PROSITE entry PS51084

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51084
Entry name [info]	HIT_2
Accession [info]	PS51084
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAR-2005 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00694
Associated ProRule [info]	PRU00464

Name and characterization of the entry

Description [info]

HIT domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=108;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=103;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9633796; R2=0.0157887; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5210.1577148; R2=3.3684211; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=351; H_SCORE=6392; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=224; H_SCORE=5965; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-40; I=-40; B1=-200; E1=-200; MI=-50; MD=-50; IM=-50; DM=-50;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-50; BD=-50;
/M: SY='I';  M=-10,-18,-11,-20,-17,-10,-24,-18,  2,-14, -2,  1,-13,-25,-12,-21, -9, -5,  1,-28,-11,-14;
/M: SY='F';  M=-19,-27,-14,-32,-19, 26,-28,-11,-11,-23, -6, -7,-24,-23,-20,-19,-19,-15,-14, -8, 13,-22;
/M: SY='C';  M= -4,-19, 42,-22,-18,-21,-19,-23,-14,-18,-16,-13,-13,-26,-16,-27, -5, -5, -8,-38,-22,-16;
/M: SY='K';  M= -8,-11,-17,-14, -7,-19,-21,-11,-14,  2,-11, -7, -9,-19, -1, -5, -7, -8,-13,-27,-13, -5;
/M: SY='I';  M= -7,-22,-21,-22,-20, -9,-26,-21, 11,-16, -1,  2,-17,-19,-17,-24,-16, -9,  7,-28,-10,-17;
/M: SY='V';  M=  3,-23,-11,-24,-17,-17,-24,-24,  4,-14, -6, -2,-17,-15,-12,-21, -7, -3,  7,-30,-15,-14;
/M: SY='K';  M= -6, -1,-22, -6, -1,-29,-12, -3,-27, 10,-26,-16,  5,-17,  4,  6,  1, -5,-24,-29,-15,  1;
/M: SY='G';  M= -9,-11,-24,-14,-12,-21,  1,-10,-20, -5,-16, -8, -5,-21, -4, -9, -6,-10,-20,-25,-13, -8;
/M: SY='E';  M= -9,  7,-30, 13, 17,-34,-14, -2,-30,  7,-27,-18,  2,-12, 13, -3, -3, -9,-27,-32,-19, 17;
/M:         M= -5, -7,-25, -4,  0,-23,-23,-14, -9, -3,-14, -9, -7,-15, -3,-11, -7, -6, -7,-32,-16,  0;
/M: SY='P';  M= -6,  0,-30,  5,  5,-36,-14,-10,-29, -2,-32,-23,  1, 27,  0,-15, -1, -4,-26,-36,-24,  4;
/I:         I=-12; MD=-15;
/M: SY='S';  M=  2, -5,-12, -7, -9,-27, -5,-10,-22, -6,-23,-15,  1, -9, -6,-12, 10,  4,-17,-34,-19, -7; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-15; IM=-15; DM=-15;
/M: SY='Y';  M=-12,-18,-24,-22,-12, -2,-26, -1, -8,-10, -4,  2,-13,-26, -5, -8,-11, -7, -8,-14,  6,-11;
/M: SY='V';  M= -9,-24,-19,-27,-14,-10,-33,-20,  9, -9,  3,  4,-20,-25, -9,-13,-15, -5, 10,-25, -9,-12;
/M: SY='I';  M=-10,-39,-16,-40,-32,  3,-40,-35, 33,-30, 22, 16,-33,-32,-27,-32,-26, -7, 32,-25, -7,-30;
/M: SY='Y';  M=-10,-22,-19,-24,-17, 11,-18,  3,-15,-16,-13, -7,-16,-26,-11,-13,-12,-13,-14, -1, 29,-17;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-30,  6, 31,-31,-26,  0,-35, 17,-28,-18, -1,-14, 18, 16, -4, -6,-27,-30,-17, 27;
/M: SY='D';  M=-10, 16,-27, 21, -2,-30, -4, -9,-26,-11,-25,-19, 13,-15, -6,-18,  3, -1,-25,-34,-20, -4;
/M: SY='D';  M= -7, 13,-30, 21, 19,-37,-17, -6,-32,  7,-31,-23,  6, -1,  9, -5,  1, -6,-29,-36,-22, 16;
/M: SY='H';  M=-14, -9,-26,-10, -7, -9,-22, 12,-19, -5,-10, -5, -7,-23,  0, -7, -7, -8,-19,-21,  3, -6;
/M: SY='V';  M=  0,-24, -1,-26,-22,-11,-18,-21,  0,-20, -7, -4,-16,-25,-19,-23, -2,  0,  5,-27,-11,-20;
/M: SY='I';  M=-13,-32,-19,-35,-24, 10,-35,-20, 12,-21,  8,  8,-27,-31,-19,-20,-20, -8, 11,-13,  7,-23;
/M: SY='A';  M= 25,-28, -8,-28,-20,-21,-14,-28,  8,-19, -7, -2,-18,-19,-18,-25, -3, -1, 16,-30,-17,-19;
/M: SY='F';  M=-17,-38,-18,-43,-30, 30,-38,-24, 19,-32, 17, 12,-34,-35,-29,-30,-26,-12, 14,-12, 10,-32;
/M: SY='L';  M=-14,-32,-21,-35,-23,  0,-35,-23, 15,-19, 27, 23,-28,-33,-14,-20,-23, -9,  9,-21, -8,-21;
/M: SY='D';  M=-13, 32,-31, 42,  7,-40, -6, -4,-32, -7,-34,-27, 25,-34, -2,-16,  2, -6,-31,-42,-23,  2;
/M:         M=-10,-13,-26,-15,-13,-20,-24,-13, -2,  0, -7, -3, -8,-20, -6, -8,-12, -9, -4,-31,-14,-10;
/M: SY='Y';  M=-13, -5,-27, -5, -4,  0,-22,  3,-19, -5,-19,-11, -4,-21, -3, -7, -7,-10,-19,-13, 17, -6;
/M: SY='P';  M=-26,-16,-36, -9, -6,-39,-18,-15,-29, -6,-36,-24,-15, 73,  1,-23,-25, -8,-28,-35,-26, -3;
/M: SY='Y';  M= -5,-24,-21,-27,-19,  0,-26,-13,  3,-14, -2,  2,-17,-24,-13,-16,-13, -8,  4,-18,  6,-18;
/M: SY='S';  M=  3, -6,-16,-11,-11,-16,-14, -8,-14, -9,-15, -9,  4,-19, -7,-12,  9,  7,-10,-35, -8, -9;
/M: SY='P';  M=-11, -7,-32, -4, -1,-32,-21,-11,-28,  3,-30,-22, -8, 25, -1, -7, -6, -8,-26,-32,-20, -2;
/M: SY='G';  M= -3,-14,-31,-14,-27,-30, 59,-14,-37,-19,-36,-26, -3,-22,-17,-26, -4,-20,-37,-14,-18,-19;
/M: SY='H';  M=-19, -7,-28,-16,-25,  1,-23, 76,-31, -5,-22, -7,  1,-23,  4, -4,-13,-19,-32,-22, 23, -6;
/M: SY='V';  M= -8,-26, -8,-30,-23, -2,-30,-25,  8,-23,  6,  5,-21,-26,-19,-24, -9,  8, 10,-16, -7,-22;
/M: SY='L';  M=-17,-38,-20,-39,-28,  6,-38,-34, 20,-27, 41, 30,-36,-37,-17,-26,-27, -9, 12,-30, -8,-26;
/M: SY='V';  M= -4,-40,-13,-40,-32, -5,-40,-38, 39,-30, 17, 14,-31,-31,-29,-32,-23, -3, 43,-28, -9,-30;
/M: SY='I';  M= -6,-36,-12,-36,-30, -4,-35,-33, 26,-27, 13, 11,-29,-21,-25,-33,-21, -6, 24,-29,-12,-27;
/I:         I=-11; MD=-14;
/M: SY='P';  M= -6,-18,-34,-12,-10,-34,-19,-18,-26, -7,-34,-25,-16, 66, -8,-22, -5, -5,-24,-33,-24, -9; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='K';  M=-15, -8,-32,-15,  0,-22,-24,  3,-26, 27,-23,-14, -7,-19,  8, 20, -9,-12,-25,-16, -4,  0;
/M: SY='K';  M= -4, -6,-28, -8,  6,-30,-21, -4,-25, 14,-24,-13, -5, -9, 10, 12, -3, -5,-20,-29,-15,  7;
/M: SY='H';  M=-14,  0,-29, -4,  1,-18,-16, 58,-34, -1,-29,-13,  7,-13,  7, -4, -5,-14,-33,-31,  6,  1;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-16,-32,-23, -3,-32,-20, 16,-20,  2,  5,-22,-25,-19,-22,-16, -5, 18,-22,  0,-21;
/M: SY='S';  M=  2, -5,-23, -5,  1,-30,-12,-12,-21, -1,-23,-14, -2, -2,  1, -9,  5,  1,-16,-32,-20,  3;
/M: SY='N';  M= -9, 11,-24, 11,  9,-27,-16,  3,-30,  3,-28,-19, 13,-16,  4, -2,  6,  0,-26,-32,-12,  8;
/M: SY='L';  M=-17,-38,-20,-40,-30, 16,-37,-24, 17,-29, 22, 17,-34,-32,-23,-30,-27,-12, 10, -7,  5,-28;
/M:         M=-12, -7,-23,-10, -4, -5,-21,  0,-17, -8,-14,-10, -5,-21, -6,-11, -4, -2,-16,-19, -1, -5;
/M: SY='D';  M=-10, 18,-30, 30, 18,-35,-16, -3,-30, -3,-27,-22,  8,-13,  6,-11, -1, -6,-27,-37,-20, 14;
/M: SY='L';  M=-11,-35,-17,-37,-27,  3,-35,-27, 18,-27, 34, 24,-33,-34,-18,-28,-23, -6, 12,-21, -9,-26;
/M: SY='D';  M= -6,  7,-26, 13,  1,-35,-13,-12,-28, -2,-30,-24,  3, 11, -1,-11, 11,  6,-24,-38,-23,  1;
/M: SY='D';  M= -2,  0,-28,  6,  3,-34,-12,-13,-23,  0,-26,-18, -3,  2,  1,-10,  0, -5,-20,-35,-22,  2;
/M: SY='E';  M= -2,  4,-27, 10, 19,-32,-16, -4,-28,  4,-27,-18,  0, -9,  8, -6, -1, -6,-23,-32,-19, 16;
/M: SY='E';  M= -7, -1,-25,  4, 15,-22,-23, -4,-20, -4,-17,-11, -4,-16,  4,-10, -5, -3,-15,-29,-13, 12;
/M: SY='M';  M= -7,-24,-23,-26,-15, -8,-26,-15, -5,-10,  0,  3,-19,-27, -5, -7,-12, -8, -4,-13, -3,-12;
/I:         I=-9; MD=-11;
/M: SY='A';  M=  2,-10,-19,-11, -7,-19,-13, -7,-13, -7,-13, -5, -6,-15, -1,-11, -1, -4,-11,-25,-10, -5; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='E';  M= -4,  6,-27, 11, 16,-31,-14,  0,-30,  3,-26,-17,  3,-14,  8, -4, -2, -8,-25,-32,-17, 14;
/M: SY='L';  M=-13,-36,-16,-38,-29,  7,-35,-24, 21,-27, 27, 24,-31,-34,-20,-28,-24, -9, 16,-19, -2,-26;
/M: SY='M';  M=-14,-25,-21,-30,-20,  5,-26,-13,  4,-20, 10, 17,-19,-29,-12,-22,-16, -9, -1,-11,  0,-17;
/M: SY='K';  M= -4, -3,-25, -2,  4,-28,-18, -8,-22,  6,-18,-12, -3,-15,  6,  0, -2, -4,-18,-30,-17,  5;
/M: SY='M';  M= -3,-17,-19,-17,-11,-11,-23,-15, -1,-17,  3,  5,-15,-23,-11,-20,-10, -1,  0,-26,-11,-11;
/M: SY='V';  M=  4,-25,-12,-28,-22,-14,-20,-25, 10,-18,  2,  9,-17,-23,-15,-23, -6,  1, 13,-27,-13,-18;
/M: SY='Q';  M= -5, -4,-26, -8,  0,-30,-16,  1,-23, 11,-22,-11,  0,-14, 13,  6, -1, -5,-20,-25,-12,  4;
/M: SY='K';  M= -6,-11,-26,-15, -2,-23,-24, -9,-16, 14,-11, -7,-10,-20,  4,  8, -6, -6,-14,-28,-15, -1;
/I:         I=-11; MD=-14;
/M: SY='V';  M= -3,-36, -9,-37,-29, -5,-33,-33, 27,-27, 16, 14,-28,-30,-24,-30,-19, -4, 28,-27,-11,-27; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='A';  M=  8,-13,-18,-14,-12,-26,  1,-15,-16, -8,-20,-11, -6,-16, -4,-13,  6, -1,-11,-29,-17, -7;
/M: SY='K';  M= -8, -1,-28, -2,  8,-30,-20, -4,-27, 15,-23,-15, -2,-15, 13, 11, -2, -6,-23,-28,-15, 10;
/M: SY='A';  M= 18,-20,-17,-22,-11,-20,-16,-16, -4, -6,-10, -3,-13,-17, -7,-14, -3, -3,  1,-27,-13,-10;
/M: SY='L';  M=-13,-38,-17,-39,-30,  3,-38,-30, 27,-28, 30, 24,-33,-34,-21,-31,-26, -8, 21,-22, -8,-27;
/M: SY='K';  M= -9, -6,-26, -7,  4,-27,-19, -9,-21, 12,-18,-11, -6,-19,  5,  6, -6, -8,-18,-29,-16,  4;
/M: SY='K';  M= -2, -1,-26, -1,  8,-31,-17, -3,-26, 16,-25,-15, -1,-13, 11,  5,  1, -6,-22,-28,-16,  9;
/M: SY='A';  M=  7,-16,-18,-16, -7,-21,-17,-14, -7, -8, -9, -4,-12,-19, -5,-13, -2, -2, -2,-28,-13, -6;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='F';  M=-17,-25,-16,-29,-21, 22,-26,-10, -5,-24,  0,  0,-21,-29,-20,-22,-16,-10, -8, -8, 17,-23;
/M: SY='N';  M= -3,  0,-26, -2, -2,-31, -2, -1,-28,  3,-28,-16,  6, -8,  5, -6,  2, -7,-25,-30,-16,  1;
/M: SY='P';  M=  6,-14,-16,-13,-13,-29,-10,-17,-19,-11,-27,-18, -9, 20,-11,-22,  1, -3,-14,-35,-21,-12;
/M: SY='D';  M= -6,  5,-25, 11,  2,-31,-15,-11,-20, -5,-23,-17,  1, -9,  1,-13,  1, -2,-17,-32,-19,  2;
/I:         I=-5; MD=-7;
/M: SY='G';  M=  1, -3,-14, -2,-13,-24, 23,-12,-21,-11,-22,-17,  0,-13, -9,-17,  4, -5,-19,-22,-17, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-7;
/M: SY='F';  M= -7,-18,-13,-20,-17,  6,-14,-14,  5,-17,  2,  2,-14,-17,-15,-18,-10, -5,  4,-12,  2,-16; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-7;
/M: SY='N';  M= -6,  9,-12,  2, -3,-15, -6,  0,-14, -4,-16, -9, 19,-11, -3, -7,  3,  3,-12,-19, -8, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='I';  M= -6,-16,-14,-18,-18, -3, -5,-15,  6,-14, -1,  2,-10,-17,-14,-17,-11, -7,  4,-15, -4,-15; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-7;
/M: SY='L';  M= -4,-22,-11,-23,-18,  1,-16,-16,  7,-17, 10,  8,-18,-21,-14,-18,-11, -5,  5,-15, -3,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-7;
/M: SY='K';  M=-10, -4,-25,-12, -6,-28,-17, -7,-16, 10,-18, -7,  4,-21,  6,  7, -3, -4,-14,-29,-15, -1;
/M: SY='M';  M=-10,-11,-17,-18,-16,-10,-23,-11,  0,-16, -1,  4,  0,-25, -9,-21, -9, -5, -2,-26, -8,-14;
/M: SY='N';  M= -7, 19,-25, 12, -6,-38, 15, -2,-31, -5,-35,-22, 33,-19, -3,-14,  5, -7,-30,-36,-22, -3;
/M: SY='G';  M= -8,-16,-24,-19,-19,-12,  9,-13,-16,-15,-15,-10, -9,-25,-13,-17,-10,-13,-17,-21, -6,-16;
/M: SY='A';  M=  1, -9,-23,-10, -4,-27, -4, -5,-22, -2,-24,-15, -4, -9, -3, -9,  0, -7,-18,-31,-16, -2;
/M: SY='A';  M= 11,-18,-17,-19,-11,-13,-13,-14, -6,-12,-11, -4,-13,-18, -9,-18, -2, -4, -3,-24, -6, -9;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='A';  M= 16,-20,-18,-20,-15,-21,  0,-18,-11,-15,-11, -7,-14,-13,-12,-22, -2, -6, -7,-24,-15,-13; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-13;
/M: SY='G';  M=  2,-14,-22,-16,-24,-25, 38,-17,-24,-17,-26,-17, -5,-21,-17,-26, -2,-14,-24,-27,-20,-18; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-13;
/M: SY='Q';  M=-10,  3,-24, -1,  0,-32, -4, -1,-26,  1,-23, -9, 10,-10, 23, -8,  0, -9,-27,-23,-15, 10;
/M: SY='T';  M= -5,-12,-19,-12, -6,-18,-23,-15, -3,-11, -8, -4, -9,-19, -9,-16, -2,  5,  2,-31,-14, -5;
/M: SY='V';  M= -3,-28,-17,-25,-23,-13,-32,-32, 24,-24,  5,  8,-23,-23,-21,-28,-18, -5, 27,-30,-13,-22;
/M: SY='P';  M= -9, -8,-29, -4, -6,-15,-17, -9,-24, -9,-24,-17, -9, 13, -9,-17, -3, -7,-23,-29,-11, -7;
/M: SY='H';  M=-19, -1,-30, -9,  1,-11,-20, 84,-38,  1,-28,-10,  8,-20, 13,-20, -9,-18,-38,-28, 16,  2;
/M: SY='L';  M= -9,-36,-15,-37,-27,  6,-35,-26, 20,-27, 22, 17,-31,-33,-22,-27,-21, -6, 18,-20, -1,-27;
/M: SY='H';  M=-19,  0,-29,-10,  0,-11,-19, 97,-39,  0,-30,-10, 10,-20, 10,  0, -9,-19,-39,-30, 19,  0;
/M: SY='I';  M=-11,-35,-20,-37,-27,  9,-34,-27, 18,-27, 16, 14,-30,-31,-22,-29,-22, -8, 14,-11,  0,-25;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,-10,-20,-10,-20, 96,-39,  1,-30,-10,  9,-20, 10,  1,-10,-20,-39,-29, 20,  0;
/M: SY='I';  M= -9,-39,-15,-40,-33, -1,-40,-35, 36,-30, 23, 18,-32,-33,-27,-33,-26, -7, 34,-27, -9,-30;
/M: SY='I';  M= -9,-39,-18,-40,-35,  4,-39,-36, 38,-30, 18, 16,-31,-31,-29,-35,-26, -8, 34,-24, -6,-30;
/M: SY='P';  M= -5,-19,-35,-11,-11,-36,-15,-19,-27,-10,-36,-26,-17, 77,-10,-28, -5, -8,-26,-38,-26,-10;
/M: SY='R';  M=-16,-11,-36,-19, -1,-28,-28, -2,-33, 25,-25,-14,-10,-22, 10, 50, -9, -9,-26,-28,-11,  0;
/M: SY='W';  M=-20,-22,-32,-23,-14,  9,-28, -1,-18,-12,-14, -8,-19,-26, -7,-11,-19,-17,-19, 19, 19,-13;
/M: SY='S';  M= -2, -3,-22, -6,  1,-23,-12, -5,-24,  3,-24,-15,  2,-13,  0, -4,  4, -2,-20,-29,-13,  1;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='G';  M= -4,  7,-28, 10, -6,-37, 25,-11,-34, -8,-33,-25,  9,-15, -6,-18,  4, -9,-32,-34,-24, -4;
/M: SY='D';  M=-15, 30,-34, 50, 11,-40, -5,-11,-35, -9,-34,-32, 12, -9, -2,-19,  1, -8,-34,-42,-25,  5;
/M:         M= -4,-19,-23,-19,-13,-13,-17,-16,-11,-12,-11, -7,-15, -3,-10,-16, -5, -1, -9,-25,-10,-12;
/M: SY='N';  M= -6, -3,-14, -6, -8,-24, -5, -8,-20, -9,-21,-13,  4,-15, -8,-16, -1, -5,-18,-32,-17, -7;
/M: SY='F';  M=-19,-23,-29,-26,-17, 13,-25,-11,-13,-17, -7, -5,-21,-29,-14,-17,-19,-15,-16, 12,  9,-17;
/I:         E1=0; IE=-50; DE=-50;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	91 in 91 different sequences
Number of true positive hits	91 in 91 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	2
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	97.85 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	HIT
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

91 sequences

AP4A_MYCTO  (P9WMK8), AP4A_MYCTU  (P9WMK9), APH1_SCHPO  (P49776),

APTX_BOVIN  (Q7YRZ2), APTX_CANLF  (P61797), APTX_CHICK  (P61798), 
APTX_CIOIN  (P61802), APTX_DANRE  (P61799), APTX_DROME  (Q8MSG8), 
APTX_HUMAN  (Q7Z2E3), APTX_MACFA  (Q9BGQ0), APTX_MOUSE  (Q7TQC5), 
APTX_PIG(Q7YRZ1), APTX_RAT(Q8K4H4), APTX_TAKRU  (P61800), 
APTX_XENLA  (Q7T287), APTX_XENTR  (P61801), BH140_ARATH (Q9M041), 
FHIT_ARATH  (F4KEV7), FHIT_BOVIN  (Q1KZG4), FHIT_DICDI  (Q86KK2), 
FHIT_HUMAN  (P49789), FHIT_MOUSE  (O89106), FHIT_RAT(Q9JIX3), 
HINT1_ARATH (Q8GUN2), HINT1_BOVIN (P62958), HINT1_HUMAN (P49773), 
HINT1_MOUSE (P70349), HINT1_PONAB (Q5RF69), HINT1_RABIT (P80912), 
HINT1_RAT   (P62959), HINT2_BOVIN (Q8SQ21), HINT2_HUMAN (Q9BX68), 
HINT2_MOUSE (Q9D0S9), HINT3_ARATH (F4K1R2), HINT3_BOVIN (Q2YDJ4), 
HINT3_DANRE (Q5PNN8), HINT3_HUMAN (Q9NQE9), HINT3_MOUSE (Q9CPS6), 
HINT3_PONAB (Q5R9L4), HINT3_RAT   (Q8K3P7), HINT3_XENTR (Q28BZ2), 
HINT4_ARATH (Q84VV6), HINT_CAEEL  (P53795), HINT_ECO57  (P0ACE8), 
HINT_ECOLI  (P0ACE7), HINT_HAEIN  (P44956), HINT_SHIFL  (P0ACE9), 
HITA_NEIGO  (O07817), HIT_BACSU   (O07513), HIT_ENTH1   (C4LYI2), 
HNT1_CANAL  (Q59WG0), HNT1_SCHPO  (O94586), HNT1_YEAST  (Q04344), 
HNT2_YEAS1  (B3LFZ1), HNT2_YEAS2  (C7GQV5), HNT2_YEAS6  (B5VGI4), 
HNT2_YEAS7  (A6ZYQ3), HNT2_YEAS8  (C8Z5L6), HNT2_YEAST  (P49775), 
NFT1_CAEEL  (O76463), NFT1_DROME  (O76464), PKIA_DICDI  (Q23921), 
Y1390_SYNE7 (P32084), Y2839_DICDI (Q558W0), Y664_CHLMU  (Q9PK09), 
Y866_METJA  (Q58276), YHI1_MYCBO  (P0A5B6), YHI1_MYCLE  (P49774), 
YHI1_MYCTO  (P9WML2), YHI1_MYCTU  (P9WML3), YHI2_MYCTO  (P9WML0), 
YHI2_MYCTU  (P9WML1), YHIT_AQUAE  (O66536), YHIT_AZOBR  (P26724), 
YHIT_BORBU  (P94252), YHIT_BUCAI  (P57438), YHIT_BUCAP  (Q8K9I9), 
YHIT_BUCBP  (Q89AG5), YHIT_CHLPN  (Q9Z863), YHIT_CHLTR  (O84390), 
YHIT_HELPJ  (P64383), YHIT_HELPY  (P64382), YHIT_MESHY  (P32083), 
YHIT_MYCGE  (P47378), YHIT_MYCPN  (P75504), YHIT_RICPR  (Q9ZDL1), 
YHIT_SACS2  (P95937), YHIT_SYNY3  (P73481), ZB14_BRAJU  (P42855), 
ZB14_MAIZE  (P42856)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

2 sequences

APTX_SCHPO  (O74859), APTX_YEAST  (Q08702)

PDB
[Detailed view]

113 PDB

1AV5; 1EMS; 1FHI; 1FIT; 1KPA; 1KPB; 1KPC; 1KPE; 1KPF; 1RZY; 1Y23; 2FHI;
» more