PROSITE entry PS50255

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50255
Entry name [info]	CYTOCHROME_B5_2
Accession [info]	PS50255
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00170
Associated ProRule [info]	PRU00279

Name and characterization of the entry

Description [info]

Cytochrome b5 family, heme-binding domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=77;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=72;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3604000; R2=0.0156478; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4612.1806641; R2=5.4457831; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=680; H_SCORE=8315; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=393; H_SCORE=6752; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -8, -4,-26, -1, -1,-19,-18,-11,-12, -4, -7, -7, -7,  1, -1, -8, -8, -5,-12,-26,-12, -2;
/M: SY='R';  M=-12, -8,-29, -7,  2,-22,-21,  1,-20, 15,-19, -8, -4,  0,  3, 16, -8, -6,-16,-24, -9,  0;
/M: SY='I';  M= -8,-18,-23,-19,-10, -5,-27,-12,  9, -9,  1,  5,-16,-18, -6, -8,-10, -6,  8,-18,  3,-10;
/M: SY='Y';  M=-14,-25,-29,-30,-24, 17,-32, -8, 18,-19,  8,  6,-21,-26,-17,-17,-19,-10,  7,  9, 33,-24;
/M: SY='T';  M= -1,  6,-15,  2,  0,-17,-11,-11,-18, -5,-20,-16,  8,-11, -3, -6, 20, 25,-10,-33,-15, -2;
/M: SY='K';  M= -4,-15,-26,-16, -7,-11,-19,-13, -9,  4, -6, -2,-12,-10, -5,  4,-10, -7, -8,-11, -5, -7;
/M: SY='E';  M=  4,  5,-21,  8, 20,-27,-12, -7,-23,  4,-20,-16,  0, -5,  8, -5,  6, -3,-19,-29,-18, 14;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-28, 13, 41,-26,-21, -4,-20,  3,-14,-14, -1, -4, 14, -4, -1, -6,-22,-29,-17, 27;
/M: SY='V';  M= -7,-29,-17,-31,-26, 12,-30,-23, 23,-23, 21, 13,-28,-29,-25,-20,-19, -6, 27,-16,  3,-26;
/M: SY='A';  M=  7, -5,-20, -7,  2,-21, -7,-11,-19,  4,-18,-11, -2,-10,  2,  2,  6, -1,-12,-24,-15,  1;
/M: SY='K';  M=  0, -1,-23, -2,  7,-25,-15, -9,-19, 14,-21,-10,  1,-11,  9,  6,  4, -1,-14,-24,-13,  8;
/M: SY='H';  M=-18,  0,-29, -1,  0,-21,-16, 79,-29, -6,-19, -2,  9,-20,  9,  3, -9,-18,-28,-29, 13,  0;
/M: SY='N';  M= -2, 16, -7,  9, -1,-22, -5, -5,-22, -3,-25,-18, 23,-17, -4, -6, 10,  1,-19,-36,-20, -3;
/M: SY='N';  M= -5,  5,-23,  3, -2,-22, -1, -9,-24,  2,-24,-16,  9,-12, -3, -3,  6,  4,-19,-23,-15, -3;
/M: SY='E';  M= -5,  2,-28,  4, 14,-27,-11, -3,-25,  7,-22,-14,  1,  3,  6,  2, -1, -7,-23,-27,-17,  9;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='D';  M=-11, 16,-27, 18, 18,-28,-11,  5,-27,  6,-24,-16, 12, -8,  8,  0,  1, -4,-25,-31,-15, 13;
/M: SY='D';  M= -9, 14,-26, 20, 14,-29, -6, -5,-30,  6,-27,-20,  8, -7,  3,  3,  6, -4,-23,-32,-18,  8;
/M: SY='C';  M= -2,-18,  4,-20,-16,-11,-15,-21, -7,-19, -2, -5,-16, -8,-17,-19, -7, -4, -4,-30,-16,-17;
/M: SY='W';  M=-19,-37,-44,-38,-28, 14,-22,-26,-12,-22, -8,-12,-37,-30,-21,-20,-37,-25,-22,114, 27,-20;
/M: SY='V';  M= -9,-28,-15,-34,-27, 15,-32,-25, 23,-24, 15, 10,-23,-26,-26,-20,-16, -5, 24,-18,  1,-27;
/M: SY='V';  M=  4,-20,-14,-25,-20, -7,-24,-24, 17,-19,  5,  5,-17,-20,-16,-20, -3,  3, 21,-26,-10,-19;
/M: SY='I';  M=-10,-26,-22,-31,-26,  5,-33,-17, 29,-25, 16, 13,-20,-25,-20,-22,-18, -8, 22,-18,  5,-26;
/M: SY='N';  M=-10, 11,-26, 10,  2,-25,  1, 10,-28,  2,-24,-15, 15,-16,  3,  7,  1, -8,-25,-30,-13,  1;
/M: SY='G';  M= -3,  1,-28,  2,-12,-29, 47,-12,-36,-15,-29,-20,  7,-18,-14,-16,  3,-13,-28,-25,-26,-13;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='K';  M=-11, -4,-27, -3,  8,-17,-22, -1,-15, 13,-13, -5, -4,-14,  7, 10, -9, -9,-12,-21, -5,  6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-32;
/M: SY='V';  M=  1,-28,-13,-30,-28,  0,-29,-27, 28,-21, 11, 10,-27,-28,-26,-21,-11, -2, 41,-26, -6,-28;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-28,-21,-19, 31,-29, 21, -3,-14,  0,  0,-17,-29,-13,-11,-20,-12,-11, 20, 61,-19;
/M: SY='D';  M=-19, 49,-29, 64, 18,-38, -9,  1,-38,  0,-30,-29, 25,-11,  0, -9,  1, -9,-30,-40,-20,  9;
/M: SY='V';  M= -3,-25, -8,-29,-26, -3,-16,-25, 14,-23, 10,  8,-22,-27,-23,-22,-13, -8, 19,-25,-10,-25;
/M: SY='T';  M=  5,  1,-12, -4, -5,-15,-10,-16,-15, -9,-16,-14,  2,-10, -7,-11, 22, 33, -5,-32,-14, -6;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-26,  9, 11,-28, -9, -8,-27,  7,-26,-18,  3,  4,  3,  2,  4, -4,-22,-30,-19,  6;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-25,-36,-28, 64,-29,-13, -2,-25,  5, -2,-22,-30,-32,-18,-22,-12, -5, 26, 40,-27;
/M: SY='L';  M= -6,-27,-19,-30,-22,  7,-28,-20, 22,-23, 29, 19,-25,-26,-19,-19,-21, -8, 18,-20,  0,-21;
/M: SY='D';  M=-10, 14,-28, 21, 20,-30,-14, -6,-29,  9,-27,-20,  7,  5,  5, -1,  2, -5,-25,-32,-19, 12;
/M: SY='E';  M=-11,  8,-27, 14, 16,-21, -7, -6,-24,  0,-15,-14,  2,-13,  2, -5, -4,-10,-22,-26,-13,  9;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='P';  M=-11,-20,-39,-11, -1,-26,-21,-17,-19,-10,-28,-19,-20, 82,-10,-19,-11,-10,-29,-26,-22,-11;
/M: SY='G';  M=  1,-11,-30,-10,-18,-30, 62,-20,-38,-19,-29,-20, -2,-12,-19,-20,  0,-19,-29,-21,-30,-19;
/M: SY='G';  M= -1,-10,-30,-10,-19,-30, 66,-15,-40,-20,-30,-19,  0,-20,-19,-19,  0,-20,-30,-20,-28,-19;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='A';  M=  9, -2,-19, -3,  3,-22,-12,-11,-11, -5,-13, -8, -5,  0,  2,-11,  2, -3,-10,-24,-16,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M= -3,  5,-23,  8, 13,-17,-15, -4,-22,  2,-18,-14,  1,-11,  3, -3,  3, -2,-17,-26,-11,  8;
/M: SY='V';  M=  3,-17,-18,-20,-14, -6,-19,-19,  3,-11, -4, -1,-13,-15,-13,-12,  0,  0,  8,-20, -8,-14;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-25,-35,-25,  4,-35,-26, 36,-29, 31, 19,-24,-24,-20,-25,-23, -9, 22,-21, -1,-25;
/M: SY='L';  M=-10,-16,-24,-19,-12, -5,-22,-15,  5, -7, 13,  9,-13,-21,-10, -5,-16, -8,  1,-21, -5,-11;
/M: SY='R';  M= -8, -1,-24, -1,  3,-17,-16, -9,-14,  3,-12, -8,  1,-15,  1,  5,  0, -1,-12,-27,-12,  1;
/M: SY='A';  M=  5, -9,-17,-14,-10, -7,-13, -3, -8,-10, -6, -5, -7,-16, -5,-12,  0,  1, -6,-17,  3, -9;
/M: SY='A';  M= 31,-11,-14,-19,-11,-16, -3,-19, -8, -8, -9, -8, -9,-13,-10,-14,  5, -1, -1,-20,-16,-11;
/M: SY='G';  M=  1, -6,-28, -8,-16,-29, 60,-17,-37,-18,-29,-20,  4,-19,-17,-18,  1,-18,-29,-22,-29,-17;
/M: SY='K';  M= -2, -3,-24, -4,  2,-24, -7,-11,-19,  9,-18, -9, -3,-13,  5,  5,  0, -3,-13,-24,-14,  3;
/M: SY='D';  M=-16, 42,-30, 60, 20,-38,-11, -2,-37,  0,-29,-28, 16, -5,  0,-10,  0,-10,-29,-38,-20, 10;
/M: SY='A';  M= 22,-14,-10,-20,-15,-13,-12,-21,  2,-16, -1, -2,-13,-17,-14,-20,  1, -1,  8,-25,-15,-15;
/M: SY='T';  M= -1,  0,-13, -8, -4,-12,-16,-18,-12, -9,-10,-11, -1,-10, -8,-10, 17, 39, -4,-30,-12, -6;
/M: SY='D';  M= -4, 10,-26, 16, 16,-27,-12, -9,-23,  0,-20,-16,  1, -1,  1, -8,  0, -5,-18,-30,-19,  8;
/M: SY='A';  M=  2, -6,-21, -7,  1, -6,-16,-13, -6,-12, -4, -5, -7,-15, -9,-15, -3, -5, -5,-22, -9, -4;
/M: SY='F';  M=-18,-30,-23,-39,-29, 64,-29,-20,  2,-28,  8,  1,-22,-29,-35,-20,-22,-11,  0, 19, 28,-28;
/M: SY='E';  M= -5, -3,-22, -7,  4, -8,-17, -8, -8, -1, -8, -1,  0,-15, -3, -3, -5, -6, -8,-24, -9,  1;
/M: SY='A';  M= 10,  2,-20,  2, -5,-23,  7,-14,-21,-10,-16,-14,  0,-11, -9,-15,  5, -3,-14,-27,-20, -7;
/M: SY='I';  M= -9,-22,-26,-25,-20,  3,-18,-15, 12,-19,  3,  4,-16,-20,-18,-19,-14,-10,  8,-14,  6,-21;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='G';  M=  3, -7,-13, -8, -9,-10,  5, -5, -7, -7, -8, -4, -5,-12, -7, -8, -2, -6, -2,-12, -6, -8; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='H';  M=-20,  4,-30,  5,  1,-21,-19, 91,-30, -9,-21, -2, 12,-19,  9, -1, -9,-19,-30,-31, 16,  1;
/M: SY='S';  M=  7, -5,-17, -5, -2,-22, -3,-12,-18,-10,-24,-16,  2,  2, -1,-12, 22, 10,-13,-34,-20, -2;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-25,  3,  8,-21,-12, -8,-20, -2,-20,-14,  4,  0,  1, -8,  2,  0,-20,-19,-15,  4;
/M: SY='S';  M=  3,  3,-18,  1, -3,-19,-11,-10,-15, -4,-17,-12,  2, -9, -7, -8,  5,  4, -8,-29,-15, -6;
/M: SY='A';  M= 31, -7,-12,-16,-11,-17, -7,-11, -8,-10,-10, -8, -5,-14,-10,-16,  7,  3,  2,-24,-15,-11;
/M: SY='R';  M=-14,-11,-30,-10, -1,-12,-23,  2,-15,  9,-13, -6, -9,-16,  1, 14,-13,-12,-13, -6,  4, -2;
/M: SY='E';  M=  0,  7,-23,  5, 14,-23,-13, -3,-20,  7,-17,-12,  8,-12,  5,  4,  0, -6,-18,-28,-16,  9;
/M: SY='M';  M= -8,-15,-22,-20, -9, -7,-23, -7,  8, -6, 12, 24,-15,-19, -2, -7,-16, -9,  3,-22, -4, -6;
/M: SY='L';  M= -9,-26,-20,-29,-20,  9,-27,-15, 17,-23, 36, 25,-25,-27,-15,-17,-24, -9,  9,-18,  2,-17;
/M: SY='E';  M= -2, -4,-25, -2,  4,-20,-19,-12,-12, -2, -8, -8, -7,  0, -1, -7, -6, -5,-12,-26,-14,  0;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-24,  9, 13,-26,-15, -5,-22,  7,-19,-10,  1,-11, 12,  5,  2,  0,-17,-28,-14, 12;
/M: SY='Y';  M=-16,-18,-20,-22,-19, 22,-26,  6,  0,-11,  3,  8,-16,-27,-12,-11,-16, -8, -6,  8, 44,-17;
/M: SY='H';  M=-13,-10,-19,-13, -8, -2,-22, 13,-17,  3,-11, -4, -4,-22, -3,  9,-12,-11,-15,-14, 10, -7;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-20,-34,-28,  1,-34,-28, 37,-26, 19, 15,-25,-25,-24,-24,-16, -4, 34,-24, -4,-28;
/M: SY='G';  M=  2, -8,-28, -9,-18,-29, 59,-18,-37,-17,-29,-19,  2,-19,-17,-16,  2,-17,-28,-21,-28,-18;
/M: SY='E';  M= -8,  0,-24,  3,  8,-16,-20, -9,-15,  1,-14,-11, -5,-10, -2,  1, -2, -2, -8,-25, -9,  2;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-19,-27,-21,  3,-30,-21, 23,-26, 30, 15,-24,-26,-20,-21,-22, -9, 16,-21, -1,-22;
/M: SY='D';  M= -4,  5,-17,  6,  2,-23,-14, -1,-18, -2,-18,-12,  3,-13,  0, -3,  2, -4,-13,-31,-14,  0;
/I:         E1=0;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	180 in 180 different sequences
Number of true positive hits	178 in 178 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences	38
Number of 'partial' sequences	2

Precision (true positives / (true positives + false positives))	98.89 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	82.41 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Cytochrome b5 heme-binding
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	178 sequences ACET6_CERPU (Q9LEN0), ACO1_AJECA (Q12618), ACO1_SCHPO (O94523), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	38 sequences CHS5B_FUSO4 (A0A0J9UR47), D5FAD_THRSP (Q8S3C1), DAP1_SCHPO (O13995), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	2 sequences NIA2_MAIZE (P39871), NIA_LOTTE (P39882)
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	2 sequences CHS4_CRYNH (J9VF17), CHS5_CRYNH (J9VNT4)
PDB [Detailed view]	79 PDB 1AQA; 1AW3; 1AWP; 1AXX; 1B5A; 1B5B; 1B5M; 1BFX; 1BLV; 1CXY; 1CYO; 1DO9; » more