PROSITE entry PS50179

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50179

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	VHS
Accession [info]	PS50179
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50179
Associated ProRule [info]	PRU00218

Name and characterization of the entry

Description [info]

VHS domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=130;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=125;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1228000; R2=0.0167642; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7779.0566406; R2=4.9245281; TEXT='Heuristic 0.1%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=441; H_SCORE=9951; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=321; H_SCORE=9360; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M= 39,-11,-11,-19,-11,-17, -4,-20, -7,-12, -7, -8,-10,-12,-10,-19,  9,  2,  1,-22,-18,-11;
/M: SY='T';  M= -2,  1, -5, -6, -4,-13,-20,-18,-14, -9,-12,-12, -1,-11, -8,-10, 16, 39, -4,-31,-12, -6;
/M: SY='S';  M= -1, 15,-18, 16,  4,-21, -7, -6,-24, -4,-25,-20, 15,-12, -2, -5, 17,  7,-17,-35,-17,  1;
/M: SY='P';  M= -7, -1,-29,  3, 12,-26,-14, -9,-19, -3,-18,-12, -4, 13,  4, -6, -2, -7,-21,-29,-19,  6;
/M: SY='T';  M= -7, -6,-22, -8, -7, -9,-15, -8, -9, -8, -6, -2, -5, -8, -7, -9, -2,  3, -9,-24, -5, -8;
/M: SY='L';  M= -5, -8,-19,-16,-14, -2,-19,-12,  7,-18, 17,  8, -3,-24,-13,-14,-12, -3,  1,-26, -7,-14;
/M:         M= -1, -7,-22, -9, -6,-15,-11,-14,-11, -6, -8, -7, -5,-13, -5, -3, -2,  0, -7,-24,-12, -7;
/M: SY='E';  M= -4, 10,-22, 13, 17,-26, -4, -8,-25, -3,-22,-18,  5, -9,  3, -8,  9,  3,-19,-32,-19, 10;
/M: SY='P';  M=-10, -2,-31,  6, 22,-26,-20,-10,-20, -3,-17,-15, -8, 23,  4,-10, -5, -7,-22,-30,-20, 11;
/M: SY='D';  M=-17, 46,-27, 55, 17,-35, -8,  3,-35,  0,-30,-27, 29,-12,  1, -7,  3, -7,-30,-40,-20,  9;
/M: SY='W';  M=-17,-37,-42,-38,-28, 10,-23,-28, -8,-23, -2, -9,-37,-30,-20,-20,-37,-25,-18,104, 22,-20;
/M: SY='A';  M= 13, -2,-19, -3,  4,-25,  3,-12,-21, -7,-21,-16, -1, -5,  0,-12, 13,  2,-15,-28,-21,  2;
/M: SY='L';  M= -3,-19,-22,-21,-16, -5,-11,-15,  3,-16,  9,  6,-15,-22,-11,-15,-11, -7,  0,-18, -2,-14;
/M: SY='I';  M= -8, -2,-25,-16,-17, -5,-22,-12, 17,-17, -1,  2, 10,-20,-12,-17, -7, -6,  3,-24, -4,-17;
/M: SY='L';  M= -9,-24,-22,-29,-20,  2,-28,-16, 23,-22, 29, 26,-21,-24,-11,-17,-22, -9, 13,-21, -2,-17;
/M: SY='E';  M= -8, 16,-28, 23, 27,-31,-10,  1,-28,  2,-20,-17,  6, -8, 11, -4, -1,-10,-26,-30,-17, 19;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-19,-37,-29, 12,-36,-28, 34,-29, 18, 14,-22,-24,-25,-26,-19, -9, 25,-18,  2,-29;
/M: SY='C';  M=  1,-15, 79,-23,-22,-20,-21,-25,-25,-24,-20,-18,-13,-31,-22,-25,  1, -2, -8,-44,-26,-22;
/M: SY='D';  M=-18, 42,-30, 61, 28,-38,-12,  0,-38,  2,-28,-28, 16, -8,  4, -8,  0,-10,-30,-38,-20, 16;
/M: SY='M';  M= -6,-17,-23,-21,-11, -6,-23,-10,  6, -7,  7, 13,-15,-20,  0, -7,-12, -7,  2,-18,  0, -6;
/M: SY='I';  M= -5,-29,-18,-34,-28,  0,-34,-28, 35,-26, 19, 15,-24,-25,-23,-25,-17, -6, 31,-24, -5,-28;
/M: SY='N';  M= -8, 22,-22,  9, -2,-21,  0,  2,-23,  5,-27,-17, 37,-19,  0, 11,  5, -2,-25,-33,-18, -2;
/M: SY='E';  M= -4,  0,-21,  0, 12,-21,-12, -3,-19,  0,-17,-10,  3,-11, 10,  0, 10,  5,-16,-30,-14, 10;
/M: SY='D';  M= -9, 14,-23, 16,  8,-25, -8, -8,-26,  4,-22,-17,  9,-11, -1,  0,  5,  6,-19,-31,-16,  4;
/M: SY='P';  M=-10, -8,-29, -4,  6,-18,-17, -8,-19, -2,-18,-12, -8, 14,  1, -1, -4, -6,-18,-25,-15,  2;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='B';  M= -5,  5,-22,  4,  2,-18,-11,-11,-15, -4,-17,-14,  4,-15, -5, -5,  2,  1,-10,-21,-14, -2;
/M: SY='G';  M= -2,  0,-25, -2, -5,-26, 16, -9,-24, -9,-20,-12,  6,-12,  2,-10,  1, -7,-23,-25,-20, -1;
/M: SY='P';  M= 10,-14,-22,-13, -5,-25, -8,-19,-18,-11,-23,-17,-13, 39,-10,-19,  2, -3,-18,-28,-26,-10;
/M: SY='K';  M=-12, -4,-29, -4,  6,-26,-20, -7,-26, 34,-24, -9, -2,-10, 11, 33, -8, -7,-18,-21,-11,  7;
/M: SY='D';  M=-15, 20,-29, 31, 22,-24,-17,  2,-27, -2,-19,-19,  5, -6,  2, -8, -3, -8,-24,-30,-11, 12;
/M: SY='A';  M= 27,-14,  4,-21,-16,-16, -7,-22, -7,-15, -9, -8,-13,-18,-16,-20,  5, -1,  5,-27,-19,-16;
/M: SY='I';  M= -1,-23,-18,-27,-21, -1,-24,-20, 18,-19, 13, 15,-21,-17,-17,-19,-11, -3, 18,-24, -7,-20;
/M: SY='R';  M=-13, -8,-28, -9, -1,-17,-19, -7,-22, 21,-18, -8, -2,-17,  5, 30, -8, -8,-17,-13, -7,  1;
/M: SY='A';  M= 21,-14, -7,-20,-14,-13, -7,-20, -4,-17,  0, -4,-12,-17,-13,-19,  3,  1,  1,-25,-15,-14;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-24,-35,-26,  4,-35,-26, 36,-29, 31, 19,-25,-25,-21,-25,-23, -9, 24,-21, -1,-26;
/M: SY='K';  M= -3, -6,-25, -8,  4,-21,-18, -9,-18, 23,-15, -1, -6,-13,  5, 19, -8, -8,-12,-21,-11,  4;
/M: SY='K';  M=-12, -1,-29, -1,  7,-27,-19,  4,-30, 38,-27, -9,  2,-13, 10, 31, -8,-10,-21,-22, -7,  7;
/M: SY='R';  M=-17, -9,-29, -9,  1,-21,-21, -4,-27, 31,-18, -8, -2,-18,  8, 55,-11,-10,-18,-20, -9,  1;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-21,-34,-26,  4,-33,-24, 33,-26, 29, 21,-26,-26,-21,-23,-21, -8, 26,-22, -2,-25;
/M: SY='N';  M= -8, 10,-24,  5,  4,-24, -2,  2,-19,  0,-19, -9, 15,-16, 10, -2,  2, -5,-22,-29,-15,  7;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='H';  M= -6,  8,-22,  5,  0,-19, -8, 27,-22, -7,-22,-10, 15,-16,  5, -5,  8, -3,-21,-30, -2,  0;
/M: SY='K';  M= -8, -2,-28,  0,  6,-26,-14, -8,-26, 20,-25,-13, -1, -1,  6, 15, -2, -5,-20,-23,-12,  5;
/M: SY='N';  M= -9, 26,-22, 20,  6,-25, -9,  2,-20, -1,-24,-16, 29,-15,  7, -3,  8,  2,-22,-35,-17,  6;
/M: SY='P';  M= -4,-10,-30, -5,  5,-22,-16,-11,-20, -8,-25,-18, -8, 44, -5,-14,  1, -3,-23,-30,-22, -3;
/M: SY='H';  M=-13,  4,-28, -1,  0,-20,-16, 34,-25,  6,-23, -8, 12,-18,  7,  9, -5, -9,-25,-18,  1,  2;
/M: SY='V';  M= -1,-17,-16,-16, -5, -9,-26,-21, 11,-12,  1,  1,-19,-20,-15,-14, -5,  2, 24,-29,-12,-10;
/M: SY='A';  M= 12,-12,-19,-16, -5,-21,-17,-12,  0, -7, -7,  0,-11,-15, 10,-10,  1, -4,  2,-23,-13,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-24,-22,-28,-20,  5,-29,-14, 21,-22, 27, 21,-21,-26,-14,-17,-22, -9, 12,-17,  5,-18;
/M: SY='Y';  M=-13,-17,-25,-18, -9,  2,-25,  1, -2,-10, 10,  7,-15,-23,  1, -1,-15, -9, -7,-11, 13, -5;
/M: SY='A';  M= 37, -7,-10,-17,-10,-18, -4,-20,-10,-10,-11,-10, -7,-10,-10,-17, 14, 12,  0,-23,-18,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-31,-22,  9,-30,-22, 21,-29, 43, 18,-30,-29,-20,-21,-29,-11, 11,-12,  1,-21;
/M: SY='T';  M= -2, -3,-15, -7, -4,-14,-17,-11,-11, -4,-13, -9, -1,-13, -4, -6, 12, 22, -3,-29, -9, -4;
/M: SY='L';  M= -3,-29,-17,-30,-23,  4,-29,-24, 23,-26, 32, 15,-28,-28,-23,-21,-21, -6, 23,-23, -4,-23;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-19,-27,-19,  6,-28,-19, 17,-26, 38, 19,-25,-26,-17,-18,-22, -1,  9,-21, -1,-18;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='E';  M=-11, 19,-27, 28, 29,-31, -8, -2,-28,  2,-22,-20,  8, -8,  9, -5,  0, -9,-25,-31,-19, 19; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='T';  M= 11,-10,-13,-18,-13,-11,-15,-18,  2,-13, -4,  1, -8,-13,-10,-15,  8, 15,  7,-26,-11,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='C';  M= -6,-23, 58,-29,-25, -9,-28,-25, -8,-28,  5, -4,-22,-33,-25,-25,-15, -9,  0,-36,-18,-25; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='V';  M=  0,-26,-16,-29,-25, -2,-26,-23, 23,-19,  9, 15,-24,-25,-21,-19,-10, -3, 31,-20, -7,-23;
/M: SY='K';  M= -4,  6,-26,  3, 12,-27,-15, -7,-26, 29,-26,-13,  7,-10,  9, 15, -1, -5,-20,-25,-14, 11;
/M: SY='N';  M=-10, 37,-20, 18,  0,-20, -1, 14,-21, -1,-29,-19, 56,-20,  1,  0, 10,  0,-29,-39,-18,  0;
/M: SY='C';  M= -5,-19, 92,-28,-28,-20,-19,-28,-26,-28,-19,-18,-18,-36,-27,-28, -8,-10,-10,-44,-28,-28;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-30, -7,-14,-30, 62,-18,-39,-17,-29,-20,  2,-19,-17,-18,  0,-19,-30,-21,-29,-15;
/M: SY='E';  M=-10,  2,-26,  6, 13,-20,-17,  8,-24,  8,-22,-13,  1, -9,  7,  4,  1, -3,-21,-23, -1,  8;
/M: SY='R';  M= -6,-10,-26,-12, -6,-15,-15, -2,-14,  0,-15, -8, -4, -2, -4,  5, -4, -5,-13,-23, -8, -8;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-20,-37,-29, 53,-31,-22, 11,-29, 16,  6,-23,-29,-34,-21,-20, -9, 11, -2, 18,-29;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='H';  M=-18, -6,-28, -7, -3,-15,-22, 59,-19, -7,-10,  2,  2,-20,  6,  6,-12,-16,-20,-24, 13, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='M';  M= -5, -8,-21, -8, -4,-12,-19, -8, -6, -5,  0,  1, -7,-18,  1, -6, -5, -4, -5,-25, -8, -2;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-28,  7, 32,-25,-19,  5,-20,  2,-11, -9,  0, -9, 20, -1, -4,-10,-24,-27,-13, 26;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-18,-34,-30,  5,-34,-29, 35,-24, 14, 13,-26,-26,-27,-24,-14, -4, 40,-24, -4,-30;
/M: SY='A';  M= 23,-11,  9,-18,-14,-19, -4,-20,-12,-15,-15,-12, -8,-17,-13,-20, 10,  1, -1,-30,-21,-14;
/M: SY='S';  M= -2, 10,-20, 11, 10,-25, -9, -6,-25,  6,-27,-18, 11,-10,  5,  3, 15,  5,-18,-33,-17,  7;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-27, -6,  7,-14,-20, -7,-25, 24,-19,-10, -3,-14,  6, 28, -7, -7,-18,-18, -7,  6;
/M: SY='D';  M=-14, 18,-29, 25, 24,-31,-12,  4,-32, 10,-25,-18, 11,-10, 12,  9, -2,-10,-28,-30,-16, 17;
/M: SY='F';  M=-16,-29,-19,-37,-28, 56,-30,-22,  8,-28, 14,  4,-21,-28,-34,-20,-18, -7,  8,  0, 20,-28;
/M: SY='L';  M= -4,-21,-19,-24,-12, -1,-25,-16, 14,-19, 24, 18,-21,-22,-12,-16,-17, -5, 10,-23, -5,-13;
/M: SY='B';  M=-10, 21,-24, 20, 12,-26, -9,  3,-26,  0,-26,-19, 21, -6,  3, -4,  7,  0,-25,-35,-17,  7;
/M: SY='E';  M=-10, 12,-27, 19, 31,-26,-15, -3,-27,  5,-18,-18,  5, -8,  8,  1,  1, -4,-24,-31,-17, 19;
/M: SY='L';  M= -9,-24,-19,-29,-21, 12,-26,-14, 17,-22, 30, 26,-23,-26,-17,-17,-22, -8, 11,-18,  1,-18;
/M: SY='V';  M= -7,-21,-20,-22,-15, -4,-28,-19, 13, -7,  6,  6,-19,-23,-14, -5,-13, -5, 18,-22, -3,-16;
/M: SY='K';  M= -2,  0,-24, -2,  3,-25,-13, -4,-22, 20,-23,-10,  2,-13,  6, 13, -1, -6,-14,-25,-12,  4;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-13,-28,-20, -2,-30,-21, 15,-15, 17, 11,-22,-26,-17, -6,-18, -8, 15,-24, -6,-20;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='I';  M= -2,-23,-16,-28,-22,  9,-25,-22, 20,-21, 15,  9,-20,-22,-21,-19,-13, -3, 20,-17, -1,-22; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='P';  M= -3, -5,-15, -3,  0,-11, -7, -9, -8, -6, -7, -6, -4,  4, -4, -5,  1,  1, -8,-17,-10, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='K';  M= -9, -5,-22, -5, -2,-24, -9,-12,-23, 10,-22,-12, -1,  0, -3,  7, -5, -6,-19,-26,-17, -4;
/M: SY='N';  M= -3,  1,-24, -1,  4,-19,-14, -2,-19,  4,-21,-13,  6, -1,  0,  1,  3, -2,-18,-26,-11,  0;
/M: SY='K';  M= -9,  5,-26,  5,  6,-24,-11, -6,-24, 12,-23,-14,  6,-14,  6,  8,  0, -6,-21,-19,-12,  6;
/M: SY='A';  M=  5,-13,-20,-15,-10,-14,-11,-15, -9, -6,-12, -8, -9, -5, -9, -5,  2,  1, -3,-23,-11,-11;
/M: SY='H';  M=-11,  6,-26,  9,  3,-19,-16, 11,-19, -6,-18,-11,  4, -3,  3, -8,  0, -4,-19,-26, -3,  1;
/M: SY='E';  M= -6, -6,-25, -6,  3,-15,-15,-12, -9, -5, -9, -6, -5, -5, -2, -6, -5, -6, -9,-26,-13, -1;
/M: SY='K';  M= -9,  4,-28,  5, 11,-27,-18, -8,-21, 16,-23,-12,  3,  0,  8,  5, -3, -4,-20,-26,-14,  9;
/M: SY='V';  M= -3,-28,-15,-30,-28,  0,-30,-27, 30,-22, 15, 13,-26,-28,-26,-21,-13, -3, 40,-28, -8,-28;
/M: SY='R';  M= -8, -4,-18, -5,  5,-27,-18, -1,-26, 21,-24, -9,  0,-15, 16, 25, -2, -7,-20,-24,-12,  9;
/M: SY='E';  M= -9, 11,-25, 11, 20,-24,-10, -2,-22,  7,-19,-13, 11,-11,  7,  2,  0, -6,-22,-30,-17, 13;
/M: SY='K';  M= -8, -7,-27, -9,  1,-21,-20, -9,-20, 30,-16, -3, -5,-15,  4, 27,-11, -9,-12,-20, -9,  2;
/M: SY='I';  M= -1,-26,-19,-31,-25, -1,-29,-24, 29,-22, 16, 17,-22,-23,-19,-22,-13, -5, 27,-24, -6,-24;
/M: SY='L';  M=-11,-23,-23,-25,-16,  3,-29,-19, 11,-14, 25, 11,-20,-24,-14, -7,-21, -7,  6,-19, -1,-16;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-22,  0,  7,-16,-18, -1,-12, -5,-10, -7,  1,-13,  2, -5,  3,  3,-11,-27, -8,  4;
/M: SY='L';  M= -6,-25,-20,-30,-21,  7,-27,-17, 19,-23, 28, 22,-24,-25,-17,-18,-20, -6, 14,-18,  2,-19;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-23,-34,-26,  4,-33,-24, 34,-27, 30, 22,-25,-25,-20,-23,-22, -9, 23,-21, -1,-25;
/M: SY='Q';  M=-13,  4,-28,  8, 13,-19,-21, -1,-19,  9,-17, -9, -2,-13, 14,  3, -6, -9,-18,-19, -1, 13;
/M: SY='E';  M=  4, -1,-13, -2, 11,-20,-14,-10,-17, -3,-15,-12,  0,-10,  3, -8, 10,  7,-12,-30,-16,  7;
/M: SY='W';  M=-18,-37,-45,-38,-28,  9,-21,-29,-15,-21,-12,-15,-37,-29,-20,-20,-37,-25,-25,125, 25,-20;
/M: SY='A';  M=  8, -4,-18, -9, -5,-15,-10,  0,-13, -6,-15, -8,  0,-15,  2, -7,  8,  5,-10,-21, -3, -2;
/M: SY='E';  M=-11,  9,-24, 13, 14,-22,-19,  0,-16, -1,-14,-10,  2,-13,  6, -5, -2, -4,-13,-29,-10, 10;
/M: SY='A';  M= 17, -2,-17, -6, -3,-19, -2,-14,-17, -9,-17,-13, -2,-12, -6,-14, 10,  5,-10,-18,-16, -4;
/M: SY='F';  M=-16,-24,-22,-30,-22, 46,-29,-17,  5,-25, 12,  3,-19,-27,-29,-19,-18, -8,  3, -2, 20,-23;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='C';  M= -4, -8,  1, -9, -6,-20, -6,-11,-23,  1,-22,-13, -4, -9, -3,  1,  1, -5,-16,-25,-14, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='N';  M= -7, 12,-24,  9,  1,-25, 10, -5,-27,  7,-26,-16, 17,-14, -2,  3,  1, -8,-23,-26,-18,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='D';  M= -7, 11,-22, 16, 10,-25, -8, -6,-22,  5,-19,-14,  5,-11,  3,  1,  1, -6,-16,-27,-15,  6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='P';  M= -7, -9,-26, -5,  0,-27, -7,-13,-23, -4,-26,-17, -7, 28, -4, -5, -2, -8,-23,-29,-24, -4;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-28, 16, 17,-29,-11, -3,-29,  9,-25,-16,  4, -6, 12,  5,  1, -6,-25,-27,-14, 14;
/M: SY='L';  M=-13,-19,-20,-20,-14, 13,-27, -4,  5,-20, 20, 11,-19,-26,-15,-15,-21,-10,  0,-13, 12,-15;
/M: SY='P';  M= -2, -3,-24, -3,  1,-23, -9,-12,-18, -2,-23,-14,  1,  8, -2, -5,  6,  0,-15,-30,-19, -2;
/M: SY='Y';  M= -6,-13,-24,-14, -6, -8,-14, -3, -8, -4, -3,  1,-11,-20,  1, -4, -9, -8, -8,-14,  4, -4;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-24,-33,-27,  8,-33,-18, 31,-22, 14, 18,-22,-25,-19,-21,-18, -8, 25,-13, 12,-26;
/M:         M= -3, -9,-22,-11, -7,-12,-13, -5, -9, -3,-14, -7, -4,-15, -4, -1,  0, -2, -5,-20, -1, -8;
/M: SY='D';  M= -1, 14,-24, 19,  9,-26,-11, -4,-26, -1,-22,-18,  5,-11,  2, -8,  3, -2,-20,-21,-14,  6;
/M: SY='V';  M= 11,-17,-14,-23,-17, -6,-18,-19,  8,-16,  9,  9,-16,-19,-14,-17, -4,  5, 12,-24, -9,-16;
/M: SY='Y';  M=-18,-18,-29,-19,-17, 16,-29, 26,  0,-11, -2,  2,-15,-27, -8, -8,-17,-11, -7, 10, 55,-17;
/M: SY='Q';  M=-10,  8,-27, 10, 11,-27,-16,  5,-23, 11,-20, -9,  6,-13, 17,  8, -2, -8,-22,-25, -8, 13;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-24,  4,  7,-18,-17, -6,-13,  3, -7, -2,  2,-15,  1,  1, -5, -6,-13,-28,-12,  4;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-21,-31,-21,  8,-29,-18, 22,-27, 44, 26,-28,-28,-17,-19,-28,-10, 11,-20,  0,-19;
/M: SY='K';  M= -7, -9,-26, -9, -1,-21,-21,-14,-15, 25,-18, -6, -7, -9,  0, 18, -9, -7, -7,-23,-11, -2;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-24, -3,  3,-15,-17, -3,-18,  9,-16, -9,  0,-16,  6, 14, -2, -5,-15,-20, -4,  3;
/M: SY='K';  M= -2, -1,-21, -1, 11,-28,-13, -6,-26, 17,-22,-12, -1,-12, 12, 16, -2, -8,-20,-24,-15, 10;
/M: SY='G';  M=  1, -7,-29, -7,-15,-30, 57,-17,-37,-17,-28,-19,  0,-18,-14,-18,  1,-18,-28,-21,-28,-15;
/M: SY='I';  M= -8,-24,-24,-27,-22,  7,-29,-10, 18,-20,  6,  6,-19,-18,-17,-19,-13, -6, 14,-11, 15,-23;
/M: SY='E';  M= -4, -2,-22, -1,  6,-18,-19,-10,-12,  3,-14, -9, -4,-13,  0, -2,  2,  3, -6,-25, -9,  2;
/M: SY='F';  M=-14,-25,-20,-34,-23, 57,-27,-18, -3,-21,  7,  0,-18,-27,-30,-15,-17, -9, -2,  3, 21,-23;
/M: SY='P';  M= -6,-16,-31,-10, -2,-26,-19,-18,-15, -8,-25,-15,-15, 53, -6,-15, -2, -3,-18,-30,-24, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	91 in 91 different sequences
Number of true positive hits	89 in 89 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences	1
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	97.80 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	98.89 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann, CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	VHS
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	89 sequences GGA1_HUMAN (Q9UJY5), GGA1_MOUSE (Q8R0H9), GGA1_YEAST (Q06336), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	1 sequence LSB5_YEAST (P25369)
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	2 sequences FES1_YARLI (Q6C239), NHAK_BACVZ (A7Z8R4)
PDB [Detailed view]	24 PDB 1DVP; 1ELK; 1JPL; 1JUQ; 1JWF; 1JWG; 1LF8; 1MHQ; 1PY1; 1UJJ; 1UJK; 1VDY; » more