PROSITE entry PS50198

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50198

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PPIC_PPIASE_2
Accession [info]	PS50198
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00840
Associated ProRule [info]	PRU00278

Name and characterization of the entry

Description [info]

PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=99;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=94;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6310000; R2=0.0155932; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6335.4868164; R2=3.9078948; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=505; H_SCORE=8309; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=377; H_SCORE=7809; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -4,-10,-31, -4,  0,-29,-11,-15,-20, -6,-26,-16,-11, 41, -3,-14, -3, -7,-22,-29,-24, -4;
/M: SY='E';  M=  0,  2,-24,  4,  9,-26,-12,-11,-21,  6,-20,-13, -2, -1,  3, -3,  1,  0,-15,-27,-17,  5;
/M: SY='R';  M=-10,  0,-26,  1, 18,-25,-19, -3,-26, 17,-21,-12,  1,-10, 16, 24,  1, -1,-21,-25,-13, 16;
/M: SY='V';  M= -5,-21,-18,-23,-20, -1,-26,-10,  9,-11,  4,  4,-19,-25,-16, -6,-10, -1, 17,-18,  5,-20;
/M: SY='R';  M=-10, -3,-25, -6,  1,-16,-19, 13,-20,  6,-14, -7,  2,-17,  5, 17, -4, -2,-17,-22, -1,  1;
/M: SY='C';  M=  7,-19, 12,-25,-21, -6,-22,-21,  1,-20,  2, -2,-18,-24,-19,-21, -6,  1,  8,-25, -7,-21;
/M: SY='R';  M= -6, -9,-22,-10, -1,-18,-16, -6,-18,  8,-11, -7, -3,-17,  6, 24,  1, -2,-13,-25,-11,  0;
/M: SY='H';  M=-19, -2,-30, -3, -2,-19,-21, 90,-24,-11,-17,  1,  8,-20,  8, -2,-11,-19,-26,-29, 19, -2;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 25,-20,  0,-27;
/M: SY='L';  M= -9,-26,-21,-26,-15,  3,-29,-17, 15,-24, 38, 17,-26,-27,-10,-16,-25, -9,  7,-21, -2,-13;
/M: SY='V';  M= -5,-25,-15,-29,-25,  5,-30,-26, 22,-22, 17, 10,-24,-26,-24,-20,-12,  4, 28,-24, -4,-25;
/M: SY='K';  M=  2, -3,-22, -6,  2,-24,-16,-14,-22, 20,-23,-12, -2, -3,  1,  8,  3,  6,-13,-24,-14,  1;
/M: SY='H';  M=-11,  1,-24,  2, -3,-15,-21,  8, -7,-12, -5, -4, -1,-13, -7,-12, -6, -3, -6,-30, -6, -7;
/M: SY='E';  M= -9, 12,-27, 16, 29,-29,-14, -2,-27, 10,-25,-18, 10,  0, 12,  1,  4, -5,-27,-31,-19, 21;
/M: SY='E';  M=-11, 11,-30, 17, 18,-32, -3, -5,-31,  6,-27,-19,  6,  1,  8, -2, -2,-11,-29,-29,-20, 13;
/I:         MD=-15;
/M: SY='B';  M= -4,  9,-12,  9,  0,-12, -5, -3, -9, -5,-10, -9,  9, -9, -2, -6,  6,  1, -8,-21, -9, -1; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='R';  M= -9,-10,-15,-10, -5,  1,-12, -4, -7,  2, -2,  0, -6, -5, -3, 13, -8, -5, -6, -9, -2, -5; D=-2;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='R';  M= -6, -1,-13,  0,  1,-11, -9, -4,-11, 12,-11, -5, -1, -8,  2, 15, -2, -3, -6,-13, -6,  0; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-15,  7, 20,-16, -8, -1,-14,  2,-13,-10,  4,  2,  9, -1,  3, -3,-15,-18,-11, 14; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='E';  M=  4,  0,-15,  1, 10,-17, -8, -3,-14,  4,-11, -7, -1, -6,  9,  6,  1, -4,-12,-15,-10,  9; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='A';  M= 20, -3, -8, -6, -6,-12, -4,-12, -4, -6, -6, -6, -6, -8, -7,-12,  3, -1,  3,-15,-11, -7; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-16, -4,  3,-12,-12,  2,-11,  5, -8, -4, -1, -9,  5, 11, -1, -2, -9,-16, -5,  2; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='E';  M=  0, -1,-13, -1,  3,-14, -3, -7,-11, -1, -9, -7, -2, -8,  1, -4,  2,  1, -7,-17,-10,  2; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='E';  M=-11, -3,-26, -2, 12,-21,-22, -7,-13,  5, -7, -5, -5,-13, 11,  8, -6, -3,-14,-24,-10, 10;
/M: SY='A';  M= 18,-21,-17,-28,-19, -7,-19,-23, 14,-20, 13,  6,-19,-19,-16,-22, -8, -5, 13,-21,-10,-19;
/M: SY='K';  M= -8,  3,-27,  4, 15,-24,-18, -4,-22, 17,-16,-10,  3,-12, 10, 14, -6, -9,-20,-25,-13, 12;
/M: SY='E';  M=  5,  1,-22,  1, 10,-25, -6,-10,-19, -1,-17,-12, -3,-11,  4, -7,  2, -3,-12,-26,-17,  7;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-22,-32,-25,  5,-32,-20, 28,-24, 20, 13,-24,-26,-21,-22,-18, -7, 23,-16,  7,-25;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-24,-25,-16,  3,-27,-11, 11,-13, 13,  7,-19,-24,-12, -6,-17, -8,  6,-11, 11,-17;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-23,  6,  8,-18,-13, -6,-24,  8,-22,-15,  7,-13,  3,  7,  4, -2,-18,-26,-12,  5;
/M: SY='E';  M=-14, 10,-29, 17, 21,-30,-18,  0,-30, 17,-23,-15,  4,-10, 17, 20, -3, -7,-25,-27,-14, 18;
/M: SY='L';  M= -6,-29,-24,-34,-24,  4,-33,-25, 32,-29, 33, 18,-24,-24,-19,-25,-23, -9, 18,-20, -1,-24;
/M: SY='R';  M= -7, -1,-26, -5,  0,-22,-19, -7,-13, 15,-17, -6,  3,-16,  7, 16, -5, -7,-11,-24,-11,  2;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-22; IM=0;
/M: SY='S';  M=  5,  1,-14,  2,  5,-18,  6, -7,-17, -4,-16,-12,  2, -7,  1, -7, 10, -1,-13,-20,-14,  3; D=-4;
/I:         DM=-22;
/M: SY='G';  M=  3, -5,-25, -7, -7,-26, 21,-14,-28,  3,-24,-13,  1,-15, -5, -4,  0,-11,-21,-22,-20, -6;
/M: SY='G';  M= -7,  1,-29,  5,  6,-29, 11, -6,-32,  2,-27,-18,  1, -5, -2, -2, -1,-10,-26,-26,-20,  1;
/M: SY='A';  M= 11,  0,-20, -3,  2,-18,  1,-13,-21, -4,-18,-14,  0,-11, -6,-10,  6,  0,-14,-24,-17, -1;
/M: SY='D';  M= -6, 16,-22, 18,  2,-24, -7, -8,-25,  0,-21,-17, 11,-13, -3, -1,  6,  5,-17,-32,-16, -1;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='A';  M= 21, -1,-18, -2,  9,-25,  2,-13,-21, -5,-18,-16, -3, -8, -2,-13,  9, -3,-13,-26,-21,  4;
/M: SY='E';  M=  6,  6,-23,  9, 13,-26,-12, -9,-23,  4,-19,-14, -1, -3,  2, -3,  2, -4,-16,-27,-18,  7;
/M: SY='L';  M= -3,-24,-19,-25,-15, -1,-26,-18, 13,-21, 29, 13,-24,-25,-10,-16,-19, -7, 10,-22, -5,-13;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='K';  M= -4, -8,-25,-10, -1,-20,-19, -6,-14, 16,-12, -2, -5,-15,  4, 14, -7, -6,-10,-22, -8,  1;
/M: SY='E';  M= -3,  0,-25,  1, 20,-27,-17, -5,-25, 17,-21,-12, -1, -9, 15, 15,  1, -3,-20,-24,-14, 16;
/M: SY='H';  M=-17, -4,-28, -5, -6, -1,-22, 25,-18,  2,-14, -5, -2,-22, -2,  6,-12,-12,-16,-10, 23, -7;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='D';  M= -5,  5,-25,  7,  7,-22,-19,  0,-12, -5,-11, -8, -1,-12,  1, -9, -3, -4,-11,-28,-10,  3;
/M: SY='C';  M=-14, 14, 36, 20, -5,-30,-13,-15,-36,-15,-26,-25,  1,-24,-15,-20, -4,-11,-21,-43,-25,-10;
/M: SY='P';  M= -6,-11,-28, -9, -2,-21,-17,-13,-15, -5,-22,-13, -8, 27, -2, -7,  4,  2,-17,-27,-15, -5;
/I:         I=-8; MI=-10; IM=-10; MD=-15; DM=-15;
/M: SY='S';  M=  5,  1,-13, -1,  4,-20, -7,-10,-19, -7,-24,-17,  6, -9,  3, -8, 30, 22,-11,-36,-17,  3;
/M: SY='A';  M= 30, -9,-16,-15, -9,-21,  7,-17,-17, -5,-16,-12, -7,-12, -9,-13,  7, -3, -8,-19,-16, -9;
/M: SY='K';  M= -8, -1,-26, -2,  4,-22,-17, -5,-15, 10,-12, -1, -1, -9,  9,  6, -7, -8,-16,-25,-12,  6;
/M: SY='N';  M=-10, 10,-26,  3,  4,-22, -9,  4,-23, 10,-23,-12, 20,-17, 12, 19,  0, -6,-25,-25,-11,  6;
/M: SY='G';  M= -1, -9,-30, -8,-15,-30, 62,-18,-39,-16,-29,-20,  0,-19,-17,-15,  0,-19,-30,-21,-29,-16;
/M: SY='G';  M=  1, -9,-29, -9,-19,-29, 65,-19,-39,-19,-30,-20,  1,-19,-19,-19,  3,-17,-29,-21,-29,-19;
/M: SY='D';  M=-15, 21,-27, 32, 10,-26,-16, -4,-24,  0,-15,-16,  5,-14,  1, -4, -5, -8,-18,-31,-11,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-21,-31,-21,  8,-30,-19, 24,-28, 43, 24,-28,-28,-18,-20,-28,-10, 13,-20,  0,-20;
/M: SY='G';  M=  0, -7,-29, -6,-17,-30, 62,-19,-39,-19,-30,-20,  1,-19,-18,-19,  3,-17,-29,-22,-29,-18;
/M: SY='W';  M=-14,-26,-39,-25,-13,  7,-20,-20,-18,-13,-17,-16,-26,-12,-14,-15,-23,-19,-23, 70, 15,-11;
/M: SY='F';  M= -2,-24,-18,-28,-20, 23,-20,-22,  6,-21,  6,  1,-20,-24,-26,-19,-11, -6, 12,-13,  2,-22;
/M: SY='S';  M=  0, -4,-22, -5, -1,-16, -3,-13,-19, -4,-17,-13, -2, -9, -6, -4,  3,  0,-12,-26,-16, -4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0;
/M: SY='R';  M= -8, -6,-26, -5,  7,-20,-17, -6,-16,  4,-14, -9, -2,  3,  6, 12, -4, -7,-17,-24,-15,  4; D=-5;
/I:         DM=-25;
/M: SY='G';  M= -4,  5,-25,  4, -4,-27, 29,-10,-31, -6,-26,-17,  9,-15, -5, -9,  3, -9,-25,-25,-22, -5; D=-5;
/I:         DM=-25;
/M: SY='Q';  M= -8,  3,-23,  0,  7,-22,-20, -6, -9, -3,-11, -5,  2,-13, 13, -4,  2,  5,-11,-27,-12, 10;
/M: SY='M';  M= -8,-24,-22,-28,-19,  6,-24, -9, 14,-18, 22, 27,-23,-17,-11,-16,-21, -9,  5,-14,  6,-16;
/M: SY='D';  M=-10,  0,-27,  4,  0,-18,-20,  3,-14, -6,-15, -9, -6, -2,  4, -9, -5, -5,-13,-20,  1,  0;
/M: SY='P';  M= -3,-10,-31, -7,  5,-27,-13,-14,-19,  2,-23,-14, -9, 28,  0, -5, -4, -8,-21,-26,-21,  0;
/M: SY='P';  M=  5, -8,-24, -9,  3,-25,-16,-13,-13, -6,-17,-10, -8, 16,  6,-11,  3,  3,-15,-26,-18,  3;
/M: SY='F';  M=-18,-25,-22,-31,-25, 54,-30,-18,  4,-27, 14,  3,-19,-28,-32,-20,-20,-10,  1,  1, 23,-26;
/M: SY='E';  M=  0,  4,-23,  7, 19,-23,-17,-10,-17,  2,-15,-13, -2, -9,  3, -4,  2,  0,-12,-28,-16, 10;
/M: SY='D';  M= -9, 17,-27, 25, 18,-31,-15, -3,-27,  7,-20,-15,  5,-10, 12, -1, -1, -6,-23,-29,-15, 15;
/M: SY='A';  M= 27,-11,  1,-18, -9,-17,-10,-20,-11, -9, -8, -9,-11,-15,-11,-16,  4,  2, -1,-25,-18,-10;
/M: SY='A';  M= 17,-16,-14,-21,-15, -7,-15,-19,  4,-17, 10,  2,-14,-20,-15,-18, -4, -1,  8,-24,-12,-15;
/M: SY='F';  M= -7,-19,-19,-26,-19, 34,-23,-15, -5,-13, -2, -4,-14,-23,-23,-12, -8, -1, -1, -3, 17,-19;
/M: SY='K';  M=  4, -3,-21, -5,  1,-25, -8,-10,-22, 13,-23,-11,  0,-11,  6,  9,  8,  3,-15,-25,-15,  4;
/M: SY='L';  M= -5,-24,-13,-27,-18,  4,-26,-19, 12,-25, 34, 16,-24,-26,-17,-19,-20, -4,  7,-23, -4,-18;
/M: SY='K';  M= -3,  0,-28, -2,  8,-28,-16, -9,-25, 28,-26,-12,  1,  0,  7, 16, -5, -8,-20,-23,-15,  7;
/M: SY='K';  M=  0, -3,-19, -6,  3,-19,-18,-12, -9,  4,-13, -7, -2,-14,  1,  0,  1,  3, -2,-27,-14,  2;
/M: SY='G';  M= -3, -3,-29, -4,-15,-28, 51,-16,-35,-14,-27,-18,  5,-19,-16,-15, -1,-17,-28,-23,-26,-15;
/M: SY='E';  M= -7,  9,-27, 14, 26,-31,-13, -2,-25,  6,-21,-14,  1, -8, 19,  0,  0, -8,-23,-27,-17, 22;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-24,-29,-21,  3,-29,-16, 19,-21, 19, 14,-25,-21,-14,-18,-21, -9, 12, -8,  7,-19;
/M: SY='S';  M=  5, -6, -2, -8, -8,-15,-10,-16,-12,-14,-18,-13,  0,-15, -8,-13, 24, 18, -1,-37,-17, -8;
/M: SY='D';  M= -3,  4,-25,  8,  0,-27,  3,-10,-23, -9,-17,-13,  0, -7,  1,-12,  1, -6,-20,-28,-19,  0;
/I:         I=-8; MI=-10; IM=-10; MD=-15; DM=-15;
/M: SY='P';  M= -9,-23,-35,-17, -8,-22,-24,-23, -3,-14,-18,-10,-21, 59,-14,-21,-11, -9,-11,-29,-23,-15;
/M: SY='V';  M= -6,-30,-19,-34,-28,  6,-33,-28, 33,-26, 21, 15,-26,-27,-25,-23,-17, -6, 34,-23, -3,-28;
/M: SY='E';  M= -6,  7,-27,  9, 17,-25,-16,  3,-27, 15,-22,-13,  4,-10,  9,  9, -3, -9,-22,-25,-11, 13;
/M: SY='T';  M=  4, -7,-10,-10,-10,-12,-14,-18, -5,-12,-14,-10, -3,-15,-10,-12, 22, 26,  7,-34,-14,-10;
/M: SY='D';  M= -6,  9,-25, 13, 10,-29,  0, -7,-27, -4,-25,-18,  6, -3,  5, -8,  8,  2,-23,-31,-20,  7;
/M: SY='F';  M= -3,-11,-19,-15,-11,  8,-15,-14, -3,-17, -3, -5, -6,-20,-16,-15, -1, -2,  0,-20, -2,-13;
/M: SY='G';  M= -3, -9,-31,-10,-17,-28, 54,-17,-36,-17,-29,-19,  0,-20,-13,-17, -2,-19,-30, -9,-24,-15;
/M: SY='W';  M=-12,-29,-30,-32,-26, 24,-25,-14, -1,-19, -1, -4,-27,-28,-21,-18,-23,-14, -5, 48, 33,-23;
/M: SY='H';  M=-14, -4,-28, -4,  0,-17,-21, 70,-20,-11,-12,  1,  4,-19,  6, -5,-10,-17,-22,-28, 12, -1;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-22,-35,-28,  2,-35,-28, 38,-27, 24, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 31,-23, -3,-28;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-24,-35,-26,  4,-35,-26, 37,-29, 30, 19,-25,-25,-21,-25,-22, -9, 25,-21, -1,-26;
/M: SY='R';  M=-13,-10,-29, -9,  5,-13,-23, -7,-16, 12, -6, -4,-10,-17,  7, 13,-14,-11,-16, -9, -2,  6;
/M: SY='V';  M= -9,-22,  4,-24,-18, -7,-27,-18,  1, -9,  6,  5,-20,-28,-15,  0,-15, -7,  9,-28,-10,-18;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-24,  6, 14,-20,-21, -9,-13,  0, -8, -9,  0,-12,  3, -5, -3,  1,-12,-28,-13,  8;
/M: SY='D';  M=  0, 14,-24, 16, 12,-26, -3, -4,-26,  1,-23,-18,  9,-11,  3, -6,  4, -6,-22,-28,-15,  7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	317 in 231 different sequences
Number of true positive hits	317 in 231 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	2
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	99.37 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	PpiC
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

231 sequences

CBF2_CAMJE  (Q0PAS1), CBF2_CAMJJ  (A1VYV6), DOD_DROME   (P54353),

ESS1_YEAST  (P22696), NIFM_AZOCH  (P23119), NIFM_AZOVI  (P14890), 
NIFM_KLEOX  (P0A3Z0), NIFM_KLEPN  (P0A3Y9), PIN1B_THEAN (P0DMT5), 
PIN1_ARATH  (Q9SL42), PIN1_BOVIN  (Q5BIN5), PIN1_DIGLA  (Q9LEK8), 
PIN1_HUMAN  (Q13526), PIN1_MACFA  (Q4R383), PIN1_MALDO  (Q94G00), 
PIN1_MOUSE  (Q9QUR7), PIN1_RHIO9  (P0C1J8), PIN1_SCHPO  (O74448), 
PIN1_THEAN  (Q4UG71), PIN4_ASPFU  (Q4WJM6), PIN4_BOVIN  (A6QPY8), 
PIN4_DANRE  (Q503Y7), PIN4_EMENI  (Q5B5W1), PIN4_GIBZE  (Q4I665), 
PIN4_HUMAN  (Q9Y237), PIN4_MOUSE  (Q9CWW6), PIN4_NEUCR  (Q7RYY4), 
PIN4_TAEGU  (B5KFL3), PIN4_XENTR  (Q6P4K8), PLP1_BORBR  (Q7WCX5), 
PLP1_BORPA  (Q7W5E0), PLP1_BORPE  (P40415), PLP_RICBR   (Q1RI35), 
PLP_RICCN   (Q92H91), PLP_RICFE   (Q4UKY0), PLP_RICPR   (Q9ZCX6), 
PLP_RICTY   (Q68WG0), PPIC_ECO57  (P0A9L7), PPIC_ECOL6  (P0A9L6), 
PPIC_ECOLI  (P0A9L5), PPIC_SALTI  (P0A266), PPIC_SALTY  (P0A265), 
PPID_BUCAI  (P57550), PPID_BUCAP  (Q8K987), PPID_ECOL6  (P0ADY2), 
PPID_ECOLI  (P0ADY1), PPID_HAEDU  (Q7VKX4), PPID_HAEIN  (P44092), 
PRSA1_BACAN (Q81U45), PRSA1_BACCR (Q81GY5), PRSA1_LACJO (P60750), 
PRSA1_LACPL (Q88X05), PRSA1_LISIN (Q92BR2), PRSA1_LISMF (Q71ZM6), 
PRSA1_LISMO (Q8Y759), PRSA1_STRP1 (P60811), PRSA1_STRP3 (P0DD42), 
PRSA1_STRP6 (Q5XBH0), PRSA1_STRP8 (Q8P0E5), PRSA1_STRPQ (P0DD43), 
PRSA2_BACAN (Q81TU1), PRSA2_BACCR (Q81GN0), PRSA2_LACJO (P60810), 
PRSA2_LACPL (Q88T16), PRSA2_LISIN (Q929F4), PRSA2_LISMF (Q71XE6), 
PRSA2_LISMO (Q8Y557), PRSA2_STRP1 (P60812), PRSA2_STRP3 (P0DD44), 
PRSA2_STRP6 (Q5X9P6), PRSA2_STRP8 (P60813), PRSA2_STRPQ (P0DD45), 
PRSA3_BACAN (Q81QT1), PRSA3_BACCR (Q81DT1), PRSA4_BACCR (Q81CB1), 
PRSA_BACSU  (P24327), PRSA_CALS4  (Q8R760), PRSA_CLOAB  (Q97E99), 
PRSA_CLOB1  (A7FPK5), PRSA_CLOB6  (C3KW94), PRSA_CLOBH  (A5I7R3), 
PRSA_CLOBJ  (C1FNE4), PRSA_CLOBK  (B1IGZ5), PRSA_CLOBL  (A7GJD2), 
PRSA_CLOBM  (B1KTE0), PRSA_CLOK1  (B9DY54), PRSA_CLOK5  (A5N4J2), 
PRSA_CLOP1  (Q0TMG9), PRSA_CLOPE  (Q8XHK0), PRSA_CLOPS  (Q0SQ68), 
PRSA_CLOTE  (Q899I2), PRSA_ENTFA  (Q837Y9), PRSA_EXIS2  (B1YK87), 
PRSA_GEOKA  (Q5L289), PRSA_GEOSW  (C5D6L9), PRSA_GEOTN  (A4IKU2), 
PRSA_HALH5  (Q9KDN4), PRSA_LACLC  (P0C2B5), PRSA_LACLS  (Q02VE3), 
PRSA_LACPA  (Q02473), PRSA_LATSS  (Q38XZ9), PRSA_LEVBA  (Q03QE1), 
PRSA_LIGS1  (Q1WUQ1), PRSA_OCEIH  (Q8CXK4), PRSA_PEDPA  (Q03GD4), 
PRSA_STAA1  (A7X3U8), PRSA_STAA2  (A6U2U4), PRSA_STAA3  (Q2FFQ5), 
PRSA_STAA8  (Q2G2S6), PRSA_STAAB  (Q2YTZ6), PRSA_STAAC  (Q5HET4), 
PRSA_STAAE  (A6QI23), PRSA_STAAM  (P60747), PRSA_STAAN  (P60748), 
PRSA_STAAR  (Q6GFL5), PRSA_STAAS  (Q6G894), PRSA_STAAT  (A8YY10), 
PRSA_STAAW  (P60749), PRSA_STAEQ  (Q5HN96), PRSA_STAES  (Q8CNR4), 
PRSA_STRA1  (Q3K1P9), PRSA_STRA3  (Q8E602), PRSA_STRA5  (Q8E0C6), 
PRSA_STRE4  (C0M9L5), PRSA_STREM  (B4U214), PRSA_STRGC  (A8AYJ0), 
PRSA_STRP2  (Q04KU8), PRSA_STRP7  (C1C6V8), PRSA_STRPI  (B1IBE1), 
PRSA_STRPJ  (B8ZPD9), PRSA_STRPN  (Q97R51), PRSA_STRPS  (B2IPD4), 
PRSA_STRR6  (Q8DQ24), PRSA_STRS7  (C0MCT3), PRSA_STRSV  (A3CLY1), 
PRSA_STRZJ  (C1CDX6), PRSA_STRZP  (C1CK62), PRSA_STRZT  (C1CRR9), 
SSP1_NEUCR  (O60045), STR12_ARATH (Q93WI0), SURA_ALBFT  (Q223E5), 
SURA_ALCBS  (Q0VMV4), SURA_ALIF1  (Q5E863), SURA_ALKEH  (Q0AC82), 
SURA_AROAE  (Q5P7I9), SURA_BAUCH  (Q1LSS0), SURA_BLOPB  (Q493R5), 
SURA_BORA1  (Q2KXA6), SURA_BORBR  (Q7WG19), SURA_BORPA  (Q7W4J5), 
SURA_BORPE  (Q7VU12), SURA_BUCAI  (P57240), SURA_BUCAP  (Q8KA01), 
SURA_BURL3  (Q39D35), SURA_BURMA  (Q62MM4), SURA_BURO1  (Q1BTQ6), 
SURA_BURP1  (Q3JVW8), SURA_BURPS  (Q63X78), SURA_BURTA  (Q2T116), 
SURA_CHRSD  (Q1QZ33), SURA_CHRVO  (Q7NQB0), SURA_COLP3  (Q47VK0), 
SURA_CUPMC  (Q1LRA3), SURA_CUPPJ  (Q475Q3), SURA_DECAR  (Q479U4), 
SURA_ECO57  (P0ABZ8), SURA_ECOL6  (P0ABZ7), SURA_ECOLI  (P0ABZ6), 
SURA_ECOUT  (Q1RGE4), SURA_HAEIN  (P44721), SURA_HAHCH  (Q2S9C1), 
SURA_HYDCU  (Q31F26), SURA_IDILO  (Q5QVN9), SURA_LEGPA  (Q5X877), 
SURA_LEGPH  (Q5ZYR3), SURA_LEGPL  (Q5WZN0), SURA_METCA  (Q60B78), 
SURA_METFK  (Q1GZC0), SURA_NITEU  (Q82W17), SURA_NITMU  (Q2YBP3), 
SURA_NITOC  (Q3JAF1), SURA_PARXL  (Q145L3), SURA_PECAS  (Q6D0E2), 
SURA_PHOLL  (Q7N8V5), SURA_PHOPR  (Q6LV39), SURA_POLSJ  (Q121Q4), 
SURA_PSE14  (Q48NT5), SURA_PSEA6  (Q15QB3), SURA_PSEAE  (Q9I5U3), 
SURA_PSEF5  (Q4K4X7), SURA_PSEPF  (Q3K5T4), SURA_PSEPK  (Q88QT4), 
SURA_PSESM  (Q88A44), SURA_PSET1  (Q3IFD3), SURA_PSEU2  (Q4ZMG7), 
SURA_RALN1  (Q8Y220), SURA_SACD2  (Q21MS8), SURA_SALCH  (Q57TG8), 
SURA_SALPA  (Q5PDE6), SURA_SALTI  (Q8XEV3), SURA_SALTY  (Q7CR87), 
SURA_SHEDO  (Q12K61), SURA_SHEFN  (Q07YK0), SURA_SHEON  (Q8EB95), 
SURA_SHESM  (Q0HLT0), SURA_SHESR  (Q0HS08), SURA_SHIBS  (Q326I0), 
SURA_SHIDS  (Q32K41), SURA_SHIFL  (P0ABZ9), SURA_SHISS  (Q3Z5V6), 
SURA_SODGM  (Q2NVX4), SURA_THIDA  (Q3SGF9), SURA_VIBCH  (Q9KUS0), 
SURA_VIBPA  (Q87ST4), SURA_VIBVU  (Q8DED4), SURA_VIBVY  (Q7MP84), 
SURA_XANAC  (Q8PP23), SURA_XANC8  (Q4UR41), SURA_XANCP  (Q8PCE1), 
SURA_XANE5  (Q3BX80), SURA_XANOM  (Q2NZI6), SURA_XANOR  (Q5GWC1), 
SURA_XYLFA  (Q9PF40), SURA_XYLFT  (Q87AJ0), SURA_YERPA  (Q1C0H3), 
SURA_YERPE  (Q7CG87), SURA_YERPN  (Q1CMT0), SURA_YERPS  (Q66EQ7), 
Y161_HELPJ  (Q9ZMQ7), Y175_HELPY  (P56112), YACD_BACSU  (P37566)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

2 sequences

PPID_BUCBP  (Q89A98), PRSA_STRMU  (Q8CVC6)

PDB
[Detailed view]

109 PDB

1EQ3; 1F8A; 1FJD; 1J6Y; 1JNS; 1JNT; 1M5Y; 1NMV; 1NMW; 1PIN; 1ZCN; 1ZK6;
» more