PROSITE entry PS50059

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50059

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	FKBP_PPIASE
Accession [info]	PS50059
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-1997 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00426
Associated ProRule [info]	PRU00277

Name and characterization of the entry

Description [info]

FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=89;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2652000; R2=0.0146837; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4888.1074219; R2=6.8946986; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=493; H_SCORE=8287; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=357; H_SCORE=7350; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G';  M= -2,  2,-27,  2, -9,-29, 39,-14,-34,-12,-29,-20,  8,-14,-12,-14,  4,-11,-27,-26,-26,-10;
/M: SY='D';  M= -7, 23,-25, 32, 10,-32,-11, -6,-27, -2,-22,-19,  7, -8,  3, -9,  1, -5,-20,-33,-18,  6;
/M: SY='T';  M= -5,-12,-19,-16, -7, -4,-23,-16, -2, -5, -5, -3, -9,-17, -9, -1, -2,  6,  4,-23, -7, -8;
/M: SY='V';  M=  4,-27, -3,-29,-27, -3,-27,-28, 22,-20,  8,  7,-26,-28,-26,-21, -9, -1, 38,-29,-12,-27;
/M: SY='T';  M= -7, -8,-21,-10, -3, -9,-20, -6, -8, -5, -7, -4, -6,-16, -5, -3,  0,  7, -4,-25, -5, -5;
/M: SY='V';  M= -6,-28,-11,-31,-28,  4,-31,-24, 27,-22, 14, 13,-26,-28,-25,-21,-15, -5, 32,-22,  0,-27;
/M: SY='H';  M=-12,  7,-28,  8,  3,-21,-15, 49,-28, -3,-22, -9, 10,-17,  5,  0, -5,-13,-26,-23,  5,  1;
/M: SY='Y';  M=-19,-23,-27,-25,-22, 37,-30,  7,  3,-17,  8,  3,-21,-30,-17,-14,-21,-10, -5, 19, 59,-22;
/M: SY='T';  M= -4, -1,-18, -5,  3,-17,-20,-12,-10, -2,-11, -8, -1,-12,  1, -4,  6, 16, -4,-28,-12,  2;
/M: SY='G';  M=  1,-12,-24,-13,-20,-24, 50,-21,-30,-20,-21,-15, -4,-21,-20,-20, -2,-15,-20,-22,-26,-20;
/M: SY='R';  M= -8,-11,-20,-14, -8,-10,-19,-11,-11,  3,-12, -3, -7,-17, -3,  8, -1,  4, -6,-15, -3, -7;
/M: SY='L';  M= -7,-24,-13,-26,-20,  8,-28,-18, 13,-25, 28, 11,-23,-28,-20,-19,-19, -5, 11,-21,  0,-20;
/M: SY='E';  M=-11,  2,-29,  6, 11,-19,-17, -7,-16, -1,-12, -9, -4,-12,  6, -5, -7, -9,-17,-17, -9,  8;
/I:         MD=-23;
/M: SY='D';  M=-12, 33,-22, 38, 11,-27, -5,  1,-27,  1,-24,-21, 24,-11,  1, -5,  3, -5,-24,-32,-16,  6; D=-4;
/I:         I=-6; MI=0; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-29, -3,-15,-30, 54,-17,-38,-14,-29,-20,  3,-18,-16,-16,  0,-17,-28,-22,-27,-15;
/M: SY='K';  M= -7,  0,-22, -2,  7,-22,-20,-11,-19, 16,-19,-10, -1,-11,  5, 11,  2, 10,-11,-26,-11,  5;
/M: SY='V';  M= -5,-14,-21,-13, -2,-12,-23,-16, -2,  0,  1,  1,-14,-17, -8, -2, -9, -2,  5,-25,-10, -5;
/M: SY='F';  M=-11,-28,-18,-37,-28, 58,-28,-22,  5,-27,  9,  1,-21,-28,-35,-20,-16, -8,  8,  1, 19,-28;
/M: SY='D';  M=-15, 35,-28, 50, 21,-33,-11, -2,-34, -1,-26,-25, 14,-10,  3, -9,  3, -7,-27,-37,-18, 12;
/M: SY='S';  M=  5,  2,-12,  0,  4,-24,  0, -9,-23, -3,-26,-17,  8,-12,  3, -6, 19,  6,-16,-33,-20,  3;
/M: SY='S';  M=  4,  0,-13, -2, -2,-20,  1,-10,-21, -6,-25,-17,  8,-13, -2, -3, 24, 13,-13,-34,-19, -2;
/M: SY='R';  M=-10,-10,-28, -8,  2,-10,-20, -4,-15,  2,-11, -8,-10, -8, -3,  4,-10, -9,-14,-12,  0, -2;
/I:         MD=-16;
/M: SY='D';  M=  1, 12,-20, 15,  8,-25,-10, -4,-21,  3,-20,-14,  6, -9,  4, -4,  4, -2,-15,-27,-14,  6; D=-3;
/I:         MD=-16;
/M: SY='R';  M= -9,  2,-20, -1,  0,-16, -8, -2,-21, 10,-18,-11,  9,-14,  3, 23,  2,  1,-16,-22,-10, -1; D=-3;
/I:         MD=-16;
/M: SY='G';  M= -4,  7,-17,  7,  0,-18, 13, -4,-21,  0,-19,-13, 11,-10, -3, -2,  2, -6,-18,-19,-14, -2; D=-3;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='K';  M= -2,  2,-18,  2, 11,-20,-10, -3,-17, 12,-16, -8,  1, -5, 10,  5,  0, -3,-14,-17,-10, 10; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='P';  M= -5,-12,-25, -7, -1,-20,-11,-14,-15, -6,-19,-13,-11, 45, -7,-12, -4, -3,-18,-21,-19, -7; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M: SY='F';  M= -7,-24,-20,-28,-20, 26,-26,-15,  6,-21, 13,  4,-20,-25,-20,-17,-15, -7,  5, -6, 14,-19;
/M: SY='E';  M= -3, -3,-18, -2,  5,-18,-19,-13,-12, -1,-11, -9, -5,-14, -2, -4,  1,  4, -5,-25,-13,  2;
/M: SY='F';  M=-17,-28,-18,-36,-27, 53,-30,-18,  6,-28, 16,  4,-21,-29,-32,-20,-20, -8,  3,  1, 23,-27;
/M: SY='T';  M= -5, -6,-22, -8,  0,-14,-19,-12,-14,  2,-12, -9, -6, -4, -2,  2,  0,  8,-10,-23, -9, -2;
/M: SY='L';  M= -8,-27,-20,-29,-22,  2,-30,-18, 24,-24, 26, 18,-25,-25,-18,-20,-20, -7, 20,-23, -3,-21;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-28, -3,-14,-29, 52,-17,-37,-14,-29,-20,  4,-18,-15,-16,  3,-15,-27,-23,-27,-15;
/M: SY='Q';  M= -5,  4,-24,  6, 10,-27,-11,  1,-20,  3,-21,-11,  2,-12, 13,  0,  4, -5,-16,-28,-13, 11;
/I:         MD=-23;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-18, -5,-10,-23, 34,-12,-27,-10,-23,-14,  4,-16, -9,-11,  0,-12,-21,-20,-22,-10; D=-4;
/I:         MD=-23;
/M: SY='E';  M= -6,  4,-21,  5, 15,-20,-12,  3,-19,  6,-18,-10,  4, -9, 13,  6,  3, -4,-19,-20, -9, 13; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V';  M= -5,-28,-15,-30,-26,  8,-29,-25, 24,-23, 20, 14,-27,-28,-25,-19,-15, -2, 31,-23, -3,-25;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-25,-35,-26, -3,-36,-28, 38,-28, 15, 14,-20,-12,-19,-28,-17, -9, 22,-23, -4,-27;
/M: SY='K';  M= -8, -8,-26, -5,  6,-26,-20,-12,-20, 15,-23,-12, -7, 13,  4,  6, -6, -7,-19,-25,-15,  3;
/M: SY='G';  M=  6,-10,-28,-11,-19,-29, 62,-20,-36,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-18,-26,-20,-29,-19;
/M: SY='W';  M=-17,-34,-33,-37,-27, 26,-26,-24,  0,-25,  9,  0,-31,-29,-24,-20,-31,-18, -8, 58, 20,-22;
/M: SY='D';  M=-11, 24,-27, 35, 29,-32,-15, -3,-31,  4,-23,-22,  8, -7,  8, -4,  2, -5,-25,-33,-18, 18;
/M: SY='E';  M= -8,  0,-26,  2, 15,-23,-21, -7,-15,  7,-13, -8, -2,-11, 10,  4, -3, -3,-13,-26,-13, 12;
/M: SY='G';  M= 17, -9,-22,-13,-15,-26, 40,-16,-28,-16,-23,-16, -3,-16,-15,-19,  5,-11,-19,-21,-25,-15;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-19,-32,-24,  7,-31,-23, 26,-26, 33, 19,-27,-28,-21,-21,-23, -8, 22,-21, -2,-23;
/M: SY='Q';  M=  0,-13,-24,-14, -2,-16,-18,-13, -4, -5, -3,  0,-12, -8,  3, -7, -7, -6, -5,-22,-11,  0;
/M: SY='G';  M=  1, -6,-25, -9,-12,-23, 24,-15,-25, -9,-17,-12, -1,-18,-10, -8, -1, -7,-19,-22,-20,-11;
/M: SY='M';  M=-10,-18,-22,-25,-16, -2,-21,  6, 11, -8, 13, 43,-16,-20,  0, -8,-18,-11,  4,-20,  2, -9;
/M: SY='K';  M= -8, -1,-14,  1, 10,-28,-18,-10,-28, 23,-27,-14, -2, -6,  6, 11, -3, -7,-20,-27,-15,  8;
/M: SY='V';  M=  1,-17,-19,-18, -9,-12,-23,-20,  5, -1, -3,  0,-17,-17,-12, -6, -8, -4, 16,-26,-12,-11;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-29, -8,-16,-30, 63,-18,-39,-18,-30,-20,  3,-19,-18,-18,  1,-19,-30,-21,-29,-17;
/M: SY='E';  M= -6, 10,-27, 18, 33,-30, -4, -4,-30,  2,-23,-20,  3, -6, 11, -5,  4, -8,-27,-30,-21, 22;
/M: SY='R';  M=-11, -4,-27, -5,  6,-23,-21, -3,-20, 22,-19, -7, -2,-13,  9, 23, -6, -5,-14,-23, -9,  6;
/M: SY='R';  M= -4,-17, -9,-21,-14, -3,-19,-16,-15, -2,-12, -9,-12,-22,-11,  8, -7, -6, -7, -6, -5,-13;
/M: SY='R';  M=-11, -3,-26, -3,  5,-18,-23, -6,-10,  5, -8, -3, -4,-14,  3,  6, -7, -3, -9,-25, -9,  2;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-20,-33,-25,  9,-32,-24, 28,-28, 33, 17,-27,-28,-23,-22,-23, -8, 22,-20,  0,-25;
/M: SY='T';  M= -3, -9,-20,-12,-10, -5,-22,-12,  0, -9, -4, -3, -9,-18, -9,-10, -1,  7,  3,-17,  4,-11;
/M: SY='I';  M= -4,-28,-10,-34,-27, -1,-33,-28, 30,-26, 17, 12,-24,-25,-23,-25,-16, -7, 28,-25, -6,-27;
/M: SY='P';  M= -6, -8,-30, -4,  3,-26,-11,-11,-22, -2,-24,-15, -7, 29, -3, -9, -1, -2,-22,-28,-20, -3;
/M: SY='P';  M= -3,-17,-30,-13, -5,-14,-16,-18,-17,-12,-23,-16,-15, 49,-12,-18, -3, -5,-21,-25,-19,-11;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-29, 16, 20,-28,-14,  6,-28,  2,-24,-18,  5,  6,  7, -3,  0, -9,-27,-31,-16, 12;
/M: SY='Y';  M= -8,-14,-24,-15, -9,  3,-23, -2,  0,-12, 10,  5,-15,-23, -6,-11,-15, -8, -5, -5, 18, -9;
/M: SY='A';  M= 30, -7,-12,-12, -5,-24, 11,-18,-20,-11,-16,-14, -7,-12,-10,-18,  6, -6,-10,-23,-22, -7;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-24,-22, 39,-30, 14, -1,-14,  2,  0,-19,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22;
/M: SY='G';  M= -1, -9,-30, -9,-19,-29, 64,-12,-39,-19,-29,-19,  1,-20,-18,-19, -1,-20,-30,-21,-26,-19;
/M: SY='E';  M=  6,  1,-23,  2, 14,-26,-12, -7,-21,  0,-21,-15, -1,  5,  5, -7,  6, -1,-18,-29,-19,  9;
/M: SY='R';  M= -4, -5,-24, -7,  5,-19,-17, -1,-16,  6,-15, -6, -2,-11,  9, 11, -2, -3,-14,-21, -6,  5;
/M: SY='G';  M=  0, -1,-27, -2,-11,-29, 47,-14,-34,-14,-29,-19,  7,-18,-12,-15,  4,-13,-27,-25,-27,-12;
/M: SY='A';  M=  3,-10,-21,-11, -1,-17,-15, -7,-11, -1, -9, -5, -8,-12,  1, -1, -1, -3, -7,-24,-10, -1;
/I:         MD=-19;
/M: SY='P';  M= -6, -6,-29, -4,  1,-26,  2,-11,-23, -2,-24,-15, -2, 20, -2, -6, -3, -9,-24,-24,-21, -2; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-24, -8, -7,-15, 13,-13,-21,-11,-18,-12, -6,  3, -6,-13, -2,-10,-19,-17,-16, -7; D=-4;
/I:         DM=-19;
/M: SY='K';  M= -4,-11,-24,-12, -7,-16,-11,-10, -8,  3,-10, -3, -8,-13, -3,  1, -7, -8, -5,-20, -8, -6; D=-4;
/I:         DM=-19;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-25,-37,-28,  2,-36,-29, 40,-27, 17, 16,-22,-20,-22,-27,-17, -8, 29,-21, -2,-28;
/M: SY='P';  M= -4,-16,-35, -9, -1,-28,-11,-19,-21, -9,-26,-18,-16, 64,-10,-18, -7,-10,-26,-28,-28, -9;
/M: SY='P';  M= -5,-15,-34,-10, -2,-28,-12,-18,-20, -3,-26,-16,-14, 51, -8,-12, -6, -9,-23,-27,-25, -8;
/M: SY='N';  M=-11, 25,-23, 16, -1,-16, -2, 14,-23, -5,-26,-17, 36,-19, -1, -4,  5, -4,-27,-32,-10, -2;
/M: SY='A';  M= 28, -7,-13,-12, -2,-19, -5,-16,-12, -9,-13,-12, -5,-11, -5,-13, 14,  4, -3,-27,-19, -4;
/M: SY='T';  M= -1, -5,-17, -9, -1,-10,-20,-17, -8, -7, -9, -8, -5, -8, -7,-10,  7, 20, -3,-27,-11, -5;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-20,-28,-19,  7,-29,-19, 17,-25, 42, 19,-27,-28,-18,-17,-26, -7,  9,-21, -1,-18;
/M: SY='V';  M= -6,-24,-15,-28,-23, -2,-27,-24, 20,-18,  8,  9,-20,-24,-20,-17,-13, -4, 23,-24, -5,-23;
/M: SY='F';  M=-18,-26,-22,-32,-23, 55,-30,-14,  2,-22,  8,  1,-19,-28,-30,-16,-19,-10,  0,  6, 29,-24;
/M: SY='E';  M=-11, 17,-29, 27, 34,-30,-17, -3,-28,  8,-21,-19,  3, -6,  9, -2, -2, -9,-23,-30,-16, 21;
/M: SY='V';  M= -4,-27,-14,-29,-24, -2,-31,-27, 27,-19, 11, 10,-25,-27,-24,-17,-12, -3, 36,-28, -8,-25;
/M: SY='E';  M=-11, 11,-27, 17, 30,-25,-19,  6,-25,  4,-17,-15,  4, -8,  9, -1, -2, -5,-23,-30,-13, 19;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-21,-27,-18,  6,-29,-18, 19,-27, 41, 17,-24,-28,-16,-18,-26, -9,  9,-21, -2,-18;
/M: SY='I';  M= -8,-24,-22,-26,-18, -2,-29,-21, 16,-11, 16, 12,-22,-19,-16,-12,-19, -8, 15,-22, -5,-18;
/M: SY='S';  M=  1,  7,-20,  9,  7,-25,  0,-10,-24, -1,-25,-18,  6,-11, -1, -7, 14,  3,-15,-32,-19,  3;
/M: SY='F';  M= -4,-25,-19,-31,-23, 16,-26,-22, 12,-19, 10,  8,-22,-25,-23,-16,-15, -6, 14, -7,  3,-22;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-26,  0,  9,-21,-20, -3,-19, 12,-18,-11,  0, -9,  2,  8, -4, -2,-14,-23,-10,  5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	870 in 829 different sequences
Number of true positive hits	870 in 829 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	123
Number of 'partial' sequences	1

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	87.61 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	4
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	PPIase FKBP-type
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	829 sequences AIP_BOVIN (Q7YRC1), AIP_CHLAE (O97628), AIP_HUMAN (O00170), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	123 sequences AIPL1_BOVIN (Q95MP1), AIPL1_HUMAN (Q9NZN9), AIPL1_MACMU (Q95MP0), » more
UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences	1 sequence FKBP2_SPIOL (P83061)
PDB [Detailed view]	479 PDB 1A7X; 1B6C; 1BKF; 1BL4; 1C9H; 1D6O; 1D7H; 1D7I; 1D7J; 1EYM; 1F40; 1FAP; » more