PROSITE entry PS50600
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| PURL [info] | https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50600 |
| Entry name [info] | ULP_PROTEASE |
| Accession [info] | PS50600 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2002 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50600 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Ubiquitin-like protease family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=176; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=171; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6647000; R2=0.0125284; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11092.2392578; R2=5.0040898; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=546; H_SCORE=13824; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=386; H_SCORE=13024; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-7; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M= -9,-25,-23,-30,-24, 3,-32,-17, 24,-17, 11, 12,-20,-24,-18,-13,-16, -7, 22,-18, 4,-23; /M: SY='V'; M= 0,-12,-14,-13, -5,-15,-21,-16, -2, -6, -3, -2,-12,-15, -4,-10, -5, -3, 1,-26,-12, -5; /M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-34,-26, 4,-33,-24, 33,-24, 20, 19,-23,-24,-18,-22,-18, -8, 26,-21, -1,-24; /M: SY='T'; M= -1, -6,-16, -9, -6,-16,-17,-14,-14, -2,-14,-10, -4,-12, -3, 2, 5, 10, -7,-22,-12, -6; /M: SY='N'; M=-10, 3,-24, -2, -2,-14,-12, -3, -9, -4,-10, -5, 9,-18, -3, -5, -5, -6,-11,-27,-10, -2; /M: SY='K'; M= -8, 2,-27, 3, 15,-26,-17, -5,-23, 17,-20,-10, 1, -7, 11, 14, -3, -6,-20,-25,-14, 12; /M: SY='D'; M=-17, 26,-27, 35, 9,-16,-16, -6,-27, -1,-21,-20, 10,-14, -6, -8, -4, -8,-21,-29,-10, 2; /M: SY='F'; M=-12,-18,-22,-19,-16, 15,-23,-17, 6,-20, 12, 3,-17,-24,-20,-15,-15, -8, 5,-15, 4,-18; /M: SY='K'; M= -6, -3,-20, -2, 2,-18,-15, -6,-21, 3,-18,-12, -5,-15, -1, -1, -3, -4,-16,-12, -8, 1; /M: SY='T'; M= -7, -9, 4,-12, -6,-16,-22, -8,-13,-13,-11, -9, -6, -9, -7,-12, 1, 6,-10,-33,-13, -8; /M: SY='L'; M=-11,-20,-22,-20,-14, 5,-28,-18, 13,-24, 29, 12,-22,-22,-17,-19,-23,-10, 6,-21, -2,-16; /M: SY='A'; M= 3, -4,-21, -7, -1,-15,-15,-10,-11, 2,-13, -8, -2,-15, -1, 0, 0, -3, -7,-23,-10, -2; /M: SY='P'; M= -8, 0,-30, 3, 10,-28,-13,-11,-24, 10,-25,-16, -2, 15, 1, 2, -4, -8,-22,-27,-20, 4; /M: SY='P'; M= -6, -6,-29, -6, -3,-25, -2, -2,-25, 2,-24,-13, -1, 9, -2, 1, -3, -8,-23,-26,-17, -4; /M: SY='E'; M=-11, 6,-27, 6, 9,-23, -7, 4,-25, 1,-19,-13, 8,-10, 6, 5, -2, -6,-24,-26,-11, 6; /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='W'; M=-18,-35,-32,-37,-28, 19,-24,-24, -9,-22, -6,-10,-33,-30,-23,-20,-32,-21,-15, 86, 26,-23; /M: SY='L'; M= -7,-29,-18,-30,-24, 12,-29,-23, 21,-26, 30, 14,-27,-28,-24,-20,-20, -6, 20,-21, -1,-24; /M: SY='N'; M= -7, 16,-21, 8, -1,-19, 3, -3,-19, -7,-18,-15, 26,-18, -5, -7, 6, 1,-21,-33,-18, -3; /M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 48, 14,-34,-10, -2,-33, 1,-28,-25, 17,-10, 2, -7, 6, -2,-25,-38,-18, 8; /M: SY='T'; M= -4, -1,-19, 0, 1,-14,-19,-11, -9, -8, -8, -7, -5,-11, -4,-11, 4, 10, -4,-27, -9, -2; /M: SY='H'; M= -8,-12,-24,-17,-15,-10,-25, 10, 9,-15, -1, 8, -7,-20, -8,-12, -9, -9, 7,-27, 0,-15; /M: SY='I'; M= -9,-25,-25,-33,-24, 0,-33,-21, 33,-22, 19, 24,-19,-21,-15,-20,-17, -5, 21,-21, -1,-22; /M: SY='D'; M= -5, 22,-18, 23, 17,-24,-11, -3,-26, -2,-22,-20, 15,-12, 1, -8, 3, -4,-23,-33,-18, 9; /M: SY='F'; M=-10,-25,-21,-32,-24, 37,-26,-11, 5,-22, 9, 8,-20,-26,-24,-18,-18,-10, 4, 4, 20,-23; /M: SY='Y'; M=-16,-20,-26,-21,-18, 21,-27, 3, 3,-13, 6, 8,-19,-23,-13,-10,-19, -9, -3, 6, 39,-18; /M: SY='L'; M= -3,-17,-19,-21,-17, -4,-22,-17, 12,-18, 13, 12,-18,-22,-13,-17,-11, -1, 11,-22, -4,-16; /M: SY='K'; M= -8, 2,-19, 1, 8,-23,-16, -7,-22, 13,-21,-11, 4, -9, 5, 10, 1, -3,-18,-29,-15, 6; /M: SY='Y'; M=-11,-21,-23,-23,-19, 13,-28, -5, 10,-18, 17, 9,-20,-26,-16,-15,-20, -9, 5, -7, 20,-19; /M: SY='L'; M=-10,-28,-24,-31,-22, 4,-30,-19, 22,-22, 26, 19,-25,-21,-17,-17,-23,-10, 13,-13, 2,-21; /M: M= -4,-13,-13,-15, -8,-13,-14,-15, -9, -8,-10, -4,-11,-18, -5,-10, -3, -1, -5,-12, -8, -6; /M: SY='H'; M=-14, 2,-23, 3, 9,-20,-16, 13,-24, 5,-17, -8, 3,-15, 8, 9, -6, -9,-22,-26, -7, 7; /M: SY='R'; M=-12, -8,-26, -8, 2,-18,-17, 1,-18, 9, -9, -3, -4,-17, 7, 19, -8, -7,-15,-23, -8, 3; /M: SY='L'; M= -4,-14,-20,-18,-12, -4,-20,-16, 4,-15, 5, 3,-10,-21,-11,-13, -6, -2, 4,-17, -6,-11; /M: M= -3,-13,-21,-15, -9, -6,-12,-15, -7, -9, -3, -4, -9,-12,-10, -8, -4, -1, -6,-22, -9,-10; /M: SY='E'; M= -5, -5,-24, -5, 6,-18,-14,-11,-19, 4,-19,-13, -2, 1, -1, 3, 3, 2,-16,-27,-15, 1; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='D'; M= -8, 10,-22, 13, 8,-24,-13, 5,-24, 8,-21,-13, 6,-10, 6, 6, 3, 0,-18,-26,-10, 6; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='E'; M= -6, -2,-21, -1, 2,-14,-10, -6,-12, -6, -9, -5, -2, -1, -2, -7, -1, -4,-13,-23, -9, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='K'; M= -5, -5,-23, -6, -1,-18,-15,-10, -8, 3,-13, -4, -3, 0, 1, -1, -3, -2, -9,-22,-12, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='N'; M= -1, -3,-20, -7, -3,-14, -8, -9,-10, -1,-10, -7, 2, -9, -4, -3, -1, -2,-10,-21,-10, -5; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-22, 0, 5,-15,-14, 4,-15, 1,-14, -8, 2, -8, 8, 2, 0, -4,-17,-18, -1, 5; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='R'; M= 1, -6,-18, -9, -2,-10,-11, -5,-15, 6,-11, -7, -2,-11, -1, 16, -2, -4,-10,-15, -6, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='N'; M= -3, 5, -8, 3, 2,-11, -7, -1,-12, 0,-13, -9, 7, -9, 2, 0, 5, 2,-10,-16, -5, 1; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='C'; M= -3,-22, 19,-27,-25, -4,-27,-25, 7,-22, -2, -2,-19,-27,-23,-22, -5, 1, 17,-30,-10,-25; /M: SY='H'; M= -8,-10,-25,-13,-10, -6,-20, 36,-12,-11, -9, 1, -4,-20, -3, -5, -8,-10,-12,-14, 16, -9; /M: SY='F'; M= -2,-18,-19,-25,-20, 13,-21,-19, 8,-18, 7, 4,-12,-23,-20,-17,-11, -6, 7,-16, 0,-20; /M: SY='F'; M=-13,-22,-17,-28,-20, 24,-27,-17, 4,-17, 11, 8,-17,-20,-22,-14,-18, -9, 3,-13, 5,-20; /M: SY='N'; M=-12, 26,-25, 21, 3,-24, -7, 6,-25, 1,-28,-20, 31,-13, 2, 2, 4, -4,-28,-28,-15, 2; /M: SY='T'; M= -1, -6,-14, -9, -7,-19,-11,-18,-18,-10,-21,-15, -3, 12, -9,-11, 14, 21,-12,-32,-19, -9; /M: SY='F'; M=-15,-28,-19,-36,-27, 48,-26,-19, -3,-25, 2, -2,-21,-28,-30,-19,-19,-11, -4, 24, 23,-25; /M: SY='F'; M=-16,-24,-22,-31,-21, 47,-28,-17, -3,-14, 8, 3,-17,-26,-26,-10,-19,-10, -2, -1, 17,-20; /M: SY='W'; M=-10,-25,-28,-27,-22, 14,-24,-10, -2,-16, -3, -4,-24,-21,-17,-16,-18, -8, -5, 34, 29,-20; /M: SY='S'; M= -7, -2,-23, -3, -5,-13, -8, -8,-18, -1,-19,-10, 1, -6, -7, -3, 2, 0,-13,-26,-12, -6; /M: SY='K'; M=-11, -1,-25, -5, -1,-16,-17, 2,-19, 18,-15, -3, 4,-17, 3, 17, -7, -8,-16,-24, -7, 0; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-31,-22, 10,-30,-20, 20,-28, 41, 17,-29,-29,-20,-20,-28,-10, 11,-12, 4,-21; /M: SY='T'; M= 3, -9,-17,-13, -7,-14,-16,-13, -5, -7, -3, -3, -6,-16, -2, -7, 4, 5, -2,-27,-11, -5; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='S'; M= -2, 1,-17, -1, 5,-15, -9, -7,-17, -3,-15,-11, 3,-11, 3, -1, 10, 7,-13,-25,-12, 4; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='R'; M= -5, 3,-12, 4, 1,-15,-11, -1,-16, 7,-11, -8, 2,-11, 0, 8, -5, -6,-11,-18, -8, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='F'; M= -8,-10,-17,-11, -9, 6,-14, -9, 1,-12, 2, 0,-10,-11,-10,-11, -9, -6, 0, -8, 5,-10; D=-2; /I: I=-2; MD=-9; /M: SY='A'; M= 5, -3,-14, -5, 1,-15, -9, -5,-14, 5,-13, -8, -2, -1, 0, 3, 3, 2, -9,-17,-10, 0; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='N'; M= -3, 13, -8, 8, 1,-15, -4, -2,-15, 4,-18,-12, 17,-10, 0, 0, 6, 0,-14,-23,-12, 0; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='G'; M= -5, -6,-19, -6, -9, -5, 15,-11,-13,-12,-10, -6, -3,-13,-12,-12, -4,-10,-11,-12, -9,-10; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='K'; M= -4, -5,-14, -6, -1,-11,-10, -7, -5, 1, -6, -1, -3,-11, 1, 0, -1, 1, -2,-18, -8, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='A'; M= 2, -1, -9, -2, -2,-18, -4, 2,-19, 0,-15, -9, 0,-12, 0, 1, 1, -3,-13,-20,-10, -2; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='A'; M= 5, -3,-17, -5, -5,-18, -8,-13,-13, -3,-10, -8, -4,-15, -7, -7, -4, -8, -9,-22,-12, -7; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='N'; M= -7, 3,-26, -1, 2,-15, 2, -1,-20, -2,-19,-13, 9,-12, -3, -4, -2, -9,-21,-21, -9, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='Y'; M=-15, -5,-20, -4, -8, 2,-21, 9,-13, -4,-10, -5, -4,-22, -4, 2, -9, -8,-13, -8, 21, -8; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: SY='P'; M= -4, -5,-27, -2, 8,-26,-15,-11,-19, 8,-21,-12, -5, 9, 2, 0, -3, -7,-15,-27,-18, 4; /M: SY='R'; M= -3, -5,-25, -7, -2,-21, -4,-11,-21, 2,-20,-11, 0, 0, -3, 5, 1, -2,-18,-26,-18, -4; /M: SY='V'; M= -8, -6,-20, -9, -8, -5,-17,-12, -3, -6, -8, -5, -2,-22,-10, -4, -5, -5, 4,-26, -9, -9; /M: SY='R'; M=-10,-14,-23,-16, -8, -8,-22,-10, -5, 5, -1, 5,-11,-20, -2, 10,-10, -6, -3,-20, -3, -6; /M: SY='R'; M=-14, -4,-29, -3, 8,-25,-20, 0,-29, 33,-24,-10, 1,-14, 10, 42, -8, -8,-21,-22, -9, 7; /M: SY='W'; M=-17,-35,-43,-36,-27, 11,-20,-26,-16,-19,-17,-17,-34,-29,-19,-19,-31,-23,-23,117, 26,-19; /M: SY='T'; M= 1,-15,-20,-21,-16, -8,-14,-21, 1,-15, -2, -1,-11,-17,-13,-16, -1, 8, 2,-12, -7,-15; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='R'; M=-11, 0,-26, 0, 7,-22,-18, -6,-22, 20,-17, -9, 2,-10, 6, 21, -6, -4,-18,-23,-11, 5; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='D'; M=-13, 15,-28, 20, 5,-28, -8, 1,-28, 5,-24,-17, 9, -1, -1, -1, -3, -8,-24,-30,-15, 1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='V'; M= -2,-24,-16,-27,-23, 5,-27,-24, 17,-17, 6, 5,-22,-21,-23,-18,-10, 0, 25,-21, -3,-24; /M: SY='D'; M=-16, 40,-29, 55, 20,-37,-11, 3,-37, 3,-28,-26, 17,-10, 2, -7, 0,-10,-28,-37,-18, 11; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='L'; M= -8,-24,-20,-27,-20, 2,-27,-20, 20,-18, 21, 15,-22,-23,-16,-14,-18, -6, 16,-14, -1,-19; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='F'; M=-10,-19,-15,-24,-16, 33,-20,-12, 2,-16, 9, 5,-14,-19,-18,-11,-14, -7, 1, -1, 12,-15; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='D'; M= -4, 9,-12, 11, 8,-19, -9, -1,-19, 2,-15,-12, 7, -9, 1, -1, 2, -3,-15,-24,-12, 4; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='K'; M= -5, -2, -7, -2, 4,-12,-14, -9,-18, 14,-16, -8, -3,-11, 0, 5, -4, -6,-12,-17, -8, 2; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='D'; M= -8, 22,-19, 31, 11,-24, -7, -3,-24, 5,-20,-17, 9, -7, 1, -3, 2, -4,-17,-24,-13, 6; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='Y'; M=-10,-15,-19,-18,-15, 12,-22, 6, 5,-13, 3, 5,-12,-19,-10,-11,-11, -4, 1, 0, 26,-15; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-35,-28, 3,-35,-26, 37,-27, 23, 17,-24,-25,-22,-25,-20, -8, 29,-20, 1,-28; /M: SY='F'; M=-16,-26,-23,-30,-24, 40,-30, -9, 7,-22, 11, 4,-21,-26,-25,-17,-19, -8, 3, 5, 33,-24; /M: SY='V'; M= 2,-23,-17,-29,-24, 0,-27,-25, 23,-21, 11, 11,-20,-22,-20,-21, -9, 1, 25,-23, -6,-23; /M: SY='P'; M=-10,-21,-39,-13, -3,-27,-22,-21,-14,-12,-26,-17,-20, 80,-11,-21,-11,-10,-25,-29,-27,-12; /M: SY='I'; M= -8,-27,-22,-34,-26, 1,-32,-21, 35,-23, 22, 29,-23,-23,-17,-22,-19, -8, 26,-22, -2,-24; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='N'; M= -7, 10,-14, 3, 0,-12, -7, 12, -7, -2,-11, -5, 18,-10, 5, -1, 1, -4,-12,-18, -5, 1; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='H'; M=-12, -1,-19, -5, -7,-13,-16, 8,-20, -8,-20,-13, 4,-21, -5, -8, -7, -7,-21, 4, 0, -6; /M: SY='E'; M= -7, 3,-22, 4, 9,-24, -1,-10,-22, -1,-17,-13, 2,-14, -2, -7, -3,-10,-19,-28,-18, 3; /M: SY='D'; M= -4, 8,-19, 12, 5,-27, 6,-10,-29, -8,-26,-21, 6,-10, -3,-12, 7, -4,-23,-26,-20, 1; /M: M= -5, -5,-15, -7, -1, -8,-18,-11, -8, -5, -7, -5, -3,-18, -7, -7, -2, -3, -5,-25, -8, -4; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='V'; M= 2,-17, 3,-21,-19, 0,-19,-20, 0,-18, -6, -5,-13,-23,-19,-17, 5, 6, 12,-28, -8,-19; /M: SY='L'; M= 2,-20,-19,-23,-18, -4, -7,-18, 4,-21, 18, 11,-18,-23,-16,-18,-13, -6, 2,-21, -9,-17; /M: SY='L'; M= 5,-24,-13,-28,-21, -3,-18,-22, 13,-23, 19, 10,-22,-24,-19,-21,-14, -7, 13,-23, -9,-20; /M: SY='V'; M= 2,-21,-20,-25,-22, -8,-17,-15, 16,-20, 1, 5,-15,-21,-18,-21, -6, -5, 19,-25, -8,-22; /M: SY='I'; M= -4,-29,-23,-36,-29, -1,-35,-29, 40,-26, 17, 15,-23,-23,-23,-26,-16, -6, 34,-23, -4,-29; /M: SY='B'; M=-11, 15, 15, 10, -5,-23,-14, -2,-25, -9,-24,-19, 15,-22, -8,-11, 2, -3,-19,-40,-19, -7; /M: SY='L'; M=-11,-11,-22,-16,-15, 0,-24, -5, 9,-18, 16, 10, -7,-24,-13,-14,-16, -8, 3,-25, -3,-15; /M: SY='P'; M= -9, -6,-31, -5, 0,-25, -8,-11,-21, -2,-24,-15, -1, 26, -2, -4, -3, -8,-24,-28,-22, -3; /M: SY='D'; M=-10, 7,-26, 11, 11,-23,-10, -7,-24, 9,-22,-15, 4,-12, 4, 7, 0, -7,-19,-27,-14, 7; /M: SY='R'; M= -9, -9,-22,-10, -5,-19, -2,-10,-26, 8,-20,-12, -4,-19, -1, 13, -8,-10,-20, -8, -9, -4; /M: M= 0,-10,-20,-13, -3,-12,-18, -2, -7, -6, -2, 0, -8,-16, -2, -6, -3, -1, -5,-23, -4, -3; /M: SY='I'; M= -9,-20,-17,-23,-22, -2,-28,-21, 19,-19, 7, 8,-18,-23,-17,-20,-14, -8, 17,-22, -2,-21; /M: SY='E'; M= -5, 2,-25, 7, 11,-19,-15,-10,-20, -4,-18,-16, -4, -2, -2, -8, 0, -1,-16,-20,-11, 4; /I: I=-1; MD=-5; /M: M= -4, -5, 0, -7, -7, -6,-12, -9, -4, -5, -7, -5, -2,-12, -7, -2, 0, -1, -1,-17, -7, -8; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='Y'; M= -6, -7,-14, -7, -8, -1, -6, 7, -3, -7, -1, 4, -5,-12, -4, -7, -6, -6, -5, -5, 10, -7; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='D'; M= -5, 6,-12, 11, 3,-12, -9, -4, -9, -4, -4, -6, 0, -8, -1, -6, 0, -1, -6,-18, -7, 1; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='I'; M= -3, -7,-12,-10, -9, -5,-14,-12, 10,-11, 1, 2, -4, -8, -7,-11, 0, 5, 7,-15, -4, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='L'; M= -4,-10,-13,-11, -8, 0,-15, -7, 4, -7, 8, 4,-10,-13, -8, -7,-10, -5, 4,-12, -1, -9; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='Y'; M=-12,-19,-24,-23,-19, 8,-29, 1, 10,-15, 3, 5,-15,-23,-14,-14,-12, -2, 7, -9, 22,-19; /M: SY='Y'; M=-14,-21,-24,-24,-19, 21,-26, -6, 4,-16, 11, 5,-17,-27,-16, -8,-18, -8, -1, 1, 25,-18; /M: SY='D'; M=-19, 45,-30, 64, 25,-39,-11, 0,-39, 1,-29,-29, 17, -9, 3, -9, 0,-10,-30,-39,-20, 14; /M: SY='S'; M= 8, -1,-15, 0, -1,-22, 1, -7,-22,-10,-28,-19, 7, -4, -2,-11, 29, 12,-13,-37,-20, -2; /M: SY='L'; M= -6,-18,-15,-22,-15, 2,-24,-15, 6,-15, 18, 10,-16,-24,-11,-12,-17, -8, 3,-21, -4,-13; /M: M= -3,-13,-22,-16,-13,-10,-12,-15, -4, -6, -9, -4, -7,-15,-10, -2, -1, -2, 0,-23, -9,-13; /M: SY='N'; M= -4, 0,-21, -3, -6,-18, -4, -7,-15, -7,-13,-10, 4,-14, -5, -4, 1, 0,-12,-29,-15, -7; /M: SY='H'; M= -2, -9,-24, -9, -4,-16, -1, 1,-19,-10,-13, -9, -4, -6, -5, -8, 0, -6,-17,-25,-11, -6; /I: I=-2; MD=-8; /M: SY='H'; M=-10, 4,-19, 3, 0,-14,-10, 14,-17, 3,-16, -8, 9, -3, 2, 8, -2, -4,-17,-18, -3, -1; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='L'; M= -6,-12,-12,-13,-10, 6,-15, -4, 7,-11, 13, 8,-12,-13, -7, -8,-11, -2, 3, -4, 11,-10; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='I'; M= -3,-11,-11,-12, -7, -3,-15,-11, 9, -8, 6, 4, -9,-11, -7, -8, -6, -3, 9,-13, -3, -8; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='Q'; M= -4, 1,-13, 2, 6,-14, -9, 1,-12, 4,-11, -5, 1, -7, 8, 6, 2, -2, -9,-16, -7, 7; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='E'; M= 1, -3, -6, -4, 3, -8,-10, -6,-11, 1, -6, -6, -4, -9, -2, 2, -3, -4, -8,-14, -8, 0; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='E'; M= -6, -4,-16, -4, 5, -6,-11, -2, -7, 1, -6, -1, -4, -9, 1, 0, -3, -2, -7,-10, 2, 2; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='C'; M= 3, -6, 12, -8, -6,-13, -8, -7,-12, -7,-13, -9, -4, -7, -6, -9, 6, 1, -5,-22,-12, -7; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: M= -1, -7,-16, -7, -4,-10,-14, -9, -4, 0, -3, -2, -8, -2, -3, -4, -6, -3, -4,-13, -4, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='D'; M= -9, 7,-21, 13, 9,-20,-12, -2,-17, 1,-14,-11, 2, 2, 2, -2, -2, -6,-15,-23,-12, 4; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='K'; M= -4, -7,-18, -6, 2,-10,-16, -6, -9, 9,-10, -5, -7, -8, -1, 3, -5, -4, -5,-12, 1, 0; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='R'; M= -9, -8,-13, -9, -5, -2,-17, -5, -7, -3, -1, -3, -5,-17, -5, 4, -7, -4, -7,-13, 3, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='K'; M= -2, -5,-17, -4, -2,-16, -9,-10,-10, 5,-12, -6, -4,-12, -1, 4, -1, -3, -4,-21,-11, -2; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -3, 9,-23,-18, -8,-19, 14,-19, -9, -2, -1, 9, 11, -1, 0,-16,-23,-12, 8; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='N'; M= -8, 6,-26, 6, 3,-23,-11, -5,-18, -3,-22,-14, 8, 7, 3, -5, 0, -3,-20,-28,-16, 1; D=-2; /I: I=-2; DM=-8; /M: SY='Y'; M=-14,-20,-25,-23,-17, 17,-21, 1, 1,-19, 8, 4,-15,-25,-16,-13,-17,-10, -4, -7, 19,-17; /M: SY='D'; M=-12, 10,-21, 13, 4,-18,-10, -5,-19, -7,-14,-12, 5,-11, -6,-10, -4, -7,-18,-30,-14, -1; /M: SY='M'; M= -4,-13,-16,-14, -8, -8,-22,-14, -2, -4, -1, 1,-13,-20, -4, -7, -8, -6, 1,-22, -6, -6; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='T'; M= -7, -3,-14, -7, -4, -8,-16, -7, -9, -5,-10, -4, -2,-16, -4, -6, 0, 3, -6,-24, -7, -4; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='P'; M= -6, -3,-21, -2, 3,-23,-10, -3,-21, -1,-22,-14, 0, 7, 0, -4, 0, -6,-20,-23,-15, 0; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='F'; M=-16,-22,-20,-27,-23, 39,-26,-18, 0,-22, 5, -2,-19,-26,-27,-17,-19,-11, -2, 13, 18,-22; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='Q'; M= -3, -3,-22, -4, 3,-20, -7, -7,-18, 1,-19,-10, -1, -1, 6, -3, 3, 1,-16,-21,-10, 4; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='Y'; M=-12,-19,-23,-22,-17, 2,-24, -8, 6, -7, 3, 8,-16,-21, -8, 1,-15, -7, 3, 3, 13,-15; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='K'; M= -9, -7,-22, -9, 1, -6,-20, -8, -9, 4, -9, -5, -5,-10, 0, 4, -6, -4, -9,-16, -3, 0; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='N'; M= -9, 4, -9, 1, -3,-17,-14, -1,-18, 1,-15,-11, 7,-13, -1, 6, -2, -4,-16,-25,-10, -3; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='M'; M= -3,-15, -9,-20,-14, -7,-21,-10, 9,-15, 7, 10,-11,-19, -8,-13,-11, -7, 5,-22, -6,-12; D=0; /I: I=0; MD=-2; /M: SY='E'; M= -8, 0,-22, 2, 3,-19,-14, -6,-12, -4,-11, -8, -2, 1, 2, -7, -2, 0,-12,-24,-12, 1; D=0; /I: I=0; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: SY='K'; M= -7, 5,-24, 2, 5,-24, -4, -5,-24, 13,-23,-13, 8, -9, 6, 11, -1, -5,-21,-23,-15, 5; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='V'; M= -1,-24,-10,-27,-23, -2,-26,-24, 18,-19, 11, 9,-23,-26,-21,-16, -9, 1, 28,-28, -9,-23; /M: SY='P'; M= -5,-15,-33,-11, -3,-19,-18,-13,-16, -7,-23,-15,-14, 49, -6,-15, -8, -8,-23,-20,-13, -8; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-28, -3, 11,-31,-20, 2,-17, 9,-15, -2, -2,-13, 35, 12, -3, -9,-21,-22,-10, 22; /M: SY='Q'; M=-11, 12,-27, 6, 12,-32,-14, 12,-21, 8,-24, -7, 19,-14, 36, 9, 2, -7,-29,-27,-12, 24; /M: SY='P'; M= -9, -7,-26, -8, -4,-18,-18,-11,-12, 2,-14, -6, -4, 3, -2, 2, -4, -1,-13,-25,-11, -5; /M: SY='N'; M= -9, 20,-22, 8, -2,-19, -7, -1,-15, -3,-22,-15, 31,-14, -3, -1, 6, 4,-20,-34,-17, -3; /M: SY='T'; M= -5, 5,-20, 4, -5,-12, -3,-13,-20, -9,-19,-14, 4,-10, -9,-11, 9, 11,-14,-28,-13, -7; /M: SY='G'; M= -6,-14,-19,-16,-17, 1, 11, -9,-19,-18,-16,-12, -7,-18,-17,-16, 0, -8,-14,-12, 2,-18; /M: SY='D'; M=-19, 45,-30, 62, 19,-38,-11, 4,-38, 1,-29,-28, 20,-11, 1, -7, 0,-10,-30,-39,-18, 10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= 0, -8,-29, -7,-18,-30, 64,-19,-39,-19,-30,-20, 1,-19,-18,-19, 2,-18,-29,-22,-29,-18; /M: SY='I'; M= -2,-24,-23,-24,-17,-10,-25,-24, 12,-18, 1, 3,-23, 10,-18,-21,-11, -5, 12,-27,-14,-20; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-24,-22,-20, 30,-27, 17, -3,-17, -1, 0,-14,-27,-17,-12,-15,-10, -4, 3, 40,-20; /M: SY='V'; M= 9,-14,-14,-20,-17, -9,-18,-17, 7,-15, -1, 3,-11,-19,-14,-16, 2, 7, 15,-27,-11,-16; /M: SY='C'; M= -8,-19, 20,-27,-21, -5,-25,-16, 2,-20, 12, 15,-18,-28,-15,-16,-17, -9, 2,-30,-11,-18; /M: SY='K'; M= -6, -6,-25, -9, 2,-11,-19, 0,-14, 11,-10, 1, -5,-15, 3, 4,-10, -9,-13,-17, -1, 2; /M: SY='F'; M=-17,-13,-22,-23,-21, 45,-24,-10, -2,-21, 1, -1, -5,-26,-26,-15,-13, -7, -5, -1, 22,-21; /M: SY='I'; M= 4,-19,-14,-25,-17, -6,-24,-22, 13,-20, 11, 5,-16,-19,-13,-19, -6, 4, 11,-24, -8,-17; /M: SY='E'; M=-11, 5,-28, 10, 33,-24,-19, -3,-25, 11,-16,-15, 1, -8, 12, 11, -2, -8,-23,-28,-16, 22; /M: SY='Y'; M=-11,-17,-14,-19,-12, 2,-21, -7, -4,-11, 2, 1,-13,-23,-10, -4,-11, -6, -5,-15, 6,-13; /M: SY='F'; M=-14,-24,-23,-28,-19, 27,-27,-11, 8,-24, 17, 7,-20,-26,-20,-17,-20,-10, 2, -7, 15,-19; /I: MD=0; /M: D=0; /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; /M: D=0; /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; /M: D=0; /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; /M: D=0; /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; /M: D=0; /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; /M: D=0; /I: I=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; /M: D=0; /I: I=0; E1=0; MI=0; IE=0; DE=0;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 42 in 42 different sequences |
| Number of true positive hits | 42 in 42 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 12 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 77.78 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | L_Falquet |
| Version [info] | 7 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
42 sequences
CDUB1_CHLT2 (B0B9A0), CDUB1_CHLTR (O84876), ESD4_ARATH (Q94F30), NEP2_SCHPO (O13612), NESP1_SCHPO (O42980), RUBP1_ARATH (Q9LSS7), SENP1_HUMAN (Q9P0U3), SENP1_MOUSE (P59110), SENP1_PONAB (Q5RBB1), SENP2_HUMAN (Q9HC62), SENP2_MOUSE (Q91ZX6), SENP2_PONAB (Q5R7K7), SENP2_RAT (Q9EQE1), SENP3_HUMAN (Q9H4L4), SENP3_MOUSE (Q9EP97), SENP5_HUMAN (Q96HI0), SENP5_MACFA (Q8WP32), SENP5_MOUSE (Q6NXL6), SENP6_HUMAN (Q9GZR1), SENP6_MOUSE (Q6P7W0), SENP7_BOVIN (A7MBJ2), SENP7_HUMAN (Q9BQF6), SENP7_MOUSE (Q8BUH8), SENP7_RAT (D3ZF42), SENP8_DICDI (Q54XR2), SENP8_HUMAN (Q96LD8), SENP8_MOUSE (Q9D2Z4), SENP8_RAT (Q5FVJ8), SENP_CAEEL (Q09353), ULP1A_ARATH (Q8GYL3), ULP1B_ARATH (O65278), ULP1C_ARATH (Q8RWN0), ULP1D_ARATH (Q2PS26), ULP1_SCHPO (O42957), ULP1_YEAST (Q02724), ULP2A_ARATH (Q0WKV8), ULP2B_ARATH (Q8L7S0), ULP2_CAEEL (Q23238), ULP2_SCHPO (O13769), ULP2_YEAST (P40537), ULP4_CAEEL (Q09275), YR355_MIMIV (Q5UQV0)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
12 sequences
CDUB1_CHLTA (Q3KKG8), CDUB1_CHLTB (B0BAX9), CDUB1_CHLTJ (C4PQR0), CDUB1_CHLTS (D3UTF4), CDUB1_CHLTZ (C4PLJ5), CDUB2_CHLT2 (B0B999), CDUB2_CHLTA (Q3KKG9), CDUB2_CHLTB (B0BAX8), CDUB2_CHLTJ (C4PQQ9), CDUB2_CHLTR (O84875), CDUB2_CHLTS (D3UTF3), CDUB2_CHLTZ (C4PLJ4)» more |
| PDB [Detailed view] |
37 PDB
1EUV; 1TGZ; 1TH0; 1XT9; 2BKQ; 2BKR; 2CKG; 2CKH; 2G4D; 2HKP; 2HL8; 2HL9; 2IO0; 2IO1; 2IO2; 2IO3; 2IY0; 2IY1; 2IYC; 2IYD; 2XPH; 2XRE; 3EAY; 3ZO5; 5AEK; 5B5Q; 5HAG; 5LNB; 6FDK; 6FDQ; 6FDU; 6GZS; 6GZT; 6MRN; 6NNQ; 6OAM; 7R2E » more |