PROSITE entry PS50166

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50166

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	IMPORTIN_B_NT
Accession [info]	PS50166
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50166
Associated ProRule [info]	PRU00115

Name and characterization of the entry

Description [info]

Importin-beta N-terminal domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=75;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=70;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7352000; R2=0.0226132; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3855.5461426; R2=3.7153847; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=344; H_SCORE=5134; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=255; H_SCORE=4803; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-80; MD=-80; IM=-80; DM=-80;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M= 43, -8,-10,-17, -8,-20,  0,-18,-12,-10,-13,-12, -7,-10, -8,-18, 15,  3, -2,-23,-20, -8;
/M: SY='E';  M= -9,  7,-28, 12, 44,-31,-20,  1,-26,  8,-19,-14,  0, -3, 28,  2,  2, -5,-28,-27,-17, 36;
/M: SY='K';  M= -8, -3,-24, -5,  7,-23,-21, -7,-18, 15,-14, -6, -3,-12, 14, 12, -1,  5,-15,-23,-10, 10;
/M: SY='Q';  M=-10, -8,-24,-13, -7, -3,-15,  0, -9,-10,-10, -2, -2,-19,  5, -7, -5, -5,-11,-18, -1,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-12, -5,-26, -5, 10,-14,-22, -7,-20, 13,-12, -8, -4,-13,  7, 19, -5, -1,-16,-21, -8,  8;
/M: SY='Q';  M=-10,  7,-26,  7, 13,-30,-16,  0,-24, 14,-23,-11,  7,-11, 22, 14,  3, -2,-23,-26,-13, 17;
/M: SY='F';  M= -1,-25,-23,-29,-19, 14,-21,-20,  1,-20,  9,  1,-23,-24,-17,-18,-17,-10,  0, 13,  6,-16;
/I:         I=-8; MI=-5; MD=-15; IM=-5; DM=-15;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-27, 14, 32,-27,-17,  2,-25,  4,-21,-15,  2, -7, 21, -1,  5, -5,-25,-26,-10, 26;
/M: SY='B';  M= -4, 15,-22, 10,  1,-24, -5, -8,-24,  7,-24,-16, 15,-13, -2,  0,  5,  6,-18,-30,-16, -1;
/M: SY='Q';  M= -7, -5,-23,-10, -4, -8,-19,  5, -7, -7, -5, -1, -1,-20,  9, -5, -6, -8,-12,-18,  2,  2;
/M: SY='P';  M= -5, -9,-31, -3,  1,-26,-17, -5,-18, -9,-20,-13,-10, 37, -2,-14, -4, -8,-22,-29,-19, -3;
/M: SY='D';  M= -7, 12,-25, 13,  0,-29, 12, -8,-29, -6,-24,-17, 10,-14,  2, -9,  5,  0,-24,-28,-19,  1;
/M: SY='F';  M= -7,-24,-18,-32,-25, 47,-25,-18,  0,-23,  5, -1,-18,-25,-30,-18,-12, -3,  3,  1, 20,-25;
/M: SY='W';  M= -1,-21,-25,-24,-17,  0,-13,-12, -7,-20,  3, -3,-19,-14,-16,-18,-14, -9, -9,  5, -1,-16;
/M:         M=  0,-14,-22,-14,-11,-14, -4,-14, -9,-10, -7, -5,-11,-11, -8,-11, -3, -5, -6,-21, -9,-10;
/M: SY='A';  M=  5,-11,-20,-13,  0, -9,-18,-14, -8, -3,  1, -2,-11,-15, -2, -7, -6, -3, -7,-20, -8, -1;
/M: SY='L';  M=  1,-24, -6,-26,-18,  1,-23,-20,  8,-25, 28,  9,-23,-26,-18,-20,-16, -6,  5,-24, -7,-18;
/M: SY='L';  M= -1,-11,-19,-12, -9, -7,-19,-12,  0,-16,  6,  0,-10,-19, -6,-14, -1,  2, -2,-23, -3, -8;
/M: SY='H';  M=-11, 13,-24, 13,  6,-26,-12, 16,-25,  1,-24,-13, 16,-14, 12,  6,  6, -1,-23,-32,-10,  7;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-22,-35,-29,  1,-35,-29, 40,-26, 19, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 36,-24, -4,-29;
/M: SY='L';  M=  0,-26,-20,-29,-21,  4,-27,-19, 19,-24, 28, 13,-24,-25,-18,-21,-19, -8, 13,-17,  2,-21;
/M: SY='A';  M= 10, -9,-20,-11,  4,-18,-15,-12, -6, -9, -4, -4, -8,-13,  4,-12,  3, -2, -7,-25,-14,  4;
/M: SY='N';  M= -4, 16,-21, 12,  3,-19, -9, -3,-23,  4,-25,-16, 19,-14,  3, -1,  7, -1,-20,-30,-14,  4;
/M: SY='D';  M= -5,  2,-24,  6,  3,-24,  0, -3,-24,-10,-21,-16,  1, -1, -4,-12,  6, -1,-20,-31,-17, -2;
/M: SY='N';  M=  0, 10,-21,  6, 12,-25,  1, -4,-23, -2,-24,-17, 15,-11,  6, -6, 11,  1,-22,-31,-20,  9;
/M: SY='N';  M= -5, 10,-19,  5, -6, -8,-13, -6,-11,-10,-12,-11, 12,-19, -9,-10,  3,  2,-10,-26, -6, -8;
/M: SY='P';  M=  0, -2,-23,  0, -1,-24,-11,-13,-17, -4,-25,-17,  0, 18, -5,-10,  8,  1,-14,-33,-21, -5;
/M: SY='L';  M= -8,-15,-24,-14,  0,-13,-23,-10, -1,-12,  9,  4,-15,-10,  6, -9,-11, -7, -6,-24, -9,  3;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-13,  3,  8,-13, -9, -2, -8, -1,-11, -7,  6, -8,  4, -3,  4, -1, -7,-20,-10,  6; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M=  4,-16,-18,-22,-17, -8,-13,-22,  8,-20,  4,  1,-12,-18,-15,-19,  0,  5,  8,-25,-11,-17;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 38,-24,-10,  0,-16, 10, 54,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='L';  M=-10,-22,-24,-24,-14,  1,-28,-13,  9,-16, 10,  7,-21,-24, -3,-13,-17, -9,  5, -3,  6, -9;
/M: SY='A';  M=  5,-19, -7,-24,-18, -2,-12,-21,  1,-22,  5, -1,-14,-21,-17,-21, -5, -4,  2,-23,-10,-18;
/M: SY='A';  M= 40, -8,-12,-16, -9,-21,  6,-18,-14,-11,-15,-12, -6,-11, -9,-18, 14,  1, -4,-23,-21, -9;
/M: SY='A';  M= 11,-16,-17,-19,-15,-11,  3,-19, -5,-19,  3, -3,-13,-20,-15,-18, -1, -4, -1,-24,-15,-15;
/M: SY='L';  M= -5,-26,-19,-28,-21,  2,-28,-22, 23,-25, 25, 13,-22,-25,-19,-21,-14, -4, 18,-25, -5,-21;
/M: SY='Y';  M= -9,-11,-23,-13, -5,  0,-24, -4, -4, -8, -7, -3, -9,-18,  3, -8, -2,  4, -6,-11, 14, -2;
/M: SY='F';  M= -8,-28,-20,-34,-24, 29,-29,-21, 15,-28, 29, 11,-24,-27,-26,-21,-22, -9,  8,-10,  8,-24;
/M: SY='K';  M=-14,  5,-30,  8, 10,-30,-19, -5,-31, 35,-27,-12,  3,-12, 13, 31, -8,-10,-22,-23,-11, 10;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='N';  M=-10, 21,-23, 10,  3,-22, -8,  2,-23, 18,-28,-15, 33,-16,  4, 15,  2, -4,-24,-30,-15,  3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Y';  M=-10,-17,-24,-17, -8,  4,-18, -9, -4, -9,  8,  1,-15,-22,-10, -8,-15, -9, -7,-11,  9,-10;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-25,-36,-28,  2,-36,-28, 40,-28, 25, 18,-24,-24,-22,-26,-21, -8, 29,-22, -2,-28;
/M: SY='T';  M= -4, -2,-16, -4, -6,-15,-19, -9,-11, -1,-14, -8, -2,-14, -7, -4,  8, 20,  0,-30, -9, -7;
/M: SY='R';  M=-10, -6,-23, -8, -2,-15,-17,  5,-20, 12,-18, -5,  0,-16,  4, 21,  1,  0,-14,-22, -1, -2;
/M: SY='H';  M=-12, -1,-28, -3, -1,-17,-11, 15,-25, 15,-23, -9,  4,-17,  3, 12, -6,-10,-21,-17,  6, -1;
/M: SY='W';  M=-20,-21,-46,-17,-19, -1,-18,-24,-24,-16,-22,-22,-27,-26,-16,-18,-31,-26,-30,109, 19,-14;
/M: SY='S';  M= -5,  0,-22,  1,  0,-22,-12, -9,-20,  6,-25,-15,  5, -2, -1,  7,  9,  2,-14,-32,-17, -2;
/M: SY='P';  M=  1, -3,-22, -2, -6,-18,-16,-15, -6,-12, -8, -5, -8,  2,-10,-17, -2, -1, -4,-29,-16, -9;
/I:         MD=-15;
/M:         M= -5,-10,-19,-11, -5,-12, -5,-14, -4, -3, -5, -2, -8,-13, -7, -6, -6, -4, -2,-18,-10, -7; D=-3;
/I:         MD=-15;
/M: SY='R';  M= -5, -3,-17, -7, -1,  0,-14, -7,-14,  5,-11, -8,  1,-13, -4,  8, -3, -1,-10,-14, -3, -2; D=-3;
/I:         MD=-15;
/M: SY='E';  M= -1,  1,-21,  3, 13,-21, -6, -5,-15,  1,-13, -9, -1, -8,  7, -1, -1, -7,-14,-20,-13,  9; D=-3;
/I:         MD=-15;
/M: SY='Q';  M= -7, 11,-20, 10, 14,-25,-10,  5,-18,  4,-19, -9, 12, -9, 25,  2,  5, -4,-22,-23,-12, 19; D=-3;
/I:         MD=-15;
/M: SY='Y';  M= -6,-13,-21,-15,-13, 10, -4,  3,-11,-13, -8, -5, -9,-10,-13,-12, -9, -9,-12, -1, 15,-14; D=-3;
/I:         MD=-15;
/M: SY='Q';  M=  0, -1,-14, -3,  2,-14, -8, -1, -9,  0, -8, -3,  2,-10, 11,  4,  2, -2,-10,-16, -8,  6; D=-3;
/I:         MD=-15;
/M: SY='Q';  M= -5,  8,-14,  8,  7,-18, -7,  1,-13,  5,-14, -7,  7, -6, 14,  3,  3, -2,-14,-16, -8, 10; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; IM=0; DM=-15;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-23,-33,-25,  0,-33,-27, 32,-26, 20, 14,-25,-15,-22,-24,-19, -7, 25,-23, -5,-26;
/M: SY='D';  M=-12, 12,-19, 22, 11,-32,-15,-10,-30, -2,-28,-23,  1, 19, -3,-11, -1, -7,-26,-36,-23,  2;
/M: SY='E';  M=  7, -3,-25, -4, 11,-24,-15,-12,-15,  3,-18,-12, -4,  8,  0, -7, -1, -7,-15,-26,-19,  4;
/M: SY='D';  M= -7, 32,-24, 34, 17,-29, -7,  0,-28,  0,-27,-23, 25,-11,  2, -6,  7, -4,-26,-37,-20, 10;
/M: SY='E';  M=  4,  2,-20,  2,  9,-21,-15, -2,-13, -4,-14,-10,  0,-13,  2, -9,  2, -1, -8,-29,-14,  5;
/M: SY='R';  M=-13, -7,-28, -7,  2,-23,-21, -7,-25, 36,-22, -8, -2,-16,  7, 43,-10, -9,-14,-21,-10,  2;
/M:         M= -2, -5,-24, -5, -2,-17,-18,-12, -8, -2, -6, -6, -4, -8, -5, -1, -7, -7, -7,-26,-14, -5;
/M: SY='S';  M=  0, -8,-21, -9, -1,-12, -3, -3,-15,-11,-12, -8, -4,-16, -2,-11,  4, -4,-11,-25,-10, -2;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  6,-26,-20, -6,-30, 42,-26,-10,  0,-14, 10, 46,-10,-10,-20,-20,-10,  6;
/M: SY='N';  M= -3, 16,-22, 12, 13,-24, -5, -5,-24,  3,-23,-17, 17,-11,  2, -3,  6,  3,-22,-31,-18,  7;
/M: SY='Y';  M=-11, -4,-22, -9, -6,  0,-19, -1, -9, -3,-10, -3,  2,-20, -5,  3, -3,  0, -8,-16,  8, -7;
/M: SY='L';  M= -3,-28,-20,-31,-23,  3,-30,-24, 26,-26, 30, 15,-26,-26,-21,-22,-20, -7, 22,-22, -4,-23;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-18,-32,-25, 11,-32,-25, 26,-27, 30, 15,-28,-28,-25,-22,-22, -7, 25,-21, -1,-25;
/M: SY='H';  M= -6, -2,-28, -1, 11,-27,-12, 14,-25,  5,-22, -9,  0, -3, 13,  1, -2, -7,-23,-25, -9, 10;
/M: SY='L';  M=  0,-16,-15,-22,-16, -2,-22,-18,  7,-17, 16, 12,-16,-20,-13,-15, -6, 13,  9,-24, -6,-15;
/M: SY='M';  M= -5,-24, -9,-31,-22,  0,-26,-16, 18,-22, 25, 27,-23,-25,-14,-19,-20, -9, 10,-23, -4,-18;
/M: SY='V';  M= -7,-21,-21,-23,-23,  1,-18,-24, 17,-23, 11,  6,-19,-25,-23,-22,-14, -8, 19,-22, -6,-24;
/M: SY='S';  M=  3,  4,-15,  2,  5,-21, -7, -9,-21,  1,-27,-17, 11,-10,  2, -3, 25, 15,-13,-35,-17,  3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	83 in 83 different sequences
Number of true positive hits	81 in 81 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences	9
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	97.59 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	90.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Importin N-terminal
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	81 sequences CSE1_SCHPO (O13671), CSE1_YEAST (P33307), IMA3_SCHPO (O59809), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	9 sequences IMB2_SCHPO (O14089), IP13A_DICDI (Q54C85), IP13B_DICDI (Q54WT9), » more
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	2 sequences ATM_CRYNB (P0CP61), ATM_CRYNJ (P0CP60)
PDB [Detailed view]	151 PDB 1F59; 1GCJ; 1IBR; 1M5N; 1O6O; 1O6P; 1QBK; 1QGK; 1QGR; 1UKL; 1WA5; 1Z3H; » more