PROSITE logo

PROSITE entry PS50018


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] RAS_GTPASE_ACTIV_2
Accession [info] PS50018
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-NOV-1995 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE;
27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC00438
Associated ProRule [info] PRU00167

Name and characterization of the entry

Description [info] Ras GTPase-activating proteins profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=195;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=190;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4110000; R2=0.0141000; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12135.0556641; R2=20.0501060; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=503; H_SCORE=22220; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=361; H_SCORE=19373; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M=-16, 31,-30, 43, 20,-40,-14,  4,-32,  4,-26,-18, 12,-10, 23, -2,  0,-10,-30,-32,-16, 22;
/M: SY='W';  M=-14,-23,-34,-24,-16, -7,-24,-20, -9,  4,-13, -7,-20,-22, -9,  6,-22,-16, -8, 37,  5,-12;
/M: SY='D';  M=-12, 27,-23, 35, 13,-28,-15, -7,-28, -3,-22,-22, 10, -9, -2, -9,  7, 12,-19,-35,-16,  6;
/M: SY='E';  M= -6, -3,-24,  0, 15, -8,-21, -8,-13, -7,  0, -6, -8,-14,  3, -9, -8, -9,-14,-22, -8, 10;
/M: SY='L';  M= -9,-21,-19,-23,-18,  8,-28,-13, 10,-21, 23,  8,-21,-25,-17,-16,-15,  5,  7,-13, 12,-18;
/M: SY='A';  M= 38,-11,-11,-19,-10,-16, -4,-19, -7,-13, -4, -7,-10,-13,-10,-19,  8,  1,  0,-22,-17,-10;
/M: SY='R';  M= -3,-10,-24,-13, -8,-13,-10, -7,-13, -1,-14, -7, -4,-17,  0,  9,  1,  0,-10,-17, -2, -6;
/M: SY='V';  M= -4,-13,-22,-18,-19,-13, -5,-20,  6,-18, -8, -3, -6,-12,-17,-19, -3, -5,  7,-28,-15,-20;
/M: SY='L';  M=-13,-29,-21,-31,-22, 25,-30,-15, 14,-28, 37, 14,-27,-30,-23,-19,-27,-10,  6, -9, 15,-22;
/M: SY='V';  M=  2,-28,-15,-30,-25,  1,-27,-26, 24,-23, 21, 12,-27,-27,-24,-21,-15, -4, 30,-25, -7,-25;
/M: SY='R';  M= -9,  9,-21,  5,  0,-20,-13, -5,-23,  9,-22,-15, 14,-15,  1, 18,  8, 10,-17,-30,-14, -1;
/M: SY='L';  M=  2,-18,-20,-25,-19, -2,-23,-20, 17,-22, 20,  9,-14,-23,-17,-20,-14, -6, 11,-23, -7,-19;
/M: SY='F';  M=-17,-26,-21,-34,-22, 53,-28,-15,  1,-24, 11,  7,-19,-27,-23,-16,-19,-10, -2,  1, 20,-19;
/M: SY='D';  M=-15,  6,-27, 12,  7,-18,-20, -3,-19,  1, -8,-10, -1,-16,  4,  7, -8, -6,-17,-24, -5,  4;
/M: SY='H';  M= -5,  2,-21,  2, 11,-21,-14, 18,-24, -1,-22,-13,  6,-11,  6, -2, 12,  6,-18,-32, -7,  7;
/M: SY='R';  M=-15, -3,-28, -1, 16,-20,-21, 12,-24, 10,-13, -9, -1,-14,  9, 24, -7, -7,-21,-25, -8, 10;
/M: SY='H';  M=-12, 11,-25,  6,  3,-16,-13, 35,-23,  1,-23,-11, 21,-18,  5,  1,  0, -7,-25,-27,  4,  2;
/M: SY='L';  M= -2,-21,-21,-23,-13, -3,-23,-16,  4,-11, 23,  8,-20,-24,-11, -2,-19, -8,  1,-20, -6,-13;
/M: SY='L';  M= -3,-19,-20,-21,-10, -2,-25,-19, 11,-21, 22,  8,-18,-20,-12,-18,-12, -2,  6,-23, -6,-12;
/M: SY='Y';  M= -7,-13,-23,-12, -5, -3,-21, 11, -6, -8,  0, -1,-11,-21, -5, -8, -9, -7, -6,-15, 14, -7;
/M: SY='Q';  M= -9,-10,-28, -9,  7,-21,-22, -9, -7, -3, -8, -4, -8,  1, 11, -1, -5, -7,-13,-25,-13,  7;
/M: SY='L';  M=-12,-31,-23,-33,-24, 19,-30,-22, 16,-28, 32, 13,-29,-29,-24,-21,-27,-11, 10, -1,  6,-23;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-20,-34,-26, 27,-31,-23, 20,-28, 28, 13,-26,-29,-27,-21,-22, -8, 16,-13,  7,-26;
/M: SY='W';  M= -7,-13, -2,-17,-11,-16,-20, -9,-22, -3,-19,-12,-12,-21, -4, -7, -9, -5,-17,  9, -3, -7;
/M: SY='N';  M=  1,  7,-18,  1,  0,-18,-13, -7,-10, -5,-13, -5,  8,-14,  0, -8,  5,  7, -8,-30,-14,  0;
/M: SY='L';  M= -2,-26,-17,-29,-21,  3,-25,-17, 19,-22, 30, 24,-26,-26,-16,-18,-20, -7, 16,-22, -4,-19;
/M: SY='L';  M= -3,-20,-21,-28,-21, 15,-25,-19, 14,-24, 17,  7,-13,-24,-21,-20,-15, -7,  7,-16,  1,-21;
/M: SY='D';  M= -8, 16,-23, 21,  8,-28,-12, -5,-24,  5,-23,-12,  7,-11,  7, -1,  7,  2,-18,-32,-15,  7;
/M: SY='K';  M=-11,  1,-26, -1,  9,-23,-19,  1,-23, 20,-18, -8,  3,-13, 10, 17, -5, -4,-19,-24, -9,  9;
/M: SY='E';  M=-11, 13,-30, 24, 57,-31,-19,  0,-31,  9,-21,-21,  2, -1, 18, -1,  0,-10,-30,-31,-20, 38;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-21,-35,-28,  9,-34,-27, 34,-27, 21, 15,-25,-26,-25,-24,-19, -7, 30,-20,  0,-28;
/M: SY='E';  M= -1,  4,-25,  8, 30,-27,-15, -6,-26, 15,-24,-17,  1, -5, 11,  4,  5, -4,-21,-28,-17, 21;
/M: SY='K';  M= -4, -7,-23, -7, -3,-15,-17, -3,-12,  4, -4,  2, -6,-17, -1,  4, -7, -7, -9,-24, -7, -3;
/M: SY='A';  M= 11, -9,-18,-13, -3,-14,-16,-17, -5, -6, -3, -5, -8,-13, -6,-11,  2,  6, -2,-24,-12, -5;
/M: SY='D';  M= -5, 21,-21, 29,  7,-29,-11, -7,-23, -5,-22,-19,  8,-12,  0,-10,  8,  1,-14,-35,-17,  3;
/M: SY='D';  M=-10, 19,-25, 26, 12,-29, -3, -3,-31,  2,-27,-22, 14,-12,  2,  4,  8, -4,-24,-34,-19,  6;
/M: SY='A';  M=  4, -8,-20,-10, -6,-18,-15,-11, -5, -8, -9,  4,-10,  1, -1,-12,  0,  0, -4,-27,-14, -4;
/I:         I=-4; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25;
/M: SY='Q';  M= -9,  8,-22,  3,  3,-22,-17,  6,-16, -3,-13, -6,  9,-14, 16, -2,  3,  6,-18,-28, -9,  9;
/M: SY='T';  M=  1,  6,-16,  6,  3,-18,-14,-13,-16, -8,-13,-14,  2,-11, -4,-10, 14, 20, -9,-32,-14,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-24,-34,-24,  5,-33,-23, 32,-28, 35, 23,-25,-25,-18,-23,-25,-10, 18,-20,  0,-23;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-19,-36,-27, 53,-30,-21,  8,-29, 20,  6,-24,-30,-34,-20,-22, -9,  8, -2, 18,-27;
/M: SY='R';  M=-18, -9,-28,-10, -1,-19,-20, -2,-28, 26,-19,-10,  0,-19,  8, 62, -7, -4,-18,-21,-10, -1;
/M: SY='G';  M=  7,-10,-26,-12,-15,-26, 41,-17,-32,-10,-24,-16, -2,-18,-13, -6,  0,-14,-22,-20,-25,-15;
/M: SY='N';  M= -9, 36,-19, 17, -1,-19, -2,  7,-19, -1,-28,-19, 54,-19, -1, -1, 11,  5,-27,-39,-19, -1;
/M: SY='S';  M=  4, -2,-13, -5, -4,-18, -9,-15,-16,-10,-23,-16,  3,  1, -5,-11, 28, 27, -9,-35,-18, -5;
/M: SY='L';  M= -9,-24,  1,-27,-19, -2,-29,-22,  8,-26, 22,  7,-23,-17,-20,-21,-19, -4,  4,-27, -9,-20;
/M: SY='A';  M= 31,-17,-11,-24,-16,-12,-11,-23,  4,-14,  1, -2,-17,-17,-16,-20,  1, -1, 15,-23,-16,-16;
/M: SY='T';  M=  4, -3,-12, -8, -7,-14,-12,-16, -9,-12,-17,-12,  3,-11, -6,-12, 26, 29, -2,-34,-14, -7;
/M: SY='K';  M=-11, -3,-28, -4,  6,-26,-20, -7,-27, 35,-24, -9,  0,-13, 12, 34, -6, -4,-19,-21,-10,  8;
/M: SY='M';  M=  3,-18, -8,-26,-18, -7,-20,-16, 11,-18,  7, 16,-14,-19,-10,-19, -5, -3,  8,-26, -9,-15;
/M: SY='M';  M= -9,-25,-20,-31,-22,  3,-26,-12, 24,-20, 29, 38,-24,-24,-12,-16,-22, -9, 16,-21, -1,-17;
/M: SY='T';  M= -3,  3,-17,  3, 11,-18,-17,-13,-15, -5,-15,-14,  0, -9, -2, -8, 13, 19, -7,-32,-15,  5;
/M: SY='Z';  M= -8, -9,-21,-12,  2,  1,-19, -8,-10, -9, -6, -1, -6,-15,  3, -8,  1,  1,-10,-20, -3,  4;
/M: SY='Y';  M=-10,-21,  8,-27,-23, 19,-26, -7, -5,-20,  1,  0,-19,-29,-20,-18,-14, -8, -4, -5, 24,-22;
/M: SY='F';  M= -6,-12,-17,-23,-18, 19,-19,-10,  2,-15,  4, 15, -7,-20,-15,-13, -7,  2,  0,-15,  4,-15;
/M: SY='R';  M=-15, -7,-29, -8,  2,-16,-21, -7,-27, 34,-22, -9, -2,-16,  6, 43,-11,-10,-18,-17, -6,  2;
/M: SY='V';  M=  1,-17,-19,-19,-15,-11,-10,-18, -1,-10, -2, -2,-12,-21,-12, -2, -2, -3,  6,-25,-13,-15;
/I:         I=-10; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25;
/M: SY='Y';  M= -9,-15,-23,-16,-12, -5,-23, -9, -5,  0,-10, -5,-13,-11, -9,  5, -5,  1,  1,-15,  7,-13;
/M: SY='G';  M=  9,-10,-26,-12,-18,-28, 57,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20,  2,-16,-24,-20,-28,-18;
/M: SY='N';  M=  4,  9,-20,  2, -1,-23, -4, -5,-17, -5,-16,-11, 12,-15,  6, -7,  5,  0,-17,-28,-16,  3;
/M: SY='E';  M= -4,  9,-23,  7, 12,-24,-15, 10,-22,  2,-19,-12,  8,-11,  9, -1,  4,  4,-20,-29,-10, 10;
/M: SY='Y';  M=-13,-20,-27,-22,-20, 30,-27, 11, -1,-12,  0, -1,-19,-28,-13,-12,-17, -9, -8, 23, 64,-20;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 46, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='Q';  M=-13, -3,-28, -3,  2,-23,-21, 13,-15,  5,-16, -4,  1,-15, 14, 12, -4, -9,-16,-25, -5,  5;
/M: SY='K';  M= -8, -3,-25, -3,  5,-26,-17,  5,-22, 19,-23, -7,  1,-13, 14, 16,  1, -5,-16,-25, -9,  9;
/M: SY='T';  M=  6,-15,-16,-22,-16, -6,-22,-22,  9,-18,  9,  3,-13,-16,-14,-18, -1, 15,  8,-24, -8,-16;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K';  M= -5,  6,-25, 10,  5,-23,-13, -3,-25, 11,-23,-14,  3,-13,  6, 10,  2, -4,-18,-23, -6,  4;
/M: SY='P';  M= -7, -4,-35,  5,  5,-32,-16,-13,-23, -6,-27,-19,-10, 53, -1,-15, -5, -9,-27,-30,-25, -1;
/M: SY='V';  M= -5,-26, -3,-28,-24,  5,-28,-24, 15,-25, 16,  7,-23,-28,-24,-21,-12, -3, 20,-26, -6,-24;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-22,-33,-24,  6,-33,-24, 30,-29, 37, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 20,-21, -1,-24;
/M: SY='R';  M=-12,  2,-27,  2,  4,-23,-17, -5,-23, 21,-18, -9,  5,-15,  8, 23, -5, -7,-19,-25,-11,  5;
/M: SY='E';  M= -9,  0,-26,  3, 12,-23,-15,-10,-14,  4,-15, -9, -3,-12,  4, -1, -4, -5,-11,-26,-14,  7;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-26,-38,-30,  0,-38,-30, 46,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 34,-22, -2,-30;
/M: SY='I';  M= -3,-25,-11,-33,-25, -3,-29,-22, 26,-22, 15, 21,-21,-23,-17,-22,-16, -8, 21,-24, -6,-23;
/M: SY='E';  M= -6,  8,-24, 11, 17,-25,-19, -7,-17, -1,-15,-12,  1, -8, 10, -7,  3,  4,-16,-29,-14, 13;
/M: SY='S';  M= -2, 11, -7, 10,  4,-23, -7,  4,-25, -8,-28,-19, 16,-14,  0, -8, 19,  5,-19,-39,-17,  1;
/M: SY='K';  M= -5,  2,-24,  2,  8,-25,-12, -8,-25, 17,-28,-16,  6, -1,  5, 12,  7,  0,-20,-29,-17,  6;
/M: SY='D';  M=-13, 24,-28, 35, 19,-35,-13, -2,-33, 13,-28,-20, 11, -9, 10,  2,  2, -7,-26,-32,-17, 15;
/I:         I=-3; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25;
/M: SY='S';  M=  3, -6,-16, -6, -3,-13, -8,-14,-17,-12,-25,-17,  1,  6, -6,-13, 24, 15,-12,-33,-17, -5;
/M: SY='C';  M=-14,-23, 37,-31,-28, 22,-20,-20,-17,-27, -8,-10,-18,-33,-31,-23,-14,-11, -8,-16,  4,-28;
/M: SY='E';  M=-11, 13,-30, 23, 52,-32,-19,  1,-30,  9,-21,-19,  2, -2, 22,  0,  0,-10,-30,-30,-19, 37;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-19,-33,-27,  3,-33,-27, 33,-26, 25, 16,-27,-27,-24,-23,-19, -6, 32,-24, -4,-27;
/M: SY='D';  M=-11, 31,-24, 43, 16,-32,-10, -4,-32, -2,-27,-25, 14, -9,  1, -9, 10,  3,-23,-38,-19,  8;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-38, -8,  2,-30,-20,-18,-22,  0,-30,-18,-17, 74, -7,-12,-10,-10,-28,-28,-27, -7;
/M: SY='T';  M=  4, -6,-15, -9, -1,-15,-14,-12, -8, -9, -9, -4, -4,-13,  0,-10, 11, 13, -3,-29,-13,  0;
/M: SY='R';  M=-13, -2,-30, -1, 13,-28,-20, -4,-29, 36,-25,-10,  0,-12, 16, 37, -8,-10,-22,-21,-11, 13;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-25; IM=0;
/M: SY='L';  M= -1,-18,-16,-21,-16,  1,-20,-16, 13,-20, 24, 10,-15,-22,-15,-16,-15, -6,  9,-19, -5,-16;D=-10;
/I:         DM=-25;
/M: SY='E';  M= -9, -8,-28, -4, 15,-20,-23,-12,-14,  6, -7, -7,-12,  4,  1, -2,-11, -9,-13,-26,-14,  7;
/M: SY='E';  M= -1,  0,-27,  4, 14,-27, -9,-12,-24,  1,-23,-18, -3, 13,  0, -7,  3, -2,-21,-29,-21,  6;
/M: SY='N';  M= -6, 14,-21, 10,  1,-23, -1,  8,-26,  1,-28,-17, 23,-15,  1,  2, 12,  0,-23,-34,-15,  0;
/M: SY='E';  M= -7, 14,-25, 24, 40,-29,-14, -2,-29,  4,-24,-22,  6, -4, 12, -4,  9, -3,-25,-34,-20, 26;
/M: SY='D';  M= -2, 18,-21, 21, 21,-27, -8, -3,-26, -1,-26,-21, 15, -9,  5, -6, 14,  1,-22,-36,-20, 13;
/M: SY='V';  M=  2,-26,-13,-27,-23,  0,-25,-25, 20,-21, 17,  9,-25,-27,-23,-19,-10, -1, 29,-27, -9,-23;
/M: SY='E';  M= -9, 13,-27, 18, 35,-29,-15, -2,-29, 14,-25,-19,  9, -6, 13,  4,  3, -6,-26,-31,-18, 24;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-23,  3, 18,-23,-18, -9,-24, 14,-20,-14,  1, -8,  7,  9,  5,  9,-17,-28,-14, 12;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25;
/M: SY='N';  M= -9, 23,-21,  9,  0,-20, -5,  6,-18,  2,-24,-11, 38,-18,  6,  6,  8,  0,-24,-35,-17,  2;
/M: SY='L';  M=-10,-16,-25,-18, -7, -9,-25, -9,  4, -7,  5,  5,-12,-20,  5, -3,-11, -7, -3,-18,  1, -3;
/M: SY='R';  M=  0,  0,-24,  0,  9,-24,-14,  0,-25, 12,-19,-12,  0,-12,  5, 19, -2, -6,-17,-24,-13,  5;
/M: SY='N';  M=-12, 11,-23,  1, -3,-15,-13, 12,-12, -5, -8, -5, 22,-21,  3,  2, -4, -6,-20,-30, -9, -1;
/M: SY='L';  M=-12,-29,-20,-32,-22, 20,-29,-18, 17,-28, 40, 21,-27,-29,-21,-19,-27,-10,  8,-15,  5,-21;
/M: SY='L';  M=-12,-20,-23,-20,-10,  2,-27, -7,  6,-12, 18, 11,-20,-24, -6, -4,-19, -9,  1,-13,  9, -9;
/M: SY='Q';  M= -3,  0,-24, -1,  3,-21,-15, -2,-17,  7,-15, -7,  2,-15, 12,  6,  0, -5,-17,-21, -6,  6;
/M: SY='Y';  M=-14,-25,-27,-28,-23, 13,-28, -3, 13,-16, 11, 16,-24,-27,-13,-15,-22,-11,  5, 13, 32,-20;
/M: SY='T';  M= -3,-16,-13,-22,-19, -3,-24,-20, 11,-15,  8, 11,-16,-20,-16,-14, -1, 18, 18,-27, -7,-17;
/M: SY='E';  M= -8, 16,-24, 20, 25,-27,-14, -5,-27,  6,-23,-19, 10, -7,  7, -2,  8,  4,-22,-33,-17, 16;
/M: SY='K';  M=-12, -3,-28, -1, 14,-25,-21, -7,-25, 32,-23,-10, -2,-12,  9, 30, -8, -9,-16,-23,-12, 10;
/M: SY='F';  M= -8,-28,-19,-34,-26, 35,-29,-22, 13,-27, 20,  8,-23,-28,-29,-21,-19, -8, 13, -9, 10,-26;
/M: SY='F';  M=-14,-32,-25,-36,-27, 33,-29,-24, 10,-27, 17,  5,-27,-29,-28,-21,-25,-12,  6, 18, 15,-25;
/M: SY='E';  M=-10, 11,-25, 17, 19,-26,-15, 17,-28,  2,-24,-16,  8,-10,  7, -2,  6, -2,-23,-33,-10, 12;
/M: SY='A';  M= 29, -7,-15,-14, -5,-22, -5,-16,-16,  5,-16,-11, -6,-11, -4, -2,  7, -1, -6,-22,-17, -5;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-27,-38,-29,  1,-38,-29, 45,-29, 22, 19,-22,-22,-21,-28,-20, -9, 30,-21, -1,-29;
/M: SY='I';  M= -7,-22,-19,-27,-22, 10,-28,-20, 17,-22, 12,  7,-18,-23,-20,-19, -9,  3, 16,-17,  5,-22;
/M: SY='S';  M=  4,  6,-17, -1, -4,-19,  2, -5,-17, -4,-23,-10, 16,-14, -2, -6, 17,  5,-14,-33,-18, -3;
/M: SY='S';  M= 12,  2,-11, -1, -2,-19, -2,-10,-18, -9,-26,-18, 11,-11, -2,-10, 33, 19,-10,-37,-19, -2;
/M: SY='S';  M=  7,-14,-14,-16,-14,-11,-15,-20,  6,-16, -9, -4, -7,-17,-12,-17, 14,  8, 14,-32,-14,-14;
/M: SY='D';  M= -8, 20,-22, 26, 11,-27,-10,  3,-25, -4,-25,-20, 14,-12,  1, -8, 11,  0,-18,-37,-16,  6;
/M: SY='E';  M=-12,  6,-28, 11, 20,-23,-20, -3,-19,  6,-18,-12,  0,-10, 10,  2, -2, -8,-19,-24, -7, 14;
/M: SY='F';  M=-14,-29, -2,-36,-27, 30,-32,-23, 11,-30, 19,  7,-23,-29,-29,-23,-21,-10,  7,-13,  7,-27;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='P';  M= -8,-14,-27,-14, -8,-10,-22,-10, -5, -4,-14, -7,-10,  8, -7,-10, -3,  0, -9,-16,  4,-11;
/M: SY='Q';  M= -5, -3,-25, -3,  5,-25, -2, -9,-17, -5,-18,-10, -1, -6,  6, -8,  1, -3,-15,-27,-18,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-22,-32,-22,  6,-30,-18, 26,-26, 39, 27,-26,-26,-16,-20,-26,-10, 14,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-17,-15, -6,-17, -9,-10,-23, -8,-23, 12,-15, -9, -7,-25, -3, 41,-11, -9,-11,-23,-10, -9;
/M: SY='Y';  M=-12,  4,-26,  6, -4, -3,-15, -2,-19, -8,-18,-15,  2,-19, -4,-10,  0, -5,-19, -2, 10, -4;
/M: SY='I';  M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='C';  M= -7,-22, 46,-30,-26, 10,-27,-20,-14,-26, -4, -9,-20,-33,-27,-24,-13, -9, -5,-22, -1,-26;
/M: SY='H';  M=-11, -3,-28, -3,  2,-23, -9, 24,-27, 13,-24, -7,  2,-15,  8,  8, -5,-12,-23,-21,  3,  3;
/M: SY='C';  M= -3, -9, 27,-15,-18,-14,-22,-21, -8,-20, -7, -9, -8,-25,-18,-20, -3,  0,  0,-36,-18,-18;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-23,-33,-23, 14,-33,-23, 26,-30, 39, 18,-27,-27,-22,-23,-27,-10, 14,-17,  3,-23;
/M: SY='R';  M=-18,-12,-30,-12, -4, -4,-24,  8,-18, 15,-14, -5, -8,-22,  8, 29,-13,-10,-17, -1, 24, -2;
/M: SY='Q';  M=-11, 11,-17, 10, 13,-32,-16,  1,-25, 12,-25,-12, 11,-13, 24,  6, -1, -8,-27,-29,-15, 19;
/M: SY='A';  M=  7,-13, -6,-17,-11,-14,-14,-16, -6, -6, -7, -2,-10,-19, -9, -6,  3,  0,  2,-28,-14,-10;
/M: SY='A';  M= 13,-17,-13,-22,-16, -6,-18,-22,  5,-17, 11,  2,-17,-19,-16,-18, -2,  8, 11,-24,-10,-16;
/M: SY='C';  M= -3,  0,  7, -3,  4,-25, -9,  3,-26, -8,-22,-15,  4,-17,  3,-10,  4, -6,-21,-34,-17,  3;
/M: SY='H';  M= -8, -4,-27, -4, 12,-21,-21, 16,-15,  3,-14, -5, -3,-13,  7,  4, -6,-11,-13,-26, -5,  7;
/M: SY='R';  M=-10, -4,-26, -6,  0,-20,-19,  0,-14, 12,-14, -5,  2,-16,  6, 13, -4, -6,-13,-25, -8,  2;
/M: SY='F';  M=-17,-24,-10,-33,-26, 46,-26,-20, -4,-26,  5, -3,-17,-30,-31,-19,-20,-11, -6, 13, 17,-25;
/M: SY='P';  M=-11,-21,-36,-15, -5,-21,-23,-19, -9,-11,-15,-11,-20, 56,-11,-13,-13,-10,-19,-27,-22,-12;
/M: SY='D';  M= -8, 24,-22, 27, 16,-27, -9, -2,-26, -1,-26,-21, 20,-10,  5, -5, 11,  4,-23,-36,-18, 10;
/M: SY='N';  M= -1, 11,-23,  3, -4,-17,-12,  5,-13, -1,-18,-10, 16,-17, -3, -5, -1, -6,-15,-25, -5, -5;
/M: SY='A';  M= 13, -7,-17,-12, -9,-18, -1,-16,-15, -9,-13,-11, -3, -6, -9, -9,  9,  7, -9,-26,-18, -9;
/M: SY='T';  M= -5, -2,-23, -3,  2,-12,-22, -2, -7,-10, -4, -6, -5,-14, -4,-12, -2,  4, -7,-23, -1, -2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='V';  M= -7, -4,-21, -3, -9,-15,-16,-12,  3,-11, -4,  4, -7,-17, -5,-13, -4, -5,  6,-27,-10, -8; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-18, -5,  4,-14,-16, -6, -9,  6, -9, -5, -2, -9,  6, 11, -1,  4, -8,-17, -7,  4; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='Y';  M= -7,-12,-16,-14, -9,  3,-19, -7,  9,-11,  7,  4,-10,-13, -8,-11, -8,  1,  4, -7, 10,-10; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='C';  M= -5,-10,  2,-11, -7, -7,-13, -9, -7, -5,  0, -3, -7,-15, -6,  2, -3, -2, -4,-19, -8, -7; D=-2;
/I:         I=-4; MI=0; IM=0; DM=-20;
/M: SY='A';  M= 15,-21,-16,-26,-20, -8,-11,-24, 10,-19,  8,  3,-19,-21,-19,-21, -7, -5, 15,-23,-12,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-28,-18,-33,-28, -2,-31,-29, 35,-23, 12, 12,-24,-24,-24,-24,-12, -4, 37,-25, -7,-28;
/M: SY='G';  M=  5, -5,-20, -5,-10,-25, 36,-15,-30,-15,-30,-20,  5,-15,-10,-15, 19, -1,-20,-30,-25,-10;
/M: SY='G';  M=  3,  1,-19, -2, -8,-24, 29,-12,-28,-13,-30,-20, 12,-15, -8,-13, 20,  1,-21,-32,-24, -8;
/M: SY='F';  M= -8,-25,-18,-32,-23, 45,-24,-19,  2,-26, 13,  2,-18,-26,-29,-19,-14, -6,  1, -4, 14,-23;
/M: SY='V';  M= -7,-29,-18,-33,-27, 11,-31,-23, 27,-24, 22, 18,-26,-27,-24,-21,-18, -6, 28,-21, -1,-26;
/M: SY='F';  M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29;
/M: SY='L';  M=-11,-29,-21,-29,-20, 12,-30,-15, 18,-28, 44, 18,-29,-30,-19,-19,-29,-10,  8,-14, 10,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='F';  M=-19,-29,-21,-36,-28, 65,-30,-15,  2,-28, 14,  2,-21,-30,-34,-19,-21,-10,  0,  9, 32,-28;
/M: SY='F';  M=-12,-29,-22,-37,-28, 30,-32,-22, 24,-26, 18, 17,-22,-26,-26,-22,-20, -9, 17,-10, 10,-27;
/M: SY='C';  M=  1,  3, 37,-10,-16,-21, -6,-14,-24,-16,-23,-18, 11,-26,-16,-17,  1, -6,-17,-39,-25,-16;
/M: SY='P';  M= -9,-21,-37,-12, -3,-27,-21,-21,-16,-11,-27,-17,-21, 80,-12,-20,-10, -9,-23,-30,-28,-12;
/M: SY='A';  M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20,  8,  0,  5,-21,-19,-12;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-28,-38,-28,  2,-38,-28, 45,-30, 25, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 26,-20,  0,-28;
/M: SY='L';  M= -6,-30,-17,-31,-25,  5,-31,-25, 27,-26, 30, 16,-29,-29,-24,-21,-21, -6, 29,-24, -4,-25;
/M: SY='S';  M= 10,  7,-14,  1, -3,-21,  6, -8,-20, -9,-28,-19, 18,-13, -3,-10, 27, 10,-15,-36,-21, -3;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M=-14, 12,-28, 18,  8,-25,-16,  9,-28, 11,-24,-14,  6,-14, 10, 10, -2, -8,-23,-23, -2,  7;
/M: SY='A';  M=  7,-12,-16,-15, -5, -9,-15,-14, -2,-13,  5,  4,-11,-16, -6,-14,  1,  4, -1,-26,-11, -6;
/M: SY='F';  M= -7,-17,-20,-22, -8, 38,-22,-15, -9,-18, -2, -7,-12,-20,-21,-15, -6, -6, -7, -6, 10,-12;
/M: SY='N';  M=-12, 22,-25, 17,  1,-24,  0, 10,-24,  1,-24,-10, 26,-17,  0, -2,  0, -8,-25,-33,-14,  0;
/M: SY='I';  M=-11,-29,-26,-34,-25,  7,-35,-21, 34,-28, 29, 18,-24,-25,-19,-24,-24,-10, 19,-15,  8,-25;
/M: SY='I';  M= -8,-26,-22,-31,-24,  0,-33,-24, 28,-21, 19, 13,-21,-23,-18,-16,-16, -3, 23,-23, -4,-24;
/M: SY='D';  M= -7, 17,-23, 25,  5,-27,-11, -9,-22, -7,-24,-20,  8, -2, -3,-13, 11,  4,-16,-37,-18,  0;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-23; IM=0;
/M: SY='E';  M= -7,  7,-22, 11, 13,-25, -2,  5,-25,  4,-21,-13,  4, -9,  9, -1,  3, -7,-21,-24,-12, 11; D=-4;
/I:         DM=-23;
/M: SY='Y';  M= -9, -8, -8,-12, -9,-11,-21, -5, -8, -2,-13, -6, -3,-21, -1, -1, -3, -4, -7,-20,  2, -6;
/M: SY='P';  M= -7,-19,-29,-15, -7,-15,-21,-19, -7,-16, -4, -7,-18, 36,-12,-18, -9, -2,-13,-28,-18,-12;
/M: SY='S';  M= -6, 10,-21, 11,  2,-23,-10, 11,-24, -7,-26,-17, 12, -2,  0, -8, 13,  6,-20,-36,-13, -1;
/M: SY='P';  M=  1, -4,-25, -2,  3,-22,-16,-16,-16, -9,-14,-14, -9, 21, -7,-15,  0,  4,-15,-29,-19, -4;
/M: SY='N';  M= -9,  6,-23,  3,  0,-21,-17,  3,-14, -3,-16, -8,  8,-14,  8,  1,  4,  4,-14,-29, -9,  2;
/M: SY='A';  M=  5,  0,-19, -4, -1,-19,-16,-12, -6, -7,-10, -7, -1,-13,  0,-11,  3,  4, -3,-27,-14, -1;
/M: SY='R';  M=  1, -8,-22, -9,  3,-20,-15, -9,-20, 14,-17,-10, -4,-15,  3, 26, -1, -5,-10,-24,-14,  0;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10,  0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='T';  M= -4, 10,-18, -1, -7,-17, -4,-11,-17, -8,-20,-15, 17, -5, -8, -9, 12, 22,-15,-32,-17, -8;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10,  8,-15,  5,-22;
/M: SY='T';  M=  2, -9,-19,-17,-14,-13,-11,-21, -2, -9, -8, -4, -6,-13,-11,-13,  4, 16,  1,-24,-11,-14;
/M: SY='L';  M= -4,-18,-16,-20,-14,  0,-22,-18,  5,-22, 21,  5,-15,-22,-14,-16, -5,  8,  4,-26, -6,-14;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-25,-36,-27,  2,-35,-25, 39,-27, 24, 23,-23,-23,-19,-25,-21, -9, 27,-21, -1,-26;
/M: SY='A';  M= 35, -6,-10,-13, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-17,-14, -3,-10, -6,-16, 21,  7, -4,-27,-20, -6;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='V';  M= -2,-17,-14,-23,-20, -5,-24,-21, 16,-17,  3,  9,-15,-20,-16,-17,  1, 12, 22,-28, -8,-19;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-23,-35,-26,  4,-35,-26, 35,-29, 31, 19,-25,-25,-21,-25,-23, -9, 24,-21, -1,-26;
/M: SY='Q';  M=-10, -3,-29, -3, 16,-35,-21,  7,-16,  6,-13,  2, -3,-12, 52,  7, -3,-10,-26,-20, -9, 34;
/M: SY='N';  M= -3, 14,-18,  5, -3,-18, -6, 10,-15, -8,-24,-14, 28,-16, -1, -6, 17,  4,-17,-37,-13, -3;
/M: SY='L';  M= -2,-28,-21,-32,-23,  2,-29,-24, 26,-26, 30, 15,-25,-25,-20,-23,-20, -8, 19,-21, -4,-23;
/M: SY='A';  M= 38, -9,-13,-16,-11,-22, 12,-19,-16,-12,-15,-13, -6,-12,-11,-19, 11, -1, -6,-22,-22,-11;
/M: SY='N';  M= -7, 31,-18, 15, -1,-19, -2,  5,-19, -2,-28,-19, 48,-18, -1, -2, 15,  7,-25,-39,-19, -1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.


Total number of hits 57 in 57 different sequences
Number of true positive hits 56 in 56 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 98.25 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.25 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Ras-GAP
Version [info] 7

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
56 sequences

BUD2_CANAL  (Q5A506), BUD2_YEAST  (P33314), DAB2P_HUMAN (Q5VWQ8), 
DAB2P_MOUSE (Q3UHC7), DAB2P_RAT   (Q6P730), GAP1_CAEEL  (Q22720), 
GAP1_DROME  (P48423), GAP1_SCHPO  (P33277), GAP2_CAEEL  (Q8MLZ5), 
GAP2_DROME  (Q8T498), GAPA_DICDI  (O00899), GAPD1_BOVIN (A5D794), 
GAPD1_HUMAN (Q14C86), GAPD1_MOUSE (Q6PAR5), GAPD1_XENLA (A2RV61), 
IQG1_CANAL  (Q5AH02), IQG1_SCHPO  (O14188), IQGA1_HUMAN (P46940), 
IQGA1_MOUSE (Q9JKF1), IQGA2_HUMAN (Q13576), IQGA2_MOUSE (Q3UQ44), 
IQGA3_HUMAN (Q86VI3), IRA1_YEAST  (P18963), IRA2_YEAST  (P19158), 
NF1_HUMAN   (P21359), NF1_MOUSE   (Q04690), NF1_RAT (P97526), 
NFAA_DICDI  (Q55AR6), NGAP_DICDI  (Q54Y08), NGAP_HUMAN  (Q9UJF2), 
RAS4B_HUMAN (C9J798), RASA1_BOVIN (P09851), RASA1_HUMAN (P20936), 
RASA1_RAT   (P50904), RASA2_HUMAN (Q15283), RASA2_MOUSE (P58069), 
RASA2_RAT   (Q63713), RASA3_BOVIN (Q28013), RASA3_HUMAN (Q14644), 
RASA3_MOUSE (Q60790), RASA3_RAT   (Q9QYJ2), RASL1_HUMAN (O95294), 
RASL1_MOUSE (Q9Z268), RASL2_HUMAN (O43374), RASL2_MOUSE (Q6PFQ7), 
RASL3_BOVIN (A6QQ91), RASL3_HUMAN (Q86YV0), RASL3_MOUSE (Q8C2K5), 
RGAA_DICDI  (Q54K32), RME6_CAEBR  (A8WVM4), RME6_CAEEL  (Q9GYH7), 
RME6_DROME  (Q9VZ08), RME6_DROPS  (Q29HW3), SYGP1_HUMAN (Q96PV0), 
SYGP1_MOUSE (F6SEU4), SYGP1_RAT   (Q9QUH6)
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

IQG1_YEAST  (Q12280)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

RLMH_PROM5  (A2BWR4)

		
PDB
[Detailed view]
27 PDB

1NF1; 1WER; 1WQ1; 3BXJ; 3FAY; 5CJP; 6OB2; 6OB3; 6V65; 6V6F; 7MOC; 7MP5; 7MP6; 7PGP; 7PGQ; 7PGR; 7PGS; 7PGT; 7PGU; 7R03; 7R04; 8BOS; 8E20; 8EDL; 8EDM; 8EDN; 8EDO
» more