PROSITE entry PS50835

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50835
Entry name [info]	IG_LIKE
Accession [info]	PS50835
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2003 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50835
Associated ProRule [info]	PRU00114

Name and characterization of the entry

Description [info]

Ig-like domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=91;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=91;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9519000; R2=0.0181497; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3098.5483398; R2=1.1827956; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=306; H_SCORE=3460; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=251; H_SCORE=3395; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -9,-19,-38,-10, -1,-29,-19,-20,-19,-10,-28,-19,-19, 82, -9,-19, -9, -9,-28,-30,-29,-10;
/M: SY='K';  M= -5, -3,-24, -3,  5,-20,-16, -7,-18,  7,-18,-10, -3, -6,  4,  4,  1,  0,-14,-24,-11,  3;
/M: SY='V';  M= -4,-22,-19,-26,-20,  5,-24,-22, 13,-18,  6,  4,-19,-19,-20,-17,-10, -3, 15,-18, -3,-20;
/M: SY='T';  M= -2,-12,-18,-15, -9, -8,-20,-12, -1, -9, -5, -1, -9,-15, -6, -9,  0,  5,  2,-23, -5, -8;
/M:         M= -6,-12,-24,-12, -4,-14,-21,-15, -1, -8, -3, -1,-12, -6, -5, -9, -7, -3,  0,-25,-11, -6;
/M: SY='T';  M= -4,-13,-19,-16,-10, -4,-21,-12,  0,-12, -1,  0,-10,-15, -9,-11, -5,  1,  1,-22, -5,-10;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='P';  M= -5,-13,-22,-12, -5,-13,-17,-11, -7, -8, -9, -6,-11,  9, -6, -9, -5, -4, -8,-21,-11, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='S';  M= -2, -5,-17, -5,  0,-18, -9, -9,-16,  0,-18,-11, -2,  0, -1, -2,  4,  0,-12,-24,-14, -2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='D';  M= -4,  3,-20,  4,  4,-20,-11, -5,-18,  0,-18,-13,  4, -4,  1, -3,  4,  0,-16,-25,-13,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M:         M= -1, -9,-17,-10, -4,-13,-15, -9, -6, -7, -7, -3, -8,-12, -3, -8,  0,  0, -3,-22, -9, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='E';  M= -7, -7,-23, -7,  1,-14,-18, -9,-11, -4,-10, -7, -6, -8, -2, -3, -3, -1, -9,-20, -9, -1;
/M: SY='V';  M=  3,-16,-17,-18,-13, -8,-16,-18,  4,-15,  1,  1,-14,-16,-13,-16, -4, -1,  9,-25,-11,-14;
/M:         M= -4, -5,-23, -6,  0,-16,-15, -9,-13, -2,-12, -8, -3, -6, -1, -2, -1, -2,-11,-24,-11, -1;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-25,  4, 16,-22,-17, -7,-18,  1,-16,-12, -2, -1,  4, -3, -1, -5,-16,-28,-15,  9;
/M: SY='G';  M= -2, -2,-26, -3,-12,-27, 41,-13,-33,-12,-27,-18,  5,-18,-12,-12,  3,-13,-26,-24,-24,-12;
/M: SY='E';  M= -3,  6,-23,  7, 13,-26, -9, -3,-23,  3,-21,-13,  5, -9, 10, -1,  6,  0,-20,-29,-16, 11;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='S';  M= -1, -3,-19, -4, -3,-17,-13,-11,-13, -3,-15,-10, -1, -4, -4, -4,  4,  3, -9,-28,-15, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='V';  M=  1,-15,-13,-18,-15, -2,-14,-15,  7,-13,  4,  3,-13,-16,-14,-12, -7, -3, 11,-18, -6,-15; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='T';  M= -2, -4,-18, -8, -3,-14,-18,-13, -9, -3,-11, -7, -2,-14, -3, -3,  7, 15, -3,-27,-11, -3;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-32,-22, 16,-29,-20, 19,-28, 36, 17,-27,-28,-22,-20,-25, -9, 12,-15,  3,-22;
/M: SY='T';  M= -3, -5,-19, -8, -4,-14,-15,-11,-10, -6,-11, -7, -2,-12, -4, -4,  6, 11, -5,-28,-11, -5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M:         M= -7, -8,-22, -9, -1,-11,-20, -6, -9, -4, -6, -4, -6,-16, -1, -1, -4,  0, -7,-21, -6, -2;
/M: SY='V';  M= 13,-19,-15,-24,-19, -6,-17,-23,  9,-17,  1,  0,-18,-18,-18,-19, -2,  0, 17,-21,-10,-19;
/M: SY='S';  M= -2,  0,-19, -1,  1,-17,-13, -7,-17, -2,-18,-12,  3,-12, -1, -1,  8,  5,-12,-26,-11, -1;
/M: SY='G';  M= -2,  3,-25,  4, -6,-26, 25,-10,-30,-10,-25,-18,  5,-14, -9,-13,  4, -9,-23,-26,-21, -8;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='Y';  M= -4, -3,-14, -5, -5, -1, -7, -2, -7, -7, -8, -6, -1, -6, -6, -7,  0,  0, -7,-10,  1, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='P';  M= -7, -7,-25, -6, -3,-13,-15, -9,-13, -7,-16,-11, -5, 14, -6,-10, -3, -3,-15,-23,-10, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='P';  M= -6, -6,-29, -1,  4,-26,-10,-12,-22, -4,-23,-16, -6, 26, -2, -8,  0, -4,-22,-28,-20, -1;
/M: SY='D';  M= -5,  3,-24,  5,  3,-22,-10, -8,-19, -3,-21,-14,  2, -1, -2, -6,  3, -2,-15,-30,-16, -1;
/M: SY='P';  M= -2,-19,-23,-20,-14,-10,-22,-18,  5,-15, -4, -2,-17,  7,-14,-18, -7, -2,  4,-23, -9,-16;
/M: SY='T';  M= -4,  1,-21, -1,  3,-16,-14, -5,-16, -2,-17,-11,  3,-12,  3, -2,  7,  8,-13,-24, -9,  2;
/M: SY='I';  M= -8,-28,-20,-32,-27, 13,-31,-21, 24,-23, 15, 12,-25,-26,-24,-20,-17, -6, 24,-12,  8,-26;
/M: SY='T';  M= -4, -3,-19, -6, -2,-13,-16, -5,-15,  0,-15, -8,  1,-14,  0,  1,  7, 10,-10,-25, -6, -1;
/M: SY='W';  M=-20,-39,-49,-40,-30, 12,-20,-29,-19,-20,-18,-19,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,144, 31,-20;
/M: SY='Y';  M=-10,-16,-22,-19,-12,  7,-23,-10, -1,-10,  2,  2,-13,-21,-11, -8,-10, -2, -1, -9,  9,-12;
/M: SY='R';  M=-12, -7,-27, -8,  0,-16,-19, -4,-19, 16,-15, -5, -4,-15,  4, 21, -8, -8,-14,-19, -5,  1;
/M: SY='B';  M= -9, 19,-25, 19,  8,-26, -6,  0,-24,  0,-23,-17, 18,-11,  4, -2,  3, -5,-24,-32,-17,  6;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='G';  M=  0,  0,-22, -1, -8,-23, 29,-10,-27,-10,-23,-15,  6,-13, -9,-11,  4, -8,-21,-22,-20, -9; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-9;
/M: SY='Q';  M= -3, -2,-18, -3, -1,-17, -4, -6,-14,  1,-14, -7,  0, -5,  2,  0,  1, -2,-11,-18,-11,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -5, -1,-16,  1,  5,-12, -9, -2,-10,  1, -9, -6, -1, -5,  2,  0, -2, -4, -9,-14, -6,  3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='T';  M= -3, -5,-15, -7, -4, -7,-12, -7, -4, -4, -5, -3, -3, -9, -3, -4, -2,  1, -3,-11, -3, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='S';  M= -2, -1,-15, -3, -4,-12, -3, -7,-11, -6,-11, -8,  2, -7, -4, -6,  5,  3, -8,-20,-10, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M:         M= -3, -6,-17, -7, -2,-11,-13, -8, -4, -6, -4, -3, -4,-10,  0, -6, -2,  0, -5,-18, -7, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='P';  M= -4, -4,-22, -1,  4,-18,-10,-10,-15, -4,-16,-11, -4, 14, -2, -8,  1, -1,-15,-23,-14,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='S';  M= -2, -2,-19, -3,  0,-14, -9, -9,-11, -5,-10, -8, -2, -8, -3, -6,  1,  0, -9,-19,-10, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='K';  M= -5, -4,-19, -4,  0,-17,-13, -8,-15,  6,-14, -8, -2, -9,  0,  5,  0, -1,-10,-22,-10, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -8,  1,-25,  2,  8,-19,-15,  4,-17, -1,-15, -8,  2, -5,  8, -2, -2, -6,-18,-23, -8,  7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-9;
/M: SY='E';  M= -7,  2,-24,  4,  9,-22,-14, -4,-20,  0,-18,-13,  0, -3,  3, -1,  1, -2,-18,-27,-12,  5;
/M: SY='N';  M= -6,  2,-24,  0,  1,-21, -7, -7,-19,  0,-19,-12,  5, -8, -1,  1,  0, -4,-17,-25,-15, -1;
/M:         M= -5, -2,-24, -3, -1,-16, -9, -3,-16, -4,-14, -9, -1,-12, -2, -3, -1, -4,-13,-23, -8, -3;
/M: SY='T';  M= -3, -9,-17,-12,-10, -9,-17,-14, -4, -9, -6, -4, -7,-16, -9, -8,  1,  6,  2,-26, -8,-10;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='F';  M= -8,-18,-17,-21,-17, 16,-21,-12,  7,-15,  8,  5,-15,-19,-16,-12,-11, -3,  6, -5, 10,-16; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='T';  M= -4, -1,-14, -2, -3, -5, -9, -2, -9, -4, -8, -6, -1,-10, -4, -5,  1,  2, -7,-13,  1, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='S';  M= -1, -1,-15, -2, -1,-13, -5, -5,-12, -3,-12, -7,  1, -7,  0, -4,  4,  1,-10,-19, -9, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='S';  M=  1, -3,-16, -5, -6,-14,  2, -9,-13, -6,-12, -8,  0,-11, -6, -7,  4,  1, -8,-20,-11, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='N';  M= -5,  1,-19,  0,  1,-17, -6, -2,-17,  0,-17,-10,  3,-11,  2, -2,  3, -1,-14,-21, -9,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-18, -4, -5,-18,  3, -7,-20, -7,-21,-14,  5,-15, -4, -7, 12,  3,-14,-28,-14, -5;
/M: SY='T';  M= -3, -6,-19, -9, -4,-12,-16,-11, -9, -6,-10, -6, -4,-15, -4, -5,  5,  8, -4,-24, -8, -5;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-17,-28,-21,  8,-28,-20, 17,-25, 32, 14,-25,-27,-20,-19,-22, -7, 12,-19,  0,-20;
/M: SY='T';  M= -5, -9,-18,-14,-10, -7,-20,-11, -5, -8, -6, -4, -6,-16, -7, -5,  2, 12, -1,-23, -3,-10;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-22,-34,-26, 11,-33,-24, 29,-26, 23, 16,-24,-25,-23,-23,-20, -7, 22,-17,  2,-26;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-23, -1,  4,-22,-14, -6,-19,  1,-19,-12,  1,  0,  4,  1,  4,  2,-17,-28,-15,  2;
/I:         I=-5; MD=-13;
/M: SY='N';  M= -2,  3,-20,  1,  1,-19, -7, -5,-16,  0,-17,-10,  7, -8,  0, -2,  4, -2,-14,-25,-14,  0; D=-2;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='V';  M=  3,-13,-13,-15,-11, -6,-17,-16,  4,-11,  0,  1,-12,-16,-11,-11, -1,  2, 10,-23, -9,-11; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -5,  1,-20,  1,  5,-19,-11, -5,-17,  2,-16,-10,  0, -9,  5,  0,  3,  2,-14,-21,-11,  5; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M:         M= -5,-11,-24,-10, -3,-13,-15,-12,-13, -5,-13,-10,-11, -1, -5, -6, -7, -6,-12, -3, -7, -5; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-23,  6, 13,-21,-10, -4,-20,  1,-18,-13,  5,-10,  5, -2,  4, -3,-18,-26,-14,  9; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='D';  M=-12, 27,-26, 36, 13,-30,-10,  4,-30, -1,-25,-20, 13,-10,  2, -7,  3, -6,-24,-34,-15,  7; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='S';  M=  2,  0,-21, -2,  0,-19, -1, -8,-20, -5,-19,-13,  2,-11, -2, -6,  7,  2,-15,-23,-13, -1; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-13;
/M: SY='G';  M=  5, -3,-25, -4, -9,-27, 31,-15,-29,-10,-24,-17,  1,-14,-10,-13,  3, -9,-21,-23,-23,-10;
/M: SY='T';  M= -6, -4,-21, -7, -2,-13,-17,-11, -8, -5,-10, -6, -2,-11, -5, -6,  1,  4, -5,-27,-10, -4;
/M: SY='Y';  M=-19,-22,-27,-24,-22, 35,-30, 11,  2,-14,  3,  1,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -5, 22, 65,-22;
/M: SY='T';  M= -5, -5,-17, -9, -5,-10,-18, -9,-11, -3,-12, -7, -3,-15, -3, -2,  6, 12, -6,-22, -3, -5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,117,-50,-50,-20,-30,-30,-28,-30,-19,-19,-20,-40,-30,-30,-10,-10, -9,-49,-29,-30;
/M: SY='Q';  M= -5, -7,-20, -9,  0,-15,-20, -8, -8,  0, -9, -3, -5,-16,  2,  2, -1,  1, -5,-25, -9,  1;
/M: SY='V';  M= 16,-20,-12,-25,-20, -8,-17,-23, 10,-15,  2,  2,-19,-21,-19,-17, -3,  0, 23,-25,-13,-20;
/M: SY='S';  M= -3,  0,-20, -3,  3,-19,-13, -6,-16, -1,-17,-10,  2,-13,  3,  0,  6,  6,-12,-25,-12,  3;
/I:         I=-5; MD=-12;
/M: SY='H';  M= -9, 11,-19,  5, -2,-13, -9, 25,-16, -5,-17, -9, 19,-16,  1, -3,  1, -5,-19,-23, -1, -2; D=-2;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='N';  M=  0,  1,-16,  0, -2,-14,  2, -7,-14, -4,-14,-10,  5, -9, -4, -4,  4, -1,-10,-21,-12, -4; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='N';  M= -2,  1,-16,  0,  0,-14, -6, -2,-12, -3,-12, -8,  4,-11, -1, -3,  4,  0,-10,-22, -9, -1; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='S';  M=  0, -3,-19, -3, -2,-17, -2, -7,-16, -6,-15,-11, -1, -5, -4, -8,  3, -1,-12,-20,-13, -4; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='G';  M= -2, -5,-19, -7, -7,-13,  3,-11,-13, -9,-12, -8, -2,-12, -8, -9,  0, -4, -9,-20,-12, -8; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M:         M= -3, -9,-21, -9, -5,-14,-10,-10, -8, -7, -9, -4, -7, -7, -5, -7, -2, -2, -6,-21,-11, -6; D=-2;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='S';  M= -3, -4,-21, -5, -1,-16,-14,-10,-12, -4,-13, -8, -3, -8, -3, -5,  2,  1, -8,-27,-12, -2;
/M: SY='E';  M= -4, -2,-22, -1,  1,-18,-16, -7,-13, -3,-12, -8, -2,-10,  0, -3,  1,  0, -9,-27,-11,  0;
/M: SY='E';  M= -4, -1,-22,  0,  8,-20,-14, -5,-18, -1,-18,-11,  0, -5,  6, -3,  7,  3,-15,-27,-11,  6;
/M: SY='K';  M=  1, -8,-21,-10, -3,-17,-16,-13,-12,  5,-11, -6, -7,-12, -2,  3, -4, -4, -6,-23,-13, -3;
/M: SY='T';  M= -3,  1,-19, -2,  4,-18,-15,-10,-15,  0,-16,-11,  2, -8, -1, -2,  7,  9,-10,-29,-14,  1;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-17,-30,-23,  6,-29,-24, 20,-23, 17, 10,-23,-24,-22,-20,-15, -3, 21,-20, -3,-23;
/M: SY='S';  M=  3,  1,-14, -3, -1,-16,-10, -9,-15, -7,-20,-14,  6,-12, -1, -7, 21, 18, -9,-32,-14, -1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS50853(15)

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	5'148 in 2'235 different sequences
Number of true positive hits	5'135 in 2'222 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	13 in 13 different sequences
Number of false negative sequences	148
Number of 'partial' sequences	4

Precision (true positives / (true positives + false positives))	99.75 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	97.20 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	144
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Ig-like
Version [info]	7

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	2222 sequences 1A01_GORGO (P30375), 1A01_PANTR (P16209), 1A01_PONPY (P16211), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	148 sequences BAG_STRAG (P27951), BY55_HUMAN (O95971), CD244_MOUSE (Q07763), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	4 sequences A1BG_RABIT (P85980), IGNAR_GINCI (P83977), PIGR_CAPHI (P85296), PIGR_PIG(Q29244) » more
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	13 sequences CTU2_YARLI (Q6CF50), EVA4_RHISA (P0C8E9), HIRA_DICDI (Q86HX1), » more
PDB [Detailed view]	4168 PDB 15C8; 1A0Q; 1A14; 1A1M; 1A1N; 1A1O; 1A2Y; 1A3L; 1A4J; 1A4K; 1A6A; 1A6U; » more