PROSITE entry PS50993
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NIDOGEN_G2 |
| Accession [info] | PS50993 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2004 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50993 |
| Associated ProRule [info] | PRU00348 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Nidogen G2 beta-barrel domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=226; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=221; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2014532; R2=0.0164333; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=16481.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=384; H_SCORE=16481; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=262; H_SCORE=16481; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= 0, -8,-25, -9, 7,-21, -9,-13, -6, -9,-11, -6, -5,-11, 3,-13, 1, -7, -8,-25,-15, 3; /M: SY='P'; M= -1,-19,-36,-11, -1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19, 75,-10,-20, -7, -9,-26,-29,-29,-10; /M: SY='Q'; M=-11,-12,-26,-13, -2,-19,-25, 5, -4, -2, -3, 4, -9,-19, 16, 6,-10,-10, -6,-23, -4, 5; /M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10, -3,-21, -7, -3,-31, 23,-21,-11, 0,-20, 6, 57, -9,-11,-21,-20,-13, -3; /M: SY='V'; M= 4,-21,-15,-24,-21, -1,-23,-18, 16,-17, 1, 3,-19,-23,-19,-18, -3, 0, 23,-20, 2,-21; /M: SY='N'; M= -2, 11,-19, 1, -2,-19, -8, -2,-21, 5,-23,-15, 23,-17, 1, 15, 9, 5,-18,-31,-16, -2; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= -1, 0,-20, -1, 5,-25,-12, -8,-22, 14,-27,-13, 4,-10, 11, 7, 15, 8,-15,-29,-14, 8; /M: SY='V'; M= -5,-29,-14,-31,-28, 11,-29,-23, 24,-21, 16, 17,-27,-29,-26,-19,-15, -4, 34,-22, -2,-26; /M: SY='T'; M= -2, -6,-19, -9, 0,-14,-19,-15, -6, -5, -8, -6, -4,-12, -4, -8, 8, 13, -4,-29,-11, -3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-11, -3,-22, -6, -5, -8,-19, -3, -7, 1,-11, -7, 4,-22, -5, 9, -5, -5, -3,-21, 0, -7; /M: SY='I'; M= -6,-26,-23,-31,-24, -1,-31,-25, 31,-26, 18, 13,-19,-22,-18,-24,-12, -4, 22,-24, -4,-24; /M: SY='N'; M=-12, 16,-23, 1, -8, -5,-12, -1, -9, -5,-17,-11, 32,-21, -7, 1, 0, -4,-17,-29,-10, -8; /M: SY='V'; M= -6, -9,-22, -6,-13,-19, 1,-18,-11, -4,-14, -8, -9,-21,-14, -2, -6, -9, 2,-26,-17,-14; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= -3, -7,-14, -7, -5,-11, 9, -6, -9, -8, -3, -2, -4,-10, 1, -6, -4, -8,-10,-11, -8, -2; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='W'; M= -8, -4,-19, -3, 7,-10,-11, 8,-13, -1,-11, -6, -5, -8, 8, -2, -7, -9,-16, 12, 2, 8; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='F'; M= -3,-11, -9,-14,-11, 9,-13,-11, 6,-12, 1, 1, -7,-12,-12,-10, -1, 0, 8,-10, 0,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='P'; M= -5, 0,-20, -1, -1,-18, 4, -5,-15, -4,-18,-11, 4, 14, 1, -7, -1, -6,-19,-18,-15, -1; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='V'; M= -5,-18,-19,-18, -9, -7,-24,-17, 14,-12, 3, 10,-18, -7,-11,-15,-10, -5, 16,-24,-10,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='E'; M= 1, -8,-21, -7, 5,-18,-19, -4,-10, -7,-12, -8,-10, 0, -5,-11, 0, 1, -4,-29,-13, -1; /M: SY='F'; M= -1,-18,-20,-25,-18, 19,-21,-20, -1,-20, -3, -5,-13, -7,-21,-19, -2, 3, -1,-14, 1,-19; /M: SY='E'; M= -7, -2,-25, 1, 4,-18, 3,-13,-19,-12, -4,-10, -5,-16, -8,-13, -6, -6,-16,-26,-16, -2; /M: SY='B'; M= -4, 18,-24, 15, 7,-24,-12, -5,-16, 2,-20,-14, 17,-13, -1, -5, 0, -6,-17,-31,-16, 2; /M: SY='T'; M= 9,-14,-16,-23,-18, -8,-22,-24, 12,-17, 1, 1,-12,-15,-15,-19, 3, 15, 14,-25, -9,-18; /M: SY='D'; M=-12, 16,-26, 24, 15,-19,-15, -4,-27, 2,-22,-18, 6,-11, 5, -4, 2, -6,-22,-28,-11, 11; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 44, 19,-30,-30,-21,-20,-27, -9, 16,-21, -1,-21; /M: SY='H'; M=-15, 1,-27, -2, 1,-20,-19, 51,-19, -7,-11, 0, 8,-19, 15, -1, -8,-14,-24,-28, 5, 6; /M: SY='S'; M= 14, -4,-16, -8, -4,-23, 5,-12,-19, -8,-21,-13, 1,-11, 2,-11, 18, 9,-12,-28,-19, -1; /M: SY='Y'; M=-16,-16,-26,-18,-14, 21,-27, 8, -4,-10, -3, -1,-14,-24, -3, -8,-12, -2,-10, 12, 49,-11; /M: SY='V'; M= 4,-25,-18,-28,-26, -7,-14,-27, 19,-21, 4, 5,-21,-24,-24,-22, -8, -5, 27,-25,-12,-26; /M: SY='V'; M= 1,-18,-10,-20,-20, -6,-23,-24, 12,-16, -1, 0,-16,-22,-20,-16, 5, 16, 28,-31,-11,-20; /M: SY='T'; M= -2, 1,-17, -2, -7,-17, -3,-10,-13,-10,-13, 0, 1,-13, -5,-11, 11, 12, -8,-31,-14, -6; /M: SY='S'; M= 0, 7,-15, 3, 4,-18, -9, -8,-14, -6,-21,-15, 14,-13, -2, -7, 19, 12, -9,-36,-18, 1; /M: SY='D'; M= -6, 16,-28, 26, 20,-31,-13, 6,-29, -2,-23,-20, 4, 4, 3, -9, -1,-10,-26,-32,-17, 11; /M: SY='G'; M= -3, -5,-30, -6,-14,-29, 48,-16,-34,-16,-30,-20, 5, -4,-16,-17, 0,-16,-30,-24,-29,-16; /M: SY='R'; M=-12, -1,-23, -5, -1,-19,-15, -3,-24, 15,-21,-13, 9,-17, 4, 39, 3, 4,-17,-27,-13, -1; /M: SY='T'; M= 10, -4,-16, -8,-10,-15,-15,-19, -1,-13, -8, -7, -6,-14,-12,-17, 8, 11, 6,-28,-14,-12; /M: SY='Y'; M=-17,-19,-29,-22,-19, 23,-26, 12, -8,-14, -5, -4,-17,-26,-13,-12,-16, -6,-13, 29, 46,-18; /M: SY='T'; M= -1, -1,-13, -9, -7,-13,-17,-16,-14, -5,-14,-11, 1,-11, -6, 0, 19, 38, -4,-30,-11, -7; /M: SY='A'; M= 24,-13,-13,-20,-14,-13,-12,-21, 2,-14, -6, -5,-10,-14,-13,-19, 9, 7, 10,-25,-15,-14; /M: SY='I'; M= -9,-30,-26,-37,-29, 1,-37,-29, 43,-29, 23, 19,-23,-23,-21,-27,-20, -9, 30,-21, -1,-29; /M: SY='S'; M= 1, 9,-15, 4, 0,-20, -3, -4,-21, -2,-29,-19, 21,-14, 1, 3, 26, 11,-16,-37,-19, 0; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='H'; M=-11, 7,-27, 2, 0,-22,-14, 21,-23, 0,-25,-12, 15, 6, 0, -2, -1, -3,-25,-31, -9, -2; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-32,-26, 4,-32,-26, 31,-26, 27, 16,-28,-28,-24,-22,-20, -6, 31,-24, -4,-26; /M: SY='P'; M= -6,-12,-31, -5, 6,-27,-17,-16,-20, -8,-27,-19,-11, 55, -5,-15, 1, 0,-24,-31,-25, -3; /M: SY='P'; M= 0, -5,-27, -2, 15,-27,-15, -8,-22, 2,-22,-15, -5, 16, 9, 1, 3, -5,-22,-27,-20, 10; /M: SY='S'; M= 4, 4,-20, 6, 8,-26,-10, -9,-21, -4,-23,-16, 2, 2, 5, -9, 14, 7,-16,-31,-19, 6; /M: SY='L'; M= -1,-28,-16,-29,-22, 4,-27,-23, 19,-25, 33, 14,-28,-28,-22,-20,-20, -6, 20,-23, -5,-22; /M: SY='G'; M= 13,-10,-25,-13,-17,-27, 52,-20,-32,-17,-25,-17, -3,-17,-17,-20, 3,-15,-22,-20,-27,-17; /M: SY='H'; M= -4, -8,-25, -9, -2,-17,-17, 7,-18, -2,-18, -9, -4, 0, 5, 3, 2, 1,-17,-21, -1, -2; /M: SY='A'; M= 9, -4,-20, -2, -1,-21,-10,-12,-14,-10,-12,-11, -4, 0, -1,-13, 7, 0,-12,-29,-17, -1; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20, 7,-27,-14, 20,-24, 42, 31,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20, 0,-17; /M: SY='R'; M=-15,-12,-28,-12, 1,-18,-22, -2,-16, 11, -4, 0, -7,-20, 16, 33,-12,-10,-16,-20, -8, 6; /M: SY='P'; M=-10,-22,-27,-20,-11, -3,-25,-20, -3,-11, -2, -3,-21, 18,-16,-13,-16, -9, -4,-21,-10,-15; /M: SY='L'; M= -7,-25,-18,-29,-22, 3,-29,-21, 23,-23, 26, 20,-24,-25,-18,-19,-17, -1, 20,-23, -3,-21; /M: SY='V'; M= 0,-18,-17,-21,-15, -3,-24,-14, 8,-15, 8, 4,-18,-22, -9,-14, -8, 3, 11,-18, 2,-13; /M: SY='P'; M= -3,-19,-25,-18,-12,-15,-22,-22, 6,-17,-11, -5,-14, 18,-13,-20, 0, -1, 3,-30,-17,-16; /M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-33,-25, 12,-33,-25, 27,-27, 21, 13,-19,-22,-21,-23,-16, -1, 17,-17, 3,-25; /M: SY='G'; M= -4,-18,-28,-19,-21,-16, 31,-21,-13,-24, -4, -5,-10,-22,-20,-21,-10,-16,-12,-20,-19,-21; /M: SY='G'; M= 6, -1,-21, -8,-13,-22, 28,-16,-26,-13,-22,-16, 6,-16,-13,-15, 8, 3,-18,-25,-22,-13; /M: SY='T'; M= -5,-16,-22,-18,-13,-11,-25,-22, 3,-16, -3, -3,-15, 12,-15,-18, -3, 13, 3,-28,-13,-16; /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-36,-27, 10,-34,-24, 34,-26, 22, 22,-22,-24,-21,-24,-20, -9, 23,-18, 2,-26; /M: SY='G'; M= -1,-14,-29,-14,-17,-12, 25, -9,-23,-15,-19,-13, -9,-11,-15,-17, -5,-14,-21, -7, 2,-18; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='L'; M= 0,-22,-17,-26,-17, 2,-23,-18, 12,-22, 30, 16,-22,-23,-15,-18,-16, -1, 7,-21, -4,-16; /M: SY='F'; M=-16,-26,-19,-35,-26, 58,-29,-20, 2,-27, 13, 2,-19,-27,-33,-19,-16, -2, 1, 0, 20,-26; /M: SY='A'; M= 44, -9,-10,-17, -9,-20, 0,-19,-11,-10,-13,-11, -7,-10, -9,-19, 14, 3, -1,-23,-20, -9; /M: SY='K'; M=-12, -2,-26, 0, 2,-22,-21,-11,-18, 23,-15, -7, -4,-16, 1, 19,-11, -9,-10,-24,-10, 0; /M: SY='E'; M= -5, -1,-24, 4, 25,-22,-19,-10,-17, -1,-17,-15, -5, 4, 4, -7, 5, 3,-14,-31,-18, 14; /M: SY='Q'; M= -5,-10,-21,-13, -5,-16,-22,-12, -1, -4, -5, 0, -8,-16, 6, -5, 1, 4, -1,-25, -9, 0; /M: SY='G'; M= -4, -1,-29, 2, -5,-31, 28,-12,-32,-11,-29,-18, 1, -4, -2,-13, 4,-11,-27,-26,-25, -4; /M: SY='P'; M= -7, -1,-32, 2, 10,-29, 12,-11,-29, -7,-27,-20, 2, 15, -4,-12, -2,-12,-30,-28,-26, 2; /M: SY='A'; M= 20, -6,-12,-14,-11, -6, -7,-15, -8,-12,-13,-10, 0,-16,-12,-15, 11, 3, -1,-25,-13,-11; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='M'; M= -4,-17,-23,-20, -9, -4,-25,-12, 9, -8, 7, 10,-17,-20, -9,-11,-14, -8, 7,-16, 3,-10; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-17,-26,-22,-31,-26, 50,-30, -7, 4,-21, 6, 1,-21,-30,-28,-16,-19, -9, 4, 11, 42,-26; /M: SY='Q'; M= -1, 0,-20, -1, 9,-29,-12, -1,-19, 0,-22, -9, 4,-10, 28, 0, 18, 9,-19,-29,-14, 18; /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-30,-21, 12,-31,-15, 21,-27, 39, 17,-27,-29,-19,-20,-27,-10, 9,-13, 12,-21; /M: SY='T'; M= 1, 0,-10, -9, -9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11, 1,-10, -9,-10, 23, 46, -1,-31,-11, -9; /M: SY='G'; M= -1, -3,-29, -6,-17,-29, 61,-16,-37,-17,-30,-20, 8,-20,-17,-17, 1,-17,-30,-23,-29,-17; /M: SY='G'; M= 12,-10,-25,-12,-18,-28, 53,-20,-33,-18,-25,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-15,-23,-20,-28,-18; /M: SY='K'; M= -4,-10,-19, -9, -1,-14,-21,-16, -6, 3, -7, -4, -9,-16, -6, -2, -1, 3, 2,-28,-11, -3; /M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-29, 63,-30,-17, 4,-27, 9, 1,-21,-30,-36,-19,-19, -9, 6, 6, 29,-29; /M: SY='N'; M= -4, 6,-18, -1, -1,-20,-13, -7,-14, 2,-20,-10, 13,-15, 5, -1, 10, 11,-10,-31,-14, 2; /M: SY='H'; M=-14, -4,-27, -4, 3,-23,-17, 33,-27, 8,-21, -7, 5,-17, 16, 26, -1, -9,-23,-26, -2, 6; /M: SY='E'; M= -9, 5,-23, 8, 16,-23,-20, 8,-19, -2,-16,-10, 1,-11, 9, -4, 2, 4,-15,-30,-10, 12; /M: SY='T'; M= 10, -8,-10,-12,-11,-12,-13,-19, -4,-12,-13, -9, -5,-15,-11,-14, 19, 21, 8,-32,-15,-11; /M: SY='Q'; M= -4, -3,-25, -3, 14,-19,-19, 1,-18, 4,-15, -8, -4,-12, 18, 5, 0, -2,-19,-16, 0, 15; /M: SY='I'; M= -6,-29,-18,-31,-25, 3,-30,-22, 28,-23, 27, 22,-27,-27,-21,-20,-20, -6, 27,-24, -4,-24; /M: SY='E'; M=-10, 1,-25, 2, 19,-25,-20, 10,-23, 6,-18, -9, 1,-10, 19, 10, 2, 3,-22,-26, -9, 18; /M: SY='F'; M=-19,-29,-23,-37,-29, 63,-31,-15, 6,-27, 10, 3,-20,-29,-33,-20,-20,-10, 2, 9, 34,-29; /M: SY='E'; M= 0, 3,-20, 4, 11,-19,-15, 2,-18, -7,-11,-11, 0,-11, 1, -9, 5, 3,-14,-30,-12, 6; /M: SY='T'; M= -1, -3,-18, -8, -5,-19, -7,-15,-17, -9,-18,-12, -1, 0, -1,-10, 14, 24,-12,-29,-16, -4; /M: SY='G'; M= -4, -2,-29, -5,-15,-28, 50, -2,-36,-16,-29,-18, 9,-20,-14,-15, 0,-17,-30,-24,-23,-15; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M=-12, -1,-30, 6, 29,-14,-12, 3,-23, 1,-16,-15, -5,-11, 7, -5, -5,-11,-25,-12, 6, 17; /M: SY='R'; M=-10, -7,-25, -8, 1, -9,-21, -6, -6, 0, -5, -4, -2,-17, -2, 2, -6, -5, -9,-20, 1, -2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-18,-33,-25, 26,-30,-22, 17,-28, 30, 12,-27,-30,-28,-20,-23, -8, 17,-14, 6,-25; /M: SY='T'; M=-10,-10, -5,-13, -9,-12,-23, 1,-13, -5,-11, -5, -7,-21, -1, 2, -2, 7, -6,-22, 1, -7; /M: SY='I'; M= -9,-27,-24,-35,-26, 1,-32,-20, 36,-23, 23, 30,-22,-22,-15,-22,-20, -9, 24,-21, -1,-23; /M: SY='T'; M= -5, 11,-19, 8, 2,-22,-14,-10,-22, 7,-22,-15, 10,-11, -1, 1, 11, 18,-14,-31,-14, 0; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-30, 0, 17,-37,-20, 22,-21, 7,-20, 0, 1,-11, 53, 9, -1,-11,-30,-21, -6, 35; /M: SY='Q'; M= -6, -7,-23, -9, 3,-20,-24,-12, -4, 2,-10, -2, -7,-13, 9, -2, -1, 4, -3,-25,-10, 6; /M: SY='F'; M= 7,-20,-19,-27,-20, 28,-18, -9, -4,-17, 0, -4,-16,-22,-20,-17, -8, -6, -3, 4, 24,-20; /M: SY='E'; M= -8, 7,-23, 10, 14,-24,-14, -5,-27, 7,-23,-17, 5,-11, 6, 14, 9, 4,-19,-31,-16, 9; /M: SY='G'; M= -3,-10,-30,-10,-17,-29, 57,-17,-39,-13,-29,-19, 0,-20,-16, -7, -1,-19,-29,-20,-27,-17; /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-29,-20, 4,-30,-20, 19,-21, 32, 15,-25,-28,-18,-10,-23, -9, 14,-21, -3,-20; /M: SY='D'; M=-14, 35,-24, 38, 6,-27, -9, -1,-23, -3,-24,-21, 26,-16, -4, -8, 2, -5,-18,-39,-19, 1; /M: SY='P'; M= -4,-13,-25,-11, -2,-14,-19,-13, -4,-11,-15, -9,-11, 12, -7,-15, 3, -1, -5,-25, -9, -7; /M: SY='D'; M=-19, 14,-34, 23, 9,-23,-16, 18,-32, -6,-24,-19, 2,-16, 0, -9,-11,-17,-30, 5, 1, 4; /M: SY='D'; M= -9, 19,-29, 25, 8,-32, 21, -7,-36, -7,-29,-23, 14,-14, -5,-11, 1,-13,-30,-31,-24, 1; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='Y'; M=-10,-14,-23,-14, -8, -5,-23, 10, -3,-10, -2, 2,-11,-22, 5, -7, -7, -6, -5,-13, 15, -3; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 19,-30,-20, 17,-30, 45, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10, 9,-16, 4,-21; /M: SY='T'; M= 2, -4,-17, -9, -7,-12,-13,-12, -8, -7, -3, -5, 1,-17, -7, -7, 4, 6, -6,-28,-12, -7; /M: SY='I'; M= -4,-23,-20,-26,-22, -4,-14,-24, 16,-24, 11, 7,-18,-24,-20,-21, -9, -5, 16,-25, -9,-22; /M: SY='D'; M=-13, 20,-28, 28, 12,-32,-14, 8,-33, 15,-29,-18, 10,-11, 5, 6, 0, -8,-24,-32,-11, 8; /M: SY='M'; M= -7,-20,-19,-28,-21, -1,-27,-18, 21,-18, 16, 24,-18,-20,-13,-17,-11, 5, 17,-23, -3,-18; /M: SY='E'; M=-10, -1,-22, -4, 6, -7,-20, 2,-14, 1,-13, -8, 1,-15, -3, -2, -2, 0,-10,-25, -5, 1; /M: SY='I'; M= -9,-30,-21,-35,-28, 14,-34,-26, 30,-27, 23, 15,-25,-26,-25,-24,-20, -7, 26,-18, 2,-28; /M: SY='S'; M= -5, 5,-21, 4, 12,-17,-11, 0,-22, 2,-23,-17, 11,-13, 5, 5, 13, 3,-19,-28, -8, 7; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-13, -7,-26, -9, 4,-15,-21, 2,-14, 7,-10, 3, -6,-16, 16, 17, -6, -2,-15,-16, 2, 8; /M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-31,-26, 4,-31,-26, 29,-25, 27, 15,-29,-29,-25,-21,-19, -5, 31,-25, -5,-26; /M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-13, -3,-25,-21,-20,-15,-13,-20,-15,-21, 74,-11,-20,-13,-10,-25,-29,-26,-11; /M: SY='E'; M= 5, 2,-22, 2, 11,-18,-13, -6,-19, -3,-17,-12, -1,-11, 11, -7, 5, -4,-17,-23,-12, 11; /M: SY='I'; M= -5,-26,-21,-30,-24, -2,-30,-26, 31,-25, 14, 12,-19,-22,-20,-23,-10, -3, 26,-25, -5,-24; /M: SY='P'; M= 5,-15,-27,-14, -6,-23, -4,-16,-15,-12,-12, -9,-14, 20, -4,-16, -6, -9,-17,-23,-21, -6; /M: SY='A'; M= 20, -8,-19,-10, 2,-17, -9,-11,-14, -7,-15,-13, -8, 2, -4,-15, 6, -1,-11,-19, -9, -3; /M: SY='D'; M=-10, 8,-29, 12, -1,-27, 6,-10,-27, -2,-21,-16, 6, -3, -7, -8, -5,-11,-24,-29,-20, -5; /M: SY='A'; M= 12, 0,-19, 0, 0,-14, 3,-13,-21,-10,-17,-16, -2,-13, -9,-15, 6, -4,-14,-23,-16, -4; /M: SY='E'; M= -6, 7,-20, 10, 14,-22,-17,-11,-19, 3,-18,-15, 1, -9, 1, -4, 8, 10,-11,-32,-15, 7; /M: SY='V'; M= 2,-28,-14,-29,-24, 1,-27,-25, 22,-23, 22, 11,-28,-28,-24,-20,-15, -4, 30,-25, -7,-24; /M: SY='H'; M=-12, -8,-24,-13,-10,-13,-25, 23, -6, -9, -8, 0, -1,-17, -2, 1, -4, 3, -7,-26, 3,-10; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-35,-28, 12,-34,-27, 32,-27, 23, 15,-25,-26,-25,-24,-19, -7, 27,-19, 1,-28; /M: SY='D'; M=-12, 10,-30, 17, 16,-32,-17, -7,-27, 6,-25,-17, 1, 14, 9, -3, -1, -3,-25,-30,-18, 11; /M: SY='D'; M=-18, 34,-32, 51, 15,-38,-12, -5,-35, -2,-30,-28, 11, 13, -2,-12, -2,-10,-30,-38,-22, 5; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21, 37,-30, 14, 0,-13, 1, 0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 27, 73,-21; /M: SY='T'; M= -1, -2,-18, -3, 6,-21,-16,-10,-15, 1,-18,-10, 0,-11, 7, -2, 13, 14, -8,-30,-14, 7; /M: SY='E'; M= -9, 4,-28, 11, 44,-28,-21, -2,-21, 6,-16,-14, -4, -5, 20, -1, -1, -9,-21,-29,-17, 32; /M: SY='E'; M= -5, -4,-22, -1, 5, -7,-20, 3,-11,-10, -4, -6, -7,-17, -6,-11, -8, -9, -7,-24, -5, -1; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 36,-30, 15, 0,-12, 1, 0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 28, 74,-21; /M: SY='V'; M= -8,-13,-20,-17,-15, -9,-25, 6, 2,-11, -4, 2, -9,-20,-10, -4, -4, 5, 8,-28, -2,-15; /M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-11, -1, -5,-23, 4,-17, 12,-14, -4, -7,-19, 14, 20,-11,-10,-18, -5, 15, 5; /M: SY='T'; M= -2, 1,-17, -1, 9,-18,-15,-11,-19, -1,-18,-15, 2, -9, 1, 1, 17, 23,-11,-31,-15, 5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='G'; M= -5, -8,-23, -8,-11,-21, 33,-11,-28, -4,-21,-13, 0,-15, -9, 5, -2,-13,-21,-15,-19,-11; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M=-10, -6,-33, 1, 3,-29,-16,-13,-25, 3,-29,-19, -7, 41, -3, 0, -3, -6,-25,-30,-23, -3; /M: SY='G'; M= 0, -1,-25, 2,-11,-29, 44,-15,-35,-15,-30,-21, 5,-17,-13,-17, 9,-10,-25,-27,-27,-12; /M: SY='Q'; M=-10,-14,-25,-14, -2,-13,-26, -6, 2, -3, -5, 2,-12,-19, 9, 1, -9, -8, 1,-17, 2, 1; /M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-24, 6,-33,-24, 29,-29, 38, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 20,-21, -1,-24; /M: SY='T'; M=-11, -9,-21,-14, -7, 2,-23, -7,-13, 1,-10, -6, -6,-17, -1, 7, -1, 11,-10,-13, 8, -5; /M: SY='S'; M= 24, -4,-10, -9, -5,-19, -3,-15,-15,-10,-19,-15, 1,-10, -5,-14, 25, 16, -5,-31,-19, -5; /M: SY='H'; M= -4,-11,-21,-11,-11,-12, -6, 4,-12, -6,-16, -7, -5,-20, -8, -7, 2, -4, -4,-22, 1,-11; /M: SY='S'; M= 9, 6,-15, 8, 4,-25, -3, -8,-22, -7,-26,-18, 8,-10, 5, -9, 26, 10,-14,-35,-19, 4; /M: SY='T'; M= 13, -5,-10,-13,-11,-13,-14,-20, -7,-11,-10, -9, -4,-12,-11,-13, 17, 29, 4,-29,-14,-11; /M: SY='R'; M=-18,-12,-28,-13, -3, -7,-22, 9,-20, 9, -9, -3, -4,-21, 8, 32,-12,-11,-17,-17, 0, 0; /M: SY='S'; M= -5, 6,-20, 8, 7,-20,-11, -5,-20, -2,-17,-15, 8,-14, 1, 3, 11, 2,-16,-33,-16, 3; /M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-33,-27, 49,-31,-12, 9,-23, 8, 3,-21,-29,-29,-18,-19, -9, 7, 7, 35,-27; /M: SY='T'; M= -5, -5,-17,-13,-11, -9,-20,-15, -2,-10, -3, -4, 0,-16, -8, -4, 5, 18, -1,-28, -9,-11; /M: SY='V'; M= -6,-26,-19,-28,-24, -2,-31,-10, 25,-22, 12, 12,-22,-26,-21,-19,-15, -6, 29,-27, -2,-24; /M: SY='D'; M=-13, 10,-25, 13, 8,-22,-17, -4,-23, 6,-16, -8, 3,-13, 3, 13, -1, 3,-16,-29,-13, 4; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='Q'; M= -6, 0,-17, -1, 5,-14,-11, -3, -5, -2,-10, -5, 3, 5, 6, -5, -2, -4,-11,-16, -9, 4; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='N'; M= 5, 4,-17, -2, -6,-21, 3, -8,-15, -8,-22,-13, 13,-16, -2, -9, 13, 2,-11,-32,-19, -4; /M: SY='Q'; M=-12,-15,-26,-16, -6,-15,-26, 3, -1, -4, 0, 5,-10,-21, 8, 8,-12,-10, -2,-23, -4, -2; /M: SY='T'; M= -1, -1,-16, -7, -8,-14,-16,-16,-10,-10,-16,-12, 2, 2,-10,-11, 14, 26, -4,-32,-15,-10; /M: SY='Y'; M= -5,-19,-26,-22,-17, -2,-23, 13, 0,-17, 0, 2,-15,-23,-10,-15,-15,-12, -2, 1, 15,-16; /M: SY='S'; M= 0, -8,-21, -8, -6,-20, -3,-13,-15, -8,-23,-14, 0, 0, -4, -5, 16, 5,-11,-32,-19, -7; /M: SY='Y'; M=-16,-22,-26,-24,-20, 21,-29, 8, 8,-15, 15, 13,-22,-29,-11,-12,-22,-10, -2, 11, 50,-19; /M: SY='T'; M= -6, -1,-20, -5, 0,-20,-17, 4,-19, 0,-17, -8, 2,-13, 12, 7, 10, 16,-14,-28, -8, 5; /M: SY='V'; M= -9,-31, -4,-34,-29, 1,-29,-29, 10,-24, 4, 0,-30,-30,-25,-23,-21,-11, 14, 14, -1,-26; /M: SY='D'; M=-16, 28,-27, 31, 11,-23,-12, 5,-28, 3,-24,-20, 22,-15, 2, 3, -1, -7,-26,-28, -7, 6; /M: SY='Q'; M=-13, 0,-30, 0, 14,-34,-20, 35,-23, 4,-20, 0, 3,-13, 46, 7, -3,-13,-30,-23, -2, 29; /M: SY='T'; M= -5, 9,-18, 5, 1,-21,-14, -7,-19, -1,-20,-14, 11,-12, 5, 2, 14, 19,-14,-32,-14, 2; /M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-39,-30, 0,-39,-30, 47,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 33,-21, -1,-30; /M: SY='T'; M= -7, -7,-18,-13, -6, -4,-22,-14,-10, -3, -6, -4, -6,-15, -2, -4, 2, 19, -6,-21, -4, -3; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24, 50,-30, 4, 0,-18, 4, 0,-20,-30,-22,-14,-20,-10, -6, 22, 60,-24; /M: SY='E'; M=-14, 17,-30, 26, 34,-34,-17, 2,-30, 9,-23,-17, 6, -7, 23, 7, -1,-10,-29,-29,-17, 28; /M: SY='E'; M= 1, 0,-26, 3, 20,-29, 8, -7,-28, -2,-23,-16, 0, -9, 9, -7, 5, -8,-25,-26,-21, 15; /M: SY='C'; M= -1,-16, 84,-26,-24,-19,-25,-27,-24,-24,-17,-17,-16,-32,-24,-26, -3, 0, -7,-43,-26,-24; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='E'; M= 1, -6,-17, -5, 6,-14,-11, -8,-12, -2, -9, -8, -6, 4, 0, 0, 0, -2,-11,-20,-13, 1; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='H'; M= -9, 4,-20, 3, 6,-17, -1, 22,-22, 0,-17, -9, 10,-12, 4, 5, -2, -9,-21,-21, -5, 3; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='R'; M= -8, 2,-28, 4, 11,-27,-16, -2,-27, 20,-21,-12, 1,-13, 14, 30, -4, -9,-21,-23,-13, 10; /M: SY='G'; M= -4, -8,-24,-10, -5, -8, 6, -2,-24, -8,-16,-11, -3,-17, -9, -3, -2, -6,-18,-19, -9, -7; /M: SY='L'; M= -5,-15,-24,-16,-12, 0,-22,-17, -1,-14, 6, -1,-15, -8,-14, -8,-14, -9, -3,-19, -6,-14; /M: SY='A'; M= 10, 0,-23, 0, 8,-25,-12, -8,-15, -3,-14, -4, -6, 0, 7,-10, 0, -7,-14,-25,-17, 7; /M: SY='P'; M= -7,-19,-27,-18,-12,-15,-12,-19, -4,-12, -8, -5,-15, 9,-13, -9, -7, -7, -4,-26,-17,-15; /M: SY='P'; M= -7, -6,-30, -2, 2,-17,-18,-12,-20, -1,-21,-14, -9, 25, 0, -8, -7, -9,-22,-22,-15, 0; /M: SY='D'; M= -4, 4,-21, 7, -2,-16,-16, 2,-13,-13, -2, -7, -2,-17, -6,-13, -2, -1,-10,-30, -8, -5; /M: SY='T'; M= -2, -6,-17, -5, 6,-16,-20,-15, -7, -1,-12, -8, -7,-13, -4, -6, 6, 10, 3,-30,-14, 1; /M: SY='Q'; M= -7, 2,-23, -1, 10,-24,-16, 1,-11, 1,-15, 1, 4,-13, 22, -1, 3, -4,-15,-28,-13, 16; /M: SY='Q'; M=-10,-10,-25,-14, -4,-16,-24, 7, -3, -3, -2, 9, -7,-16, 10, -3, -8, -4, -7,-23, -2, 2; /M: SY='L'; M= -9,-27,-20,-27,-17, 4,-29,-18, 17,-25, 37, 17,-27,-28,-13,-17,-24, -9, 12,-21, -2,-15; /M: SY='H'; M=-11, -1,-25, -3, 3,-23,-18, 19,-27, 18,-24, -9, 4,-14, 7, 19, -1, -2,-19,-26, -4, 3; /M: SY='V'; M= 12,-24,-14,-29,-24, -6,-24,-27, 23,-19, 7, 7,-22,-22,-22,-22, -7, -2, 32,-25,-11,-24; /M: SY='S'; M= -1, 12,-17, 15, 5,-25, -7, -9,-25, 0,-28,-20, 10,-10, 0, -5, 22, 13,-15,-36,-18, 2; /M: SY='R'; M= -7, -4,-22, -4, 1,-21,-12, 10,-26, 10,-25,-13, 5,-15, 6, 24, 10, 0,-17,-29,-10, 1; /M: SY='I'; M= 0,-28,-21,-34,-28, -2,-32,-29, 36,-24, 13, 13,-22,-22,-22,-25,-13, -5, 34,-24, -6,-28; /M: SY='F'; M= -5, 0,-20, -7, -3, 9,-14, -3,-13,-10,-13,-11, 8,-19, -9,-10, 2, -2,-14,-15, 6, -6; /M: SY='A'; M= 13,-16,-12,-19,-14, -9,-14,-20, 4,-17, 2, -1,-14,-19,-14,-17, 5, 3, 12,-28,-13,-14; /M: SY='D'; M= -1, 0,-22, 4, 1,-18, -8,-14,-11,-12, -2, -8, -8,-17, -9,-15, -7, -8, -6,-27,-15, -4; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21, 37,-30, 14, 0,-13, 1, 0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 27, 73,-21; /M: SY='N'; M= -7, 16,-19, 13, 3,-19,-11, -5,-12, -5,-19,-14, 19,-18, -5, -8, 6, 0, -8,-36,-18, -1; /M: SY='P'; M=-10, 3,-30, 9, 18,-30,-19, -8,-24, 5,-24,-16, -3, 19, 9, -3, -1, -1,-24,-29,-19, 12; /M: SY='E'; M=-12, 8,-27, 15, 17,-25,-17, -5,-21, 4,-19,-15, 4,-11, 5, 8, 1, -6,-17,-30,-15, 9; /M: SY='E'; M= -2, 11,-27, 19, 46,-30,-16, -3,-28, 6,-20,-20, 1, -2, 14, -4, 1, -9,-26,-30,-20, 30; /M: SY='E'; M= -1, -3,-27, -2, 12,-27, 4, -7,-28, 5,-21,-14, -1,-12, 8, 10, -1,-11,-23,-23,-19, 9; /M: SY='A'; M= 16, -9,-14,-18,-16,-12,-15,-19, 5,-13, -5, -3, -4,-17,-14,-17, 3, 5, 11,-27,-14,-16; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 40, 18,-30,-30,-22,-20,-25, -8, 20,-22, -2,-22; /M: SY='R'; M=-16, -3,-29, -6, -3,-21, -5, -1,-30, 19,-23,-13, 9,-20, 5, 48, -6,-10,-23,-23,-14, -3; /M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-34,-26, 50,-30, -9, 7,-23, 10, 9,-20,-28,-26,-17,-20,-10, 2, 8, 36,-25; /M: SY='G'; M= 16, -7,-22,-11, -6,-28, 19,-14,-24, -3,-21,-12, -4,-13, 0, -9, 2,-10,-17,-20,-21, -3; /M: SY='M'; M= 5,-23,-18,-29,-20, -2,-22,-17, 18,-19, 20, 23,-22,-22,-14,-19,-15, -7, 15,-21, -6,-18; /M: SY='T'; M= -6, 0,-19, -6, -6,-13,-16, 4,-11, -3, -9, -1, 6,-16, -2, -3, 3, 9,-10,-29, -7, -5; /M: SY='N'; M= 4, 19,-15, 6, -3,-19, -3, -3,-17, -5,-24,-17, 31,-15, -3, -6, 18, 12,-17,-36,-19, -3; /M: SY='H'; M= 1, -5,-21, -8, -1,-12,-13, 6,-20, 3,-19, -9, 0,-14, 4, 0, 5, -2,-15,-23, -5, 1; /M: SY='I'; M= 7,-23,-20,-31,-22, -4,-24,-22, 24,-21, 15, 16,-20,-20,-16,-22,-12, -6, 19,-21, -6,-21; /M: SY='G'; M= 0,-11,-20,-12,-13,-20, 10,-17,-12,-13,-15, -8, -7,-19, -7,-13, 5, 1, -3,-26,-18,-10; /M: SY='P'; M= -7,-12,-24,-14, -8,-16,-23,-18, -6, 0,-13, -7,-10, 9, -8, 0, -2, 9, -4,-26,-13,-11; /M: SY='E'; M= -2, -6,-21, -5, 5,-20, 3,-15,-15, -9,-16,-12, -6,-14, -7,-12, 5, 0, -6,-29,-19, -1; /M: SY='D'; M=-11, 7,-28, 15, 14,-27, -6, -9,-25, 0,-21,-17, -1, -2, -1, -2, -3,-10,-19,-30,-20, 5; /M: SY='G'; M= -9, 6,-26, 6, 2,-26, 8, -6,-25, -2,-22,-14, 8,-17, 2, 1, -1,-10,-20,-27,-19, 1; /M: SY='S'; M= -5, -5,-23, -1, 1,-12, -6,-14,-16,-11,-18,-14, -5, -2,-10,-14, 4, -3,-10,-28,-15, -5; /M: SY='N'; M= 2, 7,-16, -1, -6,-17, -7, -6,-13, -2,-20,-13, 18,-18, -4, 2, 11, 3, -8,-33,-17, -6; /M: SY='P'; M= 5,-15,-27,-13, -6,-25, -4,-17,-15,-10,-19,-11,-14, 24, -5,-16, -3, -8,-14,-25,-23, -7; /M: SY='C'; M= -9, -5, 46, -5, -4,-25,-21,-18,-29,-16,-24,-21, -9,-12,-13,-20, -1, -6,-18,-42,-26, -9; /M: SY='P'; M= 5, 0,-25, 2, 5,-24,-13,-13,-16, -6,-19,-15, -3, 16, -6,-14, 0, -5,-14,-30,-22, -2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 11 in 11 different sequences |
| Number of true positive hits | 10 in 10 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 1 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 90.91 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Nidogen G2 beta-barrel |
| Version [info] | 7 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
10 sequences
HMCN1_HUMAN (Q96RW7), HMCN1_MOUSE (D3YXG0), HMCN2_HUMAN (Q8NDA2), HMCN2_MOUSE (A2AJ76), NDG_DROME (A1Z877), NID1_HUMAN (P14543), NID1_MOUSE (P10493), NID2_HUMAN (Q14112), NID2_MOUSE (O88322), NID2_RAT(B5DFC9)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
1 sequence
SYL_SALAI (A8LX93) |
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
1GL4; 1H4U |