PROSITE entry PS50279

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50279

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	BPTI_KUNITZ_2
Accession [info]	PS50279
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00252
Associated ProRule [info]	PRU00031

Name and characterization of the entry

Description [info]

Pancreatic trypsin inhibitor (Kunitz) family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1543; R2=0.00996029; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=738; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=537; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M:         M= -6, -3,-22, -5, -1,-12,-14, -5,-12, -5, -8, -7,  0,-17, -2, -3,  0, -1,-11,-23, -7, -3;
/M: SY='L';  M= -6,-12,-22,-12, -1,-11,-21, -8, -2,-10, 11,  6,-13,-19,  4, -8,-11, -7, -6,-23, -7,  2;
/M: SY='P';  M= -3, -7,-30, -4,  1,-26,-14,-13,-20, -4,-25,-16, -6, 38, -3,-10, -1, -5,-23,-28,-23, -4;
/M: SY='P';  M= -6,-16,-26,-16, -8,-10,-22,-11, -6, -4, -7, -2,-14,  4, -7, -3,-11, -7, -6,-21, -7, -9;
/M: SY='D';  M= -7, 16,-25, 22, 12,-24,-12, -4,-24,  0,-21,-18,  7, -9,  1, -5,  2, -6,-18,-31,-15,  6;
/M: SY='T';  M= -1, -5,-21, -6, -1,-18,-16,-10,-12, -4,-14, -9, -4, -2, -2, -5,  4,  5, -7,-28,-13, -2;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-29, -7,-16,-28, 57,-17,-36,-17,-28,-19,  1,-19,-17,-17,  0,-18,-28,-20,-26,-17;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -6, -5,-27, -4,  0,-20,-15, -9,-16, -5,-19,-12, -4, 16, -1, -7, -1, -2,-17,-27,-15, -2;
/M: SY='C';  M= -8,-16, 86,-24,-26,-20,-14,-27,-30,-27,-21,-19,-14,-35,-27,-27, -7,-10,-13,-44,-28,-26;
/M: SY='R';  M= -6, -1,-24, -2, -2,-17, -2, -7,-22,  1,-19,-11,  2,-13, -2,  3,  2, -2,-17,-24,-11, -2;
/M: SY='A';  M=  6, -2,-22, -4, -2,-20,  5,-12,-21, -5,-18,-13,  0,-10, -5, -9,  3, -4,-16,-24,-17, -3;
/M: SY='N';  M= -4, -2,-22, -5, -3,-12, -7, -3,-16, -6,-15,-10,  2,-13, -3, -6,  2, -2,-14,-22, -5, -4;
/M: SY='I';  M= -7,-15,-23,-18,-12, -3,-22,-14,  2,-10, -2,  2,-11,-11,-10, -9, -7, -3,  2,-20, -5,-12;
/I:         MD=-26;
/M: SY='T';  M= -5, -8,-23, -9, -2,-14,-17,-12,-12, -3,-13, -9, -6,  2, -4, -3,  0,  4,-10,-19,-11, -4; D=-5;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='R';  M=-12,-10,-27,-11, -2,-19,-18, -2,-21, 20,-16, -4, -3,-18,  7, 41, -8, -8,-14,-20, -9, -1;
/M: SY='W';  M=-20,-30,-34,-33,-27, 39,-27,-10, -7,-20, -4, -7,-27,-30,-23,-17,-27,-17,-14, 65, 47,-23;
/M: SY='Y';  M=-15,-21,-27,-24,-20, 29,-25,  6, -6,-15, -3, -4,-17,-27,-16,-13,-16, -9,-10, 24, 45,-19;
/M: SY='Y';  M=-19,-24,-27,-28,-24, 46,-29,  5, -1,-18,  3,  0,-20,-30,-21,-14,-20,-11, -7, 25, 56,-23;
/M: SY='D';  M=-14, 38,-25, 40,  9,-29, -7,  5,-29,  0,-28,-23, 33,-15,  0, -5,  5, -5,-27,-38,-18,  5;
/M: SY='P';  M=  1,-10,-23,-11, -5,-17,-14,-10,-12, -5,-15, -9, -6,  3, -4, -6,  2, -1,-10,-24,-14, -6;
/M: SY='E';  M= -2,  0,-22, -1,  4,-18,-12, -8,-15,  1,-15,-10,  1,-13,  1, -1,  2,  0,-11,-26,-12,  2;
/M: SY='T';  M=  1, -2,-16, -6, -4,-14,-16,-13,-11, -6,-11, -9, -2,-13, -4, -7, 11, 20, -4,-27, -9, -5;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -8, -2,-27, -4, -3,-22,  5, -3,-24,  4,-18, -8,  2,-17,  0,  5, -4,-10,-20,-23,-14, -2;
/M: SY='Q';  M= -5, -2,-22, -5,  5,-20,-17, -6,-17,  8,-15, -6,  0,-13, 10, 10,  3,  4,-14,-25,-11,  7;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -8, -5,-24, -5,  8,-16,-21, -4,-10,  2, -9, -3, -5,-14,  7,  2, -4, -5, -9,-24, -8,  7;
/M: SY='P';  M= -6, -4,-24, -3,  6,-24,-16, -7,-19,  2,-19,-10, -3,  8,  7,  2,  0, -3,-19,-27,-17,  5;
/M: SY='F';  M=-19,-28,-21,-37,-28, 70,-29,-17,  0,-28,  9,  0,-19,-29,-36,-19,-19,-10, -1, 10, 30,-28;
/M:         M= -8,-12,-24,-15, -8, -7,-21,-10, -5, -4, -6,  0,-10,-18, -4, -4, -7, -2, -4, -8, -2, -6;
/M: SY='Y';  M=-19,-21,-30,-22,-20, 28,-28, 10, -3,-12, -3, -3,-20,-27,-13,-11,-20,-11,-11, 34, 62,-20;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -5, -1,-25, -1, -7,-21, 15, -9,-24, -8,-21,-14,  4,-14, -7, -9,  3, -4,-20,-24,-14, -8;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-30, -9,-18,-28, 61,-18,-36,-19,-27,-18,  1,-20,-18,-19, -1,-19,-28,-20,-27,-18;
/M: SY='C';  M= -6,-17, 85,-26,-24,-18,-27,-25,-24,-24,-17,-16,-17,-33,-23,-24, -7, -7, -8,-43,-24,-23;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -7,  0,-28,  2,  1,-26, 13, -7,-27, -1,-20,-13,  2,-15,  0,  0, -3,-12,-23,-24,-18,  0; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='G';  M=  0, -8,-28, -9,-15,-28, 51,-17,-35,-15,-27,-17, -1,-18,-16,-15,  0,-15,-26,-21,-26,-15;
/M: SY='N';  M= -9, 34,-21, 18,  0,-21, -2,  7,-21,  1,-28,-19, 49,-18,  1,  0,  9,  1,-28,-38,-19,  1;
/M: SY='A';  M=  5, -3,-21, -4,  2,-17, -8, -5,-17, -4,-16,-10, -2,-12,  2, -6,  5, -3,-14,-21, -8,  1;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='N';  M=-10, 39,-20, 19,  0,-20,  2,  9,-21, -1,-30,-20, 58,-20, -1, -1, 10, -1,-30,-39,-20, -1;
/M: SY='N';  M=-10, 16,-23,  4, -2,-19,-10,  3,-16,  6,-22,-12, 30,-19,  3, 13,  3, -3,-20,-32,-15, -1;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-21,-39,-29, 77,-30,-17,  0,-29,  9,  0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 11, 33,-29;
/M: SY='E';  M= -4, -3,-24, -2,  5,-17,-16, -5,-15,  1,-10, -7, -5,-11,  0, -1, -4, -5,-12,-23, -7,  2;
/M: SY='T';  M=  1,  6,-13,  3, -1,-18,-10,-12,-18, -7,-21,-16,  8,-10, -3, -8, 25, 28, -9,-35,-16, -2;
/M: SY='R';  M=-10, -9,-26, -9,  2, -9,-22, -6,-10,  3, -6, -4, -7,-16,  2,  4, -9, -7,-11,-15,  2,  1;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-25, 11, 21,-27,-15,  2,-22,  4,-18,-12,  6,-10, 15,  0,  2, -6,-21,-29,-15, 17;
/M: SY='E';  M= -6,  8,-24, 12, 20,-26,-16,  4,-22,  1,-16,-12,  2,-10, 12, -3,  2, -4,-21,-29,-13, 16;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -9, -3,-25, -3, 13,-18,-19, -3,-14,  5, -8, -1, -4,-13, 10,  6, -5, -5,-15,-24, -9, 11;
/M: SY='R';  M= -7,  0,-21, -1,  6,-21,-11, -3,-22,  6,-18,-11,  3,-15,  5,  8,  1, -4,-18,-25,-12,  5;
/M: SY='F';  M= -5,-14,-20,-19,-13, 10,-22,-12, -2,-11,  0, -1,-12,-20,-13, -9, -6,  2, -1,-12,  9,-13;
/M: SY='C';  M= -9,-20,118,-30,-30,-20,-29,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-39,-30,-30,-10,-10,-10,-49,-30,-30;
/I:         E1=0;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	479 in 393 different sequences
Number of true positive hits	479 in 393 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	9
Number of 'partial' sequences	19

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	98.16 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	12
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	BPTI/Kunitz inhibitor
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	393 sequences 3API_HETMG (C0HK72), 3BPI_HETMG (C0HK73), 3CPI_HETMG (C0HK74), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	9 sequences BLI5_CAEEL (O62247), BLI5_HAECO (D3GGZ8), HAEM_HAELO (C0HMD5), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	19 sequences BMTI2_RHIMP (P83603), BMTI3_RHIMP (P83604), BMTI4_RHIMP (P83605), » more
PDB [Detailed view]	205 PDB 1AAL; 1AAP; 1ADZ; 1B0C; 1BF0; 1BHC; 1BIK; 1BPI; 1BPT; 1BRB; 1BRC; 1BTH; » more