PROSITE entry PS50017

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

PURL [info]	https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS50017
Entry name [info]	DEATH_DOMAIN
Accession [info]	PS50017
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-1995 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50017
Associated ProRule [info]	PRU00064

Name and characterization of the entry

Description [info]

Death domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=85; TOPOLOGY=LINEAR;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=80;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6073000; R2=0.0231000; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4151.3764648; R2=5.2062349; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=342; H_SCORE=5932; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=256; H_SCORE=5484; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; I=-20; D=-20;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -2, -9,-23, -9, -1,-18,-16,-13,-12, -4,-13, -9, -5,  6, -3, -3,  2,  1,-11,-28,-16, -4;
/M: SY='E';  M= -2, -5,-16, -3,  7,-18,-16,-13,-13, -2, -4, -7,-10,-15, -4, -7, -8, -8, -9,-26,-14,  2;
/M: SY='Y';  M= -3,-11,-22,-13, -1, -4,-20, -7, -5, -3, -6,  0, -9,-16, -4, -4, -4, -3, -4,-16,  4, -4;
/M: SY='V';  M= -4,-16,-23,-18,-13,-10,-24,-16,  6, -7,  6,  4,-14,-21, -8,  1,-12, -7,  7,-23, -8,-12;
/M: SY='Y';  M=-13,-17,-26,-18, -7,  4,-25, -2, -1,-13,  5,  6,-16,-15, -2,-11,-15, -8, -8, -5, 11, -5;
/M: SY='A';  M=  5, -6,-21, -8, -1,-17,-15,-10,-11, -1, -3, -4, -5,-16,  2,  0, -4, -4, -9,-23,-12,  0;
/M: SY='V';  M= -8, -6,-10, -8,-16, -9,-24,-17,  6,-16,  0, -2, -7,-23,-17,-17, -7,  1, 11,-29, -8,-17;
/M: SY='I';  M=  4,-24,-20,-29,-21,  2,-24,-23, 15,-20,  8,  7,-21,-11,-20,-21,-11, -6, 15,-20, -6,-22;
/M: SY='E';  M=  0, -1,-10,  0,  3,-23,-10, -4,-23, -6,-18,-15, -1, -5, -4, -6,  0, -7,-18,-30,-18, -2;
/I:         MD=-30;
/M: SY='D'; D=-5;  M= -9, 12,-23, 14,  4,-23, -3, -7,-23,  1,-19,-15, 10,-15, -3, -1,  2, -3,-17,-30,-17,  0;
/I:         MI=-30; MD=-30; IM=-30; DM=-30; I=-10;
/M: SY='H'; D=-5;  M= -8, -3,-23, -3, -3,-18,-12, 10,-12, -6,-14,  0, -1, -6, -3, -8, -2, -6, -9,-29, -9, -4;
/I:         MD=-30; DM=-30;
/M: SY='L'; D=-5;  M=  2,-19,-18,-21,-14, -7,-21,-21,  6,-15,  7,  2,-18, -6,-15,-16, -7,  1,  7,-25,-11,-15;
/I:         DM=-30;
/M: SY='G';  M= -2,-14,-29,-14,-14,-21, 23,-13,-19,-19,-13,-10, -8, -5,-15,-19, -7,-15,-18,-22,-20,-16;
/M: SY='A';  M=  1, -3,-14, -2,  1,-15,-15,-12,-14, -6, -7, -8, -5,-15, -3, -9,  0, -1,-10,-27,-13, -1;
/M: SY='D';  M=-11, 15,-24, 22, 10,-28,-14, -5,-25,  5,-23,-17,  6,-12,  6,  5,  5,  0,-17,-32,-15,  7;
/M: SY='W';  M=-12,-37,-44,-38,-28,  7,-19,-29,-16,-19,-17,-17,-37,-28,-20,-20,-33,-25,-23,124, 23,-20;
/M: SY='R';  M= -7, -6,-20, -8,  1,-24,-19,-10,-25, 21,-22,-11, -4, -4,  6, 23, -4, -2,-17,-24,-14,  2;
/M: SY='E';  M=-10, -5,-28, -3, 13,-22,-12, -2,-19,  6,-10, -6, -5,-13,  9,  7, -9,-12,-19,-23,-11, 10;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-19,-33,-23, 29,-30,-21, 15,-29, 36, 14,-27,-30,-26,-20,-26, -9, 10,-12,  8,-23;
/M: SY='A';  M= 31,-13,-15,-20,-13,-18,  2,-19, -7,-12, -9, -3,-12, -9,-12,-19,  3, -4,  1,-21,-19,-13;
/M: SY='R';  M=-14, -6,-28, -7,  0,-21,-11, -4,-26, 18,-20, -9,  1,-13,  5, 39, -6, -6,-20,-23,-13, -1;
/M: SY='E';  M= -2, -1,-24, -1, 17,-17,-17, -5,-18,  5,-14,-10, -2,-11,  8,  1, -1, -6,-16,-22, -9, 12;
/M: SY='L';  M=-10,-20,-20,-23,-18,  4,-25,-10, 14,-23, 32, 18,-17,-27,-15,-16,-22, -9,  7,-23, -2,-17;
/M: SY='G';  M= -7,  2,-29,  2,  2,-30, 20, -2,-32,  1,-27,-15,  6,-15,  3, -3, -1,-14,-28,-24,-19,  3;
/M: SY='F';  M=-12,-27,-21,-30,-24, 21,-30,-15, 15,-20, 18, 11,-23,-28,-22,-13,-20, -8, 14, -9, 15,-23;
/M: SY='S';  M= -4,  1,-24,  2,  4,-22, -7, -7,-23,  1,-26,-16,  3,  3,  2, -5, 10,  2,-20,-28,-13,  2;
/M: SY='E';  M=-13,  4,-20, 12, 18,-25,-20, -1,-23, -1,-19,-15, -3, -1,  4, -4, -5,-10,-19,-29,-12,  9;
/M: SY='H';  M= -5,  1,-24,  4,  6,-18,-12,  7,-21, -3,-13,-11,  0,-15,  0,  0, -1, -5,-17,-25, -6,  2;
/M: SY='E';  M= -8,  6,-27, 11, 19,-26,-18,  0,-22,  9,-15,-11, -1,-11, 10,  1, -5, -9,-18,-27,-12, 15;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-27,-35,-26, -3,-36,-27, 40,-26, 17, 17,-20,-20,-16,-26,-17, -9, 25,-21, -2,-24;
/M: SY='D';  M=-16, 21,-28, 28, 17,-25,-15,  3,-31,  7,-24,-19, 13,-13,  7,  8, -3, -9,-26,-30,-13, 11;
/M: SY='E';  M=-12, -2,-22,  1, 13,-17,-19,  4,-22,  4,-16,-10, -1,-15, 13, 10, -2, -7,-21,-23, -6, 11;
/M: SY='I';  M= -7,-25,-25,-32,-24,  5,-31,-24, 28,-26, 17, 11,-18,-16,-20,-24,-18, -8, 16,-19, -2,-24;
/M: SY='E';  M= -4,  0,-23,  0, 18,-22,-16, -6,-22, 10,-18,-11,  0, -9,  7, 12,  4,  3,-16,-27,-15, 12;
/M: SY='H';  M=-10, -6,-14,-10,-10, -7,-20,  5, -6,-13, -3,  0, -2,-21, -6, -8, -5, -1, -5,-28, -4, -9;
/M: SY='E';  M=-13, 17,-29, 22, 25,-32,-15,  2,-28,  7,-24,-17, 12, -4, 18,  6,  0, -9,-29,-31,-17, 21;
/I:         MD=-20;
/M: SY='N'; D=-3;  M= -5,  9,-16,  2, -4, -7, -3,  1,-15, -2,-19,-12, 18,-15, -3, -3,  8,  1,-16,-20, -3, -4;
/I:         MD=-15;
/M: SY='P'; D=-3;  M= -3,-14,-24,-11, -4,-17, -6,-14, -8,-11, -8, -6,-12, 16, -6,-14, -7, -8,-11,-20,-16, -7;
/I:         MD=-10;
/M: SY='R'; D=-3;  M= -5,  0,-18, -3,  1,-16, -8, -1,-14,  5,-12, -6,  5, -7,  9, 14, -2, -5,-15,-17,-10,  3;
/I:         MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; I=-5;
/M: SY='D'; D=-3;  M= -6, 10,  3, 12, -2,-14, -3, -7,-20, -8,-17,-15,  6,-13, -7,-10,  4, -3,-14,-25,-13, -4;
/I:         DM=-15;
/M: SY='L'; D=-3;  M= -3,-12,-15,-13,-11, -3,-12,-14,  2,-17, 16,  6,-13,-18,-12,-14, -9,  0,  1,-19, -6,-11;
/I:         DM=-20;
/M: SY='R';  M=  1,-13,-16,-15, -7,-16,-14,-13,-13, -2,-11, -8,-11, -8, -5,  2, -5, -5, -9,-21,-10, -8;
/M: SY='E';  M= -6,  9,-16, 14, 27,-27,-14, -4,-26,  3,-22,-16,  3, -8, 11, -4,  8, -3,-22,-33,-19, 19;
/M: SY='Q';  M=  1, -7,-28, -6,  9,-31,-16, -5,-19,  3,-20, -9, -7, 14, 21,  2, -1, -8,-23,-23,-18, 14;
/M: SY='S';  M=  6, -7, -9,-10, -5,-19,-14,-10,-13, -2,-15, -8, -4,-15, -1, -6,  9,  6, -4,-29,-13, -3;
/M: SY='R';  M=-12,-11,-23,-15,-11,  0,-22, -1, -7,  1, -9, -1, -5,-21, -5,  8, -7, -4, -4,-15,  7, -9;
/M: SY='Q';  M=  9, -2,-20, -5,  7,-22,-11, -4,-14, -3,-14, -7, -1,-11, 14, -6,  7, -1,-14,-24,-12, 11;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-19,-28,-19, 10,-26,-16, 15,-24, 34, 22,-24,-26,-16,-17,-21, -5,  8,-20,  0,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M= -5,  4,-24,  3,  7,-23,-15, -5,-20, 10,-16,-11,  4,-14,  7, 14, -2, -5,-16,-26,-14,  5;
/M: SY='A';  M=  2,-12, -7,-17,-11,-12,-21,-18,  1,-13,  1, -2, -9,-19,-11,-12, -6, -3,  0,-27,-12,-12;
/M: SY='W';  M=-20,-39,-48,-40,-30, 14,-21,-29,-19,-21,-18,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-29,-28,141, 30,-21;
/M: SY='R';  M= -7,-13,-24,-14, -7,-12,-15, -4, -7, -4, -6, -2,-10,-20, -2,  1, -7, -6, -4,-19, -1, -6;
/M: SY='Q';  M= -3,  3,-25,  2,  5,-26, -5,  0,-23,  1,-19,-11,  4,-13, 11,  4,  1, -3,-20,-25,-14,  7;
/M: SY='R';  M= -7, -8,-24, -9, -1,-18,-17,  1,-18,  6,-12, -6, -3,-17, 10, 19,  0, -2,-15,-22, -5,  3;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-26, 10, 15,-22,-13, 10,-25, -1,-21,-15,  3, -6,  4, -5,  3, -1,-22,-27, -6,  8;
/I:         MD=-10;
/M: SY='G'; D=10;  M= -4, -6,-21, -6, -8,-19, 27,-10,-25,  0,-19,-11,  0,-13, -7,  3, -2,-11,-18,-14,-16, -8;
/I:         MI=-10; MD=-10; IM=-10; DM=-10; I=-5;
/M: SY='K'; D=-5;  M= -7, -1,-20,  0,  9,-19,-10,  4,-19, 13,-17, -8,  0, -9,  6, 12, -2, -7,-14,-19, -8,  7;
/I:         DM=-10;
/M: SY='N';  M= -5, 10,-23,  7,  9,-22, -8,  4,-21,  1,-22,-14, 15,-13,  2,  0,  6, -1,-20,-31,-14,  4;
/M: SY='A';  M= 23, -2,-17, -5, -2,-22, -3, -7,-17, -7,-13,-11, -4,-12, -5,-11,  5, -4, -9,-24,-16, -4;
/M: SY='T';  M= 10,  1,-12, -9, -8,-14,-13,-17,-12, -7,-13,-11,  3,-11, -8,-10, 17, 32, -4,-29,-13, -8;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-14,-21,-18, -1,-22,-15,  8,-18, 12,  8,-22,-21,-15,-16,-15, -6, 11,-20,  0,-18;
/M: SY='D';  M= -8, 15,-28, 21, 19,-33, -6, -2,-29,  1,-24,-17,  7, -4, 14, -5,  1, -8,-27,-29,-19, 17;
/M: SY='N';  M=  0,  5,-18,  0, -6,-16,-13, -4,-12, -4,-13,-10,  8,-17, -7, -2,  3,  5, -6,-30,-13, -7;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 46, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='I';  M= -6,-20,-22,-23,-21,  2,-15,-19, 11,-22, 11,  7,-18,-24,-19,-20,-14, -7, 10,-18,  0,-21;
/M: SY='E';  M=  0, -1,-23, -2, 11,-24,-11, -7,-19,  5,-16,-10,  0,-12, 10,  4,  2, -2,-16,-26,-15, 10;
/M: SY='A';  M= 18,-12,-11,-16,-14,-15, -5,-20, -6,-12, -4, -5,-12,-18,-15,-17, -1, -2,  4,-24,-16,-14;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-20,-31,-21, 15,-30,-20, 19,-30, 47, 19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,  9,-18,  2,-21;
/M: SY='R';  M=-10, -4,-20, -6,  3,-20,-18, -4,-25, 19,-21,-11,  1,-16,  6, 31, -3, -3,-18,-22, -9,  2;
/M: SY='K';  M= -9,  3,-26,  5, 11,-26,-18, -7,-23, 23,-21,-11,  1,-12,  8, 15, -4, -7,-16,-26,-13,  9;
/M: SY='I';  M=  0,-19,-14,-27,-20, -5,-23,-18, 18,-20, 13, 17,-14,-21,-13,-20,-12, -6, 10,-24, -7,-18;
/M: SY='N';  M= -9, 17,-27, 16,  9,-30, 10, -2,-30,  1,-27,-18, 19,-14,  7, -3,  2,-10,-29,-30,-20,  8;
/M: SY='R';  M=-15,-18,-18,-19,-10, -8,-24, -9, -9,  3,  8,  4,-13,-25, -4, 27,-18,-10, -7,-22, -7, -9;
/M: SY='S';  M= -2, -4, -9, -6, -4,-20,-10, -5,-19, -6,-16,-10, -1,-11, -5, -2,  2, -2,-14,-30,-15, -6;
/M: SY='D';  M=-12, 25,-26, 34, 10,-30, -1, -5,-31, -3,-24,-22, 13,-13, -2, -6,  2, -5,-24,-34,-19,  3;
/M: SY='I';  M=  2,-24, -3,-31,-24, -5,-28,-26, 19,-25, 13,  7,-20,-23,-20,-25,-13, -4, 15,-25, -9,-24;
/M: SY='V';  M= 14,-22,-13,-27,-20, -4,-19,-22, 13,-18, 13,  9,-22,-22,-19,-19, -9, -3, 20,-23,-10,-19;
/M: SY='E';  M=-13, 13,-28, 19, 31,-27,-17,  3,-27, 10,-20,-14,  6, -8, 11,  8, -2, -8,-25,-30,-15, 20;
/M: SY='E';  M= -7,  0,-21,  0,  2,-15,-16, -9,-10, -2, -4, -3, -1,-17, -3, -5, -2, -3, -8,-29,-12, -1;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-23,-33,-24,  8,-32,-23, 28,-28, 30, 18,-24,-25,-20,-23,-21, -8, 18,-20,  0,-23;
/M: SY='E';  M= -8, -7,-18, -6, 11,-16,-22, -6,-15,  2, -6, -5, -8,-15, 10,  1, -7, -7,-16,-21, -7, 11;
/M: SY='E';  M= -4,  6,-24,  8,  9,-23, -2, -7,-25,  2,-23,-17,  5,-12,  0, -1,  6, -1,-19,-27,-14,  4;
/M: SY='A';  M= -1, -7,-21,-10, -6, -7,-12, -9, -6, -9, -6, -1, -4,-14, -8, -9, -3, -3, -6,-21, -5, -8;
/M: SY='V';  M= -1,-14,-19,-17,-12, -9,-16,-18,  5,-16,  3,  1,-10,-19,-10,-15, -2,  2,  6,-27,-11,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_02 which contains 573'230 sequence entries.

Total number of hits	100 in 100 different sequences
Number of true positive hits	99 in 99 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	1
Number of false negative sequences	52
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	99.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	65.56 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	DEATH
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences	99 sequences AKD1A_HUMAN (Q495B1), AKD1B_HUMAN (A6NHY2), AKD1B_MOUSE (Q14DN9), » more Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences	52 sequences EDAD_HUMAN (Q8WWZ3), EDAD_MACFA (Q95LN5), EDAD_MOUSE (Q8VHX2), » more
UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences	1 sequence RPC_BP163 (P15238)
PDB [Detailed view]	58 PDB 1D2Z; 1DDF; 1E3Y; 1E41; 1FAD; 1ICH; 1IK7; 1NGR; 1WMG; 1WXP; 1YGO; 2GF5; » more