PROSITE entry PS50949

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50949
Entry name [info]	HTH_GNTR
Accession [info]	PS50949
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2003 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00042
Associated ProRule [info]	PRU00307

Name and characterization of the entry

Description [info]

GntR-type HTH domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=69;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=64;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.3032043; R2=0.0175858; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3951.6735840; R2=3.4856045; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=506; H_SCORE=5715; N_SCORE=12.2; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=182; H_SCORE=4586; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B0=-50; B1=-500; E0=-50; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R';  M= -5, -9,-23,-11, -5,-17,-17,-12, -8,  2, -9, -1, -8,-10, -1,  4, -5, -1, -5,-24,-12, -4;
/M: SY='P';  M= -6, -8,-27, -7, -2,-21,-14,-12,-17, -2,-20,-13, -5, 22, -5, -4,  0,  0,-18,-28,-17, -6;
/M: SY='L';  M= -8,-16,-23,-18, -9, -8,-24,-15,  0, -3,  5,  3,-14,-13, -8, -1,-12, -3,  0,-22, -6,-10;
/M: SY='Y';  M= -8,-14,-22,-16,-15,  7,-16,  2, -8,-11, -8, -6,-12,-22,-11,-11, -6, -3, -9,  5, 31,-15;
/M: SY='E';  M= -9, -1,-25,  0,  8,-18,-18, -4,-12, -2, -6, -5, -3,-15,  7,  0, -6, -6,-13,-25, -9,  6;
/M: SY='Q';  M= -9, -2,-27, -2, 12,-25,-18,  1,-18,  6,-15, -4, -2,-13, 26,  8, -3, -7,-20,-20,-10, 19;
/M: SY='I';  M= -3,-28,-20,-32,-26,  3,-30,-27, 29,-25, 19, 13,-24,-25,-23,-23,-16, -5, 28,-23, -4,-26;
/M: SY='A';  M=  6,-15,-21,-19,-10, -1,-17,-11, -3, -5, -4, -2,-13,-18,-10, -9, -7, -7, -1,-11,  6,-11;
/M: SY='E';  M= -5, 10,-25, 12, 19,-26,-16, -1,-21,  3,-18,-13,  4,-10, 13,  0,  1, -3,-20,-27,-13, 15;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-26, -3,  7,-20,-19, -2,-18,  8,-14, -6, -3,-14, 11, 12, -4, -5,-16,-20, -7,  8;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-24,-35,-25,  9,-34,-24, 33,-29, 33, 19,-25,-25,-21,-24,-24,-10, 20,-19,  1,-25;
/M: SY='R';  M= -6, -5,-26, -5,  6,-20,-17, -9,-20, 17,-16, -9, -3,-14,  4, 22, -5, -6,-14,-22,-12,  4;
/M: SY='E';  M= -5,  4,-24,  3, 13,-21,-14,  1,-20,  4,-17,-10,  5,-12, 12,  2,  1, -4,-20,-25,-11, 12;
/M: SY='Q';  M= -6, -2,-26,  0,  3,-19,-16, -4,-16, -1, -8, -3, -6,-16,  6,  1, -8, -9,-15,-14, -7,  4;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-26,-38,-29,  2,-38,-28, 44,-29, 22, 19,-21,-22,-21,-28,-20,-10, 27,-20,  0,-29;
/M: SY='L';  M= -4,-13,-22,-14, -7,-10,-21,-11, -1, -7,  2,  0,-10,-20, -6, -1, -8, -6,  0,-21, -8, -8;
/M: SY='S';  M= -1,  5,-21,  4,  6,-23,-10, -1,-20,  0,-20,-13,  8,-12,  5,  0, 10,  4,-16,-31,-14,  5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-25, -9,-16,-27, 48,-15,-35,-13,-26,-17,  2,-19,-15,-11,  0,-15,-26,-22,-25,-16; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -6, -5,-24, -6,  4,-18,-21, -7, -8,  1, -9, -5, -4,-14,  2,  3, -4, -4, -6,-26,-11,  2;
/M: SY='Y';  M=-14,-27,-24,-30,-23, 23,-30,-12, 12,-23, 23, 11,-25,-29,-20,-18,-24,-10,  5,  4, 24,-22;
/M: SY='K';  M= -6, -5,-26, -4,  4,-22,-14,-10,-19,  8,-15, -9, -4, -3,  4,  7, -3, -3,-16,-25,-14,  3;
/M: SY='P';  M= -1,-13,-29, -8,  1,-26,-15,-12,-18, -8,-24,-16,-13, 45, -6,-16, -4, -7,-21,-29,-23, -6;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-29, -3,-12,-30, 51,-11,-38,-16,-28,-19,  2,-18,-15,-16,  0,-17,-29,-23,-25,-14;
/M: SY='D';  M= -6, 14,-24, 20, 18,-26,-10, -3,-25,  0,-21,-16,  5, -9,  6, -6,  5, -1,-21,-29,-13, 11;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-28,-10,  1,-20,-21, -8,-18, 20,-18, -5, -5, -8,  6, 24, -8, -7,-14,-20, -9,  2;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-20,-31,-22,  7,-31,-22, 24,-29, 42, 18,-28,-28,-21,-21,-26, -9, 16,-21, -1,-22;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='P';  M= -7,-16,-32, -9, -2,-24,-16,-17,-15, -8,-23,-15,-15, 66, -9,-16, -8, -8,-22,-25,-24, -9; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S';  M=  7, -4,-17, -5, -4,-20, -5,-14,-15, -9,-22,-15,  1, -1, -5,-11, 18, 11, -8,-32,-19, -6;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='E';  M= -8,  1,-26,  6, 34,-23,-21, -6,-17,  5,-12,-11, -5, -7, 10, -1, -3, -6,-16,-27,-16, 22; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='R';  M= -9, -3,-23, -7, -2,-16,-16, -1,-18, 12,-17, -8,  5,-17,  4, 29, -2, -3,-14,-23,-10, -2; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='E';  M= -7, 10,-27, 16, 31,-27,-17, -1,-25,  5,-19,-15,  2, -5, 13,  0,  0, -6,-23,-29,-16, 21;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-21,-30,-21,  7,-31,-20, 23,-28, 42, 20,-27,-28,-18,-20,-27, -9, 12,-20,  1,-20;
/M: SY='A';  M= 23,-11, -3,-18,-11,-18, -6,-17, -9,-10,-11, -4, -9,-15, -8,-14,  7,  1,  0,-26,-17,-10;
/M: SY='E';  M=  6,  3,-21,  2, 16,-24,-13, -5,-18,  2,-16,-10,  0, -9,  7, -4,  5, -1,-15,-27,-16, 11;
/M: SY='Q';  M= -8, -4,-26, -4,  9,-21,-18, -4,-14,  5, -9, -3, -3,-14, 15,  8, -5, -7,-16,-23,-11, 11;
/M: SY='F';  M=-14,-24,-22,-28,-21, 31,-27, -9,  6,-23, 18,  7,-20,-27,-22,-16,-19, -7,  1, -3, 23,-21;
/M: SY='G';  M= -3,  3,-28,  1, -4,-28, 32, -9,-32, -7,-27,-18,  9,-16, -7,-10,  1,-13,-27,-25,-23, -5;
/M: SY='V';  M= -2,-27,-13,-30,-27,  2,-27,-27, 25,-20, 11, 12,-26,-27,-26,-20,-11,  0, 38,-26, -7,-27;
/M: SY='S';  M=  6,  5,-14,  2, -2,-21,  3, -6,-21, -8,-28,-19, 15,-12, -2, -9, 29, 14,-14,-37,-19, -2;
/M: SY='R';  M=-14,-12,-28,-13, -4,-17,-18, -7,-21, 18,-16, -8, -5,-13,  2, 43, -9, -7,-14,-21,-11, -5;
/M: SY='N';  M= -2,  0,-21, -6, -6,-17, -8, -2,-11, -9,-15, -4,  6, -8, -3,-10,  5,  5,-11,-30,-13, -6;
/M: SY='T';  M=  1, -7,-17,-12, -9,-14,-19,-20, -7,-12,-13,-10, -6,  7,-11,-14, 12, 28, -3,-30,-15,-11;
/M: SY='V';  M= -2,-29,-17,-32,-27,  1,-31,-27, 31,-24, 19, 14,-26,-26,-24,-22,-15, -4, 35,-25, -6,-27;
/M: SY='R';  M=-13, -6,-25, -8,  1,-21,-18,  1,-24, 18,-19, -9,  2,-18, 10, 43, -4, -6,-18,-23,-10,  2;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-29,  7, 30,-28,-19,  0,-27, 18,-21,-13,  0, -7, 18, 16, -2, -8,-24,-26,-15, 23;
/M: SY='A';  M= 41,-11,-11,-19,-11,-18, -1,-20, -8,-11,-10, -9,-10,-12,-11,-19, 10,  2,  3,-22,-19,-11;
/M: SY='L';  M=-13,-27,-23,-29,-21, 15,-30, -9, 17,-24, 31, 18,-25,-28,-17,-18,-25,-10,  7, -9, 18,-20;
/M: SY='R';  M= -2, -5,-23, -6,  0,-21,-15, -7,-14,  5,-14, -6, -3,-15,  5,  8,  0, -3, -9,-25,-12,  1;
/M: SY='Q';  M= -4, -4,-23, -4,  7,-20,-18, -6,-12,  2, -9, -3, -4,-14, 10,  5, -2, -3,-12,-25,-12,  8;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-30,-20,  9,-29,-19, 20,-29, 47, 21,-29,-29,-19,-20,-29,-10, 10,-20, -1,-20;
/M: SY='E';  M= -2, -5,-22, -3, 15,-20,-20,-10,-11,  1,-10, -7, -8,-12,  4, -2, -1, -3, -5,-27,-14,  9;
/M: SY='A';  M=  7, -2,-21, -4,  7,-22,-12, -8,-17,  1,-17,-11, -2,-11,  5, -1,  5,  0,-12,-23,-15,  5;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-27, 12, 24,-26,-17, -4,-22,  9,-16,-11,  2, -9, 11,  3, -3, -8,-20,-28,-15, 17;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-29, -7,-14,-29, 51,-13,-37,-12,-29,-18,  2,-19,-13,-11,  0,-17,-28,-21,-25,-14;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-23,-30,-22,  9,-29,-17, 17,-23, 28, 13,-27,-28,-19,-19,-24,-10, 10, -4, 10,-21;
/M: SY='I';  M= -3,-29,-18,-32,-26,  1,-31,-27, 31,-25, 21, 14,-26,-26,-23,-23,-16, -5, 31,-24, -5,-26;
/M: SY='E';  M= -8, -6,-25, -5, 12,-13,-22, -6,-12,  1,-10, -7, -6,-13,  7, -1, -2, -2,-12,-18, -3,  8;
/M: SY='T';  M=  0,-13,-19,-17,-11,-12,-19,-16, -4, -3, -8, -2, -9,-13, -7,  2,  1,  6,  2,-25,-11,-10;
/M: SY='R';  M= -8, -9,-25,-11, -2,-16,-20, -9,-12,  8, -9, -4, -5,-18,  3, 18, -7, -7, -8,-21, -9, -1;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Q';  M=-10, -4,-29, -2,  3,-26,-14,  1,-22,  5,-22,-11, -2,  6, 10,  9, -3, -7,-22,-24,-13,  5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M= -5, -7,-29, -8,-10,-27, 33,-10,-33, -3,-26,-15,  1,-18, -4,  2, -2,-15,-26,-20,-20, -8;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R';  M= -4, -5,-23, -7, -2,-20, -8, -7,-18,  7,-19, -9,  0,-16,  1, 12,  2, -4,-12,-25,-12, -2;
/M: SY='G';  M=  1,-10,-29, -9,-18,-29, 60,-19,-37,-18,-29,-19, -1,-16,-19,-18,  0,-18,-28,-21,-29,-19;
/M: SY='T';  M=  1,-12,-14,-19,-15,  1,-20,-17, -3,-15, -7, -7, -9,-17,-14,-15,  6, 17,  1,-11,  2,-15;
/M: SY='F';  M=-14,-22,-23,-27,-21, 29,-27, -9,  0,-14,  2,  1,-17,-26,-20, -8,-14, -5,  1,  2, 22,-20;
/M: SY='V';  M= -2,-29,-12,-32,-30,  1,-31,-30, 32,-22, 11, 11,-27,-28,-28,-22,-12, -2, 43,-27, -8,-30;
/M: SY='A';  M=  4, -6,-17,-10, -3,-17,-14,-10,-12,  0,-12, -7, -2,-13, -2,  3,  3,  2, -7,-27,-14, -4;
/M: SY='E';  M= -6,  5,-26,  7, 11,-25,-11, -6,-25,  6,-23,-16,  4, -2,  4,  7,  2, -3,-21,-27,-17,  6;
/M: SY='R';  M=-10,-12,-26,-13, -5,-10,-22,-11, -6, -2, -6, -2, -9, -4, -4,  2,-10, -7, -6,-23, -9, -6;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	235 in 235 different sequences
Number of true positive hits	235 in 235 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	1
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	99.58 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	window20
Author [info]	PS_Langendijk_Genevaux
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	HTH gntR-type
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

235 sequences

AIRSR_SALTY (Q8ZKR0), ARAR_BACSU  (P96711), ARAR_GEOSE  (Q9S470),

ARAR_HALH5  (Q9KBQ0), BPHR_PARXL  (P37335), DASR_STRAW  (Q82IW0), 
DASR_STRCO  (Q9K492), DASR_STRGR  (Q8VV01), DGOR_ECOLI  (P31460), 
EXUR_DICCH  (Q9X9E0), EXUR_ECO57  (P0ACL3), EXUR_ECOLI  (P0ACL2), 
EXUR_SHIFL  (P0ACL4), FADR_CROS8  (A7MKD4), FADR_ECO24  (A7ZKV8), 
FADR_ECO27  (B7UQ71), FADR_ECO45  (B7MK84), FADR_ECO55  (B7LGU7), 
FADR_ECO57  (P0A8V8), FADR_ECO5E  (B5YXL1), FADR_ECO7I  (B7NJF3), 
FADR_ECO81  (B7MTW5), FADR_ECO8A  (B7LXA1), FADR_ECOBW  (C4ZTM8), 
FADR_ECODH  (B1XA74), FADR_ECOHS  (A7ZZC1), FADR_ECOK1  (A1AAB0), 
FADR_ECOL5  (Q0TII8), FADR_ECOL6  (P0A8V7), FADR_ECOLC  (B1IUA5), 
FADR_ECOLI  (P0A8V6), FADR_ECOLU  (B7N3Z1), FADR_ECOSE  (B6I9P8), 
FADR_ECOSM  (B1LHY0), FADR_ECOUT  (Q1RCQ9), FADR_EDWI9  (C5B9W3), 
FADR_ENT38  (A4WBF4), FADR_ERWT9  (B2VJ49), FADR_ESCF3  (B7LSJ7), 
FADR_HAEI8  (Q4QNB9), FADR_HAEIE  (A5UA62), FADR_HAEIG  (A5UGT9), 
FADR_HAEIN  (P44705), FADR_KLEP3  (B5XQ79), FADR_KLEP7  (A6TAW6), 
FADR_PASMU  (Q9CPJ0), FADR_PECAS  (Q6D4N0), FADR_PECCP  (C6DG46), 
FADR_PHOLL  (Q7N3Z5), FADR_PROMH  (B4EXU3), FADR_SALA4  (B5F4E2), 
FADR_SALAR  (A9MP58), FADR_SALDC  (B5FTM9), FADR_SALEP  (B5R2W5), 
FADR_SALG2  (B5R8Z6), FADR_SALHS  (B4TKD5), FADR_SALNS  (B4SUJ7), 
FADR_SALPA  (Q5PCU3), FADR_SALPB  (A9MVW4), FADR_SALPC  (C0Q329), 
FADR_SALPK  (B5BI48), FADR_SALSV  (B4TXX5), FADR_SALTI  (Q8Z685), 
FADR_SALTY  (Q8ZP15), FADR_SERP5  (A8GFF9), FADR_SHEAM  (A1S6X3), 
FADR_SHEB2  (B8EAH2), FADR_SHEB5  (A3D3H2), FADR_SHEB8  (A6WM75), 
FADR_SHEB9  (A9KY80), FADR_SHEDO  (Q12NQ7), FADR_SHEFN  (Q083H2), 
FADR_SHEHH  (B0TRI9), FADR_SHEON  (Q8ED80), FADR_SHEPA  (A8H5C1), 
FADR_SHEPC  (A4Y625), FADR_SHESA  (A0KVP9), FADR_SHESM  (Q0HJX1), 
FADR_SHESR  (Q0HW67), FADR_SHIB3  (B2TZB3), FADR_SHIBS  (Q31ZM8), 
FADR_SHIDS  (Q32H29), FADR_SHIFL  (P0A8V9), FADR_SHISS  (Q3Z2W1), 
FADR_VIBC3  (A5F6Z2), FADR_VIBCH  (Q9KQU8), FADR_VIBCM  (C3LNK4), 
FADR_VIBPA  (Q87N05), FADR_VIBVU  (Q8DAG8), FADR_VIBVY  (Q7MJP0), 
FADR_YERE8  (A1JQP6), FADR_YERP3  (A7FI94), FADR_YERPA  (Q1C7V2), 
FADR_YERPB  (B2K3Q1), FADR_YERPE  (Q8ZEL9), FADR_YERPG  (A9R9D5), 
FADR_YERPN  (Q1CJ88), FADR_YERPP  (A4TJC6), FADR_YERPS  (Q66AQ8), 
FADR_YERPY  (B1JLH6), FRLR_ECO57  (Q8X835), FRLR_ECOLI  (P45544), 
FRLR_SHIFL  (Q83PX4), GABR_BACSU  (P94426), GAMR_BACSU  (O31459), 
GLAR_ECOLI  (P37338), GLCC_ECOL6  (P0ACL6), GLCC_ECOLI  (P0ACL5), 
GMUR_BACSU  (O05509), GNTR_BACLI  (P46833), GNTR_BACSU  (P10585), 
GNTR_PAENI  (Q8GAL4), HUTC_KLEAE  (P12380), HUTC_PSEAE  (Q9HU78), 
HUTC_PSEPU  (P22773), KORA_STRLI  (P22405), LLDR_ECOLI  (P0ACL7), 
LLDR_SHIFL  (P0ACL8), LUTR_BACSU  (O07007), MCBR_ECOLI  (P76114), 
MCE2R_MYCTO (P9WMG4), MCE2R_MYCTU (P9WMG5), MNGR_ECOLI  (P13669), 
MOCR_RHIML  (P49309), NAGR_BACSU  (O34817), NANR_CITRI  (D2TP58), 
NANR_CROS8  (A7MJD3), NANR_ECO27  (B7UJV9), NANR_ECO45  (B7MBY8), 
NANR_ECO55  (B7LHT2), NANR_ECO57  (Q8X4W4), NANR_ECO7I  (B7NKT7), 
NANR_ECO81  (B7N0Z9), NANR_ECO8A  (B7M0T8), NANR_ECOBW  (C4ZSW4), 
NANR_ECODH  (B1XHJ9), NANR_ECOK1  (A1AGC0), NANR_ECOL5  (Q0TCP0), 
NANR_ECOL6  (Q8FD57), NANR_ECOLC  (B1IQQ3), NANR_ECOLI  (P0A8W0), 
NANR_ECOLU  (B7NDK4), NANR_ECOSE  (B6I1U4), NANR_ECOUT  (Q1R6B4), 
NANR_EDWTF  (E0T5H9), NANR_ENT38  (A4WF39), NANR_KLEAK  (G0E1Z6), 
NANR_SALAR  (A9MNY5), NANR_SALBC  (F8VI19), NANR_SALCH  (Q57JC8), 
NANR_SALEP  (B5R0L3), NANR_SALG2  (B5RET8), NANR_SALNS  (B4T751), 
NANR_SALPA  (Q5PJS9), NANR_SALPC  (C0PZN5), NANR_SALPK  (B5BGP6), 
NANR_SALSV  (B4TWJ1), NANR_SALTI  (P67736), NANR_SALTY  (P67735), 
NANR_SHIBS  (Q31W95), NANR_SHIDS  (Q32BB3), NANR_SHIFL  (P0A8W1), 
NANR_SHISS  (Q3YX22), NORG_STAA3  (Q2FKF1), NORG_STAA8  (Q2G1P1), 
NORG_STAAB  (Q2YUS3), NORG_STAAC  (Q5HJR1), NORG_STAAM  (Q99XA5), 
NORG_STAAN  (Q7A875), NTRA_AMIAI  (P54988), PDHR_ECO57  (P0ACM1), 
PDHR_ECOL6  (P0ACM0), PDHR_ECOLI  (P0ACL9), PDHR_SALTI  (P0A2S3), 
PDHR_SALTS  (E1W823), PDHR_SALTY  (P0CL10), PDXR_CORGL  (Q8NS92), 
PHNF_ECOLI  (P16684), PHNF_MYCS2  (A0QQ72), PHNR_SALCH  (Q57SD4), 
PHNR_SALPA  (Q5PFQ9), PHNR_SALTI  (P96061), PHNR_SALTY  (Q7CR30), 
PTSJ_SALTY  (P40193), R1152_MYCS2 (A0R2N2), R1152_MYCTU (O06550), 
RMPR_MYCGS  (Q9LBW6), RSPR_ECOLI  (P0ACM2), SMOD_AGRFC  (A9CEY8), 
TAUR_RHOCB  (D5AKX9), TRER_BACSU  (P39796), UXUR_ECOLI  (P39161), 
UXUR_HAEIN  (P44487), Y043_MYCTO  (P9WMG8), Y043_MYCTU  (P9WMG9), 
Y044_MYCBO  (P67738), Y101_MYCGE  (P47347), Y239_MYCPN  (P75532), 
Y3073_CERS4 (Q01856), Y4628_STRCO (Q04296), Y494_MYCTO  (P9WMG6), 
Y494_MYCTU  (P9WMG7), Y505_MYCBO  (P67740), Y601_MYCBO  (P67742), 
Y6150_RHIME (O86029), Y792_MYCTU  (O86331), YCBG_BACSU  (P42239), 
YCXD_BACSU  (Q08792), YDCR_ECOLI  (P77730), YDEF_BACSU  (P96663), 
YDEL_BACSU  (P96669), YDFD_BACSU  (P96681), YDFH_ECO57  (P0ACM3), 
YDFH_ECOL6  (Q8FHD1), YDFH_SHIFL  (P0ACM4), YDHC_BACSU  (O05494), 
YEGW_ECO57  (P0ACM7), YEGW_ECOL6  (P0ACM6), YEGW_ECOLI  (P0ACM5), 
YEGW_SHIFL  (P0ACM8), YHCF_BACSU  (P54590), YHDI_BACSU  (O07578), 
YIDP_ECOLI  (P31453), YIEP_ECOLI  (P31475), YIHL_ECO57  (P0ACN0), 
YIHL_ECOLI  (P0ACM9), YIHL_SHIFL  (P0ACN1), YIN1_STRAM  (P32425), 
YISV_BACSU  (Q796Q6), YJIR_ECOLI  (P39389), YMFC_BACSU  (O31761), 
YTRA_BACSU  (O34712), YTUX_AGRVI  (P70790), YURK_BACSU  (O32152), 
YYDK_BACSU  (Q45591)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

1 sequence

LGOR_ECOLI  (P39399)

PDB
[Detailed view]

28 PDB

1E2X; 1H9G; 1H9T; 1HW1; 1HW2; 2WV0; 3BWG; 3F8M; 4EGY; 4EGZ; 4H0E; 4MGR;
» more