PROSITE entry PS51149

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51149
Entry name [info]	GLY_RADICAL_2
Accession [info]	PS51149
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-OCT-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00665
Associated ProRule [info]	PRU00493

Name and characterization of the entry

Description [info]

Glycine radical domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=122;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=117;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3397627; R2=0.0166475; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=371; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=250; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M=-11,  3,-30,  8,  7,-26,-12,-10,-18,  6,-18, -6, -3,  1,  0, -4, -8,-11,-17,-27,-16,  2;
/M: SY='G';  M= -5, -5,-28, -5, -5,-29, 23,  0,-33,  1,-28,-13,  2,-16,  0, -2,  0,-13,-26,-23,-17, -3;
/M: SY='V';  M= 10,-21,-18,-25,-19,-10,-21,-25, 14,-18, -1,  1,-18, -7,-18,-21, -3, -2, 19,-26,-14,-20;
/M: SY='S';  M=  1,  6,-15, -2, -6,-15, -9,-10,-10,-10,-20,-13, 17,-14, -5,-10, 21, 18, -8,-35,-15, -6;
/M: SY='P';  M=  0,-14,-33,-10,  2,-29,-17,-15,-19, -2,-25,-15,-14, 51,  0,-12, -5, -8,-24,-26,-24, -2;
/M: SY='Y';  M= -4,-17,-21,-20,-13,  8,-23, -9,  3,-12, -1,  1,-14,-20,-12,-10, -6, -2,  4,-11, 12,-14;
/M: SY='Q';  M= -3, 10,-24, 11,  5,-27,-12, 13,-19, -2,-16, -3,  6,-13, 14, -5, -1, -9,-20,-28,-10,  9;
/M: SY='G';  M= -2, -2,-27, -4, -9,-28, 34,-14,-33, -1,-30,-18,  7,-16, -9, -5,  3,-11,-25,-24,-23, -9;
/M: SY='M';  M=  3, -9,-22,-12,-11,-14, -8,-15, -4, -9, -1,  4, -9,-17, -9,-10, -6, -4, -3,-23,-12,-11;
/M: SY='D';  M=-11, 33,-26, 45, 12,-33,-11,  6,-33, -3,-25,-23, 14,-11, -1,-10,  2, -4,-24,-36,-15,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-15,-21,-18,-12,  5,-23,-15, -3, -4,  6,  1,-11,-22,-12,  1,-11, -3, -1,-19, -2,-12;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-25,  2, 10,-21, -7,  0,-21,  5,-15,-11,  7,-14,  2,  1, -2, -7,-20,-28,-13,  6;
/M: SY='G';  M=  3, -3,-27, -5, -9,-28, 47,-15,-34,-14,-27,-19,  4,-17,-13,-16,  2,-15,-27,-23,-27,-11;
/M: SY='P';  M=  0,-19,-28,-18,-10,-16,-17,-18, -9, -9,-15, -7,-17, 18,-10,-10, -7, -7,-10, -8,-14,-12;
/M: SY='F';  M= -8,-20,-20,-26,-20, 20,-27,-14,  7,-20, 12,  4,-17,-23,-19,-17,-11,  5,  4, -7, 17,-20;
/M: SY='A';  M= 15,-15,-25,-18, -7,-20,-11,-16,-12, -9,-14, -5,-15, 15, -3,-16, -4, -8,-13, -8,-15, -6;
/M: SY='I';  M= -3,-14,-22,-17,-11,-10,-21,-15,  6,-16,  5,  2, -9,-10, -7,-15, -7, -4,  2,-27,-11,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-23,-30,-22, 20,-29,-11, 14,-23, 25, 14,-24,-27,-19,-18,-22, -9,  6, -5, 20,-21;
/M: SY='R';  M=  0,  4,-22,  0,  4,-17,-13, -7,-21,  6,-18,-12,  5,-13,  3,  8,  1,  0,-16,-24,-12,  3;
/M: SY='S';  M=  6,  2,-14,  1,  0,-21, -2, -9,-20, -9,-30,-20, 12,  0, -1,-10, 32, 15,-14,-39,-21, -1;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='V';  M= -1,-16,-16,-16,-12, -3, -1,-17, -1,-15,  0, -1,-14,-19,-17,-15, -7, -7,  7,-18,-10,-14; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='G';  M= 12, -3,-17, -7, -8,-20, 21,-13,-21, -5,-19,-13,  2,-12, -8,-10,  5, -6,-14,-19,-19, -8; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='K';  M= -4, -8,-22,-11, -4, -2, -9,-13,-19, 13,-17, -8, -4,-14, -6,  5, -5, -7,-12,-13, -4, -4; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='I';  M= -9,-16,-17,-20, -5, -8,-29,-17, 11,-13,  9,  9,-15,-17, -8,-14,-13, -5,  5,-25, -7, -8;
/M: SY='D';  M= -2,  7,-11,  9,  3,-25,-15,  0,-20, -8,-19,-15,  3, -4, -5,-14, -2, -8,-17,-32,-16, -2;
/M: SY='Y';  M=-18,-21,-31,-23,-19, 17,-27,  8, -4,-12, -4, -2,-17,-26,-12, -6,-19,-11,-10, 25, 40,-18;
/M: SY='C';  M=-12,  1,  8,  0, -9,-20, -5,-14,-27, -6,-22,-17,  1,-22,-12, -5, -6,-11,-18,-31,-18,-11;
/M: SY='E';  M=-11,  2,-28,  4, 12,-22,-22, -8, -6, -1,-10, -3, -3,-11,  6, -5, -5, -8,-10,-27,-12,  7;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 13, -7, -3,-10,-10,-10, -9,-13, -1, -9, -3, -1, -9,-13,-10,-13,  0, -2,  7,-19,-11,-10; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='Y';  M= -3, -4,-21, -8, -6, -6,-17, -4, -9, -1,-10, -7,  0,-19, -5, -1, -1,  2, -8,-16,  6, -7;
/M: SY='P';  M= -1,  3,-29,  7,  1,-29, -5,-12,-21, -8,-23,-17, -1, 19, -3,-15, -2, -9,-22,-29,-22, -3;
/M: SY='G';  M=  1,  4,-26, -2,-13,-26, 45,-11,-32,-13,-28,-19, 17,-19,-13,-14,  4,-13,-28,-26,-26,-13;
/M: SY='I';  M= -6,-20,-22,-26,-19,  6,-26,-16, 13,-17,  8,  7,-15,-21,-15,-12, -9,  0,  9,-15,  6,-19;
/M: SY='Q';  M=  1, -9,-18,-12, -3,-17,-16, -8, -6, -8, -4,  2, -7,-15, 10, -7,  5,  4, -6,-26,-11,  4;
/M: SY='H';  M=-12, -9,-25, -9,  4, -9,-23, 12, -5,-11,  9,  7, -9,-19,  4, -7,-14,-11,-11,-22,  2,  3;
/M: SY='N';  M=-10, 33,-20, 23,  2,-22, -6,  1,-22, -2,-26,-20, 39,-16, -2, -4, 10,  9,-23,-38,-18,  0;
/M: SY='E';  M=-10, -9,-25,-11,  3, -6,-23,-10, -4,-10,  0,  0, -8, -5,  0,-10, -8, -3,-10,-22, -7,  1;
/M: SY='K';  M= -7, -6,-26, -8,  1,-23,-22,-12,-13, 24,-19, -5, -4,-13,  7, 13, -6, -4, -8,-23, -9,  3;
/M: SY='L';  M=  3,-26,-17,-31,-23, 13,-25,-23, 15,-24, 19,  8,-23,-25,-23,-21,-15, -6, 16,-16, -1,-23;
/M: SY='T';  M=  2,-12,-17,-16,-10, -9,-18, -8, -3,-10,  4,  3,-10,-18, -8,-10, -2,  6,  0,-25, -7,-10;
/M: SY='P';  M= -8,-11,-33, -4, 12,-28,-20,-13,-18, -5,-23,-15,-13, 45,  2,-12, -4, -7,-22,-29,-23,  5;
/M: SY='D';  M= -2, 16,-21, 17,  3,-26, -4, -6,-27,  2,-25,-19, 13,-13, -1,  1, 10,  2,-19,-32,-18,  1;
/M: SY='V';  M=  6,-15, -5,-19,-15,-12,-13,-21, -2,-12, -5, -4,-12,-20,-15,-15,  2,  3,  7,-28,-14,-15;
/M: SY='L';  M=-10,-32,-25,-33,-26, 11,-29,-25, 15,-26, 21,  8,-31,-29,-23,-21,-26,-12, 12, 15,  6,-24;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='D';  M= -6, 14,-26, 21,  8,-29, 14, -8,-32, -2,-24,-20,  6,-11, -3, -8,  0,-11,-24,-26,-20,  2; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='G';  M= -8, -5,-27, -4, -8,-15,  7,-10,-24,  0,-21,-14, -4,-16, -7, -1, -5, -9,-20,  2, -2, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='E';  M=  0,  1,-21,  3, 16,-21,-15, -8,-14, -3,-15,-11, -2, -1,  6, -8,  5,  1,-13,-26,-15, 10; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='E';  M=-12,  1,-26,  4, 22,-14,-19,  6,-19,  6,-14,-10, -1,-11, 14,  6, -5, -8,-22,-13,  5, 17; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='G';  M= -6, -5,-28, -5, -5,-27, 21,-10,-29,  0,-25,-14,  1, -5, -1,  2, -3,-13,-25,-20,-20, -4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='Y';  M=-11,-19,-24,-22,-17,  9,-29, -5, 12,-16,  4,  3,-17,-23,-12,-16,-11, -2,  6, -4, 28,-18;
/M: SY='R';  M=-12,  2,-27,  4,  3,-20,-12, -1,-21,  7,-15, -9,  2,-17,  9, 10, -6, -9,-20,-20, -4,  5;
/M: SY='N';  M= -1,  8,-24,  2,  1,-25, 11, -8,-27,  5,-26,-16, 16,-15, -3, -1,  3, -6,-23,-27,-20, -1;
/M: SY='L';  M= -8,-23,-19,-28,-21,  7,-29,-22, 18,-24, 25, 14,-21,-24,-19,-19,-15,  3, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='V';  M=  1, -7,-19,-12,-12,-13,-17,-16,  2, -7, -7, -4, -2,-11,-12,-10, -3, -2,  6,-29,-14,-13;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-17, -3, -5,-21, -5,-13,-16, -8,-16,-11,  0,-13,  0, -9, 12, 16, -8,-29,-15, -2;
/M: SY='L';  M= -9,-19,-25,-20, -7, -3,-26,-16,  8,-18, 10,  4,-16, -9, -6,-16,-12, -7,  0,-22, -6, -8;
/M: SY='I';  M= -8,-27,-23,-34,-26,  1,-34,-26, 36,-26, 21, 18,-21,-22,-20,-24,-17, -4, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='D';  M=-18, 19,-30, 28, 16,-31,-16, -1,-34, 17,-25,-20,  9,-13,  7, 25, -5,-10,-25,-30,-15,  9;
/M: SY='E';  M= -1, -2,-23, -1,  9,-25, -2, -4,-23, -5,-21,-14, -1, -1,  5, -8,  8,  4,-20,-28,-17,  6;
/M: SY='Y';  M=-11,-15,  4,-18,-12,  7,-20, -4,-14,-14, -9, -8,-14,-26, -9,-14,-11,-10,-13, -6, 19,-11;
/M: SY='F';  M=-13,-18,-10,-23,-15, 31,-25,-13, -4,-20,  2, -4,-12,-26,-22,-16,-12, -7, -2, -9, 13,-17;
/M: SY='R';  M=-11,  3,-25,  4,  6,-23,-13, -7,-25, 13,-19,-11,  2,-13,  3, 19, -1,  2,-17,-26,-13,  3;
/M: SY='C';  M=-11,-16,  4,-18,-11,-16,-24, -8,-11, -4, -6,  1,-14,-13, -7, -2,-13,-10, -7,-29,-12,-10;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G';  M= -5,  4,-24,  8,  1,-25, 23,-10,-29, -1,-23,-16,  3,-11, -5, -6, -1,-12,-22,-20,-19, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-27,-12,-18,-23, 48,-18,-29,-20,-18,-14, -1,-21,-18,-19, -3,-16,-23,-21,-25,-18;
/M: SY='Y';  M=-15,-15,-28,-18, -9,  9,-19, 11,-13,-11, -8,  1,-10,-21,  5, -7,-13,-14,-18,  3, 15, -1;
/M: SY='H';  M=-16,  1,-28,  0,  3,-21,-20, 70,-28, -3,-20, -3,  7,-17,  8,  2, -6,-11,-26,-29, 12,  2;
/M: SY='V';  M=  0,-24,-19,-26,-24, -5, -7,-23, 11,-22, 11,  8,-21,-25,-22,-20,-13, -8, 16,-23,-11,-23;
/M: SY='Q';  M=-10, 19,-26, 12, 20,-30,-12,  8,-22,  6,-24,-12, 25,-12, 27,  4,  4, -6,-30,-30,-16, 23;
/M: SY='F';  M=-13,-29,-19,-35,-28, 44,-31,-20, 13,-26, 14,  6,-23,-29,-32,-20,-19, -8, 14, -3, 19,-28;
/M: SY='N';  M=-10, 33,-22, 18,  7,-22, -4,  7,-22,  6,-29,-19, 47,-17,  3,  3,  7, -2,-29,-37,-19,  5;
/M: SY='V';  M=  3,-26,  2,-28,-27, -3,-27,-26, 18,-19,  4,  4,-26,-29,-27,-20, -8, -2, 35,-28, -8,-27;
/M: SY='L';  M= -7,-23,-17,-28,-22,  5,-28,-21, 19,-22, 21, 15,-21,-23,-19,-18,-13,  4, 18,-22, -2,-21;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='N';  M= -1, 12,-18, 12,  3,-22, -6, -4,-23,  2,-23,-17, 13,-12,  1,  8, 11,  1,-16,-30,-16,  1; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='R';  M= -5, -3,-23, -5,  1,-20,-13, -5,-23, 23,-21,-10,  3,-14,  5, 33, -2, -5,-16,-21,-11,  1; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='E';  M= -8, 11,-26, 17, 29,-27,  3, -4,-29,  1,-22,-19,  6, -6,  6, -5,  1,-10,-27,-26,-20, 18; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='T';  M= -5,  0,-15, -4, -9,-12,-21, -6, -9,-11, -7, -7, -2,-14,-10,-11,  9, 28,  0,-30, -7,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-27,  9,-30,-22,  3,-29,-21, 10,-29, 33, 14,-27,-31,-21,-21,-25,-10,  6,-26, -6,-21;
/M: SY='P';  M=-11,-13,-29,-11,  4,-17,-22,-10, -9,  5, -6,  3,-12,  7,  0,  3,-13,-10,-12,-24,-12,  0;
/M: SY='D';  M= -7, 20,-26, 30, 20,-29,-14, -6,-27,  3,-17,-18,  4,-10,  2, -6, -3, -9,-21,-31,-17, 11;
/M: SY='A';  M= 32,-14, 17,-23,-16,-18, -9,-23,-10,-15,-10,-10,-14,-18,-16,-22,  4, -2,  3,-27,-21,-16;
/M: SY='Q';  M= -7,-13,-26,-15, -8,-18, -6, -6, -5, -8, -9,  2,-10,-19, 11, -8, -7,-11, -7,-16, -3,  0;
/M: SY='E';  M= -9, 12,-26, 12, 16,-25,-14, -2,-25, 15,-21,-15, 12,-12,  6, 13, -3, -7,-23,-28,-15, 11;
/M: SY='H';  M=-17, 17,-29, 19,  6,-26,-15, 47,-31,  3,-25,-11, 18,-16,  6,  3, -5,-13,-28,-32,  0,  4;
/M: SY='P';  M=-12, -6,-37,  4,  1,-29,-20,-17,-17,-10,-25,-18,-12, 58, -9,-19, -9,-10,-24,-31,-25, -8;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-27, 13, 24,-27,-15, -3,-21,  1,-18,-11,  4,  2,  9, -6, -1, -8,-23,-30,-18, 16;
/M: SY='K';  M= -8,  4,-26,  3,  6,-27,-15, -5,-27, 27,-26,-12,  6,-13, 10, 26, -1, -6,-20,-25,-13,  7;
/M: SY='Y';  M=-18,-16,-29,-17,-16, 16,-18, 20,-10, -8, -7, -3,-13,-27, -9, -2,-16,-12,-15, 12, 50,-16;
/M: SY='P';  M=-12,-13,-15,-10,  2,-24,-22,-11,-20,  2,-20,-12,-11, 14,  2,  8, -8, -9,-17,-28,-19,  0;
/M: SY='D';  M=-12, 29,-25, 33, 11,-31,-10,  8,-29, -1,-27,-19, 21,-12, 10, -4,  6, -3,-26,-35,-15, 11;
/M: SY='L';  M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 38, 17,-30,-30,-23,-20,-24, -7, 22,-23, -3,-23;
/M: SY='V';  M= -4,-19,-16,-26,-22, -3,-28,-23, 21,-18,  7, 13,-17,-20,-17,-18, -4, 12, 25,-26, -6,-21;
/M: SY='V';  M= -4,-25,-17,-26,-23, -5,-29,-25, 20, -9,  4,  7,-22,-25,-20, -7,-11, -3, 33,-27, -9,-23;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='V';  M= -3,-27,-16,-31,-28, -1,-32,-29, 31,-22, 11, 11,-24,-25,-25,-22,-10,  2, 39,-27, -7,-28;
/M: SY='A';  M= 21, -8, 17,-14,-10,-20, -6,-18,-18,-14,-20,-16, -4,-16,-10,-18, 18,  6, -6,-35,-22,-10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Y';  M=-20,-21,-29,-22,-21, 34,-30, 17,  0,-12,  1,  0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 28, 76,-21;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='S';  M= 17, -1,  2, -8, -7,-19, -5,-14,-17,-11,-21,-16,  5,-14, -7,-14, 21, 11, -8,-34,-20, -7;
/M: SY='V';  M=  4,-13,-20,-11,-11,-18,-19,-20,  0,-11, -9, -5,-16,  3,-12,-17, -4, -4,  9,-28,-17,-12;
/M: SY='Y';  M=-16,  5,-27,  2, -2, -7,-18,  8,-18,  3,-16, -9,  9,-20,  7, 10, -6, -8,-21,-12, 13,  1;
/M: SY='F';  M=-10,-23,-23,-31,-21, 38,-23,-18, -7,-20, -1, -5,-18,-24,-20,-16,-13, -6, -7, 19, 16,-17;
/M: SY='R';  M= -9, -4, -2,-11,-12,-15,-20,-12, -9,  1,-14, -7,  3,-25,-10,  8, -5, -4,  1,-32,-15,-12;
/M: SY='P';  M= -4,  0,-26,  4,  6,-20,-15, -7,-19,  0,-21,-15, -2,  8, -2, -5, -1, -5,-17,-24,-10,  0;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-20,-31,-21, 16,-29,-18, 18,-28, 43, 22,-28,-29,-20,-19,-28,-10,  9,-17,  3,-20;
/M: SY='T';  M=  2, -3, -7, -9,-11,-15, -9,-17,-12,-12,-16,-12,  1,-10,-12,-13, 13, 20, -4,-32,-17,-12;
/M: SY='P';  M= -6, -9,-32, -6,  5,-27,-18, -2,-24, 11,-25,-13, -7, 26,  1,  5, -7,-10,-23,-25,-16,  0;
/M: SY='E';  M= -9,  9,-30, 16, 26,-31,  6, -6,-33, -1,-25,-21,  4, -1,  3, -8,  0,-12,-30,-29,-23, 14;
/M: SY='Q';  M=-10,-12,-26,-13,  0,-20,-25, -6, -3,  2, -2,  4,-11,-18, 18,  6,-10, -9, -7,-21, -7,  8;
/M: SY='Q';  M=-11,  0,-30,  0, 17,-37,-20, 17,-22, 12,-21, -1,  1,-11, 50, 11, -2,-11,-29,-21, -7, 33;
/M: SY='D';  M=-13,  8,-26, 13, 11,-23,-18, -4,-18,  3,-12,-11,  3,-16,  6,  8, -6, -8,-15,-29,-14,  8;
/M: SY='E';  M=-14, 26,-30, 40, 44,-34,-16,  0,-34,  6,-24,-24,  8, -4, 12, -4,  0,-10,-30,-34,-20, 28;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-20,-34,-28,  2,-34,-28, 37,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 34,-24, -4,-28;
/M: SY='I';  M= -1,-22,-23,-29,-22, -6,-30,-26, 26,-16,  7,  9,-16,-19,-16,-19,-10, -1, 22,-23, -6,-22;
/M: SY='S';  M= 12, -2,-15, -5,  3,-21, -8,-11,-18, -3,-19,-14,  1,-10,  3, -2, 18, 12,-10,-29,-17,  3;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='T';  M=  5, -7,-10,-15,-14, -9,-20,-22, -2,-12, -6, -6, -7,-14,-14,-13, 13, 34, 10,-29,-11,-14;
/M: SY='F';  M=-13,-12,-25,-14,  2, 17,-17,-12,-16, -2, -8, -5, -9,-17,-11, -4,-11,-11,-13,-10,  3, -3;
/M: SY='H';  M=-13,  1,-25, -3, -2,-15,-19, 44,-19, -8,-14, -3,  8,-18,  8, -3, -3, -2,-20,-25, 10,  0;
/M: SY='E';  M=-11,  7,-27, 12, 22,-25,-19, -3,-19,  5,-11, -5, -2,-10, 13, -1, -5, -7,-19,-27,-13, 17;
/M: SY='G';  M= -1,-11,-19,-10, -9,-16,  5, -5,-13,-16,-12, -8, -5,-19,-11,-14,  5, -3, -5,-29,-14,-11;
/M: SY='L';  M= -4,-17,-21,-21,-15, -4,-21,-14, 10,-18, 14, 14,-14,-11,-12,-16,-13, -6,  4,-25, -9,-15;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	132 in 132 different sequences
Number of true positive hits	132 in 132 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Glycine radical
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

132 sequences

BSSA_THAAR  (O87943), CUTC_OLEA2  (Q30W70), GRCA_ACTP2  (A3MZ79),

GRCA_ACTP7  (B3H0M3), GRCA_ACTPJ  (B0BTB3), GRCA_ACTSZ  (A6VLV5), 
GRCA_ALIF1  (Q5E2Y6), GRCA_ALIFM  (B5FAJ9), GRCA_ALISL  (B6EKY5), 
GRCA_BPT4   (P13316), GRCA_CITK8  (A8AD08), GRCA_CROS8  (A7MH19), 
GRCA_ECO24  (A7ZQ24), GRCA_ECO27  (B7UH18), GRCA_ECO45  (B7MIR4), 
GRCA_ECO55  (B7LDH2), GRCA_ECO57  (P68067), GRCA_ECO5E  (B5Z153), 
GRCA_ECO7I  (B7NRN5), GRCA_ECO81  (B7MYL2), GRCA_ECO8A  (B7M8J4), 
GRCA_ECOBW  (C4ZYK2), GRCA_ECODH  (B1XBQ6), GRCA_ECOHS  (A8A391), 
GRCA_ECOK1  (A1AEA9), GRCA_ECOL5  (Q0TEQ9), GRCA_ECOL6  (Q8FF10), 
GRCA_ECOLC  (B1IVP8), GRCA_ECOLI  (P68066), GRCA_ECOLU  (B7N6H0), 
GRCA_ECOSE  (B6I5F4), GRCA_ECOSM  (B1LP92), GRCA_EDWI9  (C5BAK4), 
GRCA_ENT38  (A4WDE8), GRCA_ERWT9  (B2VED1), GRCA_ESCF3  (B7LUY6), 
GRCA_GLAP5  (B8F6C4), GRCA_HAEDU  (Q7VMC2), GRCA_HAEI8  (Q4QPM7), 
GRCA_HAEIE  (A5UBC1), GRCA_HAEIG  (A5UFJ0), GRCA_HAEIN  (P44455), 
GRCA_HISS1  (Q0I272), GRCA_HISS2  (B0UWA8), GRCA_KLEP3  (B5XNF9), 
GRCA_KLEP7  (A6TCJ1), GRCA_MANSM  (Q65VN1), GRCA_PASMU  (Q9CPH6), 
GRCA_PECAS  (Q6D209), GRCA_PECCP  (C6DC10), GRCA_PHOPR  (Q6LUP6), 
GRCA_PROMH  (B4F057), GRCA_PSYIN  (A1SUE3), GRCA_SALA4  (B5F227), 
GRCA_SALAR  (A9MGW0), GRCA_SALCH  (Q57L55), GRCA_SALDC  (B5FRD8), 
GRCA_SALEP  (B5QTW0), GRCA_SALG2  (B5RD61), GRCA_SALHS  (B4TE27), 
GRCA_SALNS  (B4T289), GRCA_SALPA  (Q5PLH7), GRCA_SALPB  (A9N0W4), 
GRCA_SALPC  (C0PVZ1), GRCA_SALPK  (B5BAR8), GRCA_SALSV  (B4TS28), 
GRCA_SALTI  (Q8XFE0), GRCA_SALTY  (Q7CQ05), GRCA_SERLI  (P18953), 
GRCA_SERP5  (A8GI38), GRCA_SHIB3  (B2TYK2), GRCA_SHIBS  (Q31XQ5), 
GRCA_SHIDS  (Q32CU0), GRCA_SHIF8  (Q0T1S7), GRCA_SHIFL  (Q83K21), 
GRCA_SHISS  (Q3YYT6), GRCA_VIBA3  (B7VJ50), GRCA_VIBC1  (A7MS83), 
GRCA_VIBC3  (A5F5R7), GRCA_VIBCH  (Q9KPK6), GRCA_VIBCM  (C3LQD3), 
GRCA_VIBPA  (Q87SC7), GRCA_VIBVU  (Q8DEP5), GRCA_VIBVY  (Q7MNR2), 
GRCA_YERE8  (A1JKI9), GRCA_YERP3  (A7FFS5), GRCA_YERPA  (Q1C569), 
GRCA_YERPB  (B2KA62), GRCA_YERPE  (Q8ZD84), GRCA_YERPG  (A9R3Y7), 
GRCA_YERPN  (Q1CKF7), GRCA_YERPP  (A4TKZ1), GRCA_YERPS  (Q667T8), 
GRCA_YERPY  (B1JRB2), GRE1_ECOLI  (P32674), GRE2_ECOLI  (P75793), 
HPDL_CLOD6  (Q18CP5), HPDL_CLODC  (C9XIS5), HPDL_CLODI  (Q84F16), 
HPDL_CLODR  (C9YHW1), HPDL_CLOSL  (Q38HX4), HPFG_KLEOX  (A0A318FL05), 
HPSG_BILW3  (E5Y7I4), HYPD_CLODI  (A0A031WDE4), IAD_TRASO   (A0A100YXA1), 
ISLA_BILW3  (E5Y378), ISLA_DESDA  (B8J0R1), ISLA_NITV2  (Q727N1), 
ISLA_OLEA2  (Q312S2), NRDD_BPT4   (P07071), NRDD_ECOLI  (P28903), 
NRDD_HAEIN  (P43752), NRDD_SALTY  (Q9L646), PFLB_ECOLI  (P09373), 
PFLB_HAEIN  (P43753), PFLB_STAA3  (Q2FK44), PFLB_STAA8  (Q2G1D8), 
PFLB_STAAB  (Q2YV53), PFLB_STAAC  (Q5HJF4), PFLB_STAAM  (Q99WZ7), 
PFLB_STAAN  (Q7A7X6), PFLB_STAAR  (Q6GK90), PFLB_STAAS  (Q6GCQ0), 
PFLB_STAAW  (Q7A1W9), PFLB_STAEQ  (Q5HKH9), PFLB_STAES  (Q8CTX6), 
PFL_CHLRE   (P37836), PFL_CLOPA   (Q46266), PFL_LACLA   (O32797), 
PFL_LACLM   (O32799), PFL_STRMU   (Q59934), TDCE_ECOLI  (P42632)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

31 PDB

1CM5; 1H16; 1H17; 1H18; 1H78; 1H79; 1H7A; 1H7B; 1HK8; 1MZO; 2PFL; 2Y8N;
» more