PROSITE entry PS50209

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50209
Entry name [info]	CARD
Accession [info]	PS50209
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50209
Associated ProRule [info]	PRU00046

Name and characterization of the entry

Description [info]

CARD caspase recruitment domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=91;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=86;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5415000; R2=0.0210540; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4071.3303223; R2=5.2782607; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=331; H_SCORE=5818; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=236; H_SCORE=5317; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -9,-17,-22,-21, -7, -4,-23, -8, 12,-13, 16, 29,-17,-18, -3,-12,-14, -8,  4,-23, -5, -5;
/M: SY='E';  M=-12,  0,-10,  2, 14,-22,-20, -9,-26,  1,-19,-16, -4,-14,  5,  2, -3, -2,-21,-14,-13,  9;
/M: SY='E';  M= -3, 10,-25, 15, 21,-30,-14, -1,-22,  2,-18, -9,  2, -8, 19, -4,  2, -7,-21,-28,-16, 20;
/M: SY='A';  M=  2, -7,-21, -7, -4,-17,-19, -8, -5, -2, -9, -5, -8,-17, -7, -2, -5, -6,  2,-26,-11, -7;
/M: SY='E';  M=  6, -3,-23, -3,  8,-20,-15, -4,-18,  5, -9, -8, -5,-13,  1,  3, -4, -8,-13,-24,-12,  4;
/M: SY='R';  M= -9, -9,-21, -9, -5,-14,-18,-11,-17,  1,-11, -9, -8,-19, -1,  9, -9, -8,-13, -7, -7, -3;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-25,  8, 15,-26,-14,  4,-25,  8,-21,-13,  6,-11, 14,  9,  3, -4,-22,-28,-13, 13;
/M: SY='L';  M= -1,-15,-11,-21,-16,  1,-21,-18,  0,-15,  4,  0,-13,-22,-15,-12,-10, -3,  2,-16, -5,-15;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-23,-28,-20,  2,-31, -9, 21,-25, 30, 17,-23,-26,-15,-19,-23,-10, 13,-22,  1,-19;
/M: SY='E';  M=-13,  6,-28, 10, 20,-27,-18, -2,-27, 17,-20,-13,  4,-11, 13, 20, -4, -8,-23,-27,-14, 15;
/M: SY='R';  M= -7,  0,-21,  0,  9,-26,-12, -6,-26, 16,-24,-13,  3,-13, 10, 19,  4, -2,-20,-27,-15,  8;
/M: SY='N';  M= -9,  6,-19,  1,  0,-16,-15, 11,-17,  1,-15, -8, 12,-19,  0, -1, -4, -7,-16,-28, -6, -1;
/M: SY='R';  M=-18,-12,-31,-12, -2,-19,-21,  1,-24, 19,-17, -8, -4,-11,  5, 45,-11,-10,-18,-17, -8, -3;
/M: SY='M';  M= -7,-14,-22,-15, -5,-12,-23, -6, -1, -2,  0,  5,-14,-16, -5,  0,-11, -6,  3,-25, -7, -6;
/M: SY='R';  M= -1, -9,-23,-10, -1,-15,-18, -8,-11,  6, -7, -1, -8,-16,  3,  8, -6, -6, -7,-20, -6,  0;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-21,-32,-22, 16,-30,-20, 20,-26, 35, 18,-26,-28,-21,-19,-25, -9, 12,-17,  3,-22;
/M: SY='I';  M= -1,-23,-16,-27,-18, -2,-25,-23, 18,-21, 11,  7,-19,-22,-17,-21,-11, -5, 18,-24, -7,-19;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-24,  4, 13,-25,-14,  2,-23,  8,-21,-13,  5,-12, 11, 11,  3, -4,-19,-28,-14, 11;
/M: SY='Q';  M= -8,  0,-21,  2,  6,-22,-11,  6,-23,  2,-21,-12,  2,-14,  7,  7,  3, -4,-18,-26, -8,  5;
/M: SY='L';  M= -8,-28,-17,-32,-24,  6,-28,-22, 23,-26, 30, 19,-26,-27,-21,-21,-22, -9, 19,-21, -2,-23;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='G';  M= -2,  2,-11, -1, -5,-15,  6, -4,-16, -6,-14,-10,  6,-11, -3, -5,  5,  3,-13,-20,-12, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M:         M= -8, -2,-13, -4, -3,-13,-16, -6, -9, -4,-10, -3, -2,-14, -2, -6, -3, -2, -7,-23, -7, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='V';  M= -2,-21,-16,-23,-18,  0,-23,-21, 16,-19, 12,  6,-19,-15,-18,-18, -9,  0, 17,-22, -7,-19; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='D';  M= -9, 12,-25, 13, 12,-25,-10,  1,-25,  5,-22,-16, 11,-12,  5,  4,  4, -2,-21,-31,-15,  8;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='E';  M= -6, -3,-22,  0,  4,-21,  1, -8,-22, -5,-18,-13, -3, -3, -1, -7, -2, -9,-20,-19,-13,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -6,-26,-21,-29,-22,  3,-29,-15, 23,-24, 25, 15,-23,-26,-18,-20,-19, -7, 18,-21,  0,-22;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-29,-21, 13,-28,-19, 14,-26, 35, 16,-26,-27,-19,-18,-24, -5,  7,-10,  3,-19;
/M: SY='D';  M=-17, 36,-30, 52, 20,-37,-11, -2,-35,  0,-28,-26, 14,  0,  2,-10,  0, -8,-29,-37,-20, 10;
/M: SY='H';  M= -7, -2,-20, -2, -3,-10,-19, 13,-15, -7,-12, -8, -3,-19, -4, -9, -7, -8,-13,-14, 10, -6;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-20,-30,-20, 10,-28,-19, 19,-28, 45, 22,-28,-29,-19,-19,-28,-10,  9,-19,  0,-19;
/M: SY='L';  M=-10,-20,-24,-22,-12, -2,-27,-11,  5,-10,  9,  5,-17,-23,-10,  0,-16, -8,  5,-15,  0,-13;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='E';  M=  2,  1,-21,  3, 18,-26, -9, -5,-20,  2,-20,-12,  0, -8, 14, -3,  9, -2,-17,-27,-16, 16; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M= -6,  0,-17, -1,  2,-25,-11, -7,-28, 17,-25,-14,  2,-15,  3, 15, -3, -8,-20,-21,-14,  1;
/M: SY='N';  M=-11, 12,-28, 13, 11,-29, -2, -2,-30, 12,-27,-17, 14,-13,  7, 11,  0, -9,-26,-28,-18,  8;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-15,-32,-29,  6,-32,-27, 30,-23, 15, 12,-27,-28,-27,-21,-14, -3, 39,-23, -3,-29;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-22,-33,-24, 15,-32,-23, 25,-30, 37, 17,-27,-28,-23,-22,-26,-10, 15,-17,  3,-24;
/M: SY='T';  M= -2,  7,-12,  1, -4,-17,-12,-10,-16, -4,-20,-13, 12,-11, -5, -6, 16, 21,-10,-34,-15, -5;
/M: SY='E';  M= -9, -1,-28,  1, 12,-22,-14, -4,-18,  1,-14,-10,  0, -9,  9,  0, -5, -9,-20,-18,-12, 10;
/M: SY='E';  M=-10, 13,-28, 19, 27,-28,-14,  1,-27,  6,-21,-17,  6, -6, 12, -1,  1, -7,-25,-29,-14, 19;
/M: SY='E';  M=-13, 17,-28, 25, 31,-29,-16,  6,-26,  5,-19,-11,  6, -8, 13, -2, -3,-10,-25,-31,-15, 22;
/M: SY='Y';  M= -8,-10,-21,-11,  1, -7,-20,  1, -6, -7, -5,  0,-10,-17, -3, -9, -8, -7, -7,-15,  8, -3;
/M: SY='E';  M=-10, 16,-25, 25, 40,-30,-17, -1,-29,  5,-21,-20,  5, -6, 14, -3,  1, -9,-27,-32,-19, 27;
/M: SY='E';  M= -5, -3,-25, -3, 10,-20,-17, -7,-14,  8,-10, -4, -5,-13,  3,  3, -7, -6,-12,-24,-11,  6;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-21,-32,-25, -1,-33,-27, 32,-19, 12, 13,-22,-24,-20,-20,-15, -6, 31,-23, -4,-25;
/M: SY='R';  M=-10, -4,-22, -4,  3,-21,-16, -4,-20, 12,-14, -6, -1,-16,  7, 17, -4, -7,-16,-25,-11,  4;
/M: SY='A';  M=  3, -3,-13, -7, -2,-15,-14, -5,-15, -4,-13, -9,  1,-16,  1, -3,  3, -2,-12,-25, -9, -1;
/M: SY='E';  M= -4, -5,-14, -5,  5,-16,-18, -7,-16,  4,-13, -7, -5,-12,  1,  0, -3, -4,-13,-23, -6,  2;
/M: SY='P';  M= -3,  2,-25,  0, -3,-22, -4, -9,-20, -6,-23,-16,  5,  7, -6, -8,  4,  1,-19,-29,-17, -6;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='T';  M= -3,  1,-13, -4, -5,-14,-14,-16,-15, -6,-16,-12,  3,-10, -8, -9, 13, 26, -8,-30,-13, -7;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='R';  M= -5, -8,-21, -8, -4,-16,-14, -9,-11,  1,-11, -6, -3,-10,  0, 10, -1, -2, -7,-24,-12, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='R';  M= -8,-11,-24,-11,  0,-12,-19, -7,-10,  0, -7,  0, -8, -6,  4,  5, -5, -4,-10,-21, -8,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='D';  M= -9, 17,-24, 23, 12,-27,-11,  0,-25,  3,-22,-16, 11,-12,  6,  1,  5, -4,-21,-32,-15,  8; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='R';  M=-12, -4,-30, -4,  8,-29,-18, -3,-27, 31,-23, -7, -1,-14, 20, 33, -8,-10,-22,-20,-10, 13;
/M: SY='A';  M= 19, -9,-11,-17,-12,-15,-11,-15, -4, -8, -7, -2, -6,-16, -9, -8,  3,  1,  3,-25,-15,-12;
/M: SY='R';  M=-10,-13,-27,-14, -6,-17, -7, -9,-20,  9,-13, -5, -7,-20, -1, 29, -9,-11,-12,-16,-12, -6;
/M: SY='K';  M= -3, -4,-23, -5,  4,-19,-18, -7,-11,  5, -9, -4, -4,-15,  2,  5, -5, -6, -7,-25,-12,  2;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-21,-31,-21, 14,-30,-19, 19,-28, 42, 20,-28,-29,-19,-19,-28,-10,  9,-17,  2,-20;
/M: SY='L';  M= -7,-29,-18,-32,-24,  9,-31,-23, 25,-27, 31, 18,-26,-27,-22,-22,-22, -8, 20,-21, -1,-24;
/M: SY='D';  M=-14, 28,-26, 38, 12,-30,-13, -4,-28,  2,-24,-21, 14,-12,  0, -3,  2, -5,-21,-35,-17,  6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -2,-13,-19,-18,-13, -3,-21,-14,  6,-18,  7,  5,-10,-16,-11,-16, -3,  3,  3,-24, -5,-13;
/M: SY='L';  M= -5,-26,-13,-29,-24,  5,-28,-22, 20,-23, 22, 14,-25,-27,-21,-20,-16, -3, 22,-22, -2,-23;
/M: SY='Q';  M=-10, -8,-28, -7,  5,-21,-21, -6,-14,  1,-10, -5, -8,  1, 10,  3, -7, -4,-17,-20,-11,  6;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='K';  M= -5, -3,-15, -4,  2,-21,-15,-11,-19, 10,-20,-11, -1,-13,  1, 10,  3,  1,-11,-27,-14,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M=-12, -4,-30, -5,  5,-25,-19, -4,-27, 32,-25,-10, -1,-14, 12, 32, -9,-10,-21,-11, -7,  7;
/M: SY='G';  M=  0, -2,-28, -2,-12,-29, 42,-12,-34,-15,-28,-19,  5,-12,-13,-16,  1,-14,-27,-24,-25,-13;
/M: SY='D';  M= -9,  7,-27,  8,  8,-25,-13, -3,-24,  4,-25,-17,  8,  6,  4,  3,  2, -4,-24,-28,-17,  5;
/M: SY='K';  M= -6, -1,-26, -2,  5,-22,-11, -7,-18,  7,-16, -7, -1,-14,  6,  6, -4, -6,-15,-19,-12,  5;
/M: SY='A';  M= 25,-14, -7,-21,-15,-12, -1,-21,-10,-16, -7, -8,-12,-14,-15,-20,  2, -3, -1,-22,-17,-15;
/M: SY='F';  M= -3,-14, -3,-18,-16,  4, -8,-12,-16,-14,-10, -9,-11,-23,-16,-14, -6, -8,-11,-15,  2,-15;
/M: SY='D';  M= -8,  7,-19, 11, 10,-28,-17, -7,-19, -1,-20,-13,  1, -4,  9, -6,  1, -3,-16,-31,-17,  9;
/M: SY='V';  M=  2,-17,-19,-22,-13, -3,-20,-16,  7,-14,  6,  6,-14,-19,-13,-14, -6, -2,  8,-23, -7,-14;
/M: SY='F';  M=-16,-29,-19,-36,-26, 50,-30,-21,  8,-28, 20,  6,-22,-29,-32,-19,-22,-10,  5, -2, 17,-26;
/M: SY='L';  M=-10,-21,-15,-22,-15,  5,-29,-15,  9,-19, 17,  6,-20,-25,-16,-15,-19, -8,  5,-16,  7,-17;
/M: SY='E';  M= -8,  8,-23,  9, 12,-23,-12, -1,-22,  2,-19,-13,  8,-13, 12,  1,  3, -4,-22,-27,-12, 12;
/M: SY='A';  M= 11, -8,  3,-14,-10,-13,-12, -6,-15,-13,-15,-11, -4,-17, -9,-14,  9,  5, -7,-28,-11,-10;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -7,-27,-20,-29,-20, 10,-28,-20, 17,-24, 34, 14,-24,-26,-19,-17,-23, -9, 10,-17,  0,-20; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q';  M= -9, -6,-13, -8,  4,-18,-21, -4,-16,  5,-13, -6, -3,-17, 10,  8, -6, -8,-15,-25,-10,  6;
/M: SY='E';  M=-11, 11,-27, 13, 26,-18,-16,  5,-24,  2,-19,-15,  8,-10,  9, -1,  0, -7,-25,-27, -9, 17;
/M: SY='T';  M= -6, -5,-20,-10, -4, -4,-20, -8, -5, -9, -6, -5, -2,-16, -7, -8,  1,  7, -4,-23, -2, -6;
/M: SY='D';  M= -9, 10,-27, 12,  1,-23, -4,  2,-25, -3,-23,-15,  7, -7,  1, -6, -1, -8,-23,-25,-10,  0;
/M: SY='Q';  M= -8, -9,-28, -6,  4,-25,-19, -3,-18,  0,-21,-10, -9, 12, 14, -5, -4, -8,-22,-14, -9,  7;
/M: SY='H';  M= -8, -2,-25, -1,  3,-15,-13,  4,-14, -4,-14, -5, -2,-13,  3, -6, -3, -6,-13,-22, -3,  2;
/M: SY='L';  M=-12,-14,-24,-13,-11, -4,-19,  7, -4,-17, 12,  5,-12,-21,-10, -9,-15,-10, -6,-23,  1,-12;
/M: SY='L';  M=  0,-18,-19,-20,-12,  1,-22,-13,  6,-17, 15,  6,-19,-22,-12,-16,-13, -5,  4,-16,  4,-13;
/M: SY='A';  M=  9, -5,-20, -7,  0,-20,-10,-13,-13,  0,-12, -7, -5,-10, -1, -4,  2, -1, -8,-25,-15, -1;
/M: SY='D';  M= -6,  2,-25,  7,  4,-20,-18, -7,-13, -7, -9, -9, -4, -5,  0,-10, -3, -4,-13,-27,-11,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-22,-18,-23,-13,  5,-27,-16,  7,-15, 18,  9,-21,-25,-13,-11,-19, -8,  5,-15,  0,-13;
/M: SY='L';  M= -8,-15,-25,-15, -6, -6,-14,-17, -6,-12,  4, -2,-14,-13,-11,-10,-12, -5, -6,-18, -8, -9;
/M: SY='E';  M= -5,-10,-26, -8,  3,-16,-12, -3,-14, -7, -5, -6,-10,-14,  0, -5, -9,-10,-13,-15, -9,  1;
/M: SY='Q';  M= -6, -1,-25,  1,  5,-24,-13, -3,-21,  5,-19,-11,  0, -6,  7,  6,  1, -3,-18,-27,-13,  5;
/M: SY='E';  M= -6,  1,-20,  2, 13,-20,-11, -1,-20, -4,-13,-11,  0,-13,  4, -6,  0, -3,-18,-26,-11,  8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	106 in 100 different sequences
Number of true positive hits	106 in 100 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	18
Number of 'partial' sequences	1

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	85.48 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CARD
Version [info]	7

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	100 sequences 064R_FRG3G (Q6GZR1), APAF_DANRE (Q9I9H8), APAF_HUMAN (O14727), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	18 sequences APAF_DROME (Q7KLI1), CAR19_BOVIN (Q58D91), CAR19_HUMAN (Q96LW7), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	1 sequence APAF_CANLF (Q9GL23)
PDB [Detailed view]	99 PDB 1C15; 1CWW; 1CY5; 1DGN; 1Z6T; 2A5Y; 2B1W; 2DBD; 2KN6; 2L9M; 2MB9; 2N7Z; » more