PROSITE entry PS50909
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | GAT |
| Accession [info] | PS50909 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2004 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50909 |
| Associated ProRule [info] | PRU00373 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | GAT domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=123; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2406266; R2=0.0125046; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8629.8623047; R2=12.3586206; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=501; H_SCORE=14822; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=341; H_SCORE=12844; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M=-12, 14,-27, 20, 14,-26, -9, -3,-26, 1,-17,-16, 8,-14, 4, 3, -2, -8,-23,-31,-16, 8; /M: SY='E'; M=-11, 6,-29, 12, 30,-24,-23, -7,-14, 0,-13,-12, -1, -7, 7, -5, -3, -6,-16,-29,-15, 17; /M: SY='A'; M= 16, -4,-20, -5, 16,-22,-13,-13,-12, -1,-12,-11, -7, -8, 1,-10, 2, -5, -8,-24,-17, 8; /M: SY='Q'; M=-12, 3,-29, 4, 13,-30,-19, 18,-24, 16,-21, -2, 2,-12, 26, 11, -6,-12,-24,-24, -5, 19; /M: SY='S'; M= 17, -2,-14, -4, 3,-22, -4,-11,-19, -4,-23,-16, 3, -9, 3, -8, 24, 9,-10,-32,-19, 3; /M: SY='A'; M= 24, -8,-17,-14, -4,-22,-10,-16,-13, 8,-15, -8, -8,-12, -2, -4, 2, -4, -3,-21,-16, -3; /M: SY='K'; M=-10,-11,-25,-14, -4,-14,-22,-10, -7, 18, 0, 13,-11,-17, 1, 10,-17,-10, -6,-20, -5, -1; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 15,-30,-20, 19,-30, 47, 19,-29,-30,-21,-20,-29,-10, 9,-18, 2,-21; /M: SY='Q'; M= 7, -1,-23, -2, 15,-29,-14, -5,-20, 9,-19, -9, -2, -8, 20, 1, 4, -2,-18,-23,-15, 18; /M: SY='E'; M= -7, 1,-28, 5, 30,-27,-18, -2,-28, 17,-20,-14, -1, -8, 16, 20, -3, -9,-24,-25,-16, 22; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25, 5,-35,-25, 35,-30, 35, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20, 0,-25; /M: SY='R'; M=-10, -4,-27, -5, 3,-23,-16, -5,-28, 30,-24,-11, 2,-15, 8, 42, -4, -6,-18,-23,-12, 3; /M: SY='R'; M= -2, -4,-18, -4, 0,-20, -8, -6,-24, 6,-26,-16, 6,-14, 4, 22, 20, 8,-14,-32,-16, 0; /M: SY='G'; M= -2, 4,-25, -1,-11,-26, 36,-11,-31, -9,-29,-19, 15,-18,-11,-11, 7, -8,-26,-28,-25,-11; /M: SY='H'; M=-11, 3,-24, -2, 0,-20,-16, 18,-24, 10,-21,-10, 11,-16, 4, 18, 1, 3,-19,-28, -5, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M= -7, 9,-28, 17, 40,-29,-18, -1,-26, 7,-18,-14, 0, -5, 16, 1, -1, -9,-25,-29,-18, 28; /M: SY='D'; M=-19, 49,-29, 64, 17,-37, -9, 1,-37, 0,-30,-29, 25,-11, 0, -9, 1, -9,-30,-40,-20, 9; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 19,-30,-20, 17,-30, 45, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10, 9,-16, 4,-21; /M: SY='Q'; M= -5, -3,-27, -3, 15,-29,-17, -1,-24, 18,-20, -8, -1,-11, 24, 24, -3, -9,-22,-21,-13, 18; /M: SY='E'; M= 4, 3,-24, 5, 31,-25,-15, -7,-24, 7,-17,-16, -2, -5, 9, 1, 3, -2,-19,-26,-18, 19; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='K'; M= -9, -2,-27, -5, 2,-21,-18, -3,-22, 25,-16, -7, 2,-16, 4, 23, -9, -9,-16,-22, -9, 2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='M'; M=-10,-25,-24,-34,-24, 1,-30,-15, 33,-20, 22, 39,-21,-21,-10,-20,-21,-10, 19,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 11,-31,-20, -7,-29, 45,-29, -9, 0,-10, 16, 27, -9,-10,-21,-20,-10, 14; /M: SY='I'; M= -6, -9,-20,-13, -8, -7,-24,-14, 10,-13, -3, -1, -5,-19,-11,-14, -3, 1, 10,-26, -5,-11; /M: SY='M'; M=-11,-22,-21,-29,-19, 1,-23, -6, 18,-13, 24, 44,-21,-22, -5, -8,-22,-10, 9,-20, -1,-13; /M: SY='A'; M= 23,-19,-12,-25,-19, -8,-15,-20, 8,-14, 0, 3,-19,-20,-17,-19, -2, -1, 19,-21, -9,-18; /M: SY='G'; M= -2, -5,-29, -5, 0,-30, 25,-11,-32, 1,-26,-14, -1,-15, 3, -1, -1,-14,-26,-21,-21, 1; /M: SY='Y'; M=-15, -7,-25, -7, 7, 14,-24, -3,-13, -8, -7, -9, -9,-17, -4, -9, -8, -4,-15, -6, 16, 2; /M: SY='D'; M=-14, 24,-30, 35, 29,-34,-16, -3,-34, 17,-27,-21, 8, -7, 9, 4, -3,-10,-27,-31,-17, 19; /M: SY='E'; M= -5, 9,-26, 13, 33,-30,-18, -2,-25, 5,-19,-14, 1, -5, 21, -1, 3, -1,-24,-28,-16, 27; /M: SY='E'; M=-10, 11,-28, 17, 18,-28,-15, 6,-31, 14,-24,-16, 6,-11, 8, 14, -2, -9,-24,-29,-13, 11; /M: SY='R'; M=-12, 7,-25, 1, 3,-23,-13, 0,-25, 21,-25,-13, 16,-16, 10, 31, 0, -3,-22,-27,-13, 5; /M: SY='M'; M= -5,-10,-21,-17,-12,-10,-21,-14, 5, -5, 1, 11, -6,-16, -6, -7, -5, 3, 2,-25, -7,-10; /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -5, 1,-25, 5, 19,-21,-19, -8,-15, 0,-12,-11, -5, -6, 5, -6, -3, -7,-13,-27,-14, 12; /M: SY='Q'; M= -7, -1,-26, 0, 8,-23,-19, -5,-16, 8,-16, -5, -3, -9, 16, 2, -3, -6,-16,-23, -9, 12; /M: SY='I'; M= -2,-18,-24,-21,-13, -8,-24,-17, 9,-11, -1, 2,-14, -6,-12,-13, -9, -6, 6,-20, -4,-15; /M: SY='S'; M= 4, -1,-20, -1, 0,-22, -5, -9,-19, 2,-19,-12, -1,-13, -3, -3, 7, 1,-10,-28,-15, -2; /M: SY='K'; M= -7, -2,-27, -1, 14,-25,-19, -6,-21, 18,-16, -7, -3,-12, 15, 14, -5, -7,-18,-23,-12, 14; /M: SY='R'; M= -6,-14,-22,-16, -7,-10,-21, -6, -4, -4, 3, 2,-10,-17, -4, 4, -8, -3, -4,-24, -7, -7; /M: SY='R'; M= -2,-16,-20,-18,-11, -9,-21, -9, -2, -3, 2, 2,-12,-21, -7, 5, -9, -4, 3,-23, -6,-11; /M: SY='S'; M= 6, 2,-17, -1, 4,-18, -9, -6,-17, -4,-17,-13, 8,-12, 0, -5, 13, 6,-13,-31,-16, 2; /I: I=-30; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= -1, 6,-24, 11, 22,-25,-16, -8,-20, 2,-16,-14, 0, -8, 5, -3, 2, -3,-16,-29,-17, 13; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24, 10,-32,-23, 27,-29, 37, 19,-27,-27,-21,-22,-25, -9, 18,-19, 1,-24; /M: SY='E'; M= -7, 16,-22, 22, 26,-31,-13, -2,-28, 3,-22,-18, 6, -8, 12, -3, 2, -6,-25,-31,-18, 19; /M: SY='E'; M= -7, -5,-24, -5, 8,-18,-21, -7, -8, 6,-12, -4, -3,-13, 1, 0, -3, -5, -6,-27,-11, 4; /M: SY='V'; M= 12,-23,-14,-27,-22, -5,-21,-25, 16,-18, 8, 6,-22,-22,-20,-20, -7, -1, 24,-20,-10,-22; /M: SY='R'; M= -9, -1,-26, -4, 3,-23,-16, -3,-23, 20,-22,-10, 7,-15, 11, 31, -1, -5,-18,-25,-12, 5; /M: SY='N'; M= -7, 7,-23, 1, 0,-21, 2, -4,-20, -1,-20,-10, 15,-16, 1, 3, 4, -1,-20,-29,-17, 0; /M: SY='N'; M= -1, 8,-19, 0, -3,-18,-11, -4,-13, 4,-19,-11, 17,-16, -3, -1, 6, 2,-12,-31,-14, -3; /M: SY='V'; M= 8,-20, -9,-26,-20, -3,-20,-20, 11,-17, 7, 11,-19,-21,-17,-18, -6, 0, 17,-24, -9,-19; /M: SY='D'; M= -9, 11,-27, 15, 13,-28,-12, -5,-28, 15,-23,-16, 6,-11, 7, 11, -1, -5,-22,-28,-15, 10; /M: SY='L'; M= -7,-26,-18,-27,-21, 1,-26,-21, 20,-22, 25, 13,-24,-28,-19,-17,-19, -7, 20,-24, -5,-20; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-21, 13,-28,-17, 18,-25, 35, 23,-27,-25,-19,-18,-25, -9, 11,-18, 1,-20; /M: SY='S'; M= 1, 2,-19, 0, 2,-21, 0, -7,-21, -3,-21,-12, 8,-13, -1, -4, 13, 5,-15,-31,-17, 0; /M: SY='E'; M= -8, 12,-27, 18, 37,-30,-16, 3,-27, 5,-21,-17, 5, -5, 18, -2, 4, -5,-26,-31,-17, 27; /M: SY='M'; M= -9,-21,-20,-29,-20, 3,-24, -9, 18,-12, 16, 39,-20,-21, -8,-10,-17, -6, 13,-20, -1,-14; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-20, 8,-29,-18, 19,-25, 40, 19,-28,-29,-19,-16,-26, -9, 13,-20, 1,-20; /M: SY='N'; M= -4, 5,-20, 2, 0,-20, -9, -4,-14, -7,-13, -7, 7,-12, 2, -8, 6, 4,-14,-30,-14, 1; /M: SY='S'; M= 4, 4,-16, 3, 9,-23, -9, -3,-19, -4,-19,-11, 4,-11, 5, -8, 11, 3,-15,-31,-16, 7; /M: SY='Y'; M= -9,-13,-23,-16,-11, 0,-22, 1, 1,-11, 1, 5,-10,-19, -7,-10, -9, -3, -1,-15, 10,-11; /I: I=-18; MD=-18; /M: SY='D'; M= -6, 10,-19, 14, 5,-21,-11, -3,-18, 2,-17,-12, 6,-11, 1, 2, 3, -1,-11,-27,-12, 2; D=-18; /I: I=-18; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='P'; M= -5,-10,-22, -7, -2,-15, -9, -9,-13, -3,-13, -9, -9, 24, -3, -4, -5, -6,-15,-17,-12, -5; D=-18; /I: I=-18; DM=-18; /M: SY='G'; M= -3, -6,-24, -4, -2,-23, 16,-12,-24, -8,-21,-14, -3, 5, -6, -9, 1, -8,-21,-22,-21, -5; D=-18; /I: I=-18; DM=-18; /M: SY='Q'; M= -3, 5,-23, 5, 6,-25, -3, -1,-22, 1,-22,-13, 7, -3, 8, -3, 3, -5,-21,-25,-14, 6; D=-18; /I: I=-18; DM=-18; /M: SY='E'; M= -3, -1,-24, 1, 10,-20,-17, 0,-20, 1,-18,-12, -2, -3, 4, -2, 2, 0,-16,-25, -9, 6; /M: SY='E'; M= -2, 6,-24, 8, 15,-25,-13, -7,-22, 6,-23,-16, 5, -3, 4, -1, 6, -1,-18,-30,-18, 9; /M: SY='A'; M= 1, -5,-25, -4, -5,-18, -5, -9,-14,-13,-14,-10, -4, -1, -7,-15, -1, -7,-13,-25,-15, -7; /M: SY='A'; M= 3, -4,-20, -2, -4,-15,-12,-14, -9,-12, -4, -8, -6,-12, -9,-14, 0, -2, -5,-26,-14, -7; /M: SY='D'; M=-10, 18,-26, 25, 14,-30, -9, -5,-29, 7,-27,-20, 10, -9, 4, 0, 4, -4,-22,-33,-18, 9; /M: SY='B'; M=-10, 12,-25, 12, 10,-22,-10, -3,-18, -3,-14,-11, 10,-14, 4, -6, -1, -6,-19,-29,-13, 7; /M: SY='E'; M= -9, 16,-28, 26, 38,-31,-14, -2,-29, 5,-20,-19, 4, -5, 13, -4, 0, -9,-27,-31,-19, 25; /M: SY='L'; M= -2,-23,-16,-26,-20, 5,-26,-22, 14,-23, 25, 9,-22,-24,-20,-18,-13, 3, 14,-22, -4,-20; /M: SY='L'; M= -7,-24,-21,-29,-22, 6,-29,-19, 21,-23, 25, 17,-22,-24,-17,-20,-17, -2, 15,-19, 2,-21; /M: SY='Q'; M= -4, -4,-21, -5, 1,-22,-19, -6,-10, 2,-12, -4, -5,-15, 9, 0, 0, 0, -5,-26,-11, 5; /M: SY='E'; M=-11, 15,-27, 24, 31,-29,-17, -4,-26, 5,-20,-18, 3, -7, 9, -1, 1, -5,-21,-32,-18, 20; /M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-30,-21, 13,-29,-20, 18,-26, 37, 18,-27,-28,-20,-17,-25, -9, 12,-18, 1,-21; /M: SY='Y'; M= -6,-15,-16,-19,-19, 9,-24, -4, 4,-13, -1, 0,-13,-25,-14,-13, -9, -2, 6, -7, 21,-18; /M: SY='E'; M= -5, 7,-24, 10, 19,-26,-11, -3,-24, 5,-22,-15, 5,-10, 11, 1, 7, -2,-20,-29,-14, 15; /M: SY='Q'; M= -2, -2,-16, -5, 3,-24,-15, -6,-19, 5,-18, -9, 1,-13, 13, 11, 6, 4,-15,-26,-14, 7; /M: SY='C'; M= -9,-22, 74,-28,-26,-14,-26,-27,-17,-28, -6,-11,-21,-32,-27,-27,-13, -9, -5,-41,-23,-27; /M: SY='R'; M=-11, -4,-27, -3, 11,-23,-20, -6,-23, 22,-20,-10, -1,-13, 9, 27, -3, -5,-17,-23,-11, 8; /M: SY='S'; M= 1, -2,-19, -4, 3,-18,-14, -7,-16, 1,-18, -9, 0,-12, 6, -1, 9, 6,-10,-27,-12, 4; /M: SY='M'; M= 4,-11,-17,-17,-11, -7,-14, -3, -1,-10, 1, 12, -9,-18, -3,-11, -4, -4, -3,-19, 0, -8; /M: SY='Q'; M=-11, -2,-29, -2, 12,-32,-19, 11,-23, 14,-20, -3, 0,-13, 37, 20, -2, -9,-25,-22, -8, 24; /M: SY='P'; M=-11, -7,-32, -3, 11,-29,-17, -5,-24, 6,-24,-13, -5, 23, 13, 7, -3, -7,-26,-26,-18, 9; /M: SY='R'; M= -9, -7,-23,-10, -4,-17,-20,-10,-17, 14,-14, -7, -1,-16, 1, 26, -2, 5, -9,-24,-10, -4; /M: SY='I'; M= -9,-27,-22,-34,-27, 12,-33,-25, 30,-26, 21, 15,-22,-26,-24,-23,-19, -7, 24,-19, 1,-27; /M: SY='M'; M= -9,-16,-22,-19,-10, 0,-24, -8, 3, -9, 4, 12,-15,-21, 2, -6,-12, -7, 1,-17, 1, -4; /M: SY='R'; M=-13, 5,-29, 8, 14,-27,-13, 6,-29, 17,-23,-12, 4,-13, 11, 20, -5,-10,-24,-25,-11, 11; /M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-30,-22, 10,-31,-16, 22,-25, 32, 20,-25,-26,-18,-20,-24, -8, 12,-14, 9,-21; /M: SY='I'; M= 2,-25,-11,-31,-24, -4,-28,-26, 23,-23, 12, 10,-22,-20,-20,-24,-12, -5, 22,-25, -8,-24; /M: SY='E'; M= -5, 4,-23, 5, 18,-24,-11, -2,-21, 0,-21,-13, 6, -4, 8, -1, 9, 0,-20,-32,-17, 12; /M: SY='E'; M= -6, 4,-22, 7, 14,-19,-17, -2,-20, -1,-15,-13, 1,-11, 3, -2, 5, 4,-15,-29,-11, 8; /I: I=-30; MD=-32; /M: SY='T'; M= -1, -9,-14,-12, -6, -9,-21,-18, 0,-12, 0, -2,-10,-15,-10,-12, 3, 17, 7,-28,-10, -8; D=-30; /I: I=-30; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= -1, 2,-21, 2, 4,-23, -3, -4,-20, -4,-20,-13, 4,-13, 2, -4, 9, 2,-14,-30,-16, 3; /I: I=-24; MD=-25; /M: SY='D'; M=-13, 22,-25, 33, 16,-28,-11, 3,-27, 0,-22,-19, 7, -1, 4, -7, -2, -9,-24,-23,-13, 10; D=-24; /I: I=-24; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='B'; M=-10, 28,-19, 27, 7,-21, -5, 5,-21, -2,-21,-17, 26,-12, 0, -4, 5, -3,-21,-31,-14, 4; D=-24; /I: I=-24; DM=-25; /M: SY='D'; M=-15, 28,-30, 41, 40,-34,-15, 3,-34, 5,-25,-24, 10, -5, 11, -4, 0,-10,-30,-35,-19, 25; /I: I=-28; MD=-29; /M: SY='E'; M= -4, 11,-26, 15, 22,-28,-11, -3,-25, 4,-22,-17, 5, -5, 9, -3, 2, -6,-22,-28,-16, 15; D=-28; /I: I=-28; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= 2,-21,-12,-24,-18, -1,-22,-19, 7,-18, 14, 7,-20,-23,-16,-17,-11, -2, 10,-18, -5,-17; /M: SY='L'; M= -6,-23,-16,-26,-21, 3,-28,-21, 16,-22, 24, 13,-23,-25,-19,-17,-14, 5, 17,-23, -2,-20; /M: SY='A'; M= 6, -7,-15,-10, 1,-12, -6,-11,-16, -7,-14, -9, -6,-15, -2,-11, 1, -6,-11,-21,-11, 0; /M: SY='E'; M=-10, 9,-28, 14, 31,-30,-16, -2,-27, 10,-21,-15, 3, -7, 18, 4, 1, -6,-25,-28,-16, 25; /M: SY='L'; M= 1,-23,-20,-26,-20, -2,-14,-22, 11,-24, 20, 8,-20,-23,-19,-21,-15, -7, 8,-21, -8,-20; /M: SY='L'; M= -9,-27,-21,-28,-20, 8,-29,-20, 20,-28, 39, 16,-26,-27,-19,-21,-24, -9, 11,-21, -1,-20; /M: SY='Q'; M= -6, 5,-25, 6, 13,-26,-13, 5,-21, 4,-19, -9, 5, -9, 14, 2, 1, -7,-21,-28,-13, 12; /M: SY='L'; M= 3,-24,-17,-29,-22, 4,-25,-23, 17,-23, 19, 9,-22,-23,-21,-21,-13, -2, 17,-21, -4,-22; /M: SY='N'; M=-10, 35,-21, 17, 0,-21, -2, 12,-21, 1,-30,-19, 53,-17, 0, 0, 9, -1,-29,-39,-18, 0; /M: SY='D'; M=-18, 41,-26, 59, 21,-38,-11, -2,-38, 0,-29,-28, 16, -8, 1,-10, 1, -9,-29,-39,-21, 11; /M: SY='E'; M= -6, 10,-23, 13, 16,-23,-14, -4,-20, -1,-15,-14, 6,-12, 7, -4, 4, -2,-19,-30,-14, 11; /M: SY='L'; M= -9,-30,-21,-31,-22, 7,-29,-22, 23,-29, 41, 18,-28,-29,-21,-21,-26, -9, 15,-21, -2,-22; /M: SY='N'; M= -6, 10,-22, 2, 1,-22,-13, 6,-13, -3,-18, -8, 19,-14, 11, -3, 5, 2,-18,-31,-12, 6; /M: SY='Q'; M= -8, 6,-24, 0, 4,-25,-13, 2,-19, 9,-22, -9, 13,-15, 18, 15, 4, -3,-20,-28,-13, 10; /M: SY='V'; M= 3,-23,-15,-26,-22, -3,-21,-25, 16,-21, 13, 7,-22,-24,-22,-20, -9, 1, 23,-25, -9,-22; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-24, 20,-31,-22, 21,-27, 28, 14,-25,-28,-25,-21,-22, -9, 16,-16, 4,-24; /M: SY='E'; M= -3, -2,-22, -4, 4,-18,-14, -8,-11, -5, -8, -5, 0,-11, 4, -5, 1, -1,-12,-28,-14, 4; /M: SY='R'; M=-12, -5,-27, -5, 5,-23,-17, -2,-24, 21,-18, -8, -1,-15, 10, 29, -6, -6,-18,-22,-10, 6; /M: SY='Y'; M=-19,-13,-25,-15,-15, 16,-24, 36,-11,-12, -7, -2, -8,-27, -7, -8,-15,-13,-16, 6, 50,-15; /M: SY='E'; M=-10, 13,-29, 19, 24,-31,-16, 0,-29, 13,-24,-16, 5, -9, 15, 8, -2, -9,-26,-24,-14, 19; /M: SY='R'; M= -7, -5,-24, -6, 0,-18,-18, -1,-14, 2, -7, -4, -2,-17, 7, 13, -5, -5,-12,-24, -9, 2; /M: SY='L'; M= -8,-25,-22,-29,-20, 15,-27,-17, 13,-21, 17, 11,-21,-19,-19,-18,-17, -8, 8,-14, 6,-20; /M: SY='E'; M= 0, -5,-21, -5, 2,-14,-19,-14, -8, 1, -8, -6, -8,-15, -6, -4, -5, -4, -1,-25,-11, -2; /M: SY='R'; M= -6, -3,-19, -3, 7,-22,-15, -8,-21, 10,-17,-11, -1,-11, 4, 12, 0, -4,-16,-27,-14, 4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 30 in 30 different sequences |
| Number of true positive hits | 30 in 30 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | GAT |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
30 sequences
GGA1_HUMAN (Q9UJY5), GGA1_MOUSE (Q8R0H9), GGA1_YEAST (Q06336), GGA2_HUMAN (Q9UJY4), GGA2_MOUSE (Q6P5E6), GGA2_YEAST (P38817), GGA3_HUMAN (Q9NZ52), GGA3_MOUSE (Q8BMI3), GGA3_RAT(A0A0G2JV04), TM1L1_HUMAN (O75674), TM1L1_MOUSE (Q923U0), TM1L1_RAT (F1LM81), TM1L2_HUMAN (Q6ZVM7), TM1L2_MOUSE (Q5SRX1), TM1L2_XENLA (Q68FJ8), TOL1_ARATH (Q9LFL3), TOL2_ARATH (Q9LNC6), TOL3_ARATH (Q9LPL6), TOL4_ARATH (Q6NQK0), TOL5_ARATH (Q9FFQ0), TOL6_ARATH (O80910), TOL7_ARATH (F4KAU9), TOL8_ARATH (Q9C9Y1), TOL9_ARATH (Q8L860), TOM1_CHICK (O12940), TOM1_DICDI (Q54GH3), TOM1_HUMAN (O60784), TOM1_MOUSE (O88746), YB0G_SCHPO (P87157), YD85_SCHPO (Q10410)» more
|
| PDB [Detailed view] |
11 PDB
1J2J; 1NAF; 1NWM; 1O3X; 1OXZ; 1WR6; 1WRD; 1X79; 1YD8; 2N2N; 2N9D |