PROSITE entry PS50244

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50244
Entry name [info]	S5A_REDUCTASE
Accession [info]	PS50244
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50244

Name and characterization of the entry

Description [info]

Steroid 5-alpha reductase C-terminal domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2548000; R2=0.0187626; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4466.8530273; R2=6.4534535; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; H_SCORE=7481; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=361; H_SCORE=6797; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-20; E1=-20; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G';  M=  9,-12,-25,-14,-18,-24, 45,-20,-28,-19,-18,-14, -5,-19,-18,-20, -1,-15,-20,-20,-25,-18;
/M: SY='F';  M=  3,-22,-17,-28,-20, 13,-21,-19,  9,-21, 12,  7,-18,-22,-20,-19, -9, -4,  9,-17, -1,-19;
/M: SY='V';  M=  2,-22,-23,-26,-24, -3,  1,-24,  2,-22, -2, -2,-17,-23,-22,-22,-10,-11,  5, -7, -8,-23;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-22,-33,-24,  5,-33,-23, 30,-28, 36, 22,-26,-26,-20,-23,-25, -9, 19,-21, -1,-23;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-25,-35,-28, 61,-29,-12, -2,-24,  5, -2,-22,-30,-31,-18,-22,-12, -5, 29, 42,-27;
/M: SY='V';  M= -2,-27,  3,-32,-27,  1,-27,-27,  9,-24,  5,  1,-25,-28,-24,-23,-15, -9, 14, -6, -5,-25;
/M: SY='I';  M= -7,-23,-22,-30,-23, -1,-32,-25, 28,-25, 17, 12,-17,-20,-18,-23,-11,  3, 19,-23, -3,-23;
/M: SY='G';  M=  5,-11,  6,-14,-19,-26, 34,-21,-32,-20,-26,-19, -4,-22,-19,-21,  3,-11,-20,-28,-28,-19;
/M: SY='M';  M= -6, -4,-20,-10, -2, -8,-14, -2, -4, -6, -6, 14,  1,-15,  5, -7,  1, -2, -8,-26, -8,  2;
/M: SY='W';  M=-13,-29,-31,-32,-25, 10,-21,-19,  8,-24, 10,  3,-26,-27,-20,-21,-25,-15,  0, 28, 16,-23;
/M: SY='W';  M=-12,-16,-33,-18,-17, -9,-19,-23,  2,-12, -7, -4,-14,-19,-13,-16,-16,-11, -4, 15,  0,-16;
/M: SY='N';  M=-11, 23,-24, 12,  7,-27, -8, 16,-21,  3,-26,-12, 35,-16, 22,  4,  5, -5,-30,-32,-14, 14;
/M: SY='Y';  M=-15,-13,-16,-20,-18, 10,-27, 13,  2,-19, -2,  2, -3,-24,-14,-15,-13,-11, -4,-15, 15,-18;
/M: SY='H';  M= -3, -5,-23, -7, -2,-17,-18, 13,-17,  5,-17, -5, -3,-15,  6,  1, -1, -3,-12,-20,  3,  1;
/M: SY='S';  M=  1, -4,  0, -8, -8,-15,-10,-13,-10,-15,-15,-12,  5,-18, -7,-14, 18,  8, -6,-37,-17, -8;
/M: SY='H';  M=-12, 21,-28, 29,  8,-29,-13, 40,-32, -5,-23,-15, 12,-14,  3, -7, -3,-13,-26,-33, -3,  3;
/M: SY='H';  M=-11, -8,-24,-10,  2, -9,-24,  3, -2, -6, -2,  3, -7,-17, -2, -4, -9, -6, -4,-22,  1, -2;
/M: SY='I';  M= -5,-12,-26,-18,-10,-15,-26,  4,  5, -9, -4,  4, -6,-16,  1,-10, -7, -4,  0,-23, -1, -7;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='R';  M= -4,-11,-19,-14, -7,-11,-15, -7, -8,  8, -7,  0, -6,-15,  0, 25, -6, -6, -3,-16, -8, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='N';  M= -9, 11,-18,  8,  4,-13,-11,  3,-15,  1,-15,-10, 13,-12,  5,  3,  2,  2,-16,-18, -2,  4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='L';  M= -8,-20,-19,-22,-14,  0,-26,-16, 13,-20, 26, 12,-19,-21, -8,-15,-16, -2,  6,-19, -2,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='R';  M= -8, -7,-24, -8,  1,-20,-15, -4,-24, 25,-18, -9, -1,-15,  6, 44, -6, -8,-15,-18,-10,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='K';  M= -5,  0,-26, -1,  7,-27,-15, -7,-23, 27,-24, -9,  2, -1, 11, 15, -5, -8,-19,-20,-12,  9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='P';  M=  1, -1,-28,  3,  4,-28, -4, -2,-26, -1,-24,-16, -3, 13, -3, -9, -3,-10,-23,-27,-18, -1;
/M: SY='G';  M= -6,  3,-28, -1,-11,-23, 31, -8,-29,-12,-28,-19, 15, -7,-12,-13,  0,-12,-29,-24,-19,-13;
/M: SY='E';  M=-11,  1,-25,  1,  8,-18,-12,  7,-20, -1,-10, -9,  4,-17,  2,  7, -4, -8,-19,-28,-10,  3;
/M: SY='S';  M=  4, -6,-17,-11,-12,-17,  1,-18,-11, -8,-15, -9, -1,-16,-12,-11,  8,  8, -2,-28,-16,-12;
/M: SY='G';  M= -4, -8,-25, -9, -6,-22,  6,-14,-19, -1,-15, -8, -3,-16, -1, -4,  0, -4,-15,-23,-15, -4;
/M: SY='Y';  M=-18,-21,-30,-24,-20, 19,-31,  7,  9,-11,  3,  4,-18,-27,-10, -7,-19,-10, -2, 14, 54,-20;
/M: SY='R';  M= -9, -9,-24, -9, -2,-18,-18,-10,-18, 18,-14, -7, -4,-17,  2, 26, -3, -4, -9,-24,-11, -2;
/M: SY='I';  M= -8,-22,-23,-29,-25, -1,-32,-24, 34,-24, 15, 13,-14,-23,-20,-23,-15, -7, 25,-25, -5,-25;
/M: SY='P';  M=-11,-21,-36,-14, -5,-18,-22,-15,-13,-12,-17,-13,-21, 61,-11,-19,-14,-10,-23,-22,-13,-12;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R';  M=-13, -5,-22,-11, -6,  1,-20, -8,-18,  7,-14, -9,  2,-18, -4, 18, -3,  5,-13,-18, -3, -6;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-28, -8,-11,-29, 42,-16,-34, -8,-27,-16,  0,-17, -7,-10,  1,-12,-26,-21,-24, -9;
/M: SY='G';  M= -8,-14,-31,-15,-18,-12, 34,-10,-32,-15,-23,-15, -5,-22,-17, -8, -8,-19,-25, -2,-12,-17;
/M: SY='L';  M=-13,-30,-11,-32,-24,  7,-29,-21,  8,-27, 21,  6,-29,-30,-20,-22,-28,-14,  0, 13,  8,-22;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29;
/M: SY='E';  M=-10,  9,-25,  7, 20,-21,-16, -3,-22,  9,-16,-13, 11,-12,  7,  9, -1, -2,-21,-29,-15, 13;
/M: SY='Y';  M=-15,-27,-27,-27,-21, 18,-29, -6,  8,-21, 23,  8,-27,-30,-16,-16,-27,-12, -2, 19, 34,-20;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-17,-34,-30,  8,-33,-29, 33,-24, 13, 12,-26,-27,-28,-23,-14, -4, 39,-23, -3,-30;
/M: SY='S';  M=  5, -5,  5, -8, -8,-16,-10,-16,-14,-13,-21,-15,  1,-15, -8,-13, 26, 20, -2,-38,-18, -8;
/M: SY='C';  M=  4,-15, 50,-22,-21,-22, -2,-24,-28,-19,-20,-17,-12,-28,-21,-18, -4,-10,-13,-35,-26,-21;
/M: SY='P';  M=  2,-18,-34,-12, -2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 71,-10,-20, -6, -8,-24,-28,-28,-10;
/M: SY='H';  M=-14, 26,-24, 13,  0,-20, -7, 42,-24, -4,-26,-13, 42,-20,  4,  0,  3, -7,-30,-36, -6,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-24,-22, 41,-30, 12,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 69,-22;
/M: SY='F';  M= -7,-23,-17,-29,-20, 25,-26,-20,  6,-25, 23,  6,-20,-25,-23,-18,-15,  2,  4,-13,  6,-20;
/M: SY='G';  M= -9, -9,-28, -9,-18, -1, 29,-14,-27,-19,-18,-15, -4,-22,-21,-18, -6,-16,-21,-11, -6,-19;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I';  M= -4,-28,-13,-35,-28, -2,-34,-29, 34,-27, 15, 13,-22,-23,-22,-27,-16, -7, 28,-24, -6,-28;
/M: SY='I';  M=-10,-26,-11,-33,-27, -3,-22,-24, 17,-24,  8, 13,-22,-25,-18,-24,-19,-12, 10, -6, -4,-24;
/M: SY='E';  M= -5, -7,-24, -5, 14,-18,-22,-12, -1, -7, -9, -6, -6,-11,  4,-11,  2, -3, -3,-29,-13,  7;
/M: SY='W';  M=-20,-33,-43,-33,-26, 17,-24,-12,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,108, 48,-20;
/M: SY='I';  M= -7,-22, -8,-29,-22, -4,-30,-25, 21,-25, 12,  8,-16,-22,-18,-23, -9,  1, 14,-27, -7,-22;
/M: SY='G';  M= -1,-11,-27,-12,-18,-22, 42,-20,-32,-18,-27,-19, -3,-19,-16,-18,  3, -8,-24, -6,-20,-16;
/M: SY='Y';  M=-16,-28,-27,-31,-24, 33,-30, -9,  9,-23, 15,  6,-24,-29,-22,-18,-24,-11,  0, 16, 36,-24;
/M: SY='A';  M= 27,-13,-12,-21,-13, -3, -9,-19, -6,-15, -2, -6,-11,-15,-14,-18,  5,  4,  1,-19,-11,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-24,-31,-22, 10,-31,-23, 20,-27, 28, 13,-26,-14,-22,-22,-23, -9, 11,-19, -1,-23;
/I:         I=-6; MD=-30;
/M: SY='V';  M=  9,-20,-14,-25,-19, -4,-18,-18, 16,-16, 11, 14,-19,-19,-14,-17, -9, -4, 18,-20, -8,-17; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-30;
/M: SY='T';  M= 10,-10,-13,-17,-13, -3, -9,-18, -3,-14, -6, -6, -6,-13,-13,-15,  7, 11,  1,-19, -8,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
/M: SY='W';  M=-17,-24,-38,-24,-13,  2,-22,-12,-16, -9,-16,-11,-22,-11, -1, -6,-22,-18,-24, 52, 17, -6;
/M: SY='N';  M= -6, 14, -8, 12,  7,-24, -9,  8,-26, -6,-27,-19, 18,-15,  1, -7, 14,  1,-21,-39,-16,  3;
/M: SY='W';  M= -4,-26,-24,-28,-19,  4,-23,-20,  4,-19, 11,  3,-25,-25,-13,-17,-19,-11,  3, 13,  3,-15;
/M: SY='P';  M= -8,-16,-30,-13,  0, -7,-22,-10,-11,-10, -9, -8,-16, 21, -4,-13,-11, -9,-17,-16, -3, -4;
/M: SY='A';  M= 16,-19,-17,-25,-21, -4, -2,-23,  1,-19, -4, -3,-15,-19,-21,-21, -3, -6,  9,-19,-12,-21;
/M: SY='Y';  M= -4,-26,-24,-29,-23, 11,-26,-15, 11,-20,  9,  4,-24,-26,-19,-19,-18, -9,  8, 12, 19,-22;
/M: SY='L';  M= 10,-20,-18,-23,-15, -7,-12,-18,  0,-15, 14,  3,-18,-22,-14, -9,-11, -7,  2,-21,-10,-15;
/M: SY='F';  M=-15,-27,-18,-35,-28, 60,-29,-21,  2,-27,  8,  0,-19,-28,-35,-19,-14, -2,  6,  1, 21,-28;
/M: SY='A';  M= 14,-20,-17,-26,-16,  0,-17,-20,  7,-21, 14,  4,-17,-19,-16,-20, -7, -4,  6,-20, -7,-16;
/M: SY='F';  M= -9,-24,-21,-30,-25, 14,-19,-23, 14,-26, 14,  7,-19,-24,-24,-21,-14, -4, 11,-16,  1,-25;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-26,-35,-28, 35,-26,-19,  4,-22,  3,  5,-27,-29,-26,-18,-23,-13,  3, 33, 22,-25;
/M: SY='T';  M= -2,-14,-14,-19,-18,  1,-14,-22,  1,-17, -6, -4, -9,-19,-18,-16,  7, 16, 10,-25, -8,-18;
/M: SY='L';  M= -9,-26, -8,-32,-25, 15,-31,-24, 16,-26, 18,  8,-22,-27,-25,-21,-16, -2, 17,-19,  1,-25;
/M: SY='C';  M=  8,-11, 49,-20,-18,-18,-18,-23,-20,-19,-17,-16,-10,-24,-18,-21,  7,  8, -6,-38,-22,-18;
/M: SY='N';  M= -9,  7,-21, -3, -4, -7,-14, -3, -8, -8,-15, -8, 19,-18,  3, -6,  4,  0,-15,-26, -8, -1;
/M: SY='L';  M=-10,-18,-21,-25,-19,  2,-24,-11, 19,-20, 28, 28,-15,-25,-11,-16,-21, -9,  7,-22, -2,-16;
/M: SY='T';  M= -1,-12,-20,-16,-13, -6, -3,-13,-10,-13, -8, -6, -9,-19, -8,-13,  0,  3, -5,-17, -2,-11;
/M: SY='P';  M=  6,-16,-24,-20,-13,-15,-16,-21,  1,-15, -6, -3,-14, 12,-12,-20, -3,  2, -2,-24,-16,-15;
/M: SY='R';  M=-15,-19,-30,-21,-12, -1,-21,-13,-13,  0,-13, -8,-11,-22, -4, 18,-12,-10,-13, 14,  3, -9;
/M: SY='A';  M= 45, -9,-10,-18, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-12,-11, -8,-10, -9,-19, 14,  2, -1,-22,-20, -9;
/M: SY='M';  M= -1,-13,-21,-16, -7, -8,-19,-12, -6,  1, -5,  2, -9,-17, -1,  1, -5, -5, -3,-20, -6, -4;
/I:         E1=0;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	57 in 57 different sequences
Number of true positive hits	57 in 57 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	10
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	85.07 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

57 sequences

CHO2_CANAL  (Q59LV5), CHO2_CANAW  (C4YL78), CHO2_CANDC  (B9WL59),

CHO2_CLAL4  (C4Y206), CHO2_DEBHA  (Q6BY28), CHO2_LODEL  (A5DS78), 
CHO2_PICST  (A3LQW6), DET2_ARATH  (Q38944), DET2_BRADI  (I1HTF7), 
DET2_GOSHI  (Q2QDF6), DET2_SOLLC  (Q5K2N1), DFG10_YEAST (P40526), 
ENCR_TRYB2  (Q57ZC7), PLMT_EMENI  (C8VRV0), PPRD1_ARATH (Q9CAH5), 
PPRD1_ORYSI (A2XWN6), PPRD1_ORYSJ (Q7XUH5), PPRD2_ARATH (Q9SI62), 
PPRD2_ORYSI (B8B6G5), PPRD2_ORYSJ (Q7F0Q2), S5A1_BOVIN  (A5PJS2), 
S5A1_HUMAN  (P18405), S5A1_MACFA  (Q28891), S5A1_MOUSE  (Q68FF9), 
S5A1_RAT(P24008), S5A2_HUMAN  (P31213), S5A2_MACFA  (Q28892), 
S5A2_MOUSE  (Q99N99), S5A2_PIG(O18765), S5A2_RAT(P31214), 
SR5A3_AILME (D2HBV9), SR5A3_CAEBR (A8X8R3), SR5A3_CAEEL (Q17428), 
SR5A3_DANRE (Q5RIU9), SR5A3_DROME (Q9VLP9), SR5A3_HUMAN (Q9H8P0), 
SR5A3_MESAU (C7T2J9), SR5A3_MOUSE (Q9WUP4), SR5A3_RAT   (Q5RJM1), 
SR5A3_XENLA (Q8AVI9), SR5A3_XENTR (Q0P4J9), TECRL_BOVIN (Q3SZ89), 
TECRL_HUMAN (Q5HYJ1), TECRL_MOUSE (Q8BFZ1), TECR_ARATH  (Q9M2U2), 
TECR_BOVIN  (Q3ZCD7), TECR_CAEEL  (Q9N5Y2), TECR_DICDI  (Q55C17), 
TECR_HUMAN  (Q9NZ01), TECR_MOUSE  (Q9CY27), TECR_RAT(Q64232), 
TECR_YEAST  (Q99190), USTE_USTVR  (A0A1B5L6A5), YFP9_SCHPO  (O14264), 
YFY8_SCHPO  (Q9UT20), YJD4_SCHPO  (O74507), YN67_SCHPO  (O94511)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

10 sequences

PEMT1_DICDI (Q54SD5), PEMT2_DICDI (Q54H80), PEMT_BOVIN  (Q7YRH6),

PEMT_HUMAN  (Q9UBM1), PEMT_MOUSE  (Q61907), PEMT_RAT(Q08388), 
PLMT_ARATH  (Q9SAH5), PLMT_NEUCR  (Q7S5W9), PLMT_SCHPO  (O74827), 
PLMT_YEAST  (P05375)

» more

PDB
[Detailed view]

1 PDB

7BW1