PROSITE entry PS50097

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50097

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	BTB
Accession [info]	PS50097
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50097
Associated ProRule [info]	PRU00037

Name and characterization of the entry

Description [info]

BTB domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9751000; R2=0.0206820; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2912.1987305; R2=2.5245535; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=364; H_SCORE=3831; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=268; H_SCORE=3589; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-2;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C';  M= -6,-10, 28,-14, -9,-15,-20,-14,-19,-15,-17,-14, -8,-19,-14,-15,  0,  0, -9,-32,-17,-12;
/M: SY='D';  M=-16, 41,-28, 53, 15,-34,-11, -1,-33,  0,-27,-25, 21,-11,  0, -8,  2, -6,-26,-38,-19,  7;
/M: SY='V';  M=  2,-23, -8,-28,-24, -1,-24,-25, 16,-20,  7,  6,-20,-25,-23,-20,-10, -4, 24,-23, -9,-24;
/M: SY='T';  M= -2,-13,-18,-19,-13, -7,-24,-19,  6, -8, -2,  1,-11,-17,-11,-10, -1, 10, 10,-24, -6,-13;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-22,-33,-24, 15,-32,-23, 25,-29, 35, 17,-26,-27,-23,-22,-24, -9, 16,-17,  3,-24;
/M: SY='V';  M=  0,-11,-18,-13,-10,-12,-20,-13,  1, -6, -4,  2,-10,-19, -6, -7, -4, -2,  8,-25, -9, -9;
/M: SY='V';  M=  1,-25, -3,-29,-25, -2,-26,-26, 17,-22, 10,  7,-23,-25,-23,-22,-11, -3, 24,-27,-10,-25;
/M: SY='D';  M= -6,  7,-26,  8,  7,-25,  6, -7,-27,  0,-23,-17,  8,-13,  0, -3,  3, -6,-23,-27,-17,  3;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='G';  M= -6,  8,-27,  8, -3,-27, 22, -7,-30, -8,-26,-19, 10,-14, -8, -9,  2, -9,-24,-28,-21, -6;
/M: SY='K';  M= -7, -4,-23, -4,  7,-23,-13, -2,-21, 10,-18, -9, -3,-12,  7,  9, -2, -4,-16,-25,-12,  6;
/M: SY='E';  M= -8, -6,-21, -8,  1,-15,-21, -7, -7, -1,-10, -5, -3,-14,  0, -1, -2, -2, -6,-26, -9, -1;
/M: SY='F';  M=-12,-28,-22,-34,-26, 31,-31,-21, 18,-26, 16,  9,-22,-27,-27,-21,-20, -9, 14, -6, 13,-26;
/M: SY='R';  M=-13, -9,-24,-10, -3,-11,-21,  7,-17,  7,-16, -4, -4, -8,  2,  9, -9, -9,-16,-20, -1, -2;
/M: SY='A';  M= 21,-15, -8,-22,-17,-10,-10,-23,  0,-15, -5, -5,-14,-18,-17,-19,  4,  6, 12,-24,-15,-17;
/M: SY='H';  M=-15,  5,-22,  2, -1,-20,-16, 65,-26, -8,-21, -5, 15,-19,  6, -2, -2,-11,-26,-32,  7,  0;
/M: SY='K';  M=-12, -5,-29, -5,  5,-25,-18, -8,-26, 34,-24, -9, -1,-14,  8, 34, -8, -8,-17,-20,-10,  5;
/M: SY='A';  M=  4,-12,-12,-16,-10, -6,-18,-14, -2,-13, -1, -2,-11,-17,-12,-13, -3,  1,  2,-24, -8,-11;
/M: SY='V';  M= -7,-26,-19,-31,-26,  7,-32,-24, 27,-23, 14, 11,-22,-25,-23,-22,-13,  0, 28,-19,  3,-26;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-21,  9,-30,-20, 22,-29, 47, 20,-29,-29,-20,-20,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='A';  M= 18, -6,  0,-12, -8,-18, -6,-16,-15,-10,-18,-12, -2,-14, -8,-13, 18, 11, -5,-32,-19, -8;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='A';  M= 15, -9,-13,-14, -8,-12,-10,-12, -9, -4, -7, -3, -7,-14, -7, -9,  1, -1, -4,-20, -9, -7; D=-6;
/I:         DM=-32;
/M: SY='C';  M= -7,-11,  6,-16,-14, -5,-17,  1,-17,-10,-12, -8, -5,-24,-11, -3, -5, -7,-10,-25, -4,-13;
/M: SY='S';  M=  7,  3, -9,  4,  1,-22, -3, -9,-22,-10,-29,-20,  9, -9, -1,-11, 32, 15,-12,-39,-20,  0;
/M: SY='P';  M= -6, -1,-28,  2,  8,-26, -9,-10,-22, -3,-24,-17, -2, 20, -1, -8,  3, -2,-22,-30,-21,  2;
/M: SY='Y';  M=-14,-24,-24,-26,-23, 30,-29,  1,  6,-17,  5,  3,-22,-29,-19,-15,-18, -9,  2, 13, 45,-23;
/I:         I=-10; MI=-15; MD=-29; IM=-15;
/M: SY='F';  M=-18,-29,-19,-37,-28, 66,-29,-19,  4,-28, 14,  5,-21,-29,-35,-19,-20,-10,  2,  5, 24,-27; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='R';  M=-10, -4,-28, -4,  4,-17,-18, -1,-22, 17,-18, -9, -2,-16,  8, 19, -7, -9,-18,-14, -2,  4;
/M: SY='A';  M=  7, -1,-18, -5, -2,-18,-13,-12,-12, -1,-12, -9, -1,-13, -3, -2,  5,  5, -6,-27,-14, -3;
/M: SY='L';  M= -8,-22,-22,-27,-17,  2,-26,-12, 15,-16, 25, 23,-21,-23,-11,-12,-20, -8,  7,-20, -1,-15;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-21,-35,-25, 44,-30,-20,  9,-27, 19,  8,-23,-27,-29,-20,-22, -9,  5,  0, 17,-25;
/M: SY='S';  M= -4, -3,-19, -5,  0,-15,-16, -8,-13, -1,-13, -8,  1,-14,  1, -1,  3,  3,-10,-26,-10,  0;
/M: SY='N';  M= -4,  8,-20,  7,  1,-25,  2, -2,-24, -5,-23,-15, 11,-13,  1, -7,  9,  1,-19,-32,-17,  1;
/M: SY='B';  M= -6,  6,-23,  5,  6,-24, -8,  2,-22,  0,-20,-12,  6, -9,  5, -3,  1, -4,-20,-28,-13,  5;
/M: SY='F';  M=-11,-11,-25,-13,-10,  5,-15,-10,-10,-12, -7, -4, -7,-12,-11,-10, -8, -5,-11,-10,  0,-11;
/I:         MD=-15;
/M:         M= -5, -5,-14, -7, -3,-18,-13,-10,-14, -2,-14, -7, -3,-11, -3, -4, -1, -1,-11,-27,-13, -4; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-24,  7, 17,-24,-15, -7,-19,  6,-17,-12, -1, -3,  6, -1, -1, -6,-17,-26,-15, 11; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='H';  M= -5,  1,-20,  2,  3,-19, -9,  4,-19,  0,-18,-11,  2, -9,  1, -1,  3, -2,-15,-23, -9,  1; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D';  M= -5,  3,-21,  4,  4,-19,-11, -2,-15, -1,-14, -9,  3, -1,  3, -4, -1, -4,-15,-23,-12,  3; D=-1;
/I:         MD=-15;
/M: SY='Q';  M= -3,  3,-16,  3,  4,-16,-11, -4,-11, -1,-11, -5,  2, -7,  6, -3,  2,  1,-10,-20, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6;
/M:         M= -5, -6,-17, -7, -2,-10,-12, -8, -1, -7, -2, -1, -5,-11, -5, -6, -5, -4, -1,-19, -8, -4; D=-1;
/I:         DM=-15;
/M: SY='I';  M= -7,-18,-14,-23,-16, -3,-27,-18, 12,-17,  4,  4,-14,-20,-14,-15, -8,  0, 12,-23, -5,-16;
/M: SY='I';  M= -8,-16,-24,-20,-11, -6,-26,-12, 11,-15,  6,  7,-13,-13, -9,-14,-11, -3,  6,-23, -4,-12;
/M: SY='L';  M=-10,-17,-19,-20,-15,  5,-26,-16,  7,-18,  9,  5,-13,-17,-16,-14,-12, -4,  4,-21, -2,-16;
/M:         M= -8, -5,-25, -6, -4,-13,-21,-11, -2, -5, -5, -4, -3,-12, -6, -6, -7, -4, -4,-25, -8, -6;
/M: SY='D';  M=-13, 26,-27, 37, 20,-33, -7, -2,-33, -1,-26,-23, 12, -7,  3, -7,  2, -8,-27,-35,-20, 12;
/M: SY='V';  M= -3,-24,-20,-28,-21,  4,-25,-19, 14,-17, 11, 10,-20,-21,-18,-11,-14, -6, 15,-19, -3,-20;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='S';  M= -4,  9,-15, 10,  6,-23,-10, -6,-24, -1,-25,-17,  9,-11,  2, -3, 13,  4,-17,-34,-17,  4;
/M: SY='Y';  M= -3,-18,-25,-18,-12,  1,-19, -8, -7,-12,-10, -6,-16,  4,-12,-14, -8, -6, -9, -7,  8,-14;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-22, 10, 13,-25,-15, -2,-26,  8,-22,-15,  3, -8,  5,  5,  0, -4,-20,-28,-14,  8;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-19,  1, -3,-19,-11, -5,-11,-11,-14,-10, -3,-11, -8,-14,  3, -2, -4,-30,-13, -7;
/M: SY='F';  M=-11,-28,-18,-34,-27, 37,-28,-21, 13,-26, 17, 10,-23,-28,-29,-20,-18, -7, 14, -9, 11,-26;
/M: SY='E';  M= -9,  1,-25,  4, 11,-21,-16, -2,-21,  5,-15,-11, -1,-12,  5,  7, -4, -7,-17,-25,-11,  7;
/M:         M= -2, -7,-22, -8, -4,-14,-18,-13, -4, -7, -5, -4, -6,-11, -4, -7, -2, -1, -4,-26,-11, -5;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-21,-34,-26, 13,-32,-23, 28,-27, 28, 19,-25,-26,-22,-22,-22, -8, 21,-18,  2,-25;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-20,-32,-23, 10,-31,-22, 25,-28, 37, 19,-28,-28,-22,-21,-25, -8, 18,-20,  0,-23;
/M: SY='B';  M=-10, 15,-25, 15, 10,-23,-13,  1,-23,  5,-21,-15, 14,-13,  5,  4,  2, -3,-21,-29,-11,  7;
/M: SY='F';  M=-16,-23,-19,-29,-24, 40,-28, -5,  0,-20,  3, -1,-18,-28,-24,-16,-16, -8, -2, 11, 37,-23;
/M: SY='M';  M= -7,-24,-19,-31,-22,  7,-26,-15, 21,-20, 20, 29,-21,-21,-14,-18,-18, -8, 14,-19,  0,-19;
/M: SY='Y';  M=-19,-17,-30,-17,-15, 19,-28, 17, -5, -3, -4, -2,-16,-27, -6,  2,-18,-10,-11, 19, 61,-15;
/M: SY='T';  M= -3,  3,-16,  1, -3,-18,-12, -9,-20, -6,-19,-15,  2, -7, -6, -6, 10, 15,-13,-27,-12, -5;
/M: SY='G';  M= -1,  1,-25,  2, -9,-26, 31,-12,-32,-10,-26,-18,  4,-17,-12,-10,  1,-12,-24,-25,-22,-11;
/M: SY='E';  M= -9,  3,-24,  4, 13,-25,-16, -1,-24, 13,-21,-13,  3, -9,  6, 13, -3, -6,-20,-27,-13,  8;
/M: SY='I';  M= -6,-21,-18,-25,-21, -2,-29,-21, 21,-21, 14, 10,-19,-24,-17,-19,-13, -3, 19,-23, -3,-20;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-23,  3,  4,-18,-11, -7,-17, -1,-18,-13,  3, -9, -1, -5,  1, -4,-14,-25,-11,  1;
/M: SY='I';  M= -8,-25,-23,-27,-20,  1,-30,-21, 21,-20, 18, 12,-22,-18,-18,-18,-18, -7, 16,-21, -1,-20;
/M: SY='P';  M= -6,  0,-24,  2,  1,-22,-13, -8,-21, -2,-23,-15,  1, 14, -4, -7,  3,  2,-19,-31,-18, -3;
/M: SY='E';  M= -7,  1,-27,  4, 11,-24,-15, -4,-19,  2,-18,-11,  0, -1,  6, -1, -2, -6,-19,-25,-14,  7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS51463

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	644 in 615 different sequences
Number of true positive hits	644 in 615 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	95
Number of 'partial' sequences	1

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	87.14 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	BTB
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	615 sequences ABAP1_ARATH (B7U179), ABRU_DROME (Q24174), ABT3A_DANRE (Q1LVW0), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	95 sequences BACD1_BOVIN (Q2T9W0), BACD1_DANRE (A9ULR9), BACD2_RAT (Q7TNY1), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	1 sequence ZBT17_CHICK (Q90625)
PDB [Detailed view]	373 PDB 1BUO; 1CS3; 1R28; 1R29; 1R2B; 2IF5; 2IHC; 2NN2; 2PPI; 2Q81; 2VKP; 2VPK; » more