProRule [info]	PRU00686

Name and characterization of the entry

Description [info]

Glutaredoxin domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=98;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=93;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2568442; R2=0.0063679; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13487.6972656; R2=5.8649182; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1138; H_SCORE=20162; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=824; H_SCORE=18320; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-15; D=-100; I=-100; B1=-300; E1=-300; MI=-150; MD=-150; IM=-150; DM=-150;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-150; BD=-150;
/M: SY='M';  M=  5,-55,  4, 26,  6,-23,-10,  0, 21,-15, 33,  3,-16, 19, -4, -7,-13, -7,-56,-24;
/M: SY='E';  M= 18,-56, 34, 51,-37,-24,-23,-49, 14,-38,-26,-16, -7, 22, -3,  7, -8,-32,-44,-23;
/M: SY='R';  M= -7,-48,-19, 18, 15,-28, -5,-35, 29,-26, -9,-31,-23, 37, 45, -6, -2,-14,  1,-30;
/M: SY='I';  M= 11,-34,-35,-29, -5,-47,-29, 53,-26, 16, -8,-28,-13,-23,-14,-23,-27, 34,-16,-16;
/M: SY='Q';  M= -8,  4, 21, 22,-31,-24,  2,-40, 33,-36,  5, 10, -9, 43, 24, -4,-21,-38,-59,-18;
/M: SY='K';  M= -9,-19,  2, 19,-24,-17,-18,-17, 31,-35, -1, 21, 13, 28, 15, -1, -4, -8,-59,-27;
/M: SY='Q';  M=  6,-39, 11,  7,-35,-43,-17, 18,-14, 27, 24,-26, 13, 29,-23,-29,  7,-13,-40,-32;
/M: SY='I';  M=  1,-54,  8,-25,-28,-10,-25, 44,-16,  8, -3,-34,-30,-12,-20,-11, -7, 36,-60,-38;
/M: SY='K';  M=  8,-54, 10, 13,-56, 12,-29,-33, 30,-36, 14, 24,-31, 14,  2, 21, 10,-44,-61,-33;
/M: SY='E';  M=  5,-31, 24, 42,-50,-23,-19,-33, 13,-23, 10,  0,  5,  4, -5, 24,  6,-33,-63,-49;
/M: SY='N';  M= 11,-40,  7,-14,-24,-11, 37,-35, 17,-43, 10, 56,-22, 12,  0, 11,-22,-12,-63,-23;
/M: SY='P';  M=  7,-20, 10, -5,-59,-16,-27,-40, 34,-42,-10,  0, 60, -5, 26, -4, -2,-40,-61,-44;
/M: SY='V';  M=-22,-15,-63,-58,-12,-62,-38, 50,-43, 14,  1,-35,-53,-55,-44,-47,-35, 68,-59, -7;
/M: SY='V';  M= -9,-45,-52,  3, -9,-59,-39, 24,-29,  4, 37,-40,-54,-14,-33,-24, 22, 57,-60,-30;
/M: SY='V';  M=-33,-42,-64,-54, -7,-66,-57, 47,-53, 47, 21,-59,-60,-41,-57,-52,-15, 49,-57,-28;
/M: SY='Y';  M=-34,-57,-61,-55, 88,-61,-35,-22,-50,-26,-18,-56,-65,-47,-45,-46,-44,-17,-10, 90;
/M: SY='M';  M=-18,-28,-43,-34,-11,-12,-14, -2,-42,-18, 76,-38,-50, 17,-29, 42, 37, -4,-23,-11;
/M: SY='K';  M=-30,-55,-41,-25, -5,-39,-31,-49, 72,-32,-19,-26,-36,-10, 20, 13, 27,-32,-14,  8;
/I:         I=-25; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37;
/M: SY='P';  M=-13,-59,  2,  5,-44,-35, 15,-49, -1,-31,-47,  0, 76, -1, -2, 29, 12,-52,-63,-46;
/M: SY='T';  M=  4,-30,-11,-24,-19, 11, -3,-32,-11,-34, 15, -4,-47, 36,-10, 16, 41,-30,  8, 35;
/M: SY='C';  M=-44,143,-57,-62, -5,-58,-49,-57,-57,-46,-39,-32,-72,-64,-51,-46,-34,-44,-72, -4;
/M: SY='P';  M=-30, 30,-24,  7,-50, 39,-17,-49,-35,-59,-29,-43, 88,  1,-23,-24,-23,-32,-61,-51;
/M: SY='F';  M=-33,-58, 12,-31, 74,-53, 27,-30,-33,-21, 22,-11,-15, -5,-31,-43,-46,-40, 12, 70;
/M: SY='C';  M=-29,127,-52,-53,-54,-21,-54,-55,-50,-50,-51,-39,-44,-50,-56, 53, -9,-47,-74,-57;
/M: SY='H';  M=  8, -1, -8,-21,-50,-20, 36,-11, 28,-27,-25, 18, 10,-14, 21,  1,  1,  9,-44,-17;
/M: SY='K';  M= 22,-39, -7,-15,-34,-31,-27,-44, 46,-35, 11,  6,-45, 34, 37, -9, -2,-21,-37,-20;
/M: SY='V';  M= 47,-31,-55,-50,-42,-49,-56,  5,-50,  4, 16,-49,-53,-49,-53,-20, 29, 54,-63,-45;
/M: SY='K';  M=-12,-34,-45, -6,-49,-54,-44, -3, 58,-23,-14,-40,-52, -5, 49,-28,-21, 32,-58,-25;
/M: SY='Q';  M= 11,-57, 18, 21,-42,-19,-18,-46, 11,-38,-10,  3,-43, 59, 40,  4,-12,-43,-37,-43;
/I:         I=-27; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='I';  M= 20,-41,-51,-21, 12,-54,-42, 40,-34, 40,  6,-54,-49,-42,-39,-41, -7, 16, -5,  0;
/M: SY='L';  M=-29,-52,-66,-59, 34,-66,-51, 10,-58, 70, 30,-62,-52,-54,-47,-56,-44,  1,-28,-30;
/M: SY='N';  M= -8,-31, 30, 18,-56,-19, 28,-38, 23,-41,-17, 30,-43, 25, 29,  7, -1,-38,-25,-24;
/M: SY='E';  M= -3,-42,  9, 33,-44,  0, -3,-45, 15,-35,-17, 13,-32, 28, 23, 25, -9,-43,-23, -7;
/I:         I=-27; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='Y';  M=-20, 20,-40,-31, 13,-56, 34,-15,  8, 36, 22, -9,-44, 14, -2,-20,-28,-18,-28, 38;
/M: SY='G';  M= -7,-44,  3,-14,-61, 65,-19,-59,  7,-50,-43, 33,-29,  3,  5,  7,-25,-53,-60,-53;
/M: SY='V';  M=  4,-31,-37,-11,  4,-61,-36, 41,-28, 10,-17,-54,-41,-28,-32,-42,-25, 59,-58,-16;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-38; IM=0; DM=-38;
/M: SY='P';  M= -1,-48, 26, 21,-59,-35, 16,-42, 32,-45,-42, 34, 36, 10, 12,  4,-10,-42,-32,-49;
/M: SY='Y';  M=-13,-18,-59,-55, 62,-51,-16, 15,-49, -5, -6,-48, 31,-53,-53,-43,-44, 11, -3, 71;
/M: SY='E';  M=  9,-17, 19, 44,-18,-10, 11,-25, 11,-34,-44,-20,-27,  8, -2,-12, 20,-12,-58,  2;
/M: SY='E';  M= -8,-26,  3, 35,  5,-28,-28, 14,-27,-12, -2,-43,-32,-33,-36, -1, 17, 31,-23, 26;
/M: SY='V';  M=-42,-40,-54,-31, 19,-46, 31, 32, -6, -6,-17,-37,-58,-38, 35,-41,-34, 46,-29, 32;
/M: SY='D';  M=-39,-59, 75, 52,-63,-43, 15,-62,-12,-53,-21, 54,-27,-19,-32,-28,-34,-50,-30,-50;
/M: SY='V';  M=  1,-34,-63,-53,-14,-63,-59, 51,-57, 39,-11,-46,-59,-54,-58,-46,-18, 51,-58,-34;
/I:         I=-20; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L';  M=-26,-64,-15, -9,-17,-27,-31,-23,-10, 23,-14,-24, 14,-30,-41, 21,-11,-45,-45,-43; D=-20;
/I:         I=-20; DM=-29;
/M: SY='M';  M= -5,-52, 32, 26,-46,-18,  1,-26, -7,-26, 36, 25,-45, 13, -2, -8, -4,-28,-40,-22; D=-20;
/I:         I=-20; DM=-29;
/M: SY='D';  M=-24,-27, 61,-13,-48, 37, 21,-58,-29,-51, -5, 31,-40,-12,-44,  4, -3,-36,-70,-34; D=-20;
/I:         I=-20; DM=-29;
/M: SY='P';  M= 10,-56, 14, 25,-53,-23, -4,-41, -7,-42,-11,-14, 56, 11, 17, 15,-15,-35,-26,-47; D=-20;
/I:         I=-20; DM=-29;
/M: SY='E';  M= 10,-47, 33, 64,-47,-12,-33,-43, -9,-31,-27,-10,-10, 19,-18,  0, -5,-26,-63,-47;
/M: SY='I';  M= -3,-55,-13, -4, 27,-26, 15, 37,-30, 21, 15,-36,-51,-31,-18,-40,-27, 15,-28, 25;
/M: SY='R';  M=-20,-39,-13,  9,-19,-40,-15,-36, 16,-20,-23,-28,-32, 58, 71,-27,-28,-28,-56,-28;
/M: SY='Q';  M= 19,-57, 35, 42,-57,-27,-19,-37, 14,-51,-39,  7,-20, 51, -1, -4,-10,-38,-48,-35;
/M: SY='E';  M= 29,-37,-18, 52,-26, 20,-32,-40, -5,-18,-12,-14,-48, -4,-22,-27,-11,-22,-24, 27;
/M: SY='L';  M=-19,-52,-63,-33,  8,-64,-42, 33,-56, 61, 25,-60,-54,-51,-43,-40,-38, 19,-29,-12;
/M: SY='K';  M=  5,-57,-29, 13,-40,-20,-17,-16, 53,-17,  7,-32, 14, 28, 13,-15, -6,-20,-19,-23;
/M: SY='E';  M= 17,-57, 18, 54,-59,-22,-23,-33, 21,-39,-35, -3,-46, 34, 18, -3,-13,-38,-40,-47;
/M: SY='Y';  M=-23,-57,-49,-15, 25,-20, -6,  8, -7, 23, 19,-29,-58,  6, 12,-35,-30, -1, 33, 55;
/I:         I=-17; MD=-26;
/M: SY='T';  M= 12,-55,-42,-40,-47, 16,-10,-46,-38, -9, -6,-21,-55,-43,-28, 37, 41,-22,-66,-14; D=-17;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='G';  M=-26,-12, 31,-22,-63, 72,-17,-66,-20,-54,-45, 48,-47,-11,-26,-16,-39,-62,-63,-55;
/M: SY='W';  M= -5,-39,-43,-17,-11, -9,-20,-15,  2,-36,-42,-38,-50, 35, 36,-15,-28,  2,111, 11;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='P';  M=-22,-46,-30,  4,-45,-20,-23,-32, 12,-41, 10,-28, 73, -4, 39,  7, -9,-16,-58,-17;
/I:         I=-25; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37;
/M: SY='T';  M=  9,-47,-30,-36,-52,-18,-46,-41,  8,-42,-27,-16,-17, 17,-31, 17, 80,-19,-36,-37;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-36; IM=0; DM=-36;
/M: SY='V';  M=-20,-51,-55,-57, 33,-63,-57, 30,-52,  8,-16,-47,-10,-56,-57,-45, -4, 68,-53,  7;
/M: SY='P';  M=-40,-72,-45,-37,-67,-41,-51,-55,-41,-59,-37,-54,120,-39,-56,-42,-31,-60,-61,-64;
/M: SY='Q';  M= 10, 44,-35,-32,-31,-39,-24,-33,-18,-36,-11, 28,-53, 82, 11,-19, -2,  6,-59,-24;
/M: SY='V';  M=-36,-41,-65,-59,-15,-67,-58, 41,-57, 48, -5,-60,-61,-55,-45,-52,-12, 58,-59,-32;
/M: SY='F';  M=-30,-48,-61,-51, 81,-54,-37, -9,-33,-10,-16,-48,-49,-38,  8,-47,-30,  6, 52, 62;
/M: SY='I';  M=-23,-48,-21,-47,  3,-60,-61, 67,-48,  5,-18,-48,-58,-55,-39,-43,-35, 58,-58,-34;
/M: SY='N';  M=-26,-26, 40, 18,-53, 42, -9,-48, 20,-61,-45, 57,-49,-18,  0,-17,-33,-52,-65,-42;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='G';  M=-25,-58, -2,  5,-45, 76,-25,-45, -2,-53,-51,-12,-26, 10,-23,-21,-17,-26,-58,-54;
/M: SY='E';  M=-32,-48,  2, 56,-37,-51,-22,-27, 41,-36,-17, -8,-46, 30, 24,-18, -5,-17, 15,-22;
/M: SY='H';  M=-30,  9,-44,-37, 55,-35, 61,-19,-28, 29, -1,-22,-47,-25,-11, -4,-33,-13, 20, 22;
/M: SY='V';  M=-29,-54,-61,-41,  7,-56,-57, 56,-42,  0, 14,-31,-52,-15,-19,-39,-36, 58, 17,  1;
/M: SY='G';  M=-17,-46,-18,-19,-33, 86,-28,-54,-49,-50,-34,-30,-37,-40,-55, -9,-38,-48, 14, -4;
/M: SY='G';  M=-14,-57, -1, -9,-25, 81,-48,-56,-46,-47,-24,-13,-38,-12,-47,  7,-26,-46,-22,-53;
/M: SY='C';  M= 17, 75,-42,-34,-11,  6, -5,-32,-38,  7,-14,  8,-36,-31,-34, 27,-11,-24,-29, 29;
/M: SY='D';  M=-23,-59, 82, 35,-56,-25,-37,-52,-15,-59,-30,  1,-10, -6, -2, 12, -7,-45,-71,-43;
/M: SY='D';  M=-21,-48, 57, 35,-51,-43,-44, 47, -6,-40, -8,-20,-11, -9, -4, -9,-23,-15,-33,-47;
/M: SY='I';  M=-32,-32,-30,-43,-18,-50,-55, 47,-38, 34, 24,-33,-47,-39,-49,-21, 14, 42,-16,-32;
/M: SY='M';  M= -9,-36,-23, -1,-30,-52,-23,  1, 26, 13, 51,  1,-38, 19, 15,-23, -7, 14,-57,-13;
/M: SY='E';  M= 22,-55,  8, 51,-21,-23,-34,-19, 11,-30,-45,  2,-39,  8,  6, 13, -1,-35,-58,-11;
/I:         I=-20; MD=-30;
/M: SY='M';  M=-17,-49,-44,-14, -7,-31,-19, -3,-27, 50, 72,-34,-41,-33,-42,-35,-32,-13, -3, 14; D=-20;
/I:         I=-20; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
/M: SY='H';  M=-22,-47, 12, -1, 19,-51, 80, -8, -8, -5,-10, 10,-30,  0, -5,-24,-30,-15,-44, 43;
/M: SY='E';  M= -2,-58,  2, 51,-45,-23,-14,-15, 11,  6,-32,  6,-32, 48, -2,-12,-25,-27,-40,-38;
/M: SY='S';  M=  4,-50, 10, 17,-58,-24,-34,-40, 31,-47,-35, 40,-41, 15,  7, 46, -7,-45,-44,-49;
/I:         I=-25; MD=-37;
/M: SY='G';  M=-25,-60, -2,-32,-31, 78,-50,-56,-10,-58,-14,  0,-23,-24,-35,-27,-20,-41,-59,-31; D=-25;
/I:         I=-25; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37;
/M: SY='E';  M=-24,-43, 18, 66,-36,-32,  0,-48, 32,-43,-48,-13,-28, 15, 11, -2, -5,-24,-61,-39;
/M: SY='L';  M=-34,-52,-56,-47, 33,-53,-50,  2,-42, 73,-11,-53,-57,-52,-48,-45,-24,-15,-48,-13;
/M: SY='Q';  M= 19,-55, 13, 13,-31, -2,-19,-11, 16,-10, -2,-25,-22, 37,  1, -6, -7,  7,-59,-37;
/M: SY='P';  M= 10,-52, 13, 25,-38,-27,-18,-42, 32,-51,-35,-18, 55, 14,  9,  5,  8,-49,-60,-50;
/M: SY='L';  M= -4,-42,-36,  3,-28,-45,-32, 12,  9, 45, 43,-33,-45, -8, -8,-18, -5, -4,-56,-30;
/M: SY='L';  M= -6,-24,-61,-34, 18,-49,-52, 25,-47, 60, -5,-48,-25,-51,-47,-35,-25, 15,-51,-13;
/M: SY='K';  M=  8,-56,  6, 27,-58, -1,-16,-41, 46,-46,-35,  7,  5, 15, 17,  0, -3,-23,-60,-39;
/M: SY='E';  M=  8,-36, 32, 48,-50,  7,-17,-28, 14,-42,-38,-10,  0, 26,-14, -4,-14,-18,-35,-50;
/M: SY='A';  M= 38, 16,-13,-10, -2,-22,-25,  3,  1,  3,-14, -2,-33,-18,-24, -8,-15,  4, 36, -2;
/M: SY='G';  M=  5,-22,-10,  0,-35, 45,-22,-32,  2,-15,-25, 13, 17, -7, -7,  8,-14,-16,-58,-24;
/M: SY='A';  M= 40, -8,-18, -2,-23,  3,-13, -1, -3, -6,-13, -8, 10,-10, -5, -3,-22, -4,-27, -9;
/M: SY='K';  M=  8,-24,  0, -1,-29,-22,-34,  7, 23, 18,-17, -3,-13,  2,  7,-10, 13, -1,-59,-40;
/M: SY='W';  M= 14,-12, -4,  0,-15,-22, 14,-17,  7,-24,-42,  4, -5,  4,  8,  5, -5, -6, 80,  4;
/I:         E1=0; IE=-150; DE=-150;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS51352; PS51353; PS50404; PS51355

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	222 in 212 different sequences
Number of true positive hits	221 in 211 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	1
Number of false negative sequences	3
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	99.55 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	98.66 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	3
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Glutaredoxin
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	211 sequences AHPF_ECOLI (P35340), AHPF_PSEAE (Q9I6Z2), AHPF_PSEPK (P0A155), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	3 sequences GSPRX_MARGR (B3EWI1), MRX1_CORGK (P0DKT0), MRX1_CORGL (P0DKS9)
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	1 sequence MDH1B_BRAFL (Q8T773)
PDB [Detailed view]	74 PDB 1AAZ; 1ABA; 1B4Q; 1DE1; 1DE2; 1EGO; 1EGR; 1FO5; 1FOV; 1GRX; 1H75; 1HYU; » more