PROSITE entry PS51352

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51352

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	THIOREDOXIN_2
Accession [info]	PS51352
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2007 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00172
Associated ProRule [info]	PRU00691

Name and characterization of the entry

Description [info]

Thioredoxin domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=137;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=137;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.8272276; R2=0.0066185; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=16355.6416016; R2=3.6087751; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1561; H_SCORE=21989; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1259; H_SCORE=20899; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-15; D=-100; I=-100; B1=-300; E1=-300; MI=-150; MD=-150; IM=-150; DM=-150;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-150; BD=-150;
/M: SY='L';  M= 10, -9,-27,-13, -6,-24,-11,  4,-13, 27, 15,-18, 10, -3,-20,  4, -1,  8,-10, -9;
/M: SY='Q';  M=  4,-44,  0, -3,-10,-24,-15,-21, 17, 15,  4, -9, 12, 20, 11,  7,  0,-15,-34,-19;
/M: SY='I';  M= 12,-31,-21,  7,-10,-27,-30, 23,-21, 15, -4,-13, 22,-16,-20,-13, -1, 21,-26,-23;
/M: SY='G';  M=  5,-37,-14,-19,-35, 58,-34,-16,-11,-10,-22,  3,  0, -3,-21,  2, -9,-19,-30,-27;
/M: SY='D';  M=  8,-42, 37, 12,-24,-19, -3,-29, 12,-10,-17,-14,-10, 28,  1,  6, 11,-20, -5,-16;
/M: SY='P';  M= 10,-34,-17,  7,-36,-30,-25,-20, 27,-14,-17, -5, 46, 17, -3,  5, 16,-14,-46,-21;
/M: SY='A';  M= 53,-34,-33,-24,  4,-26,-35,  3,-18, 11, 12,-26,-31,-10,-33, -8,-12, 13,-47,-30;
/M: SY='P';  M= -2,-43,-15, -2,-32,-35,-23,-22,-19,-26, -8,-25, 94, -5,-23, -6, -9,-27,-50,-37;
/M: SY='D';  M= 19,-46, 45, 19,-37,-20,-21,-34,-12,-27,-20, 24, 19, 11,-18, 12, -6,-13,-64,-28;
/M: SY='F';  M=  9,-38,-33,-25, 69,-31,-36,  9,-28,  8, -1,-26,-24, -2,-30,-19,-16, 11,-20,  2;
/M: SY='T';  M= 14,-35,  3, 20,-40,-23,-16,-18,  8,-31,-25,  4, -3,  0, -8, 26, 38,-11,-43,-23;
/M: SY='L';  M= 27,-34,-32,-14,  9,-28,-24, -5,-32, 41, 18,-29,-35, -6,-37,-16,-13, 16,-47,-20;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-38; IM=0; DM=-38;
/M: SY='P';  M= -6,-36, -5, 25,-42,-41,-13,-24,  3,-27,-25,  7, 57, 19,-11,  1, 26, -6,-56,-29;
/M: SY='D';  M= 27,-41, 41, -8,-29, -3,-32,-38,-22,-29,-25, 17,  8,-25, -6, 13, 27,-25, 17,-23;
/M: SY='V';  M=  8,-32,-23,-12, -8,-41,-13, 13,-16, 11, -8,-20,-21,  6,-22,  4, 25, 32,-28, -9;
/I:         I=-27; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='D';  M= -9,-50, 54, 27,-43,-13,  0,-33,  0,-37,-25, 38, -9, 18,-21,  6,  3,-30,-66,-31;
/M: SY='G';  M= -6,-50, -1,-13,-11, 72,-33,-40,-27,-33,-40, 12, -9,-31,-39,-11,-15,-41, -3,-14;
/M: SY='K';  M=-13,-39, 19, 31,-42,-29, -5,-35, 33,-35,-30, 22,  2, 29,  8,  9,  4,-18,-49,-33;
/I:         I=-5; MD=-8;
/M: SY='I';  M=-17,-66,-48,-30,-22,-42,  2, 17,-33, -7,-12,-15,-37,-30,-40, -6,-21,  6,-23,-35; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='Q';  M=-54,-76, 22, 39,-78,-64,-35,-70, -9,-70,-56,-45, 47, 50,-25,-45,  0,-67,-75,-64; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='V';  M=-33,-53,-25,-44, 13,-50, -1, 13,-20, -3,-15, -2,-31,-52,-36,-35,-32, 40, 27, 22; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='T';  M=-24,-47,-15,-37,-64,-42,-38,-37,-14,-53,-51, 24,-49,-37, -6, 34, 35,-22,-81,-57; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='L';  M=-40,-62,-49,-57, 31,-59,-55,  8,-60, 50, -7,-55,-42,-53,-55,-25,-12, -7,-41,-20; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='D';  M= 13,-50, 30, 19,-53, -9, 15,-52, 10,-55,-45, 11,-28,  0,-13, 29,-10,-44,-49,-26; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='D';  M=-15,-60, 70, 37,-64,-24,-23,-58,  7,-61,-50, 18,-31, 18,-14, 13,-15,-52,-62,-46; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='Y';  M=  6,-36,-41,-21, 31,-37,-10, -3,-31, 28,-12,-38, 29,-19,-33,-23,-24, -7, 37, 41; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='V';  M= -2,-41,  0, -3,  1,-34,-17, 11, 15,  5, -6,-10,  2, 15,  8,-11, -9, 16,-13,-33; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='Q';  M=-22,-80,-30,-19,-33,-34,-36,-44,-19,-33,-43,-20,-34,-12,-27,-22,-29,-45,-42,-38; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='D';  M= -1,-63, 17,  3,-69, 11,-22,-63, 10,-52,-50,  7, -9, -6,-21,  8, -7,-55,-68,-50; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='G';  M= 12,-52, 25,  4,-58, 50, -3,-60,  5,-59,-47, 22,-20, -6,-25,  0,-20,-50,-64,-38; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='K';  M=-23,-44, 13,  1,-58, -4,-10,-53, 63,-52,-38,  6, 10, 19, 19, -2,-15,-42,-61,-43; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-8;
/M: SY='W';  M=-11,-28,-15,-39,-10,-14,-10,  8,-12, -3,-23, -9, 50,-38,-20,-25,  0, 28, 60, 13;
/M: SY='V';  M=-10,-24,-50,-12,-18,-37,-35, 10,-17,  7,-17,-40,-40,-15,-37,-16, 41, 52, 39,-15;
/M: SY='V';  M=-17,-31,-61,-57,  9,-39,-41, 38,-54, 41, 21,-56,-57,-55,-56,-50,-32, 53,-46,-18;
/M: SY='V';  M=-24,-43,-60,-57,-13,-64,-60, 42,-57, 39, -4,-56,-58,-54,-44,-49,-13, 63,-39,-29;
/M: SY='E';  M=-19,-31, 21, 46, 33,-41, -2,-15, -9,-12, 17, 24,-52,-18,-40,-24,-22, -2,-31, 29;
/M: SY='F';  M=-29,-34,-58,-55, 97,-52,-42, -8,-57, -5,-24,-54,-64,-59,-55, -8,-41,  7, 24, 27;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-43; IM=0; DM=-43;
/M: SY='W';  M=-29,-45,-56,-47, 50,-25, 18, -9,-49, -6, -4,-47,-42,-43,-43,  3,  3,-19, 91, 72;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-36; IM=0; DM=-36;
/M: SY='P';  M= 42, 30, 34,-36,-52,  8,-48,-50,-36,-51,-43,-17, 50,-28,-32, 18, -1,-38, 18,-32;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
/M: SY='P';  M=  9,-51, 32,-23, 17,-31,-11,-43,-20,-33,-28, 12, 48,-28,-35, 14, 19,-31,-50, 41;
/I:         I=-23; MI=0; MD=-34; IM=0; DM=-34;
/M: SY='W';  M=-31,-49,-12, -9, 36,-10, 36,-49,-36,-41,-24,  0,-54,  7,-14, -7, -9,-49,127, 17;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='C';  M=-31,136,-47,-53,-50,-52,-45,-54,-53,-49,-42,-31,-63,-51,-56,-12, 34,-42,-79,-48;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-43; IM=0; DM=-43;
/M: SY='P';  M=-11,-63,-40, -6, -9, 31, -9,-29,-21,-48,-40,-36, 89,-21,-26, -7,-20,-26,-58,-49;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='H';  M=-11,-54,-28,-28, 24, -5, 66,-22,-36,-33,-32,-10, 47,-27,-37,-12,  2,  9,-10, 45;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-43; IM=0; DM=-43;
/M: SY='C';  M=-28,142,-58,-60,-49,-52,-61,-52,-56,-47,-45,-45,-71,-57,-60, -8,-38,-11,-73,-55;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='K';  M= -3,-51,-28,-19,-35,-41, -5,-16, 44,-24,-15, -3,  9, 22, 35,  5, 16,-13,-51,  2;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-43; IM=0; DM=-43;
/M: SY='T';  M= 25,-54, -8,  8,-37,-34, 18,-34, 24,-22,  3, -3,-26, 18, 23,  2, 29,-22,-41,-25;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45;
/M: SY='E';  M= -2,-53,-34, 44, 33,-44, 19,  2,-31, 16, 20,-33,-50, 27,-39,-19,-24, -6,-29,  8;
/I:         I=-27; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='M';  M= 18,-47,-19, 15, -4,-39, 28, 10, -6, 23, 30,-10,-53, -7,-21,-15,  3,-12,-20, -5;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='P';  M= -7, -2,  2,  3,-58,-13,-14,-25, -6,-38,-37,-12, 90, -5, -8,-12,-18,-38,-57,-51;
/I:         I=-27; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='E';  M= 12,-52,  9, 24,-22,-15,  2, -2, -1,-13, -5,-11,-34,  6,  4, -6, 17, 11,-28, -5;
/M: SY='F';  M=-37,-52,-65,-60, 53,-63,-45, 24,-54, 44, 31,-50,-59,-53,-52,-50,-29, 15, 48, 36;
/M: SY='E';  M= 12,-36,  5, 38,-50,-26,-10,-16, 16,-35,-14, 25,-17, 21, 11,  3, -2, -3,-63,-42;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-43; IM=0; DM=-43;
/M: SY='E';  M= 14,-57, 25, 39,-53,-28,-12,-47, 33,-49,-32, 13,-23, 37, 16, -3, -8,-38,-54,-35;
/M: SY='L';  M=  2,-49,-35,-39, -2,-50,  0, 21,-29, 50, 17,-16,-56,-31,-23,-27,-23,  8, 45, -2;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-43; IM=0; DM=-43;
/M: SY='A';  M= 41,-33,-18,-11,-17,-27, -2,-12,  7,  0, -1,-19,-36, 12,-10, -1,-20,  0,-23, 33;
/I:         I=-29; MI=0; MD=-43; IM=0; DM=-43;
/M: SY='K';  M= 12,-47, 26, 33,-56,-19,-21,-46, 35,-47,-48, 15, 15, 18, 11,  4, -2,-41,-56,-46;
/M: SY='E';  M= -2,-58, 33, 53,-44,-37,-13,-35, 30,-29,-15, -6,-40, 29,  8, -6, -8,-35,-42,-28;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='Y';  M=-45,-40,-58,-60, 63,-58, 10,-12,-55, 26,  3,-25,-47,-33,-49,-41,-33,-26,  9, 67; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-22;
/M: SY='K';  M=  6,-60, -5, 10,-52,  6,-15,-25, 39,-41,-37, -6, 29, 10, 10, -1,-10,-21,-60,-48; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-22;
/M: SY='D';  M=  4,-49, 56, 28,-55, 10, -9,-47, 19,-48,-37, 18,-23, 11,-15,  5,-16,-41,-30,-36;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='R';  M=-15,-56, -9,-12,-48,-25, -1,-35, 13, -6,-25, -3,-16,  7, 22,-23,-29,-34,-69,-12; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-23;
/M: SY='G';  M=-25,-59, 23, -9,-58, 42, 27,-51, 17,-50,-47, 38,-26, -4,  0,-19,-26,-48,-44,-43; D=-15;
/I:         I=-15; DM=-23;
/M: SY='V';  M=  0, -7,-51,-51, 36,-46,-54, 30,-50, 14,-10,-46,-42,-52,-53,-35, -4, 57,-12,  0;
/M: SY='E';  M= -6,-49, 20, 24,-47,-20, -6,-19, 22,-32,-32,  5, 23, 21, 17,-11,  3,  6,-56,-33;
/M: SY='F';  M=-24,-29,-44,-32, 56,-56,-29, 34,-47, 20,  2,-46,-52,-40,-44,-38,-23, 44, 18, -4;
/M: SY='V';  M= 11,-44,-52,-44, -2,-25,-32, 44,-33, 24,  1,-51,-46,-46,-36,-35,-25, 45,-33, 12;
/I:         I=-23; MI=0; MD=-34; IM=0; DM=-34;
/M: SY='G';  M= 26, 14, -6, -7, -3, 33,-20,-27, 11,-30,-20,-13, 12, -2,-14, -3,-10,-20,-21,-10;
/M: SY='V';  M=-14,-20,-49,-41,  8,-31,-36, 50,-47, 15, 22,-42,-49,-44,-35,-33,-24, 54,-51,-21;
/M: SY='S';  M= -6,-30, 45,-13,-34,-15, 34,-47,-27,-44,-25, 36,  7,-24,-37, 57, -4,-46,-50,-39;
/M: SY='C';  M= 13, 43,-20,-28, -4, -8,-34,  1,-23, -7,  4,-23, 22,-25,-25,  9,  8, 26, -5,-14;
/M: SY='D';  M=-28,-56, 72, 24,-47,-16,-14,-43,-16,-38,-32, 45,-14, 11,-15, -9,  4,-40,-28,-36;
/M: SY='D';  M= 16,-39, 38, 15,-35,-15,-32,-35,  2,-24,-27,  6, 13, -3,  4, 28,  2,-25,-41,-28;
/M: SY='H';  M=  5,-30, -1, 19,-15,-27, 30,-13,-14,-15,-12, 18, 30,  7,-17,  8, -6,  4,  0, -9;
/I:         I=-14; MD=-21;
/M: SY='E';  M=  3,-59, 19, 30, 24,-13,-17,-36,  3,-34,-32, -3, 22, 15, -1, -5,-11,-27,-28, -2; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-21;
/M: SY='A';  M= 22,-35, 19, 15,-39,-23,-26,-38,  2,-39,-25, 10,-23,  3,  0, 15,  7, -1,-54,-11; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-21;
/M: SY='H';  M= 17,-64,-29,-15,-36,-42, 49,-41, -9,-24, 20,-35,-28,  1,-26, -8,-21,-32,-16,  6; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-21;
/M: SY='P';  M= -1,-70,-22, -8,-26,-23,-38,-33,  0,-22,-20,-12,  9,  1,-12,-32,-31,-39,-16,-33; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='W';  M=  6,-39,-42,-50, 21,-59,-50,  8,-44, 25,  6,-39,-54,-50,-53,-34,  2, 21, 80,-21; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-21;
/M: SY='C';  M= 46, 47,-33,-29,-26, -9,-14, -2,-13,  3,  8,-17,-19,-25,-14,  7,-24, -2,-19,-19;
/M: SY='E';  M=  0,-56,  4, 42,-43,-30,-15,-32, 33,-30, -5,  6,-39, 28, 29, -1,-10,-30,  1,-22;
/M: SY='A';  M= 31, -4, 25, 19,-21,-33,-10,-41, 25,-31,-14,-10,-37, 19, 22,  1, -1,-35,-59,-21;
/M: SY='F';  M= 14,-32,-45,-20, 50,-49,  7,  2,-33, 18, 16,-23,-31, 14,-38,-30,-29,-11, 24, 48;
/I:         I=-26; MI=0; MD=-38; IM=0; DM=-38;
/M: SY='G';  M=  0,-54, 20, 10,-58, 53, 10,-55, 23,-50,-28, 25,-35, 10,  3,-12,-31,-51,-61,-49;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='V';  M= 14,-44, -5,  2,-32,-43,-45, 37,-22,  7, 14,-31,-44,-19,-32,-26,-13, 50,-62,-35;
/I:         I=-27; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='W';  M=-29,-57,  6, 25,-20,-37,  7,-44, 27,-39,-24,  3,-33, 57, 23, -6,  3,-34, 61, -2;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42;
/M: SY='G';  M= 18,-23,-13,-30,-46, 58, -9,-51,  5,-34,-34, 30,-41,-15,-20, 15,-21,-29,-43,-23;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='F';  M=-34,-50,-50,-39, 68,-60,-32, 13,-48, 16,  3,-45,-34,-52,-52,-46,  2, 13, -2, 65;
/I:         I=-27; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='P';  M=-26,-65,-21,-12,-46,-35,-34,-45, -1,-48,-46,-24,104,-31,-18,-32,-20,-46, 54,-44;
/M: SY='T';  M=  1,-34,  5,  4,  1,-38,-22,  4,-22,  2, 17,-19,-44, -2,-29, -6, 48,  2,-20, 27;
/I:         I=-3; MD=-5;
/M: SY='L';  M=-23,-43,-72,-63, -2,-53,-47, 32,-60, 34, 33,-58,-71,-61,-65,-49,-45, 13,-17,  4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-5;
/M: SY='H';  M=-17,-41,-55,-43,-54,-62, 46,-54,-41,-26,-32,-60,-83,-42,-38, -3,-59,-50,-35, 22; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='D';  M=-13,-82, 23,-25,-39,-24,-45,-52,-36,-40,-14,-28,-37,-48, -9,-38,-22,-43,-62,-38; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='E';  M=  1,-70,-14,  3,-72,  0,-25,-52,-27,-40,-27,  0,-26,-35,-34,-30,-21,-33,-83,-44; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='D';  M=-11,-69, 16,-27,-52,-35,-47,-27, -1,-45,-57, -2, -7, 14,-28, -7,-25,-41,-63,-31; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='G';  M=-16,-56, 10, -5,-67, 15, 13,-52,-16,-31,-32,-30,-34,  8,-26,-28,-33,-58,-68,-16; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='Q';  M=-12,-64,-12, -5,-60,  2,-46,-34,-12,-36,-30,-28,-22,  4,  1,-15,-16,-23, -6,-29; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='D';  M=-26,-54, 20, -6,-48,-43,-43,-16,-14, -9, -5, -8,-18,-20,-33,-20,-23,-11, 12,-45; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='G';  M=  6,-66,-15, -2,-53,  9,-42,-48,-19,-27,-38,-18,-41,-11,-16, -4,-15,-31,-11,-32; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='D';  M=-28, -3, 11,-28,-51,-68,-39,-23,-59, -1,-33,-40,-47,-36,-47,-45,-16,-22,-40,-25; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='P';  M=-28,-83,-42,-39,-60,-58,-63,-48,-34,-53, -6,-28, 40,-32, 29,-28, -7,-49,-38,-69; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='A';  M= 10,-56,-17, -2,-68, -7,-15,-32, -3,-45,-43,-32,  2,-14, -9, -7, -9,-30,-77,-58; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='T';  M=-15,-53, -1,-11,-40,-35,-16,-12,-19,  1,-17,-30,-28,-14,  0, -2, 35, 12,-45,-15; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='F';  M=-56,-52,-68,-65, 99,-64,-35,-14,-57,-14,-25,-60,-69,-65,-54,-56,-49,-18,-10, 62; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='L';  M=-16,-48,-67,-55,-17,-39,-56, 31,-49, 31, 17,-61,-64,-41,-45,-51,-38, 31,-12,-31; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='I';  M=-22,-55,-59,-51, 18,-67,-53, 54,-52, 19,-17,-44,-58,-51,-43,-46,-34, 31,-38, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='D';  M=-14,-52, 72,-13,-35, 11,-33,-38,-22,-39,-45, 29,-48,-13,-29,-10,-26,-27,-54,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='P';  M=  9,-54,-20, 14,-56,-13,-17,-46, 44,-43,-30,-13, 49,  8, 21, -7,-18,-36,-60,-33; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='D';  M=-11,-50, 63, 21,-48,-19, -2,-53, 13,-50,-31, 44,-43, 32,-14, -4,  1,-48,-55,-40;
/I:         I=-16; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G';  M=-20,-49,-29,-36,-48, 83,-21,-65, -9,-57,-40, -2,-46,-14,-27,-11,-43,-59,-31,-48; D=-16;
/I:         I=-16; DM=-23;
/M: SY='T';  M=-29,-50,-21, 11,-32,-48,-26, -3, 39,-33,-20,  1,-40, 19, 25,-18, 41, 14,-62,-41; D=-16;
/I:         I=-16; DM=-23;
/M: SY='P';  M=-30,-55,-25, -2,-20,-59,-41, 42,-23, 16, -3,-41, 49,-30,-36,-33,-16, 36,-49,-29; D=-16;
/I:         I=-16; DM=-23;
/M: SY='R';  M= 11,-37,  2, -3,-22,-39,-18, -1,  5, -8,-11,-25,-31, 14, 31, -3, 15, 22,-60,-20; D=-16;
/I:         I=-16; DM=-23;
/M: SY='Y';  M=  8,-48,  1,-10, 34,-21, 36,-21,  6, -5,-15, -5,-34,-12,-16, -6, -7,-20, 28, 46;
/M: SY='R';  M= -1,-37,-25, -9, 13,-38, 13, 14,  5, -5, 11,-16,-27,  7, 25,  9, -7, 11,-16,  1;
/I:         I=-17; MD=-26;
/M: SY='F';  M=-36,-68,-17,-22, 23, -8,  7,  7,-28,-14, -9,-26,-51,  0,-17,-21,-16,  3,  6,-10; D=-17;
/I:         I=-17; MD=-26;
/M: SY='N';  M=-15,-75,-18,-29,-46, -8,-46, -5,-42,-41,-38, 23,-62,-23,-36,-33,-27,  2,-42,-15; D=-17;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='D';  M=-30,-64, 25, -4,-18,-30,-42,-42,-21,-28,-21,  1, -5,-27,-16,-30,-18,-18,-79,-38; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-26;
/M: SY='Y';  M=-26,-53,-30,-22, 27,-52, 28,  8,-33, 12,  2,-31,-32,-35,-35,-30,-40, 10,  7, 48; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-26;
/M: SY='P';  M=-20,-47,  6,  3,-30,-40,-16, -7, -2,-28,-21,  3, 55,-19, -5, 12, 14,  1,-49,-23; D=-17;
/I:         I=-17; DM=-26;
/M: SY='G';  M=  2,-44,-14,-24,-20, 69,-28,-36,-12,-36,-25, 13,-25,-13,-13, -6,-10,-18,-39,-43;
/M: SY='E';  M= 17,-43, 17, 18, -3, 16,-14,-28, -8,-32,-27,  7, 17,-13, -5, 11,  0,-14,-23, -5;
/M: SY='R';  M= -1,-44,-15,-17, -5,-14,-18,  9,  0, -7, -3,-12, 26, 17, 35,-11,  2,  2,-14,-15;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-36; IM=0; DM=-36;
/M: SY='N';  M=-19,-46, 38,  1,-47,-15,  7,-46, -6,-41,-35, 46, 31,-21,-26, 31, 30,-32,-37,-31;
/M: SY='Y';  M= 17,-52,-27,  7, 10,-12,-27,  3, -7,  3,  0,-32, 21,-12,-12, -9,-10, 15,-22, 21;
/M: SY='D';  M=  8,-51, 54, 48,-39,-25,-16,-55,  5,-44,-51,  3, 18, 14,-11,  5,-18,-44,-40,-40;
/M: SY='E';  M=  4,-53, 41, 51,-42,-12, -5,-44,  3,-41,-34,  1,-27, 24,-12,  4,  4,-20,-53,-19;
/M: SY='L';  M=-14,-46,-57,-53, 35,-58,-31, 29,-45, 46, 31,-52,-50,-42,-42,-41,-12, 27,  6,  3;
/I:         I=-25; MI=0; MD=-37; IM=0; DM=-37;
/M: SY='R';  M= -7,-53, -8, 24,-28,-45,-25, -3, 10, 29, -2,-18,-42, 10, 32,-14, -5,  0,-58,-27;
/M: SY='R';  M= 19,-51, 16, 32,-49,-20,-26,-46, 21,-43,-31, 13,-14, 28, 38,  4, -7,-43,-43,-37;
/M: SY='W';  M= 30,-34,-22,-15, 23,-31,-19,  9, -4, 14,  8,-30,-45,-21, -7,-30,-10, 15, 35,  5;
/M: SY='I';  M= -8,-47,-60,-47,  0,-61,-57, 51,-45, 43, 17,-52,-52,-46,-57,-44,-27, 41,-22,-23;
/M: SY='D';  M=  8,-54, 56, 33,-48,-26,-27,-49, 33,-44,-29, 19,-39, 17,  2, -8, -9,-44,-41,-35;
/M: SY='A';  M= 34,-46,-10, 28,-25,-15,-11,-39, 15,-34,-18, -1,-10, 31, -1, 14, -4,-39,-15, -2;
/M: SY='L';  M= 16,-42,-32,  0,  0,-40,  7,  8,-15, 39, 14, -6,-36, -1,-24,-23,-23,  9,-44,-10;
/M: SY='Q';  M=  6,-29,-33, -8,-19,-14,-22,  9,  7, 25,  2,-23,-33, 36, 11, -9, -1, -2,-30,-21;
/M: SY='K';  M= 24,-39, -2, 14,-15,  4,  0,-31, 25,-22,-32, 15,-10, 10, -7,  6,  5,-20,-41,-21;
/I:         E1=0; IE=-150; DE=-150;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS50404; PS51353; PS51354; PS51355

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	981 in 873 different sequences
Number of true positive hits	980 in 872 different sequences
Number of 'unknown' hits	1
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	72
Number of 'partial' sequences	5

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	93.16 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	3
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Thioredoxin
Version [info]	8

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	872 sequences 1CPX_DIRIM (O17433), 1CPX_ONCVO (P52570), AHP1_CHATD (G0S1P8), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	72 sequences APRL5_ARATH (Q93YX4), APRL6_ARATH (Q9ZPE9), APRL7_ARATH (Q84JN1), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	5 sequences PDIA3_MESAU (P86235), PRDX4_CROAT (P0CV91), PRDX5_MESAU (P86241), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Unknown' sequences	1 sequence SCO1_MOUSE (Q5SUC9)
PDB [Detailed view]	747 PDB 1A23; 1A24; 1A2J; 1A2L; 1A2M; 1AC1; 1ACV; 1AIU; 1AUC; 1BED; 1BQ7; 1CQG; » more