PROSITE entry PS50085
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| PURL [info] | https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50085 |
| Entry name [info] | RAPGAP |
| Accession [info] | PS50085 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50085 |
| Associated ProRule [info] | PRU00165 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Rap GTPase activating proteins domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=217; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=212; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1180999; R2=0.0206674; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2487.7551270; R2=30.5401878; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=382; H_SCORE=14154; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=213; H_SCORE=8993; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-24, 5,-32,-24, 28,-26, 30, 17,-26,-27,-21,-19,-22, -8, 22,-21, -2,-24; /M: SY='K'; M= -7,-10,-24,-10, -4,-17,-12, -9,-13, 10,-12, -1, -7,-17, 2, 8, -4, -6, -9,-22, -8, -1; /M: SY='N'; M= -5, 0,-19, -7, -9, -9,-16, -2, -4, -5, -6, -4, 7,-21, -7, -6, -4, -1, -4,-25, -3, -9; /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-31,-22, 16,-31,-18, 18,-26, 35, 15,-26,-29,-21,-17,-26,-10, 10,-14, 7,-22; /M: SY='D'; M=-19, 46,-30, 65, 20,-39, -7, -1,-40, 0,-30,-29, 18,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-39,-20, 10; /M: SY='E'; M= -5, -4,-23, -2, 16,-20,-18, -6,-13, -3, -8, -7, -4,-12, 12, -2, 3, -2,-15,-28,-13, 14; /M: SY='R'; M=-13,-13,-27,-16, -6,-16,-25, 4, -3, -1, -3, 5, -7,-19, 9, 11,-10, -8, -6,-22, -3, -1; /M: SY='P'; M= -7,-12,-29, -8, 2,-27,-16,-12,-14, -1,-21, -9,-11, 22, 7, -7, -4, -8,-15,-26,-19, 3; /M: SY='C'; M= -6,-20, 32,-25,-21,-13,-23,-24, -6,-24, -5, -7,-17,-17,-21,-24, -7, -6, -1,-36,-19,-22; /M: SY='R'; M=-13,-11,-25,-13, -8, -4,-20, -2,-15, 7,-14, -7, -3,-21, -1, 26, -3, -3,-10,-14, 6, -8; /M: SY='E'; M=-10, 9,-26, 14, 26,-19,-17, -4,-23, 0,-20,-18, 4, -1, 4, -6, 1, -4,-22,-28,-14, 15; /M: SY='T'; M= -5, 0,-16, -7, -5, -8,-18, -9,-12, -7,-12, -9, 4,-14, -3, -5, 11, 24, -7,-27, -8, -3; /M: SY='H'; M=-19, -4,-28, -4, -5, -3,-22, 53,-20,-11, -9, -1, 0,-22, 0, -3,-13,-16,-21,-20, 18, -5; /M: SY='K'; M= -9, 0,-28, -1, 8,-28,-20,-11,-28, 45,-28,-10, 0,-10, 8, 27, -8, -5,-18,-21,-10, 8; /M: SY='I'; M= -6,-28,-22,-35,-28, 11,-31,-26, 31,-25, 13, 14,-22,-24,-24,-24,-15, -7, 27,-18, 0,-28; /M: SY='G'; M= 20,-12,-21,-17,-16,-17, 32,-20,-24,-16,-18,-14, -6,-16,-17,-20, 3,-11,-15,-18,-21,-16; /M: SY='V'; M= -3,-30,-15,-32,-29, 1,-32,-29, 34,-23, 14, 13,-28,-28,-27,-22,-13, -3, 44,-27, -7,-29; /M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-36,-27, 30,-32,-22, 21,-28, 24, 15,-24,-27,-26,-22,-22, -9, 15,-11, 9,-26; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-21, 35,-30, 14, 1,-13, 3, 1,-20,-30,-14,-12,-20,-10, -8, 26, 71,-21; /M: SY='V'; M= -4,-23, 0,-28,-22, -8,-29,-22, 18,-19, 5, 10,-21,-25,-14,-19,-11, -5, 23,-28,-10,-19; /M: SY='G'; M= 10, -7,-24,-10, -5,-26, 12,-15,-27, 11,-23,-13, -3,-14, -5, 4, -1,-10,-17,-20,-19, -5; /M: SY='E'; M= 0, 1,-27, 4, 23,-23,-14, -4,-21, 0,-17,-15, -4, 3, 7, -8, -1, -8,-22,-23,-12, 14; /M: SY='G'; M= -1, -6,-29, -5,-12,-30, 55,-16,-38,-16,-29,-19, 1,-18,-12,-17, 2,-17,-29,-22,-28,-12; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='E'; M= -5, -2,-14, 0, 15,-19,-15, -9,-20, 1,-17,-14, -3,-12, 2, -1, 5, 3,-15,-28,-13, 8; /M: SY='D'; M= -8, 22,-19, 23, 3,-23,-11, -7,-24, -3,-23,-19, 16,-12, -3, -5, 13, 16,-17,-35,-16, 0; /M: SY='E'; M= -9, 12,-26, 13, 25,-27,-14, -2,-28, 19,-26,-17, 12, -9, 10, 11, 2, -6,-25,-30,-17, 17; /M: SY='E'; M= -4, 1, 4, 3, 22,-27,-16, -6,-27, -3,-19,-17, -5,-13, 6, -9, -2,-10,-22,-31,-19, 14; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= 1, 0,-24, 1, 18,-23,-17, -9,-11, -4,-14,-10, -2, -8, 9, -9, 4, -4,-12,-28,-15, 13; /M: SY='I'; M= -8,-26,-24,-33,-24, 0,-31,-21, 33,-25, 21, 23,-19,-21,-15,-23,-16, -7, 20,-22, -2,-22; /M: SY='L'; M=-11,-23,-21,-25,-17, 17,-26,-13, 6,-18, 23, 8,-21,-26,-17,-13,-19, -7, 1,-10, 13,-17; /M: SY='N'; M= -1, 6,-19, 2, -2,-19, -3, -6,-19, -1,-20,-14, 14,-16, -2, 2, 11, 4,-16,-32,-17, -3; /M: SY='N'; M=-10, 30,-21, 15, 4,-18, -5, 6,-17, -2,-21,-16, 45,-19, 0, -2, 6, 0,-26,-37,-18, 2; /M: SY='E'; M= -5, 1,-21, 1, 14,-21,-17, -8,-16, 0,-17,-12, 2, -8, 6, 1, 8, 8,-12,-30,-16, 9; /M: SY='E'; M=-10, 1,-26, 2, 15,-18,-15, 13,-22, 2,-18,-11, 3,-12, 7, 1, 0, -5,-21,-25, -4, 10; /M: SY='G'; M= 5, -9,-22,-11, -9,-19, 18,-16,-19,-16,-11,-11, -4,-12,-12,-16, 1, -6,-15,-25,-20,-11; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='S'; M= 3, -4,-16, -4, -2,-20, 0,-11,-19, -6,-21,-13, 3,-13, 2, -7, 21, 9,-12,-32,-17, 0; /M: SY='P'; M= -4, -5,-28, -5, 3,-21,-15, -6,-18, -2,-20,-13, -2, 19, 1, -4, -2, -6,-22,-23,-12, 0; /M: SY='A'; M= 4, -6,-22, -7, 1,-19,-12, -2,-17, -2, -9, -8, -5,-11, 1, 3, -2, -5,-13,-24,-12, 0; /M: SY='F'; M=-19,-20,-24,-23,-22, 48,-28, -6, -2,-21, 7, -1,-17,-28,-26,-16,-19,-10, -5, 9, 38,-23; /M: SY='E'; M= -6, 2,-22, 6, 8,-19,-18,-10,-13, -2, -7, -7, -4,-14, 0, -7, -2, -1, -9,-29,-13, 4; /M: SY='E'; M= -8, 10,-26, 13, 30,-26,-16, -1,-25, 8,-20,-14, 6, -7, 12, 5, 2, -4,-23,-30,-17, 20; /M: SY='F'; M=-18,-27,-21,-36,-25, 63,-29,-17, 0,-26, 11, 2,-19,-28,-29,-17,-19,-10, -2, 5, 24,-23; /M: SY='L'; M= -9,-20, -7,-20,-18, 1,-28,-20, 10,-25, 29, 9,-23,-28,-20,-19,-21, -6, 9,-26, -6,-19; /M: SY='S'; M= -2, 5,-18, 3, 0,-19,-12, -8,-18, -3,-16,-13, 7,-14, -1, 2, 11, 11,-12,-31,-14, -1; /M: SY='G'; M= -5,-10,-23,-12, -5, -8, 4,-13,-15,-11, -6, -6, -5,-19,-10, -7, -5, -9,-12,-22,-12, -8; /M: SY='L'; M= -9,-25,-21,-26,-16, 3,-29,-18, 16,-25, 36, 16,-24,-26,-12,-17,-22, -5, 7,-21, -2,-14; /M: SY='G'; M= -3,-10,-16,-11,-19,-28, 53,-10,-38,-20,-28,-18, -1,-22,-18,-19, -2,-19,-28,-24,-26,-19; /M: SY='W'; M=-15, -2,-33, 0, 1,-19,-18,-10,-26, 7,-22,-15, -6,-16, 5, 10,-11, -8,-24, 17, -2, 3; /M: SY='E'; M= -9,-10,-24, -9, 7,-13,-22,-11, -7, -2, 0, -3, -9,-16, -1, 4, -6, -4, -6,-26,-10, 2; /M: SY='V'; M= 1,-25,-16,-31,-26, 2,-29,-28, 27,-21, 9, 9,-22,-24,-24,-22, -9, 1, 33,-24, -6,-26; /M: SY='D'; M=-12, 7,-25, 10, 10,-24,-17, 9,-23, 6,-20,-12, 5,-14, 7, 10, -1, -4,-17,-30,-10, 7; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-28,-19, 11,-29,-20, 15,-21, 34, 14,-26,-28,-20,-15,-25, -9, 12,-19, 0,-19; /M: SY='K'; M= -9, -5,-28, -6, 1,-21,-10, -8,-19, 17,-20, -8, -2,-14, 3, 10, -6, -8,-16,-18, -5, 1; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -3, 6,-25, 7, -3,-25, 9,-13,-23, -8,-20,-16, 4,-14, -8, -8, 1, -4,-17,-27,-19, -6; /M: SY='H'; M= -7,-14, -4,-18,-16, 8,-21, 12,-14,-19, -8, -5,-10,-25,-17,-15,-10,-11, -8,-14, 6,-16; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M=-13, 9,-17, 14, 16,-20,-18, -6,-26, 1,-21,-17, 2, -4, 4, -4, -2, -7,-23,-29,-15, 10; /M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7, -7,-25, 22,-10,-30, 3,-25,-13, -2,-17, -2, -2, -3,-13,-24,-16,-12, -5; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-25,-20, 30,-28, -1, 0,-16, 0, -1,-15,-27,-13,-13,-18,-11, -8, 21, 41,-17; /M: SY='R'; M= -2,-11,-21,-14, -3,-12,-19,-11, -9, 2, 1, 1,-10,-17, -2, 11, -8, -1, -6,-22, -9, -4; /M: SY='G'; M= 1, -4,-28, -3, -9,-24, 42,-16,-34,-15,-25,-19, 0,-17,-15,-17, 0,-16,-25,-21,-24,-11; /M: SY='G'; M= -4, -8,-30, -9,-12,-28, 40, -7,-31,-11,-25,-13, 0,-18, -7,-12, -3,-18,-26,-21,-21,-11; /M: SY='L'; M= -9,-26, -8,-27,-18, 1,-29,-18, 13,-24, 32, 16,-26,-28,-13,-18,-23, -9, 8,-23, -4,-16; /M: SY='D'; M=-12, 23,-27, 35, 16,-32,-12, -4,-29, -3,-24,-21, 8, -1, 4, -9, 4, -5,-24,-36,-19, 10; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='T'; M= -7, -2,-18, -4, -8,-13,-21,-15, -2, -7, -7, -5, -4,-15, -8, -5, 1, 11, 5,-27,-10, -9; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='K'; M= -8, -8,-13, -9, 2,-19,-21, -9,-17, 10,-13, -7, -7,-17, 3, 10, -5, -5,-11,-24, -9, 2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='N'; M= -7, 3,-10, -4,-10,-18, 6, 0,-25,-11,-24,-16, 12,-20, -8, -8, 2, -3,-22,-17,-13,-10; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='D'; M= -7, 18,-17, 23, 7,-28, 6, -6,-31, -4,-27,-22, 14,-13, -3, -9, 7, -5,-24,-33,-21, 2; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='S'; M= -3, -1,-21, -1, 1,-17,-17, -8, -3,-10, -8, -5, -2,-12, 1,-12, 3, 1, -5,-26,-10, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='T'; M= -6, 5,-13, 2, -4,-11,-14, -9,-11, -4, -7, -8, 4,-11, -5, -1, 5, 17, -7,-23, -9, -5; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='G'; M= 0, -8,-27, -8,-14,-28, 53,-16,-35,-16,-28,-17, 1,-17,-11,-16, 4,-15,-27,-21,-26,-12; D=-2; /I: I=-2; DM=-13; /M: SY='T'; M= -1, 1,-20, -3, 1,-19,-16, -7,-13, 0,-13, -8, 3,-13, 4, -3, 5, 9,-11,-27,-11, 2; /M: SY='H'; M=-13, -7,-24,-10, 2, 5,-23, 9,-17, -3,-11, -6, -4,-16, 0, 0, -6, -3,-16,-16, 5, 2; /M: SY='A'; M= 19, -7,-12,-12, -8,-17, -8,-16,-12, -7,-15,-11, -3,-13, -7, -7, 17, 14, -1,-29,-17, -8; /M: SY='Y'; M=-10,-23,-26,-22,-19, 4,-19, -9, 4,-17, 4, 1,-22, -9,-17,-17,-16, -9, 2, -7, 16,-21; /M: SY='Y'; M=-14,-16, -1,-18,-14, 11,-27, 2, -7,-14, -7, -6,-15,-27,-12,-14,-11, -7, -9, 0, 36,-16; /M: SY='W'; M=-12,-11,-24,-12,-10, 2,-21,-10,-15,-11,-14,-12,-13,-20, -7,-12, -8, 0,-16, 25, 15, -8; /M: SY='A'; M= 10, -4,-18,-10, -4,-11,-13, 0,-13, -4,-13, -8, 0,-15, -6, -8, 1, 0, -7,-23, -8, -5; /M: SY='Y'; M=-16, 5,-26, 10, -7, 2,-21, -3,-14,-10,-11,-12, -5,-20,-12,-12, -8, -3,-11, -5, 17,-10; /M: SY='E'; M= 2, 6,-25, 9, 11,-29,-12, -7,-25, 10,-23,-15, 1, -6, 9, 5, 2, -6,-19,-27,-17, 9; /M: SY='B'; M= -7, 1,-24, 1, -6,-14, -7,-14, -7,-14, -7, -8, 1,-17,-11,-16, -5, -5, -7,-27,-13, -9; /M: SY='M'; M= -8,-17,-21,-21,-15, 3,-24, -1, 2,-11, 7, 10,-14,-22,-11, -6,-12, -2, 2,-18, 5,-14; /M: SY='E'; M= -8, 2,-28, 8, 35,-30,-13, -2,-23, 5,-18,-12, -3, -7, 21, -1, -1,-10,-23,-27,-18, 28; /M: SY='I'; M= 5,-26,-22,-33,-25, -3,-26,-26, 24,-21, 8, 10,-22,-21,-19,-23,-13, -7, 21, -7, -4,-23; /M: SY='M'; M= -2,-18,-20,-23,-15, -8,-15,-15, 13,-14, 6, 20,-16,-19,-10,-16,-10, -5, 12,-23, -9,-13; /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-29, 64,-30,-19, 4,-28, 13, 3,-22,-30,-36,-20,-20, -9, 5, 5, 26,-29; /M: SY='H'; M=-17, 1,-28, 3, -3,-21,-12, 69,-27,-11,-19, -4, 7,-20, 3, -4, -8,-17,-23,-30, 9, -3; /M: SY='V'; M= -5,-30,-10,-32,-29, 1,-30,-29, 24,-23, 11, 9,-29,-29,-26,-22,-16, -6, 33,-12, -5,-28; /M: SY='S'; M= 15, -3,-14, -4, 3,-21, -5,-13,-18, -8,-23,-17, 2, -1, -2,-12, 24, 12,-11,-33,-20, 0; /M: SY='T'; M= 1, -3,-10,-11,-11,-10,-19,-20, -7,-11,-10, -9, -2,-12,-11,-11, 19, 43, 4,-31,-11,-11; /M: SY='M'; M=-13,-13,-25,-12, -9, -9,-22, 0, -2, -7, 10, 15,-13,-13, -5, -1,-18,-11, -6,-24, -4, -8; /M: SY='L'; M= -9,-26, -7,-30,-22, 3,-26,-15, 16,-22, 30, 30,-26,-27,-15,-17,-23, -9, 12,-23, -3,-18; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='P'; M= -7,-14,-34, -6, 3,-28, -9,-16,-22, -9,-28,-19,-13, 59, -7,-16, -3, -8,-27,-29,-27, -5; D=-5; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='Y'; M= -7, -8,-17,-13,-12, 11,-18, -3, -9,-12, -9, -8, -3,-18,-11,-10, 6, 14, -7,-11, 16,-12; D=-5; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='T'; M= -5, -1,-17, -6, -3,-11,-14, 3, -9, -1, -7, 1, 3,-13, -1, 0, 0, 5, -8,-23, -6, -3; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='E'; M= -9, 7,-15, 12, 13,-29, -9, -9,-27, -1,-25,-19, 2, 1, 2, -8, 0, -8,-24,-32,-21, 6; /M: SY='G'; M= -3, -1,-23, -2, -8,-21, 16, -3,-22,-14,-19,-13, 5,-18, -9,-13, 5, -7,-16,-29,-17, -9; /M: SY='D'; M=-15, 28,-26, 35, 11,-19,-12, -2,-26, -5,-18,-20, 17,-15, -4, -9, -1, -7,-23,-33,-14, 4; /M: SY='K'; M= -5, -4,-27, -2, 5,-26,-16, -8,-18, 8,-20, -6, -5, 6, 7, 3, -2, -6,-16,-26,-16, 5; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='Q'; M= -4, 3,-24, 0, 3,-28, 4, 8,-22, -2,-22, -8, 9,-13, 19, -2, 4, -8,-25,-23,-13, 11; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='Q'; M=-11,-11, -6,-14, -4,-23,-16, -7,-15, -1,-11, -1, -8,-20, 13, 6, -8,-11,-15,-25,-13, 3; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='L'; M= -6,-11, 1,-16,-15, -4,-21,-16, 0,-20, 11, 1, -7,-24,-15,-15, -7, 2, 0,-29,-10,-15; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='Q'; M=-10, 4,-25, 8, 9,-24,-10, -4,-18, -1,-10, -7, 1,-14, 12, -3, -5, -9,-19,-25,-13, 11; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='R'; M=-11, -3,-25, -3, 6,-24,-16, -4,-26, 30,-23, -9, 1,-12, 12, 35, -4, -6,-18,-20,-10, 7; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='K'; M=-11, -1,-28, -1, 3,-22,-20,-11,-24, 27,-20,-10, -2,-13, 3, 19, -8, -3,-16,-15, -8, 3; /M: SY='R'; M=-13, -3,-26, -5, -1,-21, -7, -3,-29, 18,-24,-13, 7,-18, 5, 43, 0, -6,-20,-25,-14, -1; /M: SY='H'; M=-17, 3,-30, 5, 2,-24,-11, 73,-31, -8,-22, -4, 9,-18, 11, -2, -7,-18,-30,-29, 9, 2; /M: SY='I'; M= -6,-22,-23,-28,-21, -2,-29,-24, 26,-25, 15, 10,-15,-19,-16,-23, -8, 1, 16,-24, -4,-21; /M: SY='G'; M= 4, -5,-26, -8,-17,-26, 50,-18,-33,-17,-26,-18, 4,-18,-17,-17, 4,-10,-25,-23,-26,-17; /M: SY='N'; M= -9, 25,-23, 10, -3,-20, 3, 4,-19, -4,-26,-13, 41,-10, -3, -4, 5, -4,-27,-36,-20, -4; /M: SY='D'; M=-19, 39,-30, 56, 16,-34,-13, 3,-35, 0,-26,-25, 15,-12, 5, -8, -2,-10,-28,-32,-10, 10; /M: SY='F'; M=-12,-19,-25,-24,-11, 17,-30,-15, 11,-19, 9, 6,-16,-20,-16,-17,-14, -4, 4,-11, 10,-14; /M: SY='V'; M= 8,-26,-11,-28,-26, -4,-24,-26, 22,-17, 7, 10,-26,-26,-24,-19, -7, -1, 38,-27,-11,-25; /M: SY='T'; M= 0, -7,-15,-10, -6,-18,-17, 1,-15, -8,-17,-10, -4, 4, -6,-11, 6, 11,-11,-30,-11, -8; /M: SY='I'; M= -7,-25,-25,-31,-26, -1,-25,-23, 29,-24, 8, 10,-17,-22,-19,-24,-11, -7, 21,-19, 2,-26; /M: SY='V'; M= -5,-26,-18,-30,-27, 2,-32,-24, 30,-21, 10, 10,-23,-25,-23,-21,-11, 0, 34,-21, 1,-27; /M: SY='F'; M=-11,-28,-25,-33,-25, 37,-26,-15, 0,-22, 5, -2,-24,-28,-26,-18,-20,-12, -2, 28, 29,-24; /M: SY='Q'; M= -6, 9,-22, 4, 10,-25,-13, 0,-19, 4,-20,-10, 14,-12, 18, 2, 8, 4,-21,-29,-14, 14; /M: SY='E'; M= -9, 12,-26, 21, 36,-29,-17, -3,-25, 4,-20,-18, 2, -6, 13, -4, 3, -6,-21,-32,-18, 25; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -4, -2,-24, -2, 2,-21,-15, 0,-15, -9,-20,-13, 1, 10, -2,-12, 8, 4,-15,-32,-14, -2; /M: SY='G'; M= -2, -2,-20, -7,-14,-12, 19,-14,-20,-15,-21,-15, 8,-19,-15,-14, 8, 0,-14,-26,-18,-14; /M: SY='E'; M= -4, -4,-22, -4, 11,-17,-18, 0,-17, 0, -9, -9, -3,-12, 3, 5, 1, 2,-14,-27,-11, 6; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='P'; M= -7, -1,-26, 6, 5,-23,-19,-14,-13, -6,-17,-14, -8, 12, -7,-10, -3, -2, -8,-31,-19, -2; /M: SY='F'; M=-16,-24,-23,-29,-23, 42,-28, -7, 5,-22, 8, 2,-18,-27,-23,-17,-16, -7, 0, 7, 36,-23; /M: SY='R'; M= -6, -1,-15, -4, 0,-12,-17,-11,-19, 4,-18,-12, 1,-15, -4, 5, 4, 5,-10,-26,-11, -2; /M: SY='P'; M=-14,-19,-30,-16, -7,-10,-23, -4,-12, -6, -3, -4,-15, 13, -7, 5,-16,-11,-15,-23, -9,-10; /M: SY='D'; M= -6, 3,-23, 4, -5,-14, 1,-12,-16, -8,-15, -8, 1,-17,-10,-12, -2, -7,-11,-26,-14, -7; /M: SY='T'; M= -4,-10,-14,-15,-12,-13,-20,-16, -2,-13, -8, 1, -7, 3, -9,-15, 5, 16, -3,-30,-13,-12; /M: SY='I'; M= -7,-19,-24,-28,-23, -4,-31,-24, 30,-24, 10, 10,-10,-19,-16,-23, -9, -1, 19,-25, -5,-23; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='R'; M= -1, -8,-25, -8, 0,-22,-14, -1,-22, 12,-21,-11, -4, 5, 2, 16, -3, -7,-17,-22,-12, -2; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='S'; M= 1, 1,-16, -1, -6,-19, 5,-13,-19,-11,-20,-11, 4,-13, -6,-12, 19, 15,-11,-32,-18, -6; /M: SY='H'; M= -9, 6,-28, 8, 12,-29,-15, 24,-25, 1,-24,-10, 8, -3, 18, 0, 1, -9,-27,-29, -8, 13; /M: SY='F'; M=-16,-14,-20,-22,-20, 52,-23,-15, -7,-23, -1, -6, -7,-26,-29,-17,-10, -6, -6, -3, 17,-21; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='N'; M= -9, 4, -8, 0, -5,-16, -9, -6,-12,-11, -5, -6, 7,-20, -1, -9, -5, -5,-14,-28,-13, -3; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='H'; M=-17, 10,-26, 11, -1, -4,-16, 31,-24,-10,-18,-11, 10,-19, -4, -8, -4,-10,-22,-24, 8, -4; /M: SY='V'; M= 9,-20,-12,-23,-20, -7,-19,-23, 12,-17, 3, 2,-18,-22,-19,-18, 1, 4, 24,-29,-12,-20; /M: SY='F'; M=-12, -7,-13,-10,-10, 12,-21, -1,-11,-16, -3, -6, -5,-22,-14,-13, -5, -2, -9,-17, 7,-12; /M: SY='V'; M= -5,-17,-22,-19,-17,-10,-29,-21, 19,-13, 4, 7,-16,-21,-12,-16,-12, -6, 20,-25, -8,-16; /M: SY='V'; M= -6,-23,-20,-26,-20, -5,-29,-23, 21,-13, 7, 8,-18,-22,-16,-10,-10, -4, 23,-25, -7,-20; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-32,-27, 3,-32,-27, 31,-25, 25, 15,-28,-28,-25,-22,-19, -5, 33,-25, -5,-27; /M: SY='R'; M=-10, -4,-24, -5, 5,-16,-20, -3,-20, 10,-17, -9, -2,-14, 9, 18, 2, 6,-16,-19, -1, 5; /M: SY='P'; M= -5,-16,-31,-12, -4,-22,-20, -7,-13, -5,-19,-10,-15, 35, -6,-12, -9, -9,-15,-25,-14, -8; /M: SY='L'; M= -8,-12,-22,-14, -6, -8,-22, 1, 0,-10, 7, 6, -9,-20, -5, -9, -9, -5, -3,-26, -4, -6; /M: SY='D'; M= -5, 9,-24, 11, 2,-25, 2, -5,-25, -3,-19,-15, 8,-15, -2, -4, 3, -5,-20,-30,-17, 0; /M: SY='R'; M=-11, 2,-27, 1, 3,-16,-14, 0,-19, 2,-18,-12, 7, -4, 2, 9, -4, -7,-22,-21, -5, 0; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='C'; M= -6, -1, 4, -2, -7,-12, -6, 0,-13, -8, -9, -7, -1,-15, -7, -8, -3, -6, -7,-21, -9, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='T'; M= -3, -3,-12, -4, 1, -9,-11, -3, -8, -4, -5, -5, -2, -5, -1, -2, 5, 9, -6,-18, -7, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='E'; M= -5, -4,-17, -1, 1,-14, -2, -8, -9, -4, -6, -5, -5, -3, -3, -6, -5, -7, -7,-16,-11, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='H'; M= -8, 5,-18, 1, 1,-15, -7, 15,-12, -2,-14, -6, 12, -7, 6, 0, 0, -6,-16,-20, -5, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='T'; M= -8, 0, -7, -2, -8,-16,-15, -6,-10, -7,-12, -8, -1,-14, -9, -9, -2, 1, -4,-28,-11, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='R'; M= -8,-10, -5,-13, -6, -6,-19,-10, -8, -5, -4, -1, -7,-19, -6, 4, -5, -2, -3,-23, -9, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='Y'; M=-14,-14,-25,-17,-15, 16,-22, -1, -5, -4, -7, -4,-11,-24,-12, -6,-15, -9, -7, 17, 33,-14; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='R'; M=-10, -2,-24, -1, 1,-17,-15, 4,-19, 7,-16, -3, 1,-15, 3, 13, 0, -4,-14,-27, -8, 1; /M: SY='V'; M= -6,-24,-18,-26,-18, -3,-29,-22, 21,-16, 12, 11,-23,-24,-18,-12,-14, -5, 27,-26, -8,-19; /M: SY='K'; M= 2, -5,-20, -6, 1,-18,-13, -1,-16, 4,-17, -9, -3,-14, 1, 1, 4, 1, -9,-24, -7, 0; /M: SY='V'; M= -1,-25,-19,-27,-24, -3,-17,-26, 14,-21, 5, 3,-22,-25,-22,-20,-10, -5, 20,-10, -7,-23; /M: SY='T'; M= -4, -9,-20,-12, -7,-11,-17,-12,-10, -4, -8, -4, -5, -9, -4, 1, 3, 6, -7,-26,-11, -6; /M: SY='R'; M= 1, -3,-15, -4, 2,-21,-17,-11,-16, 3,-15,-10, -5,-15, 1, 7, 1, 0, -7,-27,-15, 0; /M: SY='R'; M=-13, 2,-27, 5, 3,-21,-10, 6,-28, 12,-23,-13, 3,-16, 3, 18, -2, -7,-21,-22, -4, 1; /M: SY='R'; M=-10, 3,-25, 6, 5,-23,-16, -6,-24, 7,-23,-15, 1, -1, 3, 10, 3, 3,-19,-27,-11, 2; /M: SY='D'; M=-10, 15,-27, 24, 19,-29,-14, -4,-30, 5,-24,-21, 6, -1, 4, 5, 2, -4,-24,-32,-19, 10; /M: SY='V'; M= -2,-17,-17,-17,-22, -9,-15,-25, 13,-18, 0, 1,-17,-24,-23,-19, -5, -2, 26,-29,-13,-23; /M: SY='P'; M= -4,-14,-31,-10, -6,-20,-15,-16,-13,-12,-20,-14,-14, 40,-10,-18, -5, -5,-18,-23,-14,-11; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='F'; M= -4,-21,-24,-23,-14, 5,-23,-19, 1,-11, -3, -3,-17,-10,-16, -9,-11, -7, 2,-10, -3,-15; /M: SY='F'; M=-13,-23,-21,-27,-19, 36,-24,-15, -5,-19, 1, -4,-15,-16,-24,-10,-10, -5, -4, -7, 12,-20; /M: SY='G'; M= -2, -5,-25, -4,-14,-26, 38,-18,-29,-14,-25,-17, 0,-18,-16,-16, 3, -9,-18,-25,-24,-15; /M: SY='P'; M= -7,-16,-26,-12, -5,-24,-20,-19,-15, -9,-22,-15,-16, 44,-10,-13,-10,-10,-20,-22,-22,-11; /M: M= -3,-11,-24,-14, -7, -4,-20, -8, -4,-14, -2, -4, -8, -1,-10,-15, -7, -4, -8,-21, -5,-10; /M: SY='L'; M= -3,-23,-21,-26,-18, 6,-17,-21, 5,-23, 17, 4,-20,-14,-20,-20,-15, -5, 2,-18, -5,-19; /M: SY='P'; M=-12, 1,-33, 9, 5,-27,-17,-12,-25, -3,-26,-20, -4, 34, -4, -7, -4, -4,-26,-24,-21, -2; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: M= 0, -3,-19, -4, -1,-14,-11,-14,-10, -5,-11, -9, -4,-16, -9, -9, 0, -1, -2,-27,-14, -5; /M: SY='S'; M= -1,-13,-23,-13, -7,-12, -4,-13,-16, -9,-14,-10, -7, -1, -5, -5, 2, -4,-13,-24,-14, -7; /M: SY='V'; M= 7,-14,-19,-17,-16,-13, -7,-22, 3,-17, -5, -3,-12,-15,-16,-19, 0, -1, 9,-27,-15,-17; /M: SY='V'; M= -3,-17,-13,-18,-20, -9,-22,-23, 11,-14, 0, 1,-17,-23,-19,-12, -7, -2, 22,-28,-12,-21; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M= -7,-24,-16,-29,-23, 27,-25,-19, 12,-22, 14, 8,-19,-23,-24,-17,-14, -3, 13,-10, 7,-22; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='A'; M= 2, -8,-18, -8, 1,-10,-14, -8,-11, -4, -6, -7, -7, -7, -3, -3, 1, 2, -9,-19, -5, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='R'; M= -8, -5,-21, -6, -4,-20,-19, -7,-14, 8,-16, -8, 0, -8, -2, 9, -5, -6,-11,-27,-12, -5; /M: SY='G'; M= -2,-10,-19,-15,-14,-15, 3, 2,-11,-15,-12, -1, -3,-19, -6,-14, -3,-10,-11,-21, -5,-12; /M: SY='A'; M= 4, 0,-23, -4, -2,-22,-14,-10,-10, 1,-13, -5, 1, -6, 2, -6, -2, -5,-11,-25,-14, -1; /M: SY='B'; M= -5, 4,-16, 3, 3,-15,-17, -5,-10, -6,-10, -5, 0,-17, -3,-10, -4, -6, -7,-26, -7, -1; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='F'; M= -9,-23,-20,-28,-20, 28,-24,-17, 6,-22, 11, 7,-18,-13,-22,-18,-15, -7, 2, -9, 7,-20; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='R'; M= -3, -7,-23, -7, 3,-19,-14, 4,-18, 6,-15, -4, -3, -6, 5, 15, -2, -6,-15,-23,-10, 2; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='B'; M= 0, 8,-20, 8, 8,-21,-11, -2,-17, 0,-16,-12, 8,-11, 1, -5, 5, -1,-14,-28,-13, 4; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='F'; M=-13,-14,-22,-22,-17, 24,-21,-10, 0,-17, 2, 1, -7,-23,-14,-12,-14, -9, -5, 4, 12,-14; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='L'; M=-10,-21,-21,-21,-15, -1,-25, -2, 9,-17, 15, 8,-18,-15,-13,-11,-18, -9, 6,-19, 2,-16; D=-4; /I: I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19; /M: SY='L'; M= -8,-18,-16,-20,-12, -3,-22, 3, 2,-15, 18, 12,-16,-22, -6, -6,-18,-10, -2,-21, -1,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='A'; M= 8, -9,-13,-14,-10, -2,-12, -6, -9,-10,-10, -7, -5,-14,-10, -8, 7, 8, -2,-21, -5,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='K'; M= -8, -5,-21, -6, 3,-11,-17,-10,-18, 14,-15, -8, -2,-12, 0, 13, -1, 2,-12,-20, -7, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='V'; M= 3,-21,-15,-25,-18, -6,-23,-11, 9,-17, 10, 6,-17,-22,-14,-12,-12, -7, 11,-24, -6,-18; /M: SY='I'; M= -3,-17,-23,-24,-17, -5,-20,-15, 17,-18, 6, 14,-12,-19,-11,-19, -9, -6, 10,-21, -3,-16; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='N'; M=-11, 19,-21, 6, -4, -9,-11, 5,-12, -6,-18,-11, 30,-18, -2, -5, 3, 0,-18,-29, -9, -3; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='A'; M= 13, -7,-16,-12,-10,-11, -2,-13,-15,-10,-14,-10, -5,-15,-12,-13, 7, 5, -6,-22,-12,-11; /M: SY='E'; M= -7, 4,-25, 7, 19,-23,-18, 4,-20, 3,-18,-12, 2, -9, 6, -1, 3, -2,-17,-29,-12, 11; /M: SY='R'; M= -6, -4,-27, -8, -4,-16,-11, -6,-12, 4,-16, -8, 2,-11, -1, 6, -6, -8,-14,-19, -5, -5; /M: SY='A'; M= 15,-16,-20,-20,-11, -9,-15,-15, -2,-12, -8, -6,-15, -7,-11,-18, -2, -2, 0, -7, -1,-13; /M: SY='A'; M= 8, -9, -6,-11, 0,-18,-16,-17,-12, -8,-12,-11,-10, -6, -8,-13, 4, 4, -4,-29,-18, -4; /M: SY='Y'; M= -9, -9,-23,-10, -4, -6,-17, 2,-14, 2,-13, -6, -6,-18, -4, 1, -2, -1, -9,-17, 7, -5; /M: SY='K'; M= -7, -4,-15, -6, 1,-22,-17, -8,-25, 14,-24,-13, -1, -6, 0, 11, -2, -3,-18,-20,-13, -1; /M: SY='A'; M= 8,-16,-21,-21,-14, -2,-13,-19, -8,-16, -5, -8,-13, -9,-14,-17, -4, -3, -8, 2, -6,-13; /M: SY='E'; M= -9, -7,-27, -8, 8, -9,-22,-11, -7, -4, -6, -6, -5, -6, -3, -4, -8, -8,-11,-23,-10, 1; /M: SY='K'; M= 1, -7,-24, -7, 2,-25, -9,-13,-19, 8,-21,-11, -6, -1, 2, 2, 0, -4,-13,-25,-17, 1; /M: SY='F'; M=-13,-23,-24,-24,-15, 19,-24,-16, -4,-16, 6, -1,-17, -5,-19, -6,-14, -8, -6,-13, 2,-17; /M: SY='Y'; M= 4,-16,-19,-20,-13, 2,-19, -8, -5, -9, 4, -1,-14,-20,-11, -6, -9, -3, -3,-12, 5,-13; /M: SY='R'; M= -7, -9,-24,-12, -2, -6,-18, 2,-20, 6,-15, -7, -3,-17, 5, 15, -3, -5,-15,-18, -2, 1; /M: SY='M'; M=-10, -8,-24,-10, -9,-12,-13, 0, -3, -9, 5, 12, -8,-20, -3, -8,-13,-10, -7,-24, -6, -7; /M: SY='R'; M= -2,-13,-26,-15, -5, -9,-12,-14,-13, 0,-10, -7, -9, -7, -5, 3, -8, -9,-11,-18,-10, -6; /M: SY='E'; M= -2, -6,-23, -6, 7,-15,-18, -7,-16, 4,-12, -9, -7, -8, 2, 2, -1, -1,-13,-19, -3, 3; /M: SY='R'; M=-15,-11,-27,-14, -1, -8,-24, -8,-13, 10,-10, -3, -5,-17, 0, 28, -9, -5,-10,-19, -6, -3; /M: SY='T'; M= -7, -4,-18, -5, -2, -8,-22,-16, -8,-10, -3, -7, -7,-10, -9, -9, 1, 16, -3,-27,-10, -6; /M: SY='R'; M=-15,-13,-27,-13, -5,-16,-13, -6,-20, 11, -8, -5, -6,-21, 3, 37,-11, -8,-15,-20,-10, -4; /M: SY='A'; M= 12, 1,-19, -2, 7,-25, -9, -6,-19, 0,-19,-12, 2,-10, 11, -1, 10, 1,-15,-27,-17, 8; /M: SY='R'; M= -3, -7,-24, -8, 5,-21,-18, -7,-13, 9,-13, -4, -4,-13, 10, 11, -1, -5,-11,-24,-12, 6; /M: SY='L'; M= -6,-20,-21,-21,-13, 3,-25,-11, 11,-17, 13, 8,-19,-23,-13,-16,-12, -5, 9,-15, 9,-14; /M: SY='L'; M=-10,-26,-18,-28,-17, 2,-30,-21, 18,-23, 30, 13,-24,-26,-17,-15,-23, -9, 13,-22, -4,-18; /M: SY='E'; M=-12, 9,-31, 15, 26,-31,-17, -2,-28, 9,-24,-17, 3, 8, 15, 5, -3, -9,-28,-29,-19, 19; /M: SY='D'; M= -5, 8,-22, 11, 6,-23, -6, -4,-19, -7,-19,-15, 4,-13, -3,-11, 5, -1,-12,-32,-16, 1; /M: SY='L'; M= -7,-23,-21,-24,-19, 2,-29,-22, 20,-24, 30, 14,-23,-26,-19,-20,-22, -8, 15,-23, -4,-20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of true positive hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Rap-GAP |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
38 sequences
GARL3_CHICK (Q5ZJY3), GARL3_DANRE (A5PF44), GARL3_HUMAN (Q5VVW2), GARL3_MOUSE (Q3V0G7), RGAP1_DICDI (Q75J96), RGAPB_DICDI (Q54SS8), RGPA1_HUMAN (Q6GYQ0), RGPA1_MOUSE (Q6GYP7), RGPA1_RAT (O55007), RGPA2_HUMAN (Q2PPJ7), RGPA2_MOUSE (A3KGS3), RGPA2_RAT (P86411), RLGPB_HUMAN (Q86X10), RLGPB_MOUSE (Q8BQZ4), RLGPB_RAT (P86410), RPGP1_HUMAN (P47736), RPGP1_MOUSE (A2ALS5), RPGP2_CHICK (Q5ZMV8), RPGP2_HUMAN (Q684P5), RPGP2_MOUSE (Q5SVL6), SI1L1_HUMAN (O43166), SI1L1_MOUSE (Q8C0T5), SI1L1_RAT (O35412), SI1L2_HUMAN (Q9P2F8), SI1L2_MOUSE (Q80TE4), SI1L2_RAT (Q5JCS6), SI1L3_HUMAN (O60292), SI1L3_MOUSE (G3X9J0), SIPA1_HUMAN (Q96FS4), SIPA1_MOUSE (P46062), TSC2_HUMAN (P49815), TSC2_MOUSE (Q61037), TSC2_RAT(P49816), TSC2_SCHPO (Q9UUG9), Y1510_DICDI (Q54EH3), Y1806_DICDI (Q55AN8), Y1809_DICDI (Q54TK4), Y5521_DROME (Q9VB98)» more
|
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1SRQ; 3BRW; 7DL2; 9CE3 |