PROSITE entry PS50268

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50268
Entry name [info]	CADHERIN_2
Accession [info]	PS50268
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00205
Associated ProRule [info]	PRU00043

Name and characterization of the entry

Description [info]

Cadherins domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=106;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=101;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8381; R2=0.02192269; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=350; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=259; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='T';  M= -7, -6,-23, -6, -2, -8,-19,-12,-10, -8, -9, -8, -6, -7, -6, -7, -2,  2, -8,-21, -7, -4;
/M: SY='P';  M= -4, -8,-27, -7,  2,-21,-18, -7,-15, -3,-17, -9, -8,  5,  5, -6, -4, -6,-17,-14,-12,  3;
/M: SY='S';  M= -3, -6,-23, -6, -1,-16,-14,-11,-12, -5,-14, -9, -4, -3, -3, -7,  1,  0,-11,-23,-12, -2;
/M: SY='P';  M= -4,-11,-24,-12, -6,-13,-19,-16, -5, -9,-11, -7, -9,  8, -9,-12, -2,  1, -5,-26,-13, -9;
/M: SY='Y';  M=-13,-14,-26,-16, -9,  6,-23,  0, -8, -2, -7, -3,-12,-15, -4,  0,-12, -7,-11, -1, 24, -9;
/M: SY='E';  M= -7, -4,-23, -4,  3,-14,-18, -5,-13, -4,-13, -9, -3, -5, -1, -3,  0,  1,-11,-24, -7,  0;
/M: SY='V';  M=  1,-20,-15,-25,-20,  1,-13,-21,  4,-19, -1,  0,-15,-20,-20,-19, -7, -5,  8,-20, -7,-20;
/M: SY='S';  M= -3, -4,-20, -5,  4,-14,-16, -7,-14, -1,-15,-10, -1,-13,  1,  0,  6,  5, -9,-26,-10,  2;
/M: SY='V';  M= -5,-27,-19,-31,-25,  3,-31,-25, 29,-23, 16, 13,-23,-25,-22,-21,-14, -4, 30,-24, -4,-25;
/M: SY='P';  M= -6,-10,  2,-10, -3,-21,-17,-14,-19, -8,-19,-12, -9,  4, -5,-11, -1, -4,-16,-32,-19, -5;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-29, 18, 49,-29,-18, -1,-29,  9,-21,-19,  2, -2, 17,  0,  1, -9,-28,-29,-19, 33;
/M: SY='N';  M= -8, 20,-22, 15,  3,-22, -1,  0,-24, -2,-24,-17, 25,-15,  0, -2,  6, -2,-24,-33,-17,  1;
/M: SY='A';  M=  7, -5,-16, -9, -3,-17,-11,-12,-10, -7,-12, -9, -1,-10, -4, -9,  7,  4, -6,-28,-15, -4;
/M: SY='P';  M= -3,-10,-27, -9, -1,-21,-13,-12,-14, -1,-15, -8, -9, 10, -3, -4, -5, -7,-13,-26,-17, -4;
/M: SY='P';  M= -3,-11,-24,-11, -7,-17,-14,-15, -5,-10,-11, -6, -9,  3, -9,-13, -4, -4, -3,-27,-16,-10;
/M: SY='G';  M= -4, -4,-27, -4,-10,-23, 25,-12,-27,-11,-25,-16,  3, -7,-12,-12,  0,-11,-22,-25,-21,-12;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='T';  M= -1, -4,-16, -8, -2, -9,-16,-10,-11, -6,-12, -9, -2, -9, -2, -7,  8, 14, -7,-22, -8, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M:         M= -6,-14,-22,-14, -6, -8,-19,-14, -1, -9, -4, -2,-12, -2, -8,-10, -5, -3, -1,-21, -7, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='V';  M= -4,-21,-14,-23,-19,  1,-23,-18, 21,-16, 12,  9,-18,-20,-16,-15,-11, -4, 23,-18, -3,-19; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='M';  M= -1,-12,-16,-15,-12, -9, -6,-10, -1,-13,  2,  5,-10,-17, -6,-12, -6, -4,  0,-19, -8, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-21, -9, -5,-16,-14, -8,-10, -2,-12, -6, -2,-14,  1,  2,  0,  2, -7,-24,-10, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='I';  M= -7,-26,-20,-29,-24,  5,-30,-21, 24,-21, 18, 13,-23,-25,-20,-18,-17, -6, 22,-20,  1,-23;
/M: SY='T';  M= -3, -4,-18, -8, -4,-15,-15, -9,-12, -1,-13, -7,  0,-14, -1, -1,  5,  9, -8,-27,-10, -3;
/M: SY='A';  M= 29,-13,-14,-20,-12,-16,-10,-17, -2,-10, -7, -5,-12,-13,-10,-16,  4, -1,  5,-22,-15,-11;
/M: SY='T';  M= -4, -8,-18,-12, -8,-10,-21,-12, -2, -9, -6, -3, -6,-16, -6, -7,  3, 12,  2,-26, -7, -8;
/M: SY='D';  M=-19, 43,-28, 60, 19,-37,-11,  2,-37,  0,-29,-27, 18,-10,  2, -9,  0,-10,-29,-38,-18, 10;
/M: SY='P';  M=  4,-10,-25, -9,  0,-21,-14,-11,-16,  2,-15, -9, -9,  9, -1, -2, -3, -6,-14,-23,-15, -2;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='D';  M=-18, 45,-28, 62, 20,-37,-10,  0,-37,  1,-28,-28, 18, -9,  1, -8,  0, -9,-28,-37,-19, 11; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='E';  M= -5, -1,-18,  1,  4,-15,-14,-10, -8, -5, -5, -6, -4,-12, -2, -6, -2, -1, -7,-24,-11,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='G';  M=  1, -5,-17, -6, -5,-15,  4,-10,-15, -7,-14,-10, -3, -1, -7, -8,  3,  1,-11,-19,-13, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='N';  M= -3,  2,-21,  0,  1,-18, -7, -3,-14, -3,-14, -8,  5, -4,  2, -3,  1, -3,-15,-24,-13,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='N';  M= -4, 12,-23,  5, -3,-21,  2,  1,-21, -6,-23,-15, 21,-10, -3, -7,  5, -4,-22,-29,-16, -4;
/M: SY='G';  M=  1, -7,-25, -9, -7,-19,  3, -9,-19,-10,-19,-12, -2,-11, -3,-11,  1, -6,-18, -9,-12, -5;
/M: SY='K';  M= -6, -5,-25, -6,  1,-20,-13, -8,-17,  5,-17, -9, -2, -3,  2,  5, -1, -1,-14,-25,-13,  0;
/M: SY='I';  M= -2,-25,-19,-30,-24, 11,-26,-22, 19,-23, 13,  8,-21,-23,-23,-21,-13, -5, 19,-17,  2,-24;
/M: SY='R';  M= -6, -8,-23,-10, -5,-12,-19, -8,-12,  1,-13, -7, -4,-10, -3,  5, -1,  1, -7,-23, -7, -6;
/M: SY='Y';  M=-20,-23,-27,-26,-23, 44,-30,  8,  0,-16,  3,  0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 65,-23;
/M: SY='S';  M= -2, -3,-19, -4,  2,-16,-13, -7,-17,  1,-19,-12,  2,-13,  3,  4, 11,  7,-11,-28,-11,  2;
/M: SY='I';  M= -7,-27,-25,-34,-24,  4,-33,-24, 31,-24, 24, 17,-22,-23,-19,-22,-21, -9, 20,-19,  0,-24;
/M: SY='T';  M= -3,-11,-20,-12, -7,-11,-18,-14, -2,-11, -1, -2,-10,-13, -8,-11, -3,  1,  0,-26,-10, -8;
/M: SY='G';  M= -4,  0,-25,  0,  1,-22,  4, -8,-23, -4,-19,-13,  3, -9, -1, -4,  3, -5,-20,-26,-16, -1;
/M: SY='G';  M= -6,  3,-26,  6,  1,-27, 10, -7,-27, -5,-24,-16,  4, -9,  0, -7,  3, -6,-22,-28,-19,  0;
/M: SY='N';  M= -7,  7,-25,  7,  2,-23, -2, -2,-23, -7,-22,-16,  8,  0, -3, -9,  2, -5,-22,-30,-17, -2;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='P';  M=  2, -3,-24,  0,  3,-23, -5,-12,-17, -7,-18,-13, -5,  6, -5,-12,  0, -5,-14,-26,-18, -2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='D';  M= -3,  6,-18,  8,  4,-19, -5, -4,-17, -2,-15,-11,  4, -7, -1, -4,  3, -2,-13,-24,-13,  1; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='D';  M= -4,  3,-12,  4,  3,-11, -6, -4, -8, -2, -7, -5,  1, -7,  0, -3,  0, -1, -6,-15, -7,  1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G';  M= -5, -1,-21, -2, -3,-19,  7, -5,-20, -1,-18,-10,  5,-10, -2,  1, -1, -7,-17,-20,-14, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='Y';  M=-11,-10,-26,-15,-12, -4,-20, -4, -3,-11, -4,  1, -5,-18, -7, -9,-12, -8, -8, -3,  3,-10;
/M: SY='F';  M=-19,-31,-24,-38,-28, 60,-29,-22,  0,-28,  9, -1,-24,-30,-34,-20,-24,-13, -2, 26, 26,-27;
/M: SY='T';  M= -2, -3,-19, -6, -2,-15,-15, -8,-14,  0,-15, -9,  0,-14, -2,  1,  7,  9, -8,-26, -9, -3;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-22,-35,-27,  0,-35,-27, 37,-26, 20, 17,-23,-23,-21,-25,-18, -7, 28,-22, -3,-27;
/M: SY='D';  M=-10, 20,-24, 21, 13,-25,-11,  3,-24,  0,-22,-17, 16,-13,  4, -3,  4, -1,-21,-33,-15,  8;
/M: SY='P';  M= -6, -3,-25, -1,  4,-22,-16,-10,-19,  4,-20,-13, -3,  7,  0,  2,  1,  3,-16,-27,-14,  0;
/M: SY='B';  M= -8, 12,-23, 12,  5,-20,-13, -4,-16, -2,-15,-12, 10,-15, -1, -5,  0, -3,-14,-30,-13,  1;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='T';  M= -2,  6,-16,  2, -1,-18,-11, -9,-17, -4,-19,-14,  8, -4, -3, -6, 12, 18,-13,-30,-15, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-26, -6,-13,-25, 43,-17,-29,-16,-22,-16, -1,-18,-16,-17, -1,-14,-21,-21,-24,-15; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='I';  M= -7,-11,-23,-13, -9, -9,-22,-13,  5,-10, -2,  1, -9,-18, -7, -9, -7, -4,  4,-17, -5, -9; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='I';  M= -5,-24,-20,-28,-21,  0,-29,-22, 24,-22, 20, 12,-20,-23,-18,-18,-15, -4, 19,-22, -3,-21; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='T';  M= -4, -6,-15,-10, -5, -9,-18, -9,-11, -3,-12, -7, -2,-16, -3, -3,  5, 11, -6,-23, -4, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-13,-20,-17, -5,-22,-18,  6,-15,  5,  2,-14,-19,-15,-13, -3,  9, 10,-26, -7,-17;
/M: SY='T';  M=  0, -8,-18,-12, -8,-12,-16,-12, -7, -3, -8, -5, -4,-16, -5, -2,  2,  7, -2,-24, -9, -7;
/M: SY='K';  M= -4, -4,-25, -5,  1,-21,-11, -8,-20, 12,-17, -9, -1,-11,  1, 11, -4, -5,-15,-22,-13,  0;
/M: SY='P';  M= -4, -9,-26, -8, -3,-21, -8,-12,-16, -3,-19,-11, -5,  9, -4, -4, -1, -4,-14,-26,-17, -5;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-21,-30,-21, 11,-29,-20, 19,-26, 34, 16,-26,-25,-20,-20,-24, -9, 12,-18,  1,-21;
/M: SY='D';  M=-16, 34,-28, 46, 13,-33,-10, -2,-32,  0,-24,-23, 16,-11,  0, -7,  0, -7,-25,-36,-18,  6;
/M: SY='R';  M=-17,-13,-27,-14, -6, -1,-22,  0,-19, 12,-11, -6, -6,-21,  0, 35,-12, -9,-15,-10,  8, -7;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-29, 14, 46,-29,-18,  0,-27,  8,-17,-16, -1, -3, 19,  0, -2,-10,-27,-28,-18, 33;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E';  M= -4, -1,-21, -1, 10,-20,-16, -6,-15,  6,-12, -7, -2, -9,  6,  1, -1, -1,-12,-24,-12,  8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='K';  M= -6, -3,-20, -7, -4,-12,-16, -5, -9,  2,-11, -4,  1,-15,  0,  2, -3, -2, -8,-20, -4, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='D';  M= -2,  6,-24,  7,  5,-26, -1, -6,-24,  1,-23,-16,  6, -4,  2, -2,  5, -4,-20,-28,-18,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='Q';  M= -7, -7,-23, -8,  0,-12,-20, -6, -8, -3, -9, -4, -5,-16,  2, -3, -3, -2, -7,-18, -5,  0;
/M: SY='Y';  M=-18,-20,-25,-21,-20, 27,-29, 17, -1,-13,  1,  1,-18,-29,-13,-11,-18,-10, -7, 17, 60,-20;
/M: SY='N';  M= -6,  1,-21, -1,  2,-16,-17, -2,-12, -3,-12, -8,  4,-15,  1, -2,  2,  4,-10,-28, -9,  1;
/M: SY='L';  M= -6,-29,-20,-32,-23, 10,-29,-23, 23,-27, 33, 16,-26,-27,-22,-21,-23, -8, 17,-19,  0,-23;
/M: SY='T';  M= -7, -9,-23,-12, -6,-10,-21, -9, -7, -7,-10, -5, -7, -2, -5, -6, -1,  5, -6,-23, -6, -7;
/M: SY='V';  M= -1,-27,-17,-32,-26,  1,-28,-26, 28,-23, 14, 12,-23,-25,-23,-23,-13, -5, 29,-23, -5,-26;
/M: SY='M';  M= -7,-11,-23,-13, -2,-12,-19, -7, -6, -3, -2,  1,-10,-17,  0, -1, -7, -4, -5,-22, -6, -2;
/M: SY='A';  M= 25,-18,-11,-24,-18,-11,-13,-23,  6,-16,  1, -1,-16,-18,-17,-21,  0, -1, 14,-23,-14,-18;
/M: SY='T';  M=  0, -8,-18,-12, -5,-14,-17,-14, -7, -4, -9, -5, -5,-14, -3, -3,  6, 11, -1,-27,-11, -5;
/M: SY='D';  M=-16, 42,-26, 52, 15,-34, -9,  0,-33,  0,-28,-26, 24,-12,  0, -8,  3, -5,-27,-39,-19,  8;
/M: SY='N';  M= -2, -2,-22, -4,  0,-19, -8, -5,-16, -2,-15, -6,  1,-11,  1,  0,  1, -4,-14,-26,-13,  0;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='G';  M=  1,  2,-24,  2, -4,-25, 19, -6,-26, -9,-21,-14,  4,-15, -4,-10,  2,-10,-20,-24,-19, -5; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='N';  M= -3, -4,-18, -6, -6,-13, -1, -8,-10, -6,-11, -6,  1,-10, -4, -6,  1, -3, -9,-19, -9, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='P';  M= -7, -8,-24, -6, -1,-15,-12, -6,-15, -2,-17,-10, -6, 20, -3, -4, -4, -5,-16,-19,-10, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='P';  M= -3, -6,-25, -6, -5,-22,  3,-12,-19, -8,-21,-14, -2,  9, -7,-10,  1, -4,-17,-26,-19, -8; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='L';  M= -6,-15,-22,-16, -7, -8,-21,-13, -4, -4,  3,  3,-13,-13, -3, -2,-12, -6, -4,-20, -7, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='S';  M= -1, -1,-18, -1,  6,-17,-13, -9,-17, -3,-17,-12,  0,-10,  1, -5, 13, 11,-11,-29,-13,  3;
/M: SY='S';  M=  3,  0,-13, -3, -5,-20,  2,-11,-20, -8,-21,-15,  5,-13, -4,-10, 11,  3,-15,-29,-16, -5;
/M: SY='T';  M= -4, -7,-20,-10, -4,-13,-21,-15, -8, -7,-10, -7, -6, -1, -6, -7,  4, 17, -4,-26,-11, -6;
/M: SY='A';  M= 10,-11,-10,-16,-13,-14, -5,-17, -7,-14, -8, -6, -7,-17,-12,-16,  6,  7,  0,-27,-15,-13;
/M: SY='T';  M= -6, -4,-21, -6, -2,-14,-20,-11, -9, -5,-10, -6, -4, -6, -3, -7,  3, 12, -6,-26, -9, -3;
/M: SY='V';  M= -4,-28,-14,-31,-25,  6,-30,-25, 24,-25, 24, 13,-26,-27,-24,-22,-18, -6, 26,-23, -4,-25;
/M: SY='T';  M= -7, -6,-21,-10, -8,-10,-19, -9, -5, -6, -7, -4, -2,-16, -6, -3, -1,  6, -3,-24, -6, -8;
/M: SY='I';  M= -3,-29,-19,-34,-29,  1,-33,-29, 36,-25, 16, 14,-24,-25,-24,-25,-15, -5, 36,-24, -5,-29;
/M: SY='R';  M= -8,  0,-23, -4, -1,-17,-18, -1,-14,  4,-15, -7,  4,-14,  1,  5,  1,  4,-11,-25, -7, -1;
/M: SY='V';  M= -3,-29,-15,-31,-28,  1,-31,-28, 31,-23, 17, 13,-27,-28,-26,-21,-14, -3, 39,-27, -7,-28;
/M: SY='C';  M= -8,-12,  5,-14, -6,-12,-25,-14, -6,-14,  0, -3,-13,-20, -8,-14, -9, -3, -5,-29,-11, -8;
/M: SY='D';  M=-16, 38,-29, 53, 16,-36, -7, -2,-36,  0,-28,-26, 16, -9,  0, -8,  1, -9,-28,-37,-19,  8;
/M: SY='V';  M= -4,-17,  8,-21,-15,-11,-25,-21,  4,-16, -3, -1,-17,-23,-14,-18, -7, -4, 11,-30,-13,-15;
/M: SY='N';  M=-11, 34,-22, 23,  5,-23, -3,  7,-22, -1,-28,-20, 44,-17,  1, -2,  8, -2,-27,-38,-19,  3;
/M: SY='D';  M=-14, 31,-28, 44, 20,-33, -8,  0,-33,  0,-25,-23, 13,-10,  2, -8,  1, -8,-26,-35,-18, 11;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='N';  M= -8, 22,-18, 11,  1,-18, -2, 13,-20, -1,-23,-14, 33,-16,  2,  0,  5, -3,-24,-31,-12,  1; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='A';  M=  7,-11,-20,-11, -5,-19, -7,-14,-14, -8,-14,-10, -9,  7, -8,-11, -1, -5,-12,-23,-17, -8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='P';  M=-10,-16,-38, -7,  2,-29,-19,-18,-21, -8,-28,-19,-17, 76, -8,-17, -9,-10,-29,-29,-28, -7;
/M: SY='V';  M= -5,-12,-18,-14, -4,-11,-22,-13, -1, -4, -6, -1,-10,-17, -4, -4, -5, -1,  2,-23, -7, -5;
/M: SY='F';  M=-15,-25,-21,-32,-23, 46,-26,-20,  2,-25,  7,  1,-18,-20,-29,-19,-16, -7,  1, -3, 14,-24;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	2'381 in 342 different sequences
Number of true positive hits	2'379 in 340 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	99.92 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	34
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann, N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Cadherin
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

340 sequences

CAD10_CHICK (P79995), CAD10_HUMAN (Q9Y6N8), CAD10_MOUSE (P70408),

CAD11_CHICK (O93319), CAD11_HUMAN (P55287), CAD11_MOUSE (P55288), 
CAD12_HUMAN (P55289), CAD12_MOUSE (Q5RJH3), CAD13_BOVIN (Q3B7N0), 
CAD13_CHICK (P33150), CAD13_HUMAN (P55290), CAD13_MOUSE (Q9WTR5), 
CAD13_PONAB (Q5R5W6), CAD15_HUMAN (P55291), CAD15_MOUSE (P33146), 
CAD16_HUMAN (O75309), CAD16_MOUSE (O88338), CAD16_RABIT (Q28634), 
CAD17_HUMAN (Q12864), CAD17_MOUSE (Q9R100), CAD17_RAT   (P55281), 
CAD18_BOVIN (Q08DJ5), CAD18_HUMAN (Q13634), CAD19_HUMAN (Q9H159), 
CAD20_CHICK (Q8QGH3), CAD20_HUMAN (Q9HBT6), CAD20_MOUSE (Q9Z0M3), 
CAD20_RAT   (Q5DWV1), CAD20_XENLA (Q91838), CAD22_HUMAN (Q9UJ99), 
CAD22_MOUSE (Q9WTP5), CAD22_RAT   (Q63315), CAD23_HUMAN (Q9H251), 
CAD23_MOUSE (Q99PF4), CAD23_RAT   (P58365), CAD24_HUMAN (Q86UP0), 
CAD24_MOUSE (Q6PFX6), CAD26_HUMAN (Q8IXH8), CAD26_MOUSE (P59862), 
CAD2A_XENLA (P33147), CAD2B_XENLA (P20310), CAD86_DROME (Q9VGW1), 
CAD87_DROME (Q9VGG5), CAD89_DROME (Q9VEU1), CAD96_DROME (Q9VBW3), 
CAD99_DROME (Q9VAF5), CADE_DROME  (Q24298), CADH1_ANOGA (A0A1S4GGP7), 
CADH1_BOVIN (Q6R8F2), CADH1_CANLF (F1PAA9), CADH1_CHICK (P08641), 
CADH1_DANRE (Q90Z37), CADH1_HUMAN (P12830), CADH1_MOUSE (P09803), 
CADH1_PONAB (Q5RAX1), CADH1_RAT   (Q9R0T4), CADH1_XENLA (P30944), 
CADH2_BOVIN (P19534), CADH2_CALJA (B0KW95), CADH2_CHICK (P10288), 
CADH2_CRIGR (O55075), CADH2_DANRE (Q90275), CADH2_HUMAN (P19022), 
CADH2_MOUSE (P15116), CADH2_OTOGA (B4USZ0), CADH2_PONAB (Q5R9X1), 
CADH2_RAT   (Q9Z1Y3), CADH2_RHIFE (B2KI42), CADH3_BOVIN (P19535), 
CADH3_CAEEL (P34616), CADH3_HUMAN (P22223), CADH3_MOUSE (P10287), 
CADH3_PIG   (O18926), CADH4_CAEEL (Q19319), CADH4_CHICK (P24503), 
CADH4_HUMAN (P55283), CADH4_MOUSE (P39038), CADH4_RAT   (Q63149), 
CADH4_XENLA (P79883), CADH5_BOVIN (Q6URK6), CADH5_CHICK (Q8AYD0), 
CADH5_DANRE (Q68SP4), CADH5_HUMAN (P33151), CADH5_MOUSE (P55284), 
CADH5_PIG   (O02840), CADH6_BOVIN (Q3SWX5), CADH6_CHICK (Q90762), 
CADH6_HUMAN (P55285), CADH6_MOUSE (P97326), CADH6_RAT   (P55280), 
CADH7_CHICK (Q90763), CADH7_HUMAN (Q9ULB5), CADH7_MOUSE (Q8BM92), 
CADH7_RAT   (Q5DWV2), CADH8_HUMAN (P55286), CADH8_MOUSE (P97291), 
CADH8_RAT   (O54800), CADH9_HUMAN (Q9ULB4), CADH9_MOUSE (P70407), 
CADHB_XENLA (P33152), CADHF_XENLA (P33148), CADHK_CHICK (P33145), 
CADN2_DROME (Q9VJB6), CADN_DROME  (O15943), CASY1_CAEEL (G5ED46), 
CDHR1_BOVIN (Q8WN91), CDHR1_CHICK (Q8UVJ7), CDHR1_DANRE (Q6B3P0), 
CDHR1_HUMAN (Q96JP9), CDHR1_MOUSE (Q8VHP6), CDHR1_RAT   (Q91XU7), 
CDHR1_XENLA (Q6B457), CDHR2_HUMAN (Q9BYE9), CDHR2_MOUSE (E9Q7P9), 
CDHR3_HUMAN (Q6ZTQ4), CDHR3_MOUSE (Q8BL00), CDHR4_HUMAN (A6H8M9), 
CDHR5_HUMAN (Q9HBB8), CDHR5_MOUSE (Q8VHF2), CDHR5_RAT   (Q9JIK1), 
CELR1_HUMAN (Q9NYQ6), CELR1_MOUSE (O35161), CELR2_HUMAN (Q9HCU4), 
CELR2_MOUSE (Q9R0M0), CELR2_RAT   (Q9QYP2), CELR3_HUMAN (Q9NYQ7), 
CELR3_MOUSE (Q91ZI0), CELR3_RAT   (O88278), CELR_CAEEL  (G5EDK5), 
CSTN1_DANRE (F1R520), CSTN1_DROME (Q9V498), CSTN1_HUMAN (O94985), 
CSTN1_MOUSE (Q9EPL2), CSTN1_RAT   (Q6Q0N0), CSTN2_DANRE (B0S5G3), 
CSTN2_HUMAN (Q9H4D0), CSTN2_MOUSE (Q9ER65), CSTN2_RAT   (Q8VDA1), 
CSTN3_BOVIN (Q0VCN6), CSTN3_DANRE (A0A8M9PFP2), CSTN3_HUMAN (Q9BQT9), 
CSTN3_MOUSE (Q99JH7), CSTN3_PONAB (Q5R9Q9), CSTN3_RAT   (Q8R553), 
DSC1_BOVIN  (Q01107), DSC1_HUMAN  (Q08554), DSC1_MOUSE  (P55849), 
DSC2L_DANRE (F1QSQ0), DSC2_BOVIN  (P33545), DSC2_HUMAN  (Q02487), 
DSC2_MOUSE  (P55292), DSC3_BOVIN  (Q28060), DSC3_HUMAN  (Q14574), 
DSC3_MOUSE  (P55850), DSG1A_MOUSE (Q61495), DSG1B_MOUSE (Q7TSF1), 
DSG1C_MOUSE (Q7TSF0), DSG1_BOVIN  (Q03763), DSG1_CANLF  (Q9GKQ8), 
DSG1_HUMAN  (Q02413), DSG1_PIG(Q3BDI7), DSG21_DANRE (H2EQR6), 
DSG2L_DANRE (A0A8M2BIB6), DSG2_HUMAN  (Q14126), DSG2_MOUSE  (O55111), 
DSG3_CANLF  (Q7YRU7), DSG3_HUMAN  (P32926), DSG3_MOUSE  (O35902), 
DSG4_HUMAN  (Q86SJ6), DSG4_MOUSE  (Q7TMD7), DSG4_RAT(Q6W3B0), 
DS_DROME(Q24292), FAT1_HUMAN  (Q14517), FAT2_DROME  (Q9VW71), 
FAT2_HUMAN  (Q9NYQ8), FAT2_MOUSE  (Q5F226), FAT2_RAT(O88277), 
FAT3_HUMAN  (Q8TDW7), FAT3_MOUSE  (Q8BNA6), FAT3_RAT(Q8R508), 
FAT4_HUMAN  (Q6V0I7), FAT4_MOUSE  (Q2PZL6), FAT_DROME   (P33450), 
HMR1_CAEEL  (Q967F4), HMU_HALWD   (Q18DN4), PC11X_GORGO (Q6X862), 
PC11X_HUMAN (Q9BZA7), PC11X_PANPA (Q6WYY1), PC11X_PANTR (Q71M42), 
PC11X_PIG   (Q6KEQ9), PC11X_PONPY (Q6WXV7), PC11Y_HUMAN (Q9BZA8), 
PCD10_HUMAN (Q9P2E7), PCD12_HUMAN (Q9NPG4), PCD12_MOUSE (O55134), 
PCD15_CHICK (Q0ZM14), PCD15_HUMAN (Q96QU1), PCD15_MOUSE (Q99PJ1), 
PCD16_HUMAN (Q96JQ0), PCD16_MOUSE (E9PVD3), PCD16_RAT   (D4ACX8), 
PCD17_HUMAN (O14917), PCD18_BOVIN (A7MB46), PCD18_HUMAN (Q9HCL0), 
PCD18_MOUSE (Q8VHR0), PCD19_DANRE (F8W3X3), PCD19_HUMAN (Q8TAB3), 
PCD19_MOUSE (Q80TF3), PCD20_HUMAN (Q8N6Y1), PCD20_MOUSE (Q8BIZ0), 
PCD23_HUMAN (Q6V1P9), PCDA1_HUMAN (Q9Y5I3), PCDA1_PANTR (Q5DRF5), 
PCDA2_HUMAN (Q9Y5H9), PCDA2_PANTR (Q5DRF0), PCDA3_HUMAN (Q9Y5H8), 
PCDA3_PANTR (Q5DRE9), PCDA4_HUMAN (Q9UN74), PCDA4_MOUSE (O88689), 
PCDA4_PANTR (Q5DRE8), PCDA4_RAT   (Q767I8), PCDA5_HUMAN (Q9Y5H7), 
PCDA5_PANTR (Q5DRE7), PCDA6_HUMAN (Q9UN73), PCDA6_PANTR (Q5DRE6), 
PCDA7_HUMAN (Q9UN72), PCDA7_MOUSE (Q91Y13), PCDA7_PANTR (Q5DRE5), 
PCDA8_HUMAN (Q9Y5H6), PCDA8_PANTR (Q5DRE4), PCDA9_HUMAN (Q9Y5H5), 
PCDA9_MOUSE (Q91Y11), PCDA9_PANTR (Q5DRE3), PCDAA_HUMAN (Q9Y5I2), 
PCDAA_MOUSE (Q91Y20), PCDAA_PANTR (Q5DRF4), PCDAB_HUMAN (Q9Y5I1), 
PCDAB_PANTR (Q5DRF3), PCDAC_HUMAN (Q9UN75), PCDAC_PANTR (Q5DRF2), 
PCDAD_HUMAN (Q9Y5I0), PCDAD_PANTR (Q5DRF1), PCDB1_HUMAN (Q9Y5F3), 
PCDB1_PANTR (Q5DRE0), PCDB2_HUMAN (Q9Y5E7), PCDB2_PANTR (Q5DRD2), 
PCDB3_HUMAN (Q9Y5E6), PCDB3_PANTR (Q5DRD1), PCDB4_HUMAN (Q9Y5E5), 
PCDB4_PANTR (Q5DRD0), PCDB5_HUMAN (Q9Y5E4), PCDB5_PANTR (Q5DRC9), 
PCDB6_HUMAN (Q9Y5E3), PCDB6_MOUSE (Q91XZ4), PCDB6_PANTR (Q5DRC8), 
PCDB7_HUMAN (Q9Y5E2), PCDB7_PANTR (Q5DRC7), PCDB8_HUMAN (Q9UN66), 
PCDB8_MOUSE (Q91XZ2), PCDB8_PANTR (Q5DRC6), PCDB9_HUMAN (Q9Y5E1), 
PCDB9_PANTR (Q5DRC4), PCDBA_HUMAN (Q9UN67), PCDBA_PANTR (Q5DRD9), 
PCDBB_HUMAN (Q9Y5F2), PCDBB_PANTR (Q5DRD8), PCDBC_HUMAN (Q9Y5F1), 
PCDBC_PANTR (Q5DRD7), PCDBD_HUMAN (Q9Y5F0), PCDBD_PANTR (Q5DRD6), 
PCDBE_HUMAN (Q9Y5E9), PCDBE_MOUSE (Q6PB90), PCDBE_PANTR (Q5DRD5), 
PCDBF_HUMAN (Q9Y5E8), PCDBF_PANTR (Q5DRD3), PCDBG_HUMAN (Q9NRJ7), 
PCDBH_PANTR (Q5DRC3), PCDBI_HUMAN (Q96TA0), PCDBI_MOUSE (Q91Y02), 
PCDBI_PANTR (Q5DRD4), PCDC1_HUMAN (Q9H158), PCDC1_PANTR (Q5DRE2), 
PCDC2_HUMAN (Q9Y5I4), PCDC2_PANTR (Q5DRE1), PCDG1_HUMAN (Q9Y5H4), 
PCDG1_PANTR (Q5DRC2), PCDG2_HUMAN (Q9Y5H1), PCDG2_PANTR (Q5DRB8), 
PCDG3_HUMAN (Q9Y5H0), PCDG3_PANTR (Q5DRB7), PCDG4_HUMAN (Q9Y5G9), 
PCDG4_MOUSE (Q91XY4), PCDG4_PANTR (Q5DRB6), PCDG5_HUMAN (Q9Y5G8), 
PCDG5_PANTR (Q5DRB5), PCDG6_HUMAN (Q9Y5G7), PCDG6_PANTR (Q5DRB4), 
PCDG7_HUMAN (Q9Y5G6), PCDG7_PANTR (Q5DRB3), PCDG8_HUMAN (Q9Y5G5), 
PCDG8_PANTR (Q5DRB2), PCDG9_HUMAN (Q9Y5G4), PCDG9_PANTR (Q5DRB1), 
PCDGA_HUMAN (Q9Y5H3), PCDGA_PANTR (Q5DRC1), PCDGB_HUMAN (Q9Y5H2), 
PCDGB_PANTR (Q5DRC0), PCDGC_HUMAN (O60330), PCDGC_PANTR (Q5DRB9), 
PCDGD_HUMAN (Q9Y5G3), PCDGD_PANTR (Q5DRB0), PCDGE_HUMAN (Q9Y5G2), 
PCDGE_PANTR (Q5DRA9), PCDGF_HUMAN (Q9Y5G1), PCDGG_HUMAN (Q9UN71), 
PCDGG_PANTR (Q5DRA8), PCDGH_HUMAN (Q9Y5G0), PCDGH_PANTR (Q5DRA7), 
PCDGI_HUMAN (Q9Y5F9), PCDGI_PANTR (Q5DRA6), PCDGJ_HUMAN (Q9Y5F8), 
PCDGJ_PANTR (Q5DRA5), PCDGK_HUMAN (Q9UN70), PCDGK_PANTR (Q5DRA4), 
PCDGL_HUMAN (Q9Y5F7), PCDGL_PANTR (Q5DRA3), PCDGM_HUMAN (Q9Y5F6), 
PCDGM_PANTR (Q5DRA2), PCDH1_HUMAN (Q08174), PCDH3_RAT   (Q63418), 
PCDH7_HUMAN (O60245), PCDH8_HUMAN (O95206), PCDH8_MOUSE (Q7TSK3), 
PCDH8_RAT   (D3ZE55), PCDH9_HUMAN (Q9HC56), PCDL_ACRMI  (B8V7Q1), 
RET_HUMAN   (P07949), RET_MOUSE   (P35546), RET_RAT (G3V9H8), 
STAN_DROME  (Q9V5N8)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences

2 sequences

CHIA_PSEO7  (P32823), FREM2_LYTVA (Q9GV77)

PDB
[Detailed view]

196 PDB

1EDH; 1FF5; 1L3W; 1NCG; 1NCH; 1NCI; 1NCJ; 1O6S; 1Q1P; 1SUH; 1WUZ; 1WYJ;
» more