PROSITE entry PS50939

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50939
Entry name [info]	CYTOCHROME_B561
Accession [info]	PS50939
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-OCT-2003 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50939
Associated ProRule [info]	PRU00242

Name and characterization of the entry

Description [info]

Cytochrome b561 domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=202;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=197;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.5680041; R2=0.0213224; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8818.9765625; R2=16.2176704; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=302; H_SCORE=13717; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=138; H_SCORE=11057; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M= -1,-19,-20,-22,-15,  3,-20,-17,  5,-17,  9,  5,-16,-18,-14,-15,-10, -5,  4,-19, -4,-15;
/M: SY='A';  M=  4,-12,-10,-15,-11,-10,-10,-17, -6,-15, -4, -6, -8,-15,-13,-14,  1,  3, -2,-28,-14,-12;
/M: SY='Q';  M=-10, -1,-25, -2,  4,-19,-13,  4,-17,  0,-13, -7,  3,-14,  6,  5, -3, -4,-17,-25, -8,  3;
/M: SY='L';  M= -5,-20,-15,-22,-18,  1,-21,-17,  8,-21, 13,  6,-17,-22,-18,-16,-11, -4,  9,-24, -6,-18;
/M: SY='L';  M= -5,-17, -9,-21,-17,  0,-20,-13,  3,-20,  8,  3,-13,-24,-15,-16, -9, -4,  3,-25, -5,-16;
/M: SY='G';  M=  1, -4,-23, -6, -9,-19, 14, -9,-23, -8,-21,-13,  3,-12, -8, -6,  4, -7,-18,-24,-16,-10;
/M: SY='H';  M=-10,-15,-23,-18,-13, -2,-20, 11, -2,-16,  4,  5,-10,-22, -7,-10,-10, -5, -4,-20,  6,-11;
/M: SY='T';  M=  1,-10,-16,-15,-11,-13,-14,-13, -1,-12, -4, -1, -6,-17, -8,-13,  1,  3,  0,-27,-11,-10;
/M: SY='T';  M=  0,-12, -4,-15,-12,-11,-17,-18, -5,-15, -4, -3,-12,-20,-12,-16, -1,  3,  1,-20,-11,-12;
/M: SY='I';  M=  1,-14,-19,-18,-14, -9,-21, -9,  8,-16,  4,  3,-10,-19,-11,-16, -4,  0,  7,-26, -6,-14;
/M:         M= -1, -7,-18,-10,-11,-13,-11,-12, -4,-13, -8, -5, -3,-16, -9,-12,  0, -2, -2,-27,-12,-11;
/M: SY='L';  M=-10,-19,-23,-19,-12,  3,-21,-12,  2,-17, 12,  5,-18,-17,-12,-12,-15, -8,  0,-19, -1,-12;
/M: SY='V';  M= -2,-13,-18,-19,-17, -7,-23,-18, 12,-11,  3,  6, -8,-21,-14,-11, -6,  1, 13,-27, -9,-16;
/M: SY='T';  M=  2,-12,-18,-16,-12, -8,-10,-15, -6,-17, -1, -4, -9,-11,-12,-16,  3, 10, -4,-25,-10,-13;
/M: SY='V';  M= -2,-17,-17,-21,-18,  1,-19,-16,  7,-15,  1,  1,-14,-22,-16,-14, -4,  3, 12,-19,  1,-18;
/M: SY='W';  M= -3,-20,-29,-23,-15,  5,-15,-15,-13,-14,-11,-11,-19,-19,-15,-14,-14,-12,-13, 36,  9,-13;
/M: SY='I';  M= -4,-18,-18,-24,-17,  2,-22,-18,  9,-16,  7,  8,-14,-20,-13,-13, -6,  3,  9,-21, -4,-16;
/M: SY='L';  M= -4,-13,-20,-17,-14, -3,-10,-15,  0,-17,  2,  1, -7,-18,-13,-15, -5, -3, -1,-23, -7,-14;
/M: SY='Y';  M=-10,-10,-24,-12, -9, -1,-21, -3, -3,-10, -2, -2, -7,-20, -8,-10, -9, -5, -5,-14,  5, -9;
/M: SY='Y';  M=-10,-14,-23,-17,-14,  8,-23, -4, -2,-10,  1,  2,-11,-19,-12,-10,-11, -2, -3, -9, 13,-14;
/M: SY='R';  M= -4, -8,-12,-10, -4,-15,-18,-12,-16,  0,-12, -9, -5,-10, -4,  8,  0,  4, -9,-27,-13, -6;
/M: SY='G';  M=  3, -2,-21, -5, -7,-19,  6,-13,-17,-10,-13,-11,  1,-16, -7,-10,  5,  0,-13,-27,-17, -7;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-20,-10,-12,-22, 31,-16,-27,-13,-22,-15, -3,-18,-12,-11,  2, -9,-19,-17,-21,-12; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='A';  M=  5, -9,-16,-12,-12, -9, -2,-16, -5,-12, -7, -6, -5,-17,-13,-13,  2,  0,  0,-23,-12,-13; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='L';  M= -1,-14,-21,-15,-10, -6,-12,-16, -3,-15,  4, -1,-13,-20,-10,-14, -8, -6, -2,-16, -8,-10;
/M: SY='S';  M=  0,  0,-22,  0, -2,-16,  0,-12,-20, -9,-20,-15,  1,-15, -6,-12,  5, -1,-15,-16,-13, -4;
/M: SY='R';  M= -5, -7,-26, -7, -3,-16, -9, -3,-19,  1,-14, -9, -3,-17, -2,  2, -4, -7,-16, -9, -6, -3;
/M: SY='S';  M= -4,  7,-21, 10,  6,-23,-10, -1,-22, -6,-22,-16,  6, -6,  4, -8, 14,  7,-17,-32,-13,  4;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G';  M= -6,  2,-22,  0, -6,-17,  8, -9,-23, -2,-22,-14,  7,-13, -5, -3,  2, -4,-19,-17,-13, -6; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='P';  M= -4, -6,-19, -5, -1,-15,-10, -8,-14,  0,-13, -9, -3,  5, -2, -1,  3,  1,-12,-23,-12, -3; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='S';  M= -2, -1,-17,  0, -1,-14, -1, -5,-17,  2,-17,-11,  3,-11, -1,  5,  6, -1,-12,-18, -8, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M:         M= -4, -9,-17,-10, -4, -9,-13, -5, -5, -3,  0, -1, -7, -6,  0, -1, -7, -3, -7,-14, -4, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='L';  M= -6,-15,-18,-15, -4, -3,-19,-13,  7,-12, 10,  5,-14,-13, -7,-11,-11, -6,  3,-18, -5, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='F';  M= -9,-16,-19,-20,-13, 17,-22,-14,  4,-11,  5,  2,-12,-18,-15, -9,-12, -7,  2, -9,  6,-14; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='N';  M= -3,  4,-23, -3, -3,-21, -5, -7,-18,  6,-22,-12, 12,-16,  2,  5,  3, -2,-16,-24,-15, -1;
/M: SY='L';  M= -4,-24,-25,-26,-18, -2,-20,-20,  3,-16,  8,  3,-23,-20,-14,-16,-17, -7,  2,  7,  1,-16;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='P';  M=  9,-14,-28,-13,-10,-26, 16,-19,-23,-13,-23,-15,-10, 23,-13,-20, -2,-11,-21,-24,-26,-13;
/M: SY='I';  M= -4,-27,-20,-32,-24, 15,-27,-23, 17,-24, 16, 10,-23,-25,-23,-21,-16, -7, 15, -7,  3,-23;
/M: SY='L';  M=-12,-27,-15,-31,-23, 20,-28,-14, 14,-24, 29, 21,-25,-28,-20,-18,-24, -9,  9,-13,  9,-21;
/M: SY='M';  M= -3,-11,-13,-21,-16, -6,-17, -6,  8,-11,  8, 28, -8,-20, -4,-11,-11, -4,  4,-25, -7,-10;
/M: SY='I';  M= -1,-20,-18,-27,-22,  0,-18,-22, 11,-20,  3,  5,-16,-20,-18,-20, -7,  1, 10,-13, -4,-20;
/M: SY='L';  M= -4,-26,-18,-32,-23, 13,-28,-23, 19,-25, 21, 12,-22,-24,-22,-22,-18, -6, 13,-14,  1,-23;
/M: SY='G';  M= 16, -9,-22,-12,-15,-26, 41,-19,-29,-16,-24,-17, -2,-16,-15,-19,  8, -9,-19,-22,-26,-15;
/M: SY='W';  M=-17,-32,-32,-37,-27, 33,-24,-21, -4,-23,  2,  2,-28,-28,-24,-18,-27,-16,-10, 58, 22,-22;
/M: SY='V';  M= -6,-22,-20,-25,-24, -4, -2,-20,  4,-22, -1,  3,-15,-23,-20,-21,-10,-10,  6,-16, -8,-23;
/M: SY='F';  M=-11,-26,-20,-32,-26, 30,-27,-21, 13,-25, 15,  6,-21,-27,-28,-20,-16, -4, 13, -9, 11,-26;
/M: SY='L';  M=-11,-27, -8,-31,-23, 20,-29,-20, 12,-28, 29, 13,-24,-29,-24,-20,-22, -6,  7,-17,  3,-22;
/M: SY='M';  M= -4,-19,-20,-24,-18, -1,-21,-11, 13,-15, 10, 20,-16,-21, -8,-14,-11, -3, 10,-19,  1,-13;
/M: SY='P';  M=  3,-12,-29,-10, -9,-27, 18,-18,-25,-14,-26,-17, -7, 20,-11,-18,  1, -8,-23,-25,-26,-12;
/M: SY='E';  M= -5, -4,-24, -4, 11,-15,-18,-12, -4, -8, -6, -6, -4,-13, -1,-11, -4, -6, -5,-27,-13,  4;
/M: SY='G';  M= 22,-10,-20,-14,-14,-24, 30,-19,-22,-15,-20,-14, -4,-15,-14,-19,  7, -8,-13,-22,-24,-14;
/M: SY='I';  M=  0,-25,-21,-32,-23,  3,-28,-22, 26,-23, 19, 18,-21,-22,-18,-22,-16, -7, 19,-20, -3,-22;
/M: SY='L';  M= -7,-27,-21,-32,-22,  4,-29,-19, 26,-25, 33, 26,-25,-25,-16,-20,-23, -9, 16,-21, -1,-20;
/M: SY='V';  M=  3,-23,-12,-28,-22,  7,-24,-24, 14,-22,  7,  4,-19,-23,-22,-21, -6, -1, 19,-22, -5,-22;
/M: SY='Y';  M=  8,-14,-16,-20,-14,  3,-17,  2, -7,-11, -6, -4,-12,-20, -9,-12, -5, -6, -6, -6, 17,-13;
/M: SY='R';  M=-16, -7,-28, -8, -1,-18,-18,  3,-26, 21,-21,-11,  2,-15,  7, 47, -5, -6,-19,-20, -6, -1;
/M: SY='Y';  M= -9,-16,-23,-17,-15,  4,-19, -5, -2,-13,  0, -1,-15,-18,-12,-13, -8, -2, -2, -7, 18,-16;
/M: SY='F';  M= -7,-22,-16,-26,-18, 13,-14,-18, -1,-21,  6,  3,-18,-20,-20,-18,-14,-10, -1, -9,  1,-18;
/M: SY='R';  M=-13, -5,-28, -6,  0,-19,-17, -2,-24, 18,-22,-11,  1,-11,  5, 28, -6, -6,-20,-13, -6,  0;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='P';  M= -4, -6,-13, -6, -3,-12,-12, -9, -7, -6, -8, -5, -5,  1,  0, -7,  0,  0, -7,-15, -9, -2; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M:         M= -6, -2,-10, -4, -4, -5,-10, -2, -9, -1,-10, -5,  0, -8, -2, -1, -1, -1, -8, -7, -2, -3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M:         M= -5, -8,-17,-10, -6, -2, -8, -6, -7, -6, -6, -4, -4,-10, -6, -4, -3, -4, -7, -8, -1, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M:         M= -7,-13,-12,-15,-12, -7,-15,-12, -4,-15,  0, -2,-11,-22,-12,-12, -8, -5, -3,-22, -3,-13;
/M: SY='S';  M=  2, -7,-22, -8, -5,-20,  2,-13,-20, -1,-20,-13, -3,-13, -6, -3,  5, -1,-13,-20,-15, -6;
/M: SY='K';  M=-11,  2,-27,  5,  5,-24,-12, -1,-24, 11,-19,-10,  0,-11,  3, 11, -5, -6,-18,-26,-12,  3;
/M: SY='P';  M= -7, -7,-28, -7, -2,-18,-19,-12,-13,  1,-12, -8, -5,  9, -3,  1, -9, -8,-15,-25,-14, -5;
/M: SY='T';  M= -3,-13,-19,-18,-15, -4,-17,-14,  0,-11,  0,  0, -9,-19,-11, -7, -5,  3,  3,-20, -3,-14;
/M: SY='W';  M=-11,-23,-34,-24,-16, -3,-17,-20,-15, -5,-11, -9,-22,-23, -9, -5,-21,-15,-17, 50,  8,-10;
/M: SY='F';  M=-12,-11,-23,-18,-11, 21,-22,-13,-11,  1, -9, -5, -5,-20,-14, -1, -9, -5, -9, -9,  8,-11;
/M: SY='Y';  M= -7,-15,-24,-17,-10, -1,-22, -1, -5, -5,  0,  1,-12,-21, -1,  2,-11, -5, -8, -6, 14, -7;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-19,-33,-24,  6,-30,-25, 24,-26, 23, 12,-24,-25,-21,-23,-19, -7, 17,-14, -1,-24;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='M';  M=  4,-19,-21,-24,-17, -8,-15,-16,  1, -8,  1,  7,-17,-20,-10, -3,-10, -7,  4, -8, -7,-14;
/M: SY='A';  M=  8,-17,-18,-20,-18, -6, -9,-20,  3,-18,  0, -1,-14,-20,-17,-19, -3, -2,  8,-19, -9,-18;
/M: SY='L';  M= -6,-24,-14,-27,-20,  6,-24,-20, 13,-26, 26, 12,-22,-26,-19,-20,-19, -8,  9,-21, -3,-20;
/M: SY='H';  M=-11,  0,-27, -3,  4,-26,-12, 27,-18, -2,-15,  3,  5,-16, 25,  1, -4,-11,-24,-25, -4, 13;
/M: SY='L';  M= -1,-22,-15,-28,-21,  3,-22,-21, 13,-22, 15, 11,-18,-22,-18,-20,-11, -2, 10,-21, -4,-20;
/M: SY='V';  M= -3,-22,-13,-26,-21,  0,-24,-22, 15,-21, 15, 10,-20,-24,-19,-18, -9,  4, 18,-25, -6,-21;
/M: SY='G';  M= 24, -9,-18,-14,-14,-23, 25,-20,-21,-14,-19,-14, -5,-14,-14,-19,  8, -3,-11,-22,-23,-14;
/M: SY='F';  M=-10,-27,-22,-31,-25, 24,-21,-20, 10,-25, 13,  5,-22,-27,-26,-20,-18, -9,  9, -4, 10,-25;
/M: SY='I';  M=  2,-22,-17,-26,-21, -4,-17,-24, 11,-22,  7,  3,-18,-19,-19,-21, -9, -4, 11,-17, -8,-21;
/M: SY='L';  M= -8,-26,  7,-30,-23,  5,-29,-22, 11,-27, 23, 10,-24,-29,-22,-22,-19, -8,  9,-25, -6,-23;
/M: SY='G';  M=  7,-13,-21,-17,-17,-16, 19,-19,-13,-16,-12, -5, -8,-18,-14,-18,  0, -5, -6,-21,-18,-16;
/M: SY='V';  M=  3,-23, -9,-28,-22, -1,-26,-25, 17,-22, 14,  7,-21,-24,-21,-21,-10, -1, 20,-25, -8,-22;
/M: SY='V';  M=  8,-20,-17,-27,-20, -2,-19,-23, 13,-20,  8,  5,-17,-20,-18,-21, -6,  1, 14,-21, -7,-20;
/M: SY='G';  M=  8, -9,-20,-11,-17,-27, 49,-19,-33,-18,-27,-18, -1,-18,-17,-19,  5,-13,-23,-23,-27,-17;
/M: SY='I';  M= -4,-26,-17,-31,-24, 10,-26,-22, 18,-24, 16, 10,-22,-25,-22,-22,-16, -7, 16,-14,  2,-24;
/M: SY='V';  M= -4,-23,-17,-25,-21,  1,-19,-21,  8,-18,  9,  4,-20,-25,-19,-17,-13, -5, 11,-14, -1,-21;
/M: SY='A';  M=  8,-20, -7,-26,-19, -1,-16,-22,  5,-21,  8,  2,-16,-21,-18,-21, -7, -3,  6,-21, -8,-19;
/M: SY='V';  M=  3,-16,-22,-20,-16,-15, -7,-21,  2, -9, -7, -1,-12,-15,-12,-13, -4, -6,  6,-23,-13,-15;
/M: SY='F';  M=-11,-26,-21,-32,-23, 33,-28,-21, 10,-25, 15,  6,-21,-26,-26,-20,-17, -6,  7, -4, 11,-23;
/M: SY='V';  M= -6,-11,-24,-12, -9,-12,-23,-13,  2, -4, -6,  0,-10,-17, -6, -6, -7, -4,  3,-17, -4, -9;
/M: SY='Y';  M= -9, -7,-21,-10, -4,  1,-18,  2, -9,-10, -5, -3, -1,-20, -1, -6, -1, -2,-12,-17,  6, -3;
/M: SY='H';  M=-11, -3,-26, -5, -2,-15,-14, 20,-20,  4,-14, -4,  1,-17,  1,  4, -7, -8,-18,-22,  1, -2;
/M: SY='N';  M= -9, 18,-24, 15,  7,-24, -3,  6,-24, -1,-23,-16, 22,-15,  2, -3,  3, -5,-24,-33,-16,  4;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-28, -5, -3,-14,-11, -7,-18, -1,-15,-10, -3,-19, -2,  1, -9,-11,-16,  0, -6, -2;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='S';  M=  1, -8,-17,-11, -8,-10, -9, -8, -8, -6, -8, -5, -3,-16, -7, -4,  3,  1, -4,-24,-10, -8; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='H';  M= -8, -4,-19, -5, -4, -8, -1,  7,-15, -2,-13, -7,  0,-10, -3, -1, -6, -9,-15,  1, -1, -4; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M:         M= -2, -8,-19, -9, -7, -7,-16,-13,  0, -9, -2, -3, -9, -7, -8,-11, -6, -1, -2, -8, -4, -8; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='P';  M=  4, -7,-20, -8, -5,-17, -4,-13,-11, -7,-13, -9, -7,  7, -6,-11, -1, -4,-10,-15,-14, -6; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='N';  M= -9,  8,-21,  2, -5,-10, -9, 13,-12, -6,-15, -8, 15,-15, -4, -6, -2, -6,-15,-19, -1, -6; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='F';  M=-10,-18,-22,-22,-17, 14,-20,-15, -1,-17,  7,  4,-14,-24,-16,-12,-13, -6, -2, -2,  4,-15;
/M: SY='Y';  M= -8,-10,-22,-13,-14,  0,-18, -3, -4, -9, -8, -5, -8,-22,-10, -9, -4,  1, -2, -6, 15,-14;
/M: SY='S';  M=  1,  2,-17,  1,  0,-21, -3, -7,-20, -6,-25,-16,  7, -8, -1, -8, 20, 12,-13,-34,-17, -1;
/M: SY='L';  M= -6,-20,-22,-23,-15,  0,-23,-14,  2,-12, 14,  6,-18,-24,-13, -8,-17, -6,  1, -7,  0,-14;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='S';  M=  4, -6,-19, -8, -5,-18,  2,-12,-21, -5,-22,-14,  0,-12, -2, -1, 14,  5,-13,-27,-17, -4;
/M: SY='W';  M=-10,-19,-34,-19,-15, -7,-13,-17,-13, -7,-13,-10,-17,-22, -8, -5,-18,-16,-16, 37,  6,-11;
/M: SY='L';  M= -7,-26,-10,-31,-23,  6,-30,-23, 20,-27, 24, 12,-23,-26,-21,-22,-18, -5, 16,-23, -3,-23;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-30, -9,-19,-30, 67,-19,-39,-19,-30,-20,  2,-20,-19,-19,  0,-19,-30,-21,-30,-19;
/M: SY='I';  M= -9,-26,-20,-32,-24,  9,-29,-19, 22,-26, 22, 15,-21,-25,-21,-22,-19, -8, 15,-19,  1,-24;
/M: SY='A';  M=  7,-16,-14,-23,-17, -6,-12,-22,  3,-19,  4,  0,-12,-18,-16,-20, -2,  5,  5,-23,-10,-17;
/M: SY='A';  M= 12,-14, -9,-21,-16, -7,-14,-21,  0,-17,  1, -3,-13,-18,-16,-18,  3,  9,  7,-25,-12,-16;
/M: SY='F';  M= -7,-24,-18,-28,-23, 18,-24,-18, 11,-22, 13,  8,-20,-26,-22,-18,-13, -2, 13,-13,  8,-22;
/M: SY='V';  M=  2,-21,-10,-26,-22, -2,-19,-24, 12,-21,  4,  3,-17,-22,-21,-21, -5,  1, 17,-25, -9,-22;
/M: SY='L';  M= -4,-27,-17,-30,-21,  7,-27,-20, 17,-26, 34, 17,-26,-27,-19,-20,-23, -9, 11,-16, -1,-20;
/M: SY='F';  M=  5,-18, -3,-25,-20,  6,-11,-15, -5,-19, -4, -4,-15,-23,-19,-20, -6, -6, -2,-12,  4,-20;
/M: SY='A';  M=  3,-20,-12,-25,-20,  1, -7,-22, -5,-21, -1, -5,-16,-23,-20,-20, -7, -6,  0, -7, -7,-20;
/M: SY='L';  M=  0,-25, -9,-29,-21,  5,-22,-22, 11,-25, 21,  8,-22,-26,-21,-22,-16, -7,  9,-21, -5,-21;
/M: SY='Q';  M= -3, -1,-27, -2, 16,-37,-17,  6,-19,  7,-20, -2,  0,-10, 49,  6,  3, -7,-26,-21,-12, 33;
/M: SY='W';  M= -9,-26,-25,-27,-20,  4,-24,-20,  1,-18, -2, -2,-24, -3,-19,-19,-17, -9, -3, 12,  4,-20;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='V';  M=  1,-14, -8,-15,-12,  1,-13,-13,  9,-12, 11,  5,-13,-14,-12,-11, -6, -1, 12,-14, -4,-12; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='F';  M= -1, -9, -6,-12,-10,  4, -8,-10, -1,-11, -1, -2, -5,-13,-10,-10,  0,  1,  1,-12, -2,-10; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='G';  M=  2, -6,-16, -6,-11,-17, 37,-11,-22,-11,-17,-11,  0,-11,-11,-11,  1,-10,-16,-12,-17,-11; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='F';  M=-13,-28,-21,-34,-25, 36,-27,-21, 11,-28, 21,  9,-23,-28,-28,-20,-21, -9,  6, -4, 12,-25;
/M: SY='A';  M= 10,-16, -8,-23,-19, -3,-15,-21,  4,-18,  2,  0,-13,-21,-18,-19, -3, -2,  9,-24,-10,-18;
/M: SY='A';  M=  4,-14,-17,-19,-15, -1, -7,-16, -4,-16, -1, -2, -9,-19,-14,-14,  0,  2, -1,-21, -7,-15;
/M: SY='F';  M=-13,-26,-21,-30,-22, 35,-28,-17,  4,-23, 15,  4,-21,-24,-25,-17,-18, -6,  2,  0, 17,-22;
/M: SY='F';  M= -3,-26,-12,-31,-23, 20,-20,-22,  1,-25, 16,  2,-23,-27,-24,-21,-19,-10,  1, -1,  4,-22;
/M: SY='R';  M=-12,-16,-21,-18, -9, -1,-22, -7,-13,  3, -5, -3,-10,-20, -5, 20,-12, -8, -8,-16, -1, -9;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-28,-10, -1,-28,-20,-18,-21, -8,-28,-19,-16, 66, -9,-13, -7, -7,-26,-31,-27, -9;
/M: SY='G';  M= -3, -4,-19, -4, -6,-24,  6, -8,-27, -2,-23,-15,  0, -9, -6, -4, -2,-10,-21,-21,-17, -6;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M:         M= -2,-13,-23,-14, -6,-11,-16,-14, -8, -2, -5, -3,-12, -1, -6, -4, -7, -4, -7,-19, -8, -7; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S';  M= -2, -2,-22, -4, -1,-18,-10, -8,-17, -5,-19,-13,  1,  0, -4, -5,  6,  5,-14,-28,-15, -3;
/M: SY='N';  M= -8, -1,-23, -1, -1,-14,-12, -1,-13, -6,-11, -7,  1,-15, -3, -3,  0, -3,-12,-27, -8, -3;
/M: SY='K';  M= -5,  1,-23, -1,  4,-21,-13, -5,-22, 12,-24,-14,  5, -8,  2,  7,  6,  2,-18,-22,-12,  3;
/M: SY='Y';  M= -8,-17,-20,-19,-12, -3,-25,-10,  2, -7,  0,  3,-14,-18, -6, -4, -9, -3,  1,-16,  5,-11;
/M: SY='R';  M=-16,-11,-28,-12, -3,-18,-17, -4,-22, 21,-16, -6, -3,-19,  5, 50, -9, -8,-14,-21,-10, -3;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A';  M=  1,-10,-24,-11, -2,-17,-16, -9,-14,  1,-15, -9, -7,  1, -2,  1,  0, -3,-11,-25,-13, -4;
/M: SY='Y';  M= -5,-16,-24,-18,-12,  1,-21, -8, -1, -6, -1, -1,-12,-21, -9, -1,-10, -6, -2,-10, 11,-13;
/M: SY='W';  M=-13,-31,-28,-34,-25, 23,-26,-20,  4,-24, 14,  4,-28,-28,-22,-19,-27,-13, -2, 35, 17,-22;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='N';  M= -9,  3,-23, -6, -5,-10,-14, -3,-10,  5,-11,  2, 11,-19, -2,  4, -7, -7,-13,-20, -8, -3;
/M: SY='W';  M=-11,-24,-35,-22,-15, -5,-18,-19,-11,-14,-13,-10,-23, 11,-14,-17,-17,-11,-17, 26,  1,-15;
/M: SY='Y';  M= -9,-22,-27,-25,-20, 10,-17,-10,  1,-17,  3,  0,-19,-24,-15,-15,-16,-10, -5, 13, 22,-19;
/M: SY='H';  M=-20, -1,-25, -1, -1,-20,-20, 95,-30,-11,-20, -1,  9,-21,  9, -1,-10,-20,-29,-31, 18, -1;
/M: SY='H';  M= -9,-13,-27,-16,-12,-12,-16,  7,-11, -6,-12, -5, -7,-22, -4,  4,-11,-12, -9, -1,  0,-10;
/M: SY='F';  M= -8,-19,-14,-26,-21, 16,-22,-16,  3,-21,  5,  2,-14,-24,-20,-18,-10, -2,  1, -6,  9,-20;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-14,-30,-25, 14,-24,-23, 16,-24, 15,  8,-23,-27,-25,-21,-14, -5, 19,-19, -1,-24;
/M: SY='G';  M=  1,-10,-29,-11,-19,-28, 62,-20,-36,-20,-27,-18, -1,-20,-19,-20,  0,-18,-27,-21,-28,-19;
/M: SY='L';  M= -9,-18,-22,-22,-16,  4,-24,-11,  5,-13, 12,  7,-15,-23,-11, -5,-14, -3,  2,-14,  6,-15;
/M: SY='A';  M= 10,-17,-16,-21,-17, -3,-10,-20,  2,-18,  0, -2,-13,-19,-17,-19,  1,  1,  7,-22, -9,-17;
/M: SY='V';  M=  6,-17,  1,-24,-20,-11,-14,-23,  4,-21, -2, -2,-13,-21,-18,-22, -3, -2,  8,-28,-15,-20;
/M: SY='F';  M=-12,-25,-18,-29,-23, 27,-27,-11,  5,-22,  9,  3,-19,-27,-22,-16,-16, -8,  4, -1, 20,-22;
/M: SY='I';  M= -4,-23,-20,-27,-21,  0,-22,-22, 16,-21,  9,  7,-18,-23,-17,-20,-10, -3, 16,-18, -3,-20;
/M: SY='L';  M= -7,-28,-15,-31,-24, 12,-29,-21, 20,-25, 27, 17,-26,-27,-22,-20,-20, -6, 18,-19,  0,-23;
/M: SY='A';  M= 25,-12,-16,-18,-14,-16, 14,-20,-14,-15,-12,-10, -8,-16,-15,-19,  6, -5, -5,-21,-19,-14;
/M: SY='I';  M=  0,-23,-15,-29,-23, -2,-27,-22, 23,-21, 12, 13,-20,-22,-18,-21,-10, -3, 21,-23, -4,-22;
/M: SY='V';  M= 11,-19, -7,-24,-20,-10,-11,-19,  4,-18, -1,  0,-17,-22,-19,-20, -3, -3, 14,-25,-12,-20;
/M: SY='N';  M=  9,  9,-14, -3, -6,-15, -7, -9,-14, -7,-18,-14, 17,-14, -5, -9, 15, 17,-11,-31,-15, -5;
/M: SY='I';  M=  5,-21,-16,-27,-19, -8,-25,-22, 19,-19,  8,  8,-17,-20,-11,-20, -8, -4, 17,-23, -8,-17;
/M: SY='F';  M= -8,-21,-18,-25,-17, 19,-21,-13,  3,-19,  6,  3,-18,-24,-20,-17,-14, -8,  3, -8, 13,-18;
/M: SY='L';  M= -7,-17,-19,-22,-16,  6,-22,-14,  4,-15, 11,  8,-15,-21,-12,-13, -9,  4,  2,-16,  4,-14;
/M: SY='G';  M=  8,-10,-26,-11,-17,-28, 54,-19,-34,-17,-27,-18, -1,-18,-17,-17,  3,-15,-24,-21,-27,-17;
/M: SY='L';  M= -7,-24,-23,-29,-21, 10,-28,-10, 16,-20, 20, 15,-21,-25,-15,-15,-19, -9,  8,-11, 12,-20;
/M:         M= -7, -1,-20, -2, -2,-17,-16, -1,-14, -1,-13, -7,  0,-13, -1, -2, -3, -2,-11,-25, -7, -3;
/M: SY='E';  M= -4, -5,-22, -6,  8,-16,-20, -7, -5, -6, -6, -2, -4,-13,  4, -7,  0,  0, -6,-27,-11,  5;
/M:         M= -4,-13,-26,-15,-10, -8,-11,-13,-11, -2, -7, -4,-12,-13, -8, -6,-11, -9,-10, -9, -1,-10;
/M:         M= -5,-12,-25,-14, -8, -5,-11, -9,-12, -6, -5, -5, -9,-20, -6, -5, -8, -9,-11, -9, -1, -7;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='F';  M= -4, -9,-14,-13, -8,  5,-12,-11, -2, -8, -1, -2, -5,-12,-10, -6, -2,  2, -1,-12, -1, -9; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='P';  M= -1, -4,-16, -4,  1,-15, -4, -7,-10, -2,-13, -7, -2,  4,  2, -3,  3, -1,-10,-17,-12,  0; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='G';  M=  3, -5,-19, -7, -4,-19,  5,-12,-16,  1,-17,-10, -2, -8, -5, -3,  1, -5,-10,-20,-15, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='Y';  M= -7, -4,-17, -5, -4, -6,-15, -6,-11, -5, -9, -8, -3,-16, -5, -4, -2, -2,-10, -7,  3, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S';  M=  0, -8,-21,-11, -9,-10, -5, -9,-11,-11, -9, -7, -3,-16, -8, -8,  2, -1, -8,-24, -9, -9;
/M: SY='K';  M= -4, -7,-26,-10, -5,-15,-10,-11,-19,  2,-20,-13, -2,-14, -2,  2, -3, -4,-17,  2, -6, -3;
/M:         M= -6,-11,-24,-13, -5, -3,-19,-11, -5, -4,  0, -1, -9,-16, -8, -4,-10, -6, -6,-17,  0, -8;
/M:         M= -6,-17,-24,-18,-10, -7,-13,-17, -8,-16, -7, -8,-15, -8,-11,-16, -9, -6,-10,  0, -5,-11;
/M: SY='S';  M= -2, -4,-23, -4, -8,-17, -2, -9,-16, -9,-18,-10, -2, -2, -8,-13,  4,  2,-13,-25,-11, -9;
/M: SY='Y';  M=-11,-11,-19,-11,  1,  0,-25, -5, -6,-12, -2, -4,-12,-13, -7,-13,-10, -7, -8,-15,  7, -4;
/M: SY='A';  M=  4,-11,-16,-14,-12,-17, -4,-15, -9,-11, -8, -5, -9,-18, -8,-14, -4, -6, -6,-19,-13,-10;
/M: SY='V';  M= -2,-19,-16,-24,-18,  6,-18,-18,  3,-15,  0,  3,-15,-18,-18,-14, -8, -5,  7,-18, -3,-18;
/M: SY='L';  M= -5,-19,-19,-25,-19,  6,-25,-20, 10,-21, 17,  6,-16,-23,-18,-16,-12,  3,  8,-16, -2,-19;
/M: SY='I';  M=  0,-21,-16,-26,-21, -4,-23,-22, 15,-20,  7,  7,-17,-19,-17,-20, -9, -1, 15,-19, -6,-21;
/M: SY='N';  M=  1,  1,-16, -6, -5,-13,-10, -9,-12, -8,-15,-10,  8,-11, -3, -9,  6,  2,-12,-29,-14, -4;
/M: SY='V';  M= -1,-23, -7,-27,-24,  7,-21,-23, 10,-20,  5,  4,-20,-25,-24,-19, -7,  1, 20,-22, -4,-24;
/M: SY='L';  M= -5,-23,-13,-27,-21,  0,-27,-21, 14,-22, 18, 11,-22,-22,-18,-19,-14,  0, 13,-20, -4,-20;
/M: SY='G';  M=  4,-10,-14,-13,-16,-19, 22,-19,-20,-18,-15,-12, -4,-17,-17,-18,  2, -4,-13,-26,-22,-17;
/M: SY='I';  M= -5,-26,-22,-29,-22,  5,-26,-18, 20,-23, 19, 12,-22,-22,-18,-21,-17, -7, 15,-16,  4,-22;
/M: SY='V';  M= -1,-19,-17,-24,-15,  3,-21,-17,  6,-19,  6,  3,-16,-21,-17,-18, -9, -2,  7,-16, -3,-16;
/M: SY='V';  M=  0,-22,-10,-27,-21,  6,-22,-22, 10,-22, 10,  4,-19,-24,-21,-20, -9, -2, 13,-21, -4,-21;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-21,-33,-25,  9,-30,-24, 24,-23, 19, 12,-24,-25,-22,-19,-18, -7, 22,-15,  0,-25;
/M: SY='V';  M= -3,-23, -6,-28,-22,  3,-23,-16, 10,-19,  9, 10,-21,-26,-19,-16,-13, -6, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='F';  M=-14,-23,-18,-28,-20, 26,-29,-10,  8,-25, 20,  9,-19,-27,-22,-18,-20, -9,  2,-10, 13,-20;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-18,-10, -4,-17,  8,-15,-17,-12,-14,-11, -6,-17, -9,-14, -1, -7,-11,-24,-16, -6;
/M: SY='V';  M= -3,-17,-12,-22,-18, -6,-20,-19,  8,-15,  1,  3,-12,-22,-14,-12, -6, -3, 12,-25, -9,-17;
/M: SY='T';  M= -7, -5,-17, -8,-10,  0,-21,-13, -3,-13, -2, -5, -4,-20,-13,-12, -4,  2, -1,-22, -1,-12;
/M: SY='V';  M= -4,-20,-20,-22,-19, -7,-21,-20, 10,-11,  1,  3,-17,-20,-16, -9,-10, -4, 16,-20, -7,-18;
/M: SY='I';  M= -1,-20,-20,-24,-19, -1,-23,-23,  5,-19,  2, -1,-19,-19,-18,-18,-12, -6,  5,  0, -3,-19;
/M: SY='Y';  M= -9,-20,-23,-22,-17,  9,-19, -7,  2,-15,  6,  3,-18,-25,-15,-11,-14, -7,  2, -6, 14,-17;
/M: SY='L';  M= -3,-13,-23,-14, -7, -9,-15,-12, -4,-10,  2, -1,-12,-16, -8,-10, -8, -5, -4,-22, -7, -8;
/M: SY='V';  M=  0,-18,-16,-21,-14, -2,-20,-19,  4,-14,  2,  1,-16,-18,-15,-14, -8, -3,  8,-18, -5,-15;
/M:         M= -6,-13,-20,-16, -9,-10,-21,-11, -4, -6, -3, -2, -9,-15, -4, -1, -6, -2, -5,-19, -5, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	53 in 53 different sequences
Number of true positive hits	53 in 53 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Cytochrome b561
Version [info]	7

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

53 sequences

ACET1_MAIZE (Q6I681), ACET1_ORYSJ (A3A9H6), ACET2_ORYSJ (Q7XMK3),

ACFR1_ARATH (Q8L856), ACFR2_ARATH (Q9SWS1), ACFR2_MAIZE (C4IYS8), 
ACFR3_ARATH (Q67ZF6), ACFR4_ARATH (Q9C540), B561A_ARATH (Q9FFU6), 
B561C_ARATH (Q9LSE7), B561G_ARATH (Q9SJ74), B561H_ARATH (Q9LYS9), 
B561I_ARATH (Q9M363), B561J_ARATH (Q9FGK4), B561K_ARATH (Q0WRW8), 
B561L_ARATH (O80854), B561M_ARATH (Q0WPS2), B561O_ARATH (Q9SV71), 
B561P_ARATH (Q9FKH6), B561Q_ARATH (Q9FKC1), B651B_ARATH (Q8VYH6), 
C56D1_HUMAN (Q8N8Q1), C56D1_MOUSE (A2AE42), C56D2_BOVIN (Q5E965), 
C56D2_HUMAN (O14569), C56D2_MOUSE (Q9WUE3), C56D2_RAT   (Q641Y1), 
CY561_BOVIN (P10897), CY561_CAEEL (P34465), CY561_HUMAN (P49447), 
CY561_MOUSE (Q60720), CY561_PIG   (Q95245), CY561_PONAB (Q5RCZ2), 
CY561_SHEEP (Q95204), CY561_XENLA (Q91577), CYAC3_BOVIN (A5D9A7), 
CYAC3_DANRE (A3KPR5), CYAC3_HUMAN (Q8NBI2), CYAC3_MOUSE (Q6P1H1), 
CYAC3_RAT   (Q5U2W7), CYBR1_DANRE (Q503V1), CYBR1_HUMAN (Q53TN4), 
CYBR1_MOUSE (Q925G2), CYBR1_PONAB (Q5RAJ4), CYBR1_RAT   (Q5RKJ2), 
CYBR1_XENLA (Q6DDR3), CYBR1_XENTR (Q5CZL8), FRRS1_BOVIN (A2VE04), 
FRRS1_DANRE (A4QP81), FRRS1_DROME (Q8MSU3), FRRS1_HUMAN (Q6ZNA5), 
FRRS1_MOUSE (Q8K385), FRRS1_XENLA (Q6INU7)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

5 PDB

4O6Y; 4O79; 4O7G; 5ZLE; 5ZLG