PROSITE entry PS50115

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50115
Entry name [info]	ARFGAP
Accession [info]	PS50115
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2002 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50115
Associated ProRule [info]	PRU00288

Name and characterization of the entry

Description [info]

ARF GTPase-activating proteins domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=122;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=117;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9473000; R2=0.0108972; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6979.9799805; R2=6.1108871; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=923; H_SCORE=12620; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=694; H_SCORE=11221; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E';  M= -6,  7,-27, 10, 17,-29,-12, -2,-27, 12,-22,-14,  4,-11, 15, 14, -1, -9,-23,-26,-16, 15;
/M: SY='R';  M= -3,  0,-24, -2,  6,-23,-12, -4,-20, 10,-19,-11,  2,-13,  5, 11, -1, -5,-15,-25,-13,  4;
/M: SY='V';  M=  2,-19,-18,-21,-13, -1,-21, -9,  3,-12,  5,  5,-16,-22,-13, -7,-10, -6,  9,-21, -5,-14;
/M: SY='L';  M= -8,-24,-20,-25,-17,  5,-26,-18, 13,-21, 27, 13,-21,-25,-16,-16,-17, -6,  8,-22, -2,-16;
/M: SY='K';  M= -6,  1,-25,  2, 10,-26,-18, -6,-21, 15,-17, -9, -1,-12, 13, 13, -2, -4,-18,-24,-12, 11;
/M: SY='M';  M= -9,-11,-25,-10,  2,-13,-23, -9, -3, -3,  6,  7,-11,-17,  2, -1,-12, -9, -6,-23, -8,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-31,-23,  7,-30,-21, 25,-27, 38, 22,-28,-28,-20,-20,-25, -9, 18,-21, -1,-22;
/M: SY='R';  M=-14, -9,-27,-11, -1,-20,-18, -5,-20, 15,-14, -6, -2,-17, 11, 37, -6, -4,-16,-21,-10,  2;
/M: SY='S';  M=  2,  5,-17,  4,  1,-25, -6, -9,-24,  5,-26,-17,  7, -6, -1,  1,  9,  0,-17,-31,-19, -1;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='M';  M= -4,-10,-13,-14, -6,-10,-18,-10,  2, -8,  3,  5, -8,-15, -1, -8, -6, -3,  0,-21, -7, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='D';  M= -8,  8,-23, 14, 10,-23, -9, -6,-22,  4,-19,-13,  2,  3,  1, -2,  1, -2,-18,-25,-15,  5; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='G';  M= -3,  2,-23,  4,  4,-24, 16, -8,-27, -4,-23,-17,  5, -7, -4, -4,  3, -8,-22,-24,-20, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='N';  M= -5, 31,-20, 15,  1,-22, -2,  7,-19,  0,-28,-18, 48,-18,  4, -1, 11,  0,-27,-37,-19,  3;
/M: SY='N';  M= -1,  6,-21,  1,  4,-22,-10, -5,-21, 12,-22,-13, 13,-14,  3, 11,  6, -1,-17,-29,-15,  3;
/M: SY='K';  M= -7, -8,-23,-10, -2,-12,-21, -4, -8,  6,-10, -3, -5,-18, -3,  3, -7, -7, -2,-22, -4, -4;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='F';  M=  4,-15, -3,-21,-19, 17,-13,-19,-10,-20, -4, -6,-13,-22,-23,-20, -7, -7, -3,-14, -2,-19;
/M: SY='D';  M=-17, 39,-30, 57, 31,-37,-13,  0,-37,  3,-27,-27, 15, -7,  5, -7,  0,-10,-30,-37,-20, 18;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G';  M= -4, -1,-29,  1, -6,-30, 37,-13,-36, -6,-29,-19,  4,-16, -7, -8,  1,-14,-27,-24,-24, -7;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='A';  M= 20,  0,-16, -7, -1,-22,  0,-11,-17, -2,-19,-12,  4,-11,  0, -8, 11,  2,-11,-25,-18,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -7,-12,-28,-12, -4,-14,-20,-11,-16,  7,-17, -9, -9, 12, -6,  5, -9, -8,-14,-22,-12, -7;
/M: SY='N';  M=-10, 24,-24, 21,  7,-22, -3,  5,-25, -3,-24,-19, 26,-15, -1, -6,  4, -2,-25,-31,-12,  3;
/M: SY='P';  M= -8,-22,-35,-13, -5,-25,-22,-22,-11,-12,-23,-15,-22, 69,-13,-20,-10, -8,-16,-30,-27,-13;
/M: SY='Q';  M= -8,  6,-22,  7, 13,-25,-18, -5,-22,  3,-18,-12,  3,-10, 14,  5,  8, 12,-17,-28,-13, 13;
/M: SY='W';  M=-20,-38,-46,-38,-29, 16,-21,-25,-17,-20,-16,-17,-37,-30,-21,-19,-37,-27,-26,131, 34,-21;
/M: SY='A';  M= 23,-17,  9,-23,-19,-14,-14,-24, -2,-16, -6, -6,-16,-20,-19,-21,  3,  1, 13,-29,-18,-19;
/M: SY='S';  M=  9,  3,-11,  0, -1,-19, -2,-10,-19, -9,-27,-19, 12,-11, -1,-10, 35, 20,-10,-38,-19, -1;
/M: SY='V';  M= -7,-27,-12,-30,-26,  1,-29,-22, 17,-21,  7,  9,-26,-23,-21,-20,-16, -6, 20, -9,  1,-25;
/M: SY='N';  M= -4, 14,-18,  4, -2,-19, -9, -6,-18,  1,-24,-16, 23, -9, -2, -2, 14, 16,-17,-34,-16, -2;
/M: SY='F';  M=-13,-25,-23,-27,-19, 20,-29,-13,  8,-16, 20,  8,-22,-27,-19,-10,-22, -9,  5, -8, 15,-19;
/M: SY='G';  M= -1,-11,-30,-11,-19,-28, 62,-20,-36,-20,-26,-18, -2,-16,-20,-20, -2,-19,-28,-20,-29,-20;
/M: SY='V';  M=  2,-21, -9,-26,-23, -5,-26,-26, 19,-20,  4,  4,-18,-22,-21,-21, -3,  6, 27,-29,-10,-23;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-22,-35,-27, 43,-28,-20,  6,-25,  9,  4,-23,-28,-30,-19,-19, -7,  5, 13, 19,-26;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-24,-35,-26,  4,-35,-26, 36,-29, 32, 19,-25,-25,-21,-25,-23, -9, 23,-21, -1,-26;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='I';  M= -7,-19,-23,-23,-20, -4,-24,-23, 20,-24, 15,  8,-16,-21,-17,-22,-11, -3, 13,-24, -6,-20;
/M: SY='E';  M= -9, 10,-26, 14, 28,-29,-15, -1,-27, 11,-24,-17,  7, -8, 16,  8,  5, -5,-25,-30,-17, 22;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S';  M= 16, -6, -3,-10, -7,-12, -4,-15,-16,-13,-21,-16,  1,-13, -8,-15, 25, 11, -7,-31,-16, -7;
/M: SY='G';  M=  6, -6,-12,-10,-16,-26, 40,-18,-32,-17,-27,-19,  2,-19,-16,-18,  6,-11,-22,-26,-27,-16;
/M: SY='I';  M= -5,-25,-20,-30,-24,  4,-30,-25, 25,-20, 11,  9,-20,-23,-21,-19,-11, -4, 25,-22, -3,-24;
/M: SY='H';  M=-19, -4,-29, -4, -3,-16,-21, 82,-23,-13,-10,  3,  4,-21,  6, -3,-13,-19,-24,-29, 17, -3;
/M: SY='R';  M=-18, -9,-28, -9,  0,-20,-18, -1,-29, 27,-21,-11,  1,-19,  9, 63, -6, -8,-19,-22,-11,  0;
/M: SY='N';  M= -2,  9,-20,  2, -6,-19, 12, -3,-23, -5,-28,-18, 21,-17, -5, -7, 14,  1,-21,-29,-13, -6;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-31,-21,  7,-29,-18, 23,-26, 41, 25,-28,-28,-18,-19,-27, -9, 14,-21, -1,-20;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='G';  M=  0, -9,-27, -9,-16,-27, 53,-18,-34,-17,-28,-18, -1, -9,-16,-18,  2,-15,-26,-20,-27,-16; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='V';  M= -4,-18,-20,-18,-14,-12,-23,-21,  1, -9, -9, -5,-17,  5,-15, -7, -2,  7, 10,-29,-15,-17;
/M: SY='H';  M=-16,  6,-28,  6,  2,-22,-16, 74,-29, -8,-22, -5, 14,-18, 11, -1, -3,-14,-28,-32, 10,  3;
/M: SY='I';  M=-10,-24,-24,-28,-23,  3,-33,-23, 27,-22, 17, 12,-20,-23,-19,-17,-18, -8, 20,-21, -2,-23;
/M: SY='S';  M=  4, -1,-12, -2, -4,-12, -7,-13,-15,-12,-22,-16,  4,-13, -6,-11, 28, 17, -5,-35,-15, -5;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='F';  M=-10,-12,-13,-16, -8,  8,-21,-10,-15,  7,-12, -6, -9,-19, -7,  4,-11, -9,-11, -8,  7, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='V';  M= -2,-26,-12,-28,-26,  5,-28,-26, 24,-20, 12,  9,-25,-26,-26,-18,-11,  0, 37,-24, -6,-26; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 37,-24,-10,  0,-16, 10, 55,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='S';  M=  6,  0,-13,  0,  0,-20, -3,  5,-21,-10,-29,-17, 10,-11,  1, -9, 33, 14,-13,-39,-14,  0;
/M: SY='L';  M= -6,-26,-18,-29,-23,  2,-30,-24, 24,-25, 25, 13,-24,-26,-21,-21,-16, -1, 23,-24, -4,-23;
/M: SY='T';  M= -5,  3,-17, -1, -4,-16,-15,-11,-17,  0,-16,-12,  6,-14, -3,  6, 11, 18, -9,-31,-13, -4;
/M: SY='M';  M=-11,-22,-21,-26,-16,  1,-25, -5, 13,-15, 29, 30,-22,-24, -9,-11,-24,-11,  5,-21,  0,-13;
/M: SY='D';  M=-15, 39,-26, 53, 14,-34,-11, -4,-34, -2,-27,-26, 16,-10, -1,-10,  6,  1,-24,-39,-19,  6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='S';  M=  1,  4,-19, -1, -1,-21,-11, -9,-18,  4,-21,-13,  9, -7,  0,  1, 10, 10,-13,-30,-16, -1;
/M: SY='W';  M=-20,-37,-42,-40,-30, 26,-23,-27,-14,-23,-10,-14,-35,-30,-25,-20,-35,-24,-21,110, 29,-22;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-23,  8, 14,-24,-18,-11,-23,  7,-21,-16,  1,  1,  2, -1,  6, 12,-17,-30,-16,  7;
/M: SY='E';  M=-12, -1,-32,  6, 16,-26,-19, -6,-22,  1,-22,-15, -5, 13,  9, -1, -5,-10,-25,-19,-14, 11;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='E';  M= -5, -3,-21, -4, 11,-16,-19, -9, -7, -1, -6, -5, -4, -7,  4, -5, -3,  0, -9,-22,-11,  7; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M=-13,  9,-29, 14, 27,-29,-19, 13,-23,  2,-16,-10,  4,-10, 22, -1, -3,-11,-26,-28,-11, 24;
/M: SY='L';  M= -7,-29,-20,-31,-23,  5,-31,-24, 27,-27, 32, 16,-26,-27,-21,-22,-21, -7, 21,-23, -3,-23;
/M: SY='R';  M=-10, -2,-26,  1, 12,-22,-20, -5,-18,  9,-12, -6, -4,-14,  9, 16, -6, -7,-14,-25,-12,  9;
/M: SY='R';  M=-10,-14,-23,-17, -7,  1,-23, -8, -8,  3, -1,  2,-11,-20, -7,  7,-12, -7, -4,-17, -1, -7;
/M: SY='M';  M= -8,-27,-18,-31,-23, 10,-27,-15, 21,-21, 27, 30,-26,-27,-17,-17,-21, -8, 19,-20,  0,-20;
/M: SY='Q';  M= -8, -8,-25, -8,  7,-18,-22,  1,-11,  5, -6,  1, -7,-15,  8,  7, -9, -8,-10,-23, -7,  6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A';  M=  6, -6,-19,-11, -3,-12,-15,-14,-10,  1, -7, -6, -4,-16, -6, -4, -1,  0, -4,-24,-11, -4;
/M: SY='G';  M= -6,-15,-25,-17,-15,-13,  7, -5,-10,-16, -2,  0, -9,-22,-12,-11, -9,-12, -8,-23,-10,-15;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-28, -6,-17,-25, 52,-14,-34,-17,-28,-19,  7,-20,-16,-17,  2,-15,-28,-20,-22,-17;
/M: SY='N';  M= -9, 37,-19, 18, -1,-19, -2,  8,-19, -1,-28,-19, 55,-19, -1, -1, 11,  4,-28,-39,-19, -1;
/M: SY='E';  M= -2,  5,-22,  5, 11,-22, -9, -2,-20,  1,-19,-14,  7,-13,  2, -1,  5, -3,-16,-30,-16,  6;
/M: SY='N';  M= -3,  0,-23, -6, -8,-18, -5, -9,-14,  3,-18,-10,  8,-14, -6,  3, -2, -5,-11,-25,-13, -8;
/M: SY='A';  M= 15,-14,  1,-23,-18, -1,-16,-21, -3,-17, -3, -5,-11,-20,-19,-20, -1,  1,  4,-22,-10,-18;
/M: SY='N';  M= -6, 14,-23,  3, -2,-21, -3, -1,-23,  9,-25,-15, 26,-18,  1, 17,  3, -3,-22,-29,-17, -2;
/M: SY='Q';  M= -1,  0,-22,  0, 11,-25,-12, -2,-19,  4,-18, -7,  2,-11, 15,  8,  6, -2,-17,-27,-15, 12;
/M: SY='F';  M=-12,-28,-23,-35,-28, 28,-32,-22, 19,-25, 11,  7,-22,-26,-27,-22,-17, -6, 16, -2, 15,-27;
/M: SY='W';  M=-18,-31,-33,-34,-26, 32,-27,-14, -4,-22,  4, -4,-29,-30,-23,-18,-29,-17,-11, 58, 36,-22;
/M: SY='E';  M= -9,  5,-27,  9, 35,-24,-19, -3,-22,  8,-14,-13,  1, -7, 13,  1, -2, -7,-22,-28,-16, 24;
/M: SY='S';  M=  7, -3,-20, -3, -2,-24,  1, -2,-24,  0,-25,-15,  2, -7, -2, -3, 11, -1,-16,-29,-16, -3;
/M: SY='N';  M= -6,  6,-23,  2,  0,-21,-10,  8,-20,  1,-15, -9, 11,-17,  5,  3, -1, -5,-19,-28,-10,  1;
/M: SY='L';  M= -8,-12,-21,-14,-14, -1, -9,-16, -1,-19,  7,  0, -8,-20,-17,-16,-12, -7, -1,-24, -9,-16;
/M:         M= -9, -4,-21, -1, -4,-17,-14, -8,-12, -9,-12,-10, -7, -6, -8, -9, -7, -9,-11,-24, -8, -8;
/M: SY='D';  M= -8,  6,-27, 10,  3,-19,-13, -7,-19, -3,-16,-14,  2, -2, -5, -9, -6, -9,-19,-21,-10, -2;
/M: SY='Q';  M=-11, -8,-26,-10, -1, -5,-13, -8,-16, -3,-12, -5, -5, -7,  1,  1, -6, -7,-17,-19, -7,  0;
/M: SY='S';  M=  2, -6,-21, -6, -3,-11,-11,-10,-13,-11,-12,-11, -3, -1, -7,-13,  5,  2,-12,-24, -9, -6;
/M:         M= -7,-11,-21,-11, -8, -5,-15,-12, -8, -6, -4, -5, -8,-19, -9, -4, -3,  0, -4,-20, -2, -9;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='K';  M= -6, -5,-23, -7, -4,-20,-18,-12,-14,  8,-17, -9, -3, -8, -1,  5, -8, -9,-13,-12,-10, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='P';  M= -7,-12,-25,-12, -5,-11,-13,-14,-11, -4,-15, -7, -9, 14, -7, -7, -3, -2,-12,-22,-12, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='P';  M= -3,  0,-19,  1,  2,-19,-12, -8,-14,  3,-16,-10, -1,  6,  3, -1,  2,  1,-12,-21,-12,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='D';  M= -5,  9,-20, 10,  0,-18,  0, -7,-18, -1,-17,-12,  7, -6, -3, -6,  0, -5,-15,-21,-13, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='P';  M= -1, -7,-13, -7, -2, -5, -9, -9, -8, -5,-10, -8, -5,  6, -5, -4,  3,  2, -6,-15, -8, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-12;
/M: SY='D';  M= -5,  7,-13,  8,  1,-13, -4,  3,-12, -1,-10, -4,  5, -8,  0,  1,  1, -3,-10,-17, -7,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M:         M= -3, -1, -4,  0, -5,-18,-16,-12,-10,-11, -9, -9, -4, -8, -6,-14, -3, -5, -7,-28,-15, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='R';  M= -9, -1,-27,  0,  4,-24,-17,  0,-24, 10,-22,-11,  0, -3, 11, 14, -1, -3,-20,-25,-11,  6;
/M: SY='Q';  M= -4, -3,-24, -2, 11,-24,-18,  3,-15, -4,-12, -6, -4, -7, 17, -4,  1, -4,-16,-27,-11, 13;
/M: SY='K';  M= -9, -6,-26, -7,  5,-19,-22,-12, -8, 13,-11, -4, -4,-14,  3,  6, -8, -7, -7,-24,-10,  3;
/M: SY='Y';  M=-14,-15,-26,-15,-10, -1,-25, -1, -7, 11, -7,  0,-13,-22, -4, 12,-15, -9, -5, -4, 21, -9;
/M: SY='E';  M= -5, 10,-25, 14, 26,-26,-15, -4,-25,  7,-20,-16,  6, -8, 10, -1,  4, -3,-22,-30,-17, 18;
/M: SY='Q';  M=  1,  6,-21,  4, 12,-26,-10,  4,-22,  3,-24,-13, 11,-11, 15,  0, 12,  0,-21,-30,-15, 13;
/M: SY='F';  M=-18,-25,-29,-28,-19, 30,-26,-14, -9,-12, -3, -5,-20,-17,-20, -5,-21,-13,-11, 22, 22,-19;
/M: SY='I';  M=  3,-25,-21,-33,-25,  2,-28,-26, 27,-24, 13, 10,-20,-21,-21,-24,-12, -4, 23,-20, -4,-25;
/M: SY='R';  M=  7, -9,-23,-13, -2,-22,-14, -6,-17, 10,-14, -6, -5,-15,  7, 17, -3, -7,-11,-20,-12,  1;
/M: SY='E';  M= 10,  5,-22,  5, 13,-27, -7, -9,-23,  8,-21,-15,  2, -9,  5, -3,  4, -5,-17,-26,-18,  9;
/M: SY='K';  M= -9, -2,-27, -1,  6,-25,-19, -9,-22, 31,-19, -5, -2,-12,  7, 18, -8, -8,-16,-22,-10,  6;
/M: SY='Y';  M=-20,-21,-29,-21,-21, 34,-30, 17,  0,-11,  1,  0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 29, 76,-21;
/M: SY='E';  M=-10, -5,-27, -2, 19,-22,-23, -7,-14, 11,-11, -7, -6,-12, 11, 11, -7, -9,-12,-25,-12, 14;
/M: SY='E';  M=-14,  2,-28,  5, 13,-18,-21, -3,-19, 10,-13, -6, -3,-13,  8, 10, -9,-10,-17,-22, -7, 10;
/M: SY='K';  M=-11, -7,-28, -7,  2,-22,-16,  0,-21, 21,-13, -4, -4,-16,  7, 18,-12,-11,-17,-21, -7,  4;
/M: SY='L';  M= -2,-13,-21,-15, -4,-12,-21,-15, -5,  2,  3,  0,-12,-18, -5,  3,-10, -3, -2,-22, -9, -5;
/M: SY='F';  M= -5,-20,-22,-26,-20, 33,-21,-18, -8,-19, -2, -6,-16,-23,-24,-16,-12, -7, -6, 14, 15,-19;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V';  M= -5,-14, -7,-19,-16, -8,-25,-17,  6,-13,  0,  1,-11,-22,-11,-14, -5,  3, 10,-25, -5,-15;
/M: SY='E';  M=-10, -5,-28, -2,  1,-17,-18,  1,-11,-10, -4, -5, -8,  0, -5,-12,-11,-10,-14,-27,-10, -4;
/M: SY='K';  M= -3, -8,-12, -7, -3,-19,-19,-16,-17,  3,-17,-12,-10,  0, -8, -1, -6, -7, -9,-27,-16, -6;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-26, -1, 13,-18,-21, -6,-12,  0, -5, -6, -6,-14,  8,  4, -6, -8,-13,-24, -9,  9;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-27,  1,  5,-24,  5, -9,-28,  2,-26,-16,  3, -4,  2, -1,  4, -7,-23,-26,-18,  3;
/M: SY='K';  M= -2, -1,-15, -2,  1,-24,-16,-10,-17,  4,-19,-11,  0, -9,  3,  1,  1, -3,-12,-28,-16,  1;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-27, 12, 16,-24,-14, -5,-19,  3,-17,-11,  0,-11,  6, -1, -1, -7,-16,-27,-12, 10;
/M: SY='E';  M= -6, -8,-29, -4,  4,-14,-19,-14,-14, -5,-13,-12,-11, -3, -5, -4, -9,-10,-12, -8,-10, -1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	109 in 109 different sequences
Number of true positive hits	109 in 109 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Arf-GAP
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

109 sequences

ACAP1_BOVIN (A5PK26), ACAP1_HUMAN (Q15027), ACAP1_MOUSE (Q8K2H4),

ACAP2_CHICK (Q5ZK62), ACAP2_HUMAN (Q15057), ACAP2_MOUSE (Q6ZQK5), 
ACAP2_RABIT (Q6IVG4), ACAP2_RAT   (Q5FVC7), ACAP3_HUMAN (Q96P50), 
ADAP1_HUMAN (O75689), ADAP2_HUMAN (Q9NPF8), ADAP2_MOUSE (Q8R2V5), 
ADAP2_RAT   (Q9JK15), AGA11_HUMAN (Q8TF27), AGAP1_HUMAN (Q9UPQ3), 
AGAP1_MOUSE (Q8BXK8), AGAP1_XENLA (Q6NRL1), AGAP2_HUMAN (Q99490), 
AGAP2_MOUSE (Q3UHD9), AGAP2_RAT   (Q8CGU4), AGAP3_HUMAN (Q96P47), 
AGAP3_MOUSE (Q8VHH5), AGAP4_HUMAN (Q96P64), AGAP5_HUMAN (A6NIR3), 
AGAP6_HUMAN (Q5VW22), AGAP7_HUMAN (Q5VUJ5), AGAP9_HUMAN (Q5VTM2), 
AGD10_ARATH (O82171), AGD11_ARATH (Q8L7A4), AGD12_ARATH (Q9FVJ3), 
AGD13_ARATH (Q8LFN9), AGD14_ARATH (Q8RXE7), AGD15_ARATH (Q0WQQ1), 
AGD1_ARATH  (Q9FIT8), AGD2_ARATH  (Q9C6C3), AGD3_ARATH  (Q5W7F2), 
AGD4_ARATH  (Q9SMX5), AGD5_ARATH  (Q9FL69), AGD6_ARATH  (Q9M354), 
AGD7_ARATH  (O80925), AGD8_ARATH  (Q8H100), AGD9_ARATH  (Q9FIQ0), 
AGE1_YEAST  (Q04412), AGE2_YEAST  (P40529), AGFG1_BOVIN (Q2TA45), 
AGFG1_HUMAN (P52594), AGFG1_MOUSE (Q8K2K6), AGFG1_RAT   (Q4KLH5), 
AGFG2_HUMAN (O95081), AGFG2_MOUSE (Q80WC7), AK1_DICDI   (Q54DK4), 
ARAP1_HUMAN (Q96P48), ARAP1_MOUSE (Q4LDD4), ARAP2_HUMAN (Q8WZ64), 
ARAP2_MOUSE (Q8BZ05), ARAP3_HUMAN (Q8WWN8), ARAP3_MOUSE (Q8R5G7), 
ARFG1_HUMAN (Q8N6T3), ARFG1_MOUSE (Q9EPJ9), ARFG1_RAT   (Q62848), 
ARFG2_BOVIN (A1L520), ARFG2_HUMAN (Q8N6H7), ARFG2_MOUSE (Q99K28), 
ARFG2_PONAB (Q5RAT7), ARFG2_RAT   (Q3MID3), ARFG2_XENTR (Q28CM8), 
ARFG3_BOVIN (Q17R07), ARFG3_HUMAN (Q9NP61), ARFG3_MACFA (Q4R4C9), 
ARFG3_MOUSE (Q9D8S3), ARFG3_PONAB (Q5R787), ARFG3_RAT   (Q4KLN7), 
ASAP1_BOVIN (O97902), ASAP1_HUMAN (Q9ULH1), ASAP1_MOUSE (Q9QWY8), 
ASAP1_RAT   (Q1AAU6), ASAP2_HUMAN (O43150), ASAP2_MOUSE (Q7SIG6), 
ASAP3_HUMAN (Q8TDY4), ASAP3_MOUSE (Q5U464), ASAP_DROME  (A1Z7A6), 
CEG1A_DROME (Q9NGC3), CNT1_CAEEL  (Q9XXH8), CNT2_CAEEL  (Q9XX14), 
CNT6_SCHPO  (Q10165), CSX2_SCHPO  (Q9UUE2), GCS1_YEAST  (P35197), 
GIT1_HUMAN  (Q9Y2X7), GIT1_MOUSE  (Q68FF6), GIT1_RAT(Q9Z272), 
GIT2_HUMAN  (Q14161), GIT2_MOUSE  (Q9JLQ2), GIT2_RAT(Q66H91), 
GIT_DROME   (Q95RG8), GLO3_SCHPO  (Q10367), GLO3_YEAST  (P38682), 
GTS1_YEAST  (P40956), GXCDD_DICDI (Q1ZXH8), SMAP1_HUMAN (Q8IYB5), 
SMAP1_MOUSE (Q91VZ6), SMAP2_BOVIN (Q5EA00), SMAP2_CHICK (Q5F413), 
SMAP2_HUMAN (Q8WU79), SMAP2_MOUSE (Q7TN29), SPS18_YEAST (P32572), 
UCP3_SCHPO  (O74345), YC8E_SCHPO  (O94601), YIQ9_SCHPO  (Q9UT34), 
YQP4_CAEEL  (Q09531)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

22 PDB

1DCQ; 2B0O; 2CRR; 2CRW; 2D9L; 2IQJ; 2OLM; 2P57; 3DWD; 3FEH; 3FM8; 3JUE;
» more