Matrix / Profile
[info]
|
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=80;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=80;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5409752; R2=0.0069537; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=973; N_SCORE=8.3; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=714; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-15; D=-150; I=-150; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
...
A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
/I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='D'; M=-17,-53, 24, 15,-16,-19, 20, -8, -6, 13, -6, -2, -9, 4, 14, -4, -3, 10,-44,-31;
/M: SY='D'; M= -7,-49, 45, 19,-17, -7, 6,-41, -9,-35,-33, 26, 14, 25, 1, 11, -3,-25,-30,-22;
/M: SY='V'; M= 0,-48,-13,-19, 5,-25,-20, 13,-19, 13, 32,-27,-22,-17,-21, -5, 8, 35,-20, 8;
/M: SY='E'; M= 6,-59, 4, 30, 8,-19, 16, 12,-25, 16, 7,-26,-31, -6,-22, -2,-19, 2, 2, -6;
/M: SY='D'; M=-18,-45, 41, 25,-47,-32, 17,-35, -7,-27, -9, 1, 12, -8, 16, 26, 20,-18,-62,-19;
/M: SY='F'; M=-21,-48, 2, 2, 47,-29,-11, 9,-31, 37, -6,-25,-36,-16,-30,-14,-19, -2,-17, 6;
/I: I=-33; MD=-57;
/M: SY='A'; M= 24,-38, -5, 22,-31, 8, 2, -4,-10, -9,-12,-12, 2, 7, 7, -5,-20,-29, -8,-12; D=-33;
/I: I=-33; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
/M: SY='D'; M=-10,-57, 32, 23,-14, 15, 2,-37,-11,-18,-34, 19,-22, 16, 5, 11, -2,-30,-35,-37; D=-33;
/I: I=-33; DM=-57;
/M: SY='G'; M= -9,-61, 13, 13,-21, 34, -6,-10, -9, -4,-11, 2, 4, -2, -6, 8, -7,-17,-33,-30;
/M: SY='D'; M= -9,-49, 43, 25,-49, 17,-16,-52, 14,-29,-30, 11, -5, 11, 17, 6, 0,-31,-61,-54;
/M: SY='L'; M= 13,-42, -7, 9, -3, -9,-11, 13,-19, 16, 2,-12, -5, -8,-18,-17,-10, 15, -1, 5;
/M: SY='E'; M=-16,-36, 21, 45,-25,-13, 9,-21,-20,-39,-29, 7,-24, 14, 14, 15, -4,-12,-49, 28;
/M: SY='I'; M=-12,-47,-58,-49, 12,-47,-37, 44,-55, 40, 43,-59,-22,-42,-32,-44, -4, 28,-47, -3;
/M: SY='V'; M= 6,-34,-25, 9, 9,-37, -9, 22,-32, 6, 23,-37,-52,-13, 5, -9, 5, 34,-39,-12;
/M: SY='E'; M= -8,-40, -6, 77,-46,-25,-19,-24,-15,-24,-32,-28,-43, 14, 8, -7,-14,-23, 19,-30;
/M: SY='V'; M= 16,-42,-65,-48, 38,-43,-41, 34,-56, 18, 10,-57,-63,-44,-24,-43,-20, 43,-30, 23;
/M: SY='R'; M=-11,-39,-10, 23,-42,-49, -8, -2, 20,-16,-26,-16, -3, 10, 30, -7, 22, 21,-52,-29;
/M: SY='V'; M= 4,-18,-65,-63,-27,-67,-66, 54,-61, 21, -7,-57,-49,-59,-55,-45,-24, 64,-65,-46;
/M: SY='P'; M= -7,-32, 2, 3,-37, -5, 28,-31, -3,-13,-13,-13, 54,-15, 5, 10, 20,-27,-63, -1;
/M: SY='P'; M= 14,-59, 2, 34,-43, -7,-14,-27, 7,-36,-36, 14, 50, -4,-11, -1,-20, -4,-64,-17;
/I: I=-45; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='G'; M=-17,-45, 36, 25,-53, 39, -7,-53, -3,-48,-44, 32, -7, -6, -9, 11, 15,-48,-68,-35;
/I: I=-33; MD=-57;
/M: SY='S'; M= 11, 17,-18,-23,-39, -9,-16,-57,-17,-53,-40, 12,-27,-30,-29, 73,-18,-50,-40,-53; D=-33;
/I: I=-33; MD=-57;
/M: SY='P'; M=-16,-72,-15, -5,-39,-38,-35,-27, 11,-44,-37,-24, 68, -4, 7, 0, -8,-42, 18,-27; D=-33;
/I: I=-33; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
/M: SY='W'; M= 0,-16,-55,-50, 24,-55,-23, 24,-55, 48, 20,-55,-62,-51,-50,-40,-25, 23, 49, 12;
/M: SY='V'; M= 23, -1, 4,-19,-15,-48, -4, 36,-43, -7,-20,-13,-50,-39,-30,-26,-15, 52,-51,-30;
/M: SY='G'; M=-34,-58, 3,-39,-54, 87,-15,-72,-38,-62,-59, 32,-47,-31,-42,-22,-49,-68,-62,-27;
/M: SY='K'; M=-32,-46,-37,-13,-55,-51, 12,-33, 68,-23, 3,-21,-50, 32, 49,-26, -6,-23,-54,-22;
/I: I=-72; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='T'; M= -3,-35,-39,-25,-47,-50,-14,-44, 3,-36,-22, -9, 34, -1, 17, 39, 64,-42,-67,-38;
/M: SY='L'; M=-26,-57,-60,-64,-25,-68,-61, 50,-63, 61, -1,-66,-46,-59,-63,-56,-42, 37,-50,-41;
/M: SY='R'; M= 15,-54,-10, 5,-40, 22,-14,-31, 31,-35,-21,-16,-47, 9, 42, 19,-17,-30,-53,-39;
/M: SY='E'; M=-14,-64, 62, 68,-63,-37,-21,-63,-10,-53,-42, -4,-44, 34,-15, -3,-20,-55,-71,-50;
/M: SY='L'; M= 4,-37,-63,-51, -1,-49,-53, 37,-56, 55, 1,-34,-51,-46,-57, 5,-13, 13,-59,-34;
/M: SY='N'; M= -3,-51, 28, 18,-50, 10, 11,-40, 13,-41,-33, 37, 9, 16, 29, -5,-20,-36,-58,-41;
/M: SY='L'; M=-22,-45,-27,-11, 42,-51,-25, 20,-23, 47, 6,-44,-26, 4,-19,-34,-31, -2, 27,-30;
/I: I=-79; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
/M: SY='G'; M=-28,-47, 37,-15,-66, 63, -4,-70,-16,-69,-63, 29,-37,-12, -8,-15,-47,-70,-20,-62; D=-29;
/I: I=-29; DM=-50;
/M: SY='V'; M= 27, 43,-56,-54, -2,-36,-52, 23,-54, 9, 2,-55,-52,-56,-57, -8, 11, 48,-19,-17;
/M: SY='T'; M=-13,-52,-26,-21, 1,-45,-12, 11,-11, 8, -8, 32,-51,-10, 24, 1, 34, 7,-26, -4;
/M: SY='I'; M=-32, -9,-67,-65,-14,-69,-67, 63,-61, 23,-13,-64,-18,-61,-64,-49,-39, 62,-64,-44;
/M: SY='V'; M= 5,-20,-55,-31,-27, -6,-38, 35,-40, 22, 10,-37,-52,-41,-29, -5, 5, 46,-64,-39;
/M: SY='A'; M= 58,-32,-35,-10,-31, 32,-42,-39,-31,-19, -3,-34,-55,-15, 19, 2,-14,-33,-50,-33;
/M: SY='I'; M=-34,-47,-69,-61,-23,-72,-32, 74,-62, 25, -7,-63,-63,-43,-58,-49,-32, 50,-51,-20;
/M: SY='R'; M=-28,-57,-28, 1, 1,-45, -3, 14, 32,-13,-10,-15,-58, 6, 45, -9,-18, 10, 17, 16;
/M: SY='R'; M=-44,-62,-22,-26,-50,-57, 18,-67, 11,-56,-42,-32,-36, -4,101,-26,-30,-58,-63,-43;
/I: I=-24; MD=-40;
/M: SY='G'; M= -5,-63, 36, 5,-33, 44, 3,-59, 4,-49,-42, 39,-22, 12, 0, -8,-37,-50,-20,-46; D=-24;
/I: I=-24; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='G'; M=-25,-56, 37, 30,-60, 54, 10,-45, 3,-58,-53, 23,-38, 5, -8,-11,-18,-46,-67,-49;
/M: SY='E'; M=-16,-62, 2, 36,-11,-34, 10,-10, 21,-18, 8, -6,-36, 30, 22,-19, -1, -1, 22,-26;
/M: SY='I'; M=-13,-21,-19, -4, -2,-33,-20, 33,-31, 18, -1,-15, 0,-18, 5, -7, 10, 21,-17,-12;
/M: SY='I'; M=-27,-59,-33,-12, 23,-62,-10, 49,-35, 31, 11,-39, -8,-30,-22,-33,-14, 23,-49, 2;
/M: SY='I'; M=-13,-34,-14,-16,-15,-31, -3, 33,-22, 3, 9, 21, -6,-14, -4, 17, 9, 17,-45,-21;
/M: SY='P'; M= 8,-69,-25,-13,-52,-12,-33,-39,-32,-48,-32,-43,104,-30,-37,-24,-21,-22,-65,-44;
/I: I=-42; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='H'; M=-14,-43, 25, -2,-42, 6, 36,-36, -5, 4,-28, 11, 5, 1, 16, 18, 18,-36,-43,-36;
/M: SY='P'; M= 17,-58, 2, -8,-63, 51,-13,-50,-20,-49,-39,-27, 64,-28, -5, 4,-34,-47,-48,-51;
/M: SY='D'; M=-23,-62, 71, 34,-52,-11, -7,-59, -9,-59,-41, 33,-45, 13,-18, 15, -1,-49,-63,-21;
/M: SY='T'; M=-11,-39, 12, 8, 10,-52,-29, -2,-37, -2, 6,-34,-33,-20,-30, -9, 69, -2,-16, -9;
/M: SY='V'; M=-34,-31,-41, 8,-42,-61,-30, 27, 7,-12, -5,-40, 3, 5, 29,-28, 17, 47,-55,-45;
/M: SY='L'; M=-47,-58,-71,-65, 15,-73,-60, 56,-64, 62, 7,-66,-64,-60,-63,-61,-44, 16,-57,-32;
/M: SY='Q'; M= -8,-56,-19, 45,-35,-50, 23,-53, 20,-16,-12, -6,-42, 61, 36,-21,-23,-46,-25,-13;
/M: SY='P'; M= 38,-39,-12, 32,-25,-22,-26,-31, -4,-20,-22,-35, 49, 1,-11, -4,-21, -6,-62,-22;
/M: SY='G'; M=-34,-56, 16,-15,-62, 83,-11,-71,-23,-69,-48, 31,-54,-25,-29,-21,-47,-68,-64,-49;
/M: SY='D'; M=-40,-46,110,-13,-72,-43,-24,-61,-41,-67,-46,-21,-53,-24,-45,-22,-29,-65,-87,-50;
/M: SY='V'; M=-33,-47,-40, 9,-41,-58, 31, 31, -3, -1, 2,-39,-57, 1, 31,-25, 23, 32,-51, -7;
/M: SY='L'; M=-34,-44,-70,-64,-18,-69,-60, 36,-63, 63, -1,-67,-63,-59,-62,-59,-41, 46,-61,-28;
/M: SY='I'; M=-23,-17,-62,-51, 11,-48, 4, 39,-51, 34, 4,-48,-63,-29,-29,-33, 5, 36, -3, 27;
/M: SY='V'; M= -2,-14,-69,-61, 27,-60,-61, 33,-61, 38, 12,-63,-65,-60,-61,-53,-39, 57,-59,-21;
/M: SY='V'; M= 1, -9,-40,-13, 21,-55,-32, 31,-37, 16, 16,-51,-60, -1,-11,-10, -4, 41,-44,-12;
/M: SY='G'; M= 22, 10,-45,-57,-51, 75,-57,-37,-52,-33,-21,-41,-38,-49,-60, -5, 8, -5,-53,-48;
/M: SY='T'; M= 0,-50, 25, 9,-47,-21, 11,-40, 11,-27,-31, 18, 26, -1, 10, 22, 28,-33,-68,-32;
/M: SY='P'; M= -4,-55, 13, 16,-45,-26, -9,-20, 11,-26,-26, -1, 52, -1, 25, 5, 3,-17, 9,-36;
/M: SY='E'; M= 4,-57, 45, 45,-51, -9, 8,-48, 22,-55,-41, -1,-15, 14, 6, 9,-11,-37,-54,-50;
/I: I=-45; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='D'; M= 18,-24, 41, 14,-19, -9, 23,-29, -9,-36,-27, 12,-47, 26, 4, 9,-11,-13,-65, -8;
/M: SY='I'; M= -9,-45,-58,-28,-13,-54,-33, 49,-46, 43, 20,-53,-61,-36,-28,-37,-25, 37,-55,-25;
/M: SY='E'; M= 10,-53, 27, 35,-54,-20, -8,-38, 14,-31,-26, 7, 18, 22, 24, 3,-11,-33,-48,-30;
/M: SY='R'; M= 15,-54, 14, 33,-46,-32, -2,-44, 25,-33,-35, -6,-47, 33, 44, -1, -2,-39,-55,-35;
/M: SY='L'; M= 11,-31,-67,-56, 41,-50,-55, 23,-60, 43, 5,-54,-65,-55,-57,-44,-15, 40,-28,-14;
/M: SY='E'; M= 15,-22, -2, 37,-34,-17, -8,-30, 14, -8, 16, -9,-33, 15, 22, -2, -4,-22,-44,-11;
/M: SY='Q'; M= 4,-52, 17, 32,-58,-21, 2,-55, 33,-40,-33, 13,-17, 35, 32, 7,-14,-45,-53,-29;
/M: SY='F'; M=-20,-19,-40,-52, 64,-52,-32, 16,-40, 46, 15,-24,-30,-32,-33,-42,-23, -6,-28, -5;
/M: SY='G'; M= -5,-52,-12, 9,-54, 48, -1,-39, -1,-28,-13, 1,-49, 33, 15, 8,-11,-18,-50,-10;
/M: SY='P'; M= -9, -4, 11, 1,-13, 7, 5,-18, 7, 9,-34, 11, 26, -9, 7, -5,-13, -3,-52,-28;
/M: SY='E'; M= -4,-29, -8, 20,-25, -2,-10, 2, 8, 0, 10,-11, -2,-15, 9, 13, 5, 2,-31,-29;
/I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
» more
|