PROSITE entry PS51270

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51270
Entry name [info]	ZF_CTCHY
Accession [info]	PS51270
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-2006 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51266
Associated ProRule [info]	PRU00965

Name and characterization of the entry

Description [info]

Zinc finger CTCHY-type profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=65;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=60;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4404461; R2=0.0072403; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9587.9794922; R2=2.7765853; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=962; H_SCORE=12259; N_SCORE=9.4; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=561; H_SCORE=11146; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-17; D=-80; I=-80; B1=*; E1=*; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='M';  M= 10,-31,-45,-36, 40,-37,-25, -2,-33, 20, 85,-35,-38,-28,-32,-20,-22,  8,-30, -9;
/M: SY='G';  M= 40,-33,-28,-31,-43, 67,-33,-42,-29,-41,-33,-17,-31,-26,-35, 13,-22,-32,-39,-38;
/M: SY='K';  M=-24, 19, -2, 34,-38,-33,-19,-40, 60,-27,-29,  3,-28, 13, 16, -3,-20,-36,-38, -7;
/M: SY='Y';  M=-35,-45,-33,-36, 17,-41, 18,-21,-29,-17,-13,-34,-46,-24,-25,-29,-29,-26,  9,110;
/M: SY='Y';  M=-35,-39,-40,-40, 74,-43,-13,-16,-34,-11,-14,-35,-46,-35,-32,-30, -3,-21,  2, 85;
/M: SY='C';  M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='D';  M= -3,-34, 42, -2,-37,  2,-20,-34,  5, -8,-29, 33, -8,-16,-22, 40,-12,-32,-48,-31;
/M: SY='I';  M=-12,-38,-38,-31,-20,-45,-40, 62, 29, -6, -7,-30,-34,-27,-23,-28, -5, 30,-39,-23;
/M: SY='C';  M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='K';  M=-27,-39,-14,-10,-39,-29, 39,-15, 70,-38,-26, 42,-29, -7,  4,-18,-19,-34,-42,-26;
/M: SY='F';  M=-33,-33,-49,-42, 60,-49,-32,  0,-42, 59,  2,-45,-48,-39,-39,-40,-28, -7,-22, -2;
/M: SY='W';  M=-38,-43,-51,-44, 79,-43,-29,-19,-37,-13,-19,-44,-47,-41,-36,-38,-35,-26,110, 57;
/M: SY='D';  M=-31,-43, 94,  3,-50,-26,-15,-48,-17,-48,-45, 31,-31,-17,-26,-18,-19,-46,-66,-34;
/M: SY='D';  M=-27,-40, 81, -1,-47,-24,-15,-46, 10,-47,-41, 46,-31,-15,-13,  5,-16,-43,-60,-33;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='D';  M=-30,-44, 90, 33,-50,-29,-16,-49,-16,-47,-45, 15,-29,-14,-24,-19,-21,-45,-62,-34;
/I:         I=-22; MD=-71;
/M: SY='T';  M=-27,-56,-51,-29,-51,-56,-56,-11,-46,-33,-40,-47, 13,-48,-27, -7, 16,  7,-69,-52; D=-22;
/I:         I=-22; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71;
/M: SY='S';  M=-37,-54,-12, -2,-62,-45,-44,-59, -5,-61,-55,  0,-49,-34,-40, 28, 12,-53,-70,-54; D=-22;
/I:         I=-22; DM=-71;
/M: SY='K';  M=-27,-42, 11, -6,-42,-34,-20,-44, 73,-41,-30,-12,-29, -4, 50,-21,-23,-39,-38,-28;
/M: SY='Q';  M=-10,-38, 17, 16,-44,-10,-18,-40, 25,-41,-31, 26, 10, 43, -5, 33, -7,-37,-44,-31;
/M: SY='Q';  M=-23,-41,-32,-18,-27,-40,  7, 48,-20,-10, 19,-25,-34, 68,-21,-13,-22, 19,-39,-21;
/M: SY='Y';  M=-36,-43,-37,-39, 55,-42, -5,-18,-31,-13,-13,-36,-47,-29,-28,-31,-29,-23,  7,101;
/M: SY='H';  M=-33,-44,-17,-17,-31,-34,127,-50,-21,-32,-17, -6,-33,-11,-15,-22,-31,-49,-67,  0;
/M: SY='C';  M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='D';  M=-18,-44, 68,  8,-44,-27,  9,-43,-18,-44,-37, 21, 53,  9,-26, -4,-20,-42,-50, -8;
/M: SY='D';  M=-25,-41, 55,  5, 21, 35,-22,-40, 17,-36,-34, -1,-14,-20,-22,-12,-24,-39,-34, 12;
/M: SY='C';  M=-24,137,-44,-44,-35,-22,-44,-42,-40,-33,-33,-30,-54,-47,-47,-27,-25,-30,-64,-45;
/M: SY='G';  M=-16,-38,-18,-31,-45, 74,-25,-49, -5,-49,-37, 49,-33,-24,-30,-12,-25,-46,-42,-39;
/M: SY='I';  M=-28,-38,-49,-45,-10,-52,-42, 69,-41, 32, 25,-41,-40,-37,-43,-37,-22, 22,-37,-19;
/M: SY='C';  M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='R';  M=-31,-47,-27,-15,-39,-41,-15,-46, 13,-38,-27,-20,-39, -3, 95,-25,-29,-40,-39,-26;
/M: SY='V';  M=-23,-34,-40,-35,-17,-46,-37, 41,-27, 18, 21,-33,-38,-30, 16,-27, 19, 42,-43,-22;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-28,-39,-46, 88,-34,-54,-33,-50,-39,-14,-32,-31,-41,-13,-32,-48,-37,-41;
/M: SY='G';  M= -6,-40,  8, -6,-40, 46,-26,-36, 11, -8,-26,-17, 25, 34, -8,-16, -3,-34,-40,-33;
/M: SY='G';  M=  0,-40,-24,-12,-43, 56,-27,-44, 31,-43,-33, -5, 14,-17, 21, -4,-24,-31,-39,-35;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='E';  M=-25,-42, 31, 48,-37,-21,-23, 20, 38,-28,-25,-16,-26,  4,-11,-14,-22,-15,-42,-30;
/M: SY='D';  M=-25,-38, 73,  3,-45,-22,-14,-45,  6,-46,-39, 53,-31,-14, -7, 16,-15,-42,-58,-33;
/M: SY='F';  M=-34,-36,-41,-41, 89,-40,-22,-16,-36, -9,-16, -2,-46,-40,-34, -4,-26,-20, -5, 52;
/M: SY='F';  M=-38,-36,-47,-27, 98,-46,-27,-13,-40, -5,-14,-39,-48,-47,-37,-36,-30,-18, -3, 39;
/M: SY='H';  M=-33,-44,-17,-17,-31,-34,127,-50,-21,-32,-17, -6,-33,-11,-15,-22,-31,-49,-67,  0;
/M: SY='C';  M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='M';  M=-15,-38, 44, 11,-32,-32,-19,-27, 39,-12, 49, -3,-16, 11,-11,-14, -3,-28,-41, -4;
/M: SY='K';  M=-24,-38,  2,  1,-35,-35,-24,  0, 61,-29,-23,  0,-29,  3, 17,-19, 13,  7,-41,-28;
/M: SY='C';  M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='N';  M=-21, 18, 17,-11,-42, 39,-16,-42,-17,-42, -6, 70,-34, 15,-12, -3,-18,-41,-49,-35;
/M: SY='C';  M= 22, 85,-38,-34,-25,-32,-36, 10,-33,  7, 18,-28,-39,-31,-37,  9,  7, 10,-47,-30;
/M: SY='C';  M=-25,139,-44,-45,-35,-40,-44,-42,-40,-32,-33,-31,-55,-48,-47,-27,-25,-29,-65,-46;
/M: SY='Y';  M=-30,-36,-44,-39,  2,-46,-20, 16,-36, 48, 46,-41,-44,-30,-34,-36,-26,  1,-18, 61;
/I:         I=-24; MD=-77;
/M: SY='S';  M=  7,-34,-26,-26,-40, 33,-30,-32,-27,-39,-32,-17, 39,-22,-33, 51,  1, -6,-44,-36; D=-24;
/I:         I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
/M: SY='M';  M=-23,-34,-34,-31,-18,-39,-28, 36,  1,  2, 62, -5,-33,-24, -8,-13, 29, 17,-39,  1;
/I:         I=-22; MD=-71;
/M: SY='Q';  M=-10,-37,  6,  6,-37, -5,-23,-19, 18,-21, -7,  2,-31, 27, 17, 24, 12, -6,-44,-30; D=-22;
/I:         I=-22; MD=-71;
/M: SY='L';  M=-32,-38,-48,-43,-13, -9, 12, 12,-43, 56, 20,-43,-48,-36,-41,-40,-30, -2,-41,-22; D=-22;
/I:         I=-22; MI=-71; IM=-71; DM=-71;
/M: SY='R';  M=-26,-42,-20, 24,-15,-37, 27, -4, 29,-20,-22,-20, 14, 11, 47,-10,-14, -6,-40,-24;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='D';  M=-29,-45, 50,  9,-48, 23,-25,-45, -2,-31,-39, 31,-37,-21,  5,-11,-26,-31,-55,-39; D=-22;
/I:         I=-22; DM=-71;
/M: SY='N';  M=-20,-36, 16, 25,-42, 12,-18,-42, 30,-42,-33, 45,-28,-10,  9, 20,  8,-37,-46,-33;
/M: SY='H';  M=-33,-44,-17,-17,-31,-34,127,-50,-21,-32,-17, -6,-33,-11,-15,-22,-31,-49,-67,  0;
/M: SY='K';  M=-18, 10,-22,-12,-38,-34, 17,-22, 56,-34,-25, -6, -6, 13, 39, -8,  5, -9,-41,-27;
/M: SY='C';  M=-25,135,-42,-42,-35,-40, 22,-42,-39,-32,-31,-28,-53,-44,-44,-27,-25,-30,-65,-40;
/M: SY='I';  M=-24,-36,-45,-39,-15,-49,-41, 53,-30, 20, -3,-38,-41,-33, 15,-33,-20, 48,-42,-22;
/M: SY='E';  M= -7,-42,  4, 86,-46,-37,-18,-46, -6,-39,-35,-20,-19,  1,-16,-18, -7,-37,-44,-37;
/M: SY='N';  M=-26,-37,  9,-14,-41,  6,-14,-43, 38,-44,-32, 67,-34,-10, 42,-15,-18,-41,-46,-32;
/M: SY='S';  M= 29, 29,-28,-26,-32, -2,-31, -8, -5,-25,  6,-19,-31,-22,-27, 41, 19, 13,-45,-30;
/M: SY='M';  M=  1,-29,-33,-30,-20,-32,-27,  4,-28, 20, 62,-23,-31,-24,-30, 22, 42, -2,-42,-22;
/M: SY='H';  M=-26,-43, 33, 39,-42,-33, 62,-46, 12,-39,-30,-11,-29, 16, 42,  2,-23,-42,-48,-23;
/M: SY='C';  M=-22, 63,  7,-17,-37,  1, 56,-36,-19,-31, 20, 26,-34, 44,-21, 14, -1,-34,-50,-24;
/M: SY='N';  M=-27,-35, 57,-10,-43,-18, 26,-43,-14,-46,-36, 82,-34,-14,-22, -2,-14,-43,-62,-32;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	10 in 10 different sequences
Number of true positive hits	10 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	window20
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	ZN_FING
Feature description [info]	CTCHY-type
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

10 sequences

BTSL1_ARATH (F4IDY5), BTSL2_ARATH (F4HVS0), BTS_ARATH   (Q8LPQ5),

MIEL1_ARATH (Q8VZK0), SRFP1_ORYSJ (Q10LI1), YERG_SCHPO  (O14099), 
ZFP34_ARATH (Q9FFB6), ZFP34_ORYSJ (Q5JL96), ZN363_HUMAN (Q96PM5), 
ZN363_MOUSE (Q9CR50)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

3 PDB

2DKT; 2K2C; 7YNX