PROSITE entry PS01124

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS01124

Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	HTH_ARAC_FAMILY_2
Accession [info]	PS01124
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-NOV-1995 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00040
Associated ProRule [info]	PRU00593

Name and characterization of the entry

Description [info]

Bacterial regulatory proteins, araC family DNA-binding domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=99;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=94;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5162; R2=0.0218; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=321; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=229; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M=-10, 11,-25, 14, 13,-25,-12,  2,-25,  4,-22,-15,  7,-13,  8,  4,  0, -7,-23,-25,-10, 10;
/M: SY='R';  M= -7, -1,-26, -1,  5,-24,-15, -3,-24, 15,-19,-11,  0,-11,  8, 20, -3, -6,-18,-22,-11,  5;
/M: SY='V';  M=  8,-24,-17,-29,-22, -2,-24,-25, 21,-21, 15,  9,-22,-22,-20,-22,-11, -3, 22,-23, -8,-22;
/M: SY='V';  M= -7,-18,-10,-21,-13, -7,-25,-14,  4,-11,  5,  4,-15,-23,-10, -5,-11, -2,  6,-23, -5,-13;
/M: SY='Q';  M= -2, -1,-20, -3,  2,-23,-10,  1,-19,  0,-14, -7,  0,-15,  7,  1, -1, -4,-16,-26,-12,  3;
/M: SY='Y';  M=-12,-25,-25,-28,-22, 20,-27, -9,  3,-16,  5,  1,-22,-27,-18,-13,-20,-10, -2, 19, 30,-21;
/M: SY='I';  M= -8,-28,-20,-35,-26,  2,-34,-24, 34,-27, 24, 21,-23,-23,-19,-25,-20, -9, 22,-21, -2,-25;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-25,  6, 20,-21,-19,  2,-19,  1,-13,-11,  0,-11,  7,  2, -1, -5,-17,-28,-12, 13;
/M: SY='E';  M= -3,  6,-24,  8, 12,-22,-10, -4,-23,  3,-18,-14,  4,-12,  4,  1,  2, -3,-18,-28,-15,  7;
/M: SY='N';  M=-12, 21,-22, 17,  3,-23,-10, 20,-24, -1,-23,-14, 26,-17,  3,  0,  2, -4,-24,-34,-10,  2;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-24,-26,-17,  7,-28,-16, 14,-22, 20, 10,-23,-14,-17,-19,-20, -9,  5,-14,  6,-18;
/M: SY='E';  M=  3,  0,-20,  0,  9,-24,-12, -1,-21,  1,-18,-11,  0,-10,  9, -3,  5, -1,-17,-27,-13,  9;
/M: SY='R';  M= -9,  4,-24,  5, 13,-26,-15,  4,-26, 12,-22,-12,  5,-12, 14, 16,  1, -5,-22,-27,-12, 12;
/I:         MD=-25;
/M: SY='P';  M= -4, -1,-25,  1,  5,-23, -6, -7,-22,  4,-23,-15,  1,  7,  0,  1,  3, -3,-20,-26,-17,  1; D=-5;
/I:         I=-7; MI=0; IM=0; DM=-25;
/M: SY='W';  M=-13,-31,-27,-34,-26, 10,-27,-25,  8,-24, 10,  2,-28,-26,-22,-20,-26,-14,  2, 33,  9,-23;
/M: SY='T';  M= -3,  3,-17, -1, -1,-18,-12, -5,-20,  1,-20,-13,  7,-13, -2,  3, 12, 15,-13,-30,-12, -2;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-22,-32,-23,  4,-31,-24, 25,-26, 30, 16,-27,-24,-20,-21,-23, -8, 17,-16, -2,-23;
/M: SY='E';  M=  0, 12,-24, 15, 17,-27, -9, -5,-26,  3,-21,-17,  6, -8,  3, -2,  4, -4,-20,-30,-18, 10;
/M: SY='D';  M= -6, 11,-22, 14,  8,-24,-14, -6,-20,  1,-18,-13,  5,-12,  4,  0,  3, -3,-16,-30,-15,  5;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-18,-32,-26,  9,-32,-24, 27,-26, 26, 16,-27,-28,-24,-21,-20, -6, 27,-21, -1,-26;
/M: SY='A';  M= 38,-11, -1,-19,-12,-19, -3,-20,-11,-12,-11,-10,-10,-13,-12,-20, 10,  2,  0,-24,-20,-12;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-25, 13, 16,-27,-10, -1,-26,  6,-21,-15,  6,-11,  9,  5,  2, -6,-22,-28,-16, 12;
/M: SY='H';  M= -4, -4,-20, -5,  5,-17,-17,  9,-16, -2,-11, -6, -3,-15,  5, -2, -3, -6,-15,-24, -4,  4;
/M: SY='V';  M=  5,-21,-11,-26,-19,  6,-21,-19,  8,-20,  9,  4,-19,-23,-19,-19, -8, -3, 11,-19, -2,-19;
/M: SY='G';  M= -4, -5,-15, -9,-13,-15, 14, -3,-23,-13,-18,-11,  2,-20,-10,-12, -3,-11,-20,-21, -9,-13;
/M: SY='M';  M= -7,-23,-14,-28,-22,  3,-26,-15, 17,-18, 16, 18,-22,-25,-17,-17,-15, -3, 17,-18,  4,-20;
/M: SY='S';  M=  7,  1,-12, -1, -2,-19,  0, -8,-20,-10,-27,-18, 10,-11, -2,-10, 33, 20,-11,-37,-18, -2;
/M: SY='P';  M= -7, -9,-29, -5,  9,-23,-18,-11,-18,  5,-17,-12,-10, 15,  1,  3, -7, -8,-17,-25,-17,  3;
/M: SY='R';  M= -5, -9,-23,-12, -6,-11,-15,-10,-16,  1,-17,-11, -2,-17, -2, 13,  4,  1,-11,-11, -6, -6;
/M: SY='Y';  M= -6, -9,-18,-12,-10, -5,-20, 10,-10, -9, -7, -4, -5,-20, -5, -5, -1,  5, -8,-16, 11,-10;
/M: SY='L';  M=-11,-30,-20,-32,-23, 21,-30,-20, 18,-29, 38, 16,-27,-29,-23,-20,-26,-10, 11,-14,  6,-23;
/M: SY='R';  M= -8, -5,-22, -7,  2,-19,-18,  8,-20,  9,-18, -7, -1,-16, 12, 15, -1, -5,-17,-20, -1,  5;
/I:         I=-10; MI=-35; MD=-35; IM=-35;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-26, -5,  3,-22,-16,  0,-22, 17,-19, -9,  1,-14,  5, 24, -4, -5,-16,-24,-10,  2; D=-6;
/I:         DM=-35;
/M: SY='L';  M= -8,-15,-22,-18, -9,-10,-21, -8, -2, -5,  8,  6,-12,-21, -3,  4,-13, -7, -3,-22, -6, -7;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-12,-35,-26, 51,-29,-20,  3,-29, 17,  5,-22,-30,-32,-20,-20, -9,  2, -3, 17,-26;
/M: SY='R';  M=-10, -2,-28, -1, 12,-25,-16, -4,-26, 23,-21,-10,  0,-13, 12, 25, -5, -8,-21,-23,-12, 11;
/M: SY='K';  M= -2,  2,-24,  2, 11,-26,-14, -5,-24, 16,-22,-12,  2,-11, 13, 13,  3, -2,-18,-25,-14, 11; D=-6;
/M: SY='E';  M= -2, -6,-22, -6,  7,-13,-19,  1,-10, -7,-10, -7, -6,-14,  2, -9, -1, -3, -8,-21, -3,  3;
/M: SY='T';  M= -3, -8,-17,-13,-11, -7,-14,-13, -5,-10, -2, -2, -6,-19,-10, -9, -2,  7, -2,-23, -5,-11;
/M: SY='G';  M= -1, -7,-25,-10,-17,-23, 40,-16,-28,-16,-21,-15,  1,-19,-16,-15,  1, -8,-20,-23,-23,-16;
/I:         I=-7; MI=-30; MD=-30; IM=-30;
/M: SY='M';  M= -4,-12,-14,-16, -9, -8,-18, -8,  3, -7,  2,  7,-10,-15, -3, -6, -6,  0,  3,-18, -4, -7; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-14, -4, -5,-18, -4,-14,-18, -7,-22,-15,  6, -6, -6, -9, 19, 22,-11,-32,-17, -6; D=-6;
/M: SY='P';  M=-10,-25,-26,-25,-16,  8,-26,-20,  1,-19, -2, -3,-22, 18,-20,-19,-15, -9, -3,-16, -3,-20;
/M: SY='N';  M= -5, -3,-19, -8, -5,-17, -8, -6,-15,  2,-13, -4,  3,-17, -1,  2, -1, -3,-13,-26,-12, -4;
/M: SY='Q';  M= -3,  4,-25,  4, 16,-29,-11,  0,-24,  7,-21,-12,  5,-10, 21,  7,  3, -5,-23,-26,-15, 18;
/M: SY='Y';  M=-16,-25,-31,-27,-21, 15,-29, -4,  7,-17,  5,  3,-23,-27,-12,-15,-23,-13, -3, 28, 37,-18;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-23,-31,-22,  4,-32,-21, 26,-24, 27, 16,-23,-25,-17,-17,-21, -8, 17,-19,  1,-22;
/M: SY='R';  M=-10, -5,-23, -9, -2,-13,-18, -3,-12,  3, -6, -1,  1,-18,  2, 15, -5, -1,-11,-25, -9, -1;
/M: SY='D';  M= -7,  9,-25, 10, 10,-25,-14, -1,-22,  5,-19,-13,  7,-13,  9,  8,  1, -4,-19,-28,-13,  8;
/M: SY='R';  M= -8,-18,-17,-20,-12, -8,-22,-12, -6, -5, -5, -2,-14,-22, -6,  5,-11, -6, -3, -6, -1,-10; D=-6;
/M: SY='R';  M=-18, -9,-30, -9,  2,-22,-20, -1,-29, 32,-21, -9,  0,-18, 11, 62,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='M';  M= -8,-26,-21,-32,-22,  3,-28,-16, 25,-22, 29, 31,-24,-24,-14,-18,-22, -9, 16,-20, -1,-19;
/M: SY='E';  M= -5, -2,-17, -2,  6,-20,-14, -5,-16, -3,-13, -9, -1,-13,  3, -2,  2, -1,-13,-29,-14,  3;
/M: SY='R';  M=-10, -5,-21, -6,  2,-16,-18,  4,-18,  7,-13, -5, -3,-17,  6,  8, -7, -8,-16,-20, -1,  2;
/M: SY='A';  M= 36,-13,-13,-21,-13,-17, -4,-21, -3,-13, -6, -6,-11,-13,-12,-20,  6,  0,  4,-22,-17,-13;
/M: SY='R';  M=  0,-10,-22,-13, -3,-18,-17, -4,-16, 10,-10, -5, -6,-17,  2, 18, -7, -7,-10,-22,-10, -3;
/M: SY='R';  M= -3, -5,-23, -7,  1,-17,-17, -4,-13,  4, -8, -4, -3,-16,  5,  7, -5, -6,-11,-22, -8,  2;
/M: SY='L';  M= -8,-13,-18,-13, -7, -3,-23,-12,  0,-15, 15,  5,-16,-22, -9,-12,-16, -9, -3,-19, -2, -8;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-20,-30,-20,  8,-29,-20, 21,-28, 43, 19,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 12,-21, -1,-20;
/M: SY='R';  M= -5,-12,-18,-14, -5,-10,-21,-12, -5, -5, -1, -1, -8,-19, -3,  3, -5, -2, -4,-24, -9, -5;
/M: SY='B';  M= -9,  4,-23,  3,  3,-14,-16,  0,-16, -3,-11, -7,  3,-15,  0, -2, -1, -1,-14,-26, -7,  1;
/M: SY='S';  M= -1,  1,-20, -1, -2,-21, -3, -7,-21, -6,-22,-15,  5, -3, -3, -8, 13, 12,-16,-30,-16, -3;
/I:         MD=-23;
/M: SY='N';  M= -7, 15,-24, 15,  9,-26, -2, -2,-27,  2,-25,-18, 16,-12,  3,  1,  5, -4,-23,-29,-18,  5; D=-4;
/I:         MD=-23;
/M: SY='M';  M= -5,-10,-21,-12, -5, -8,-14, -3, -8, -3, -3,  2, -8,-15, -1, -2, -9, -8,-10,-13,  1, -4; D=-4;
/I:         I=-7; MI=0; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-20, -3,  0,-21, -9, -8,-18, -3,-24,-14,  5,  3,  2, -6, 15,  9,-16,-31,-16,  0;
/M: SY='I';  M= -5,-29,-21,-35,-29,  1,-34,-28, 38,-25, 17, 16,-24,-24,-23,-25,-16, -6, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='T';  M=  4, -6,-17,-11, -8, -9,-12,-14, -8, -9, -8, -7, -2,-16, -9,-10,  6, 10, -3,-25,-10, -8;
/M: SY='E';  M= -7, 12,-25, 17, 21,-29,-14, -2,-25,  4,-21,-15,  5, -9, 15,  0,  4, -2,-22,-29,-15, 17;
/M: SY='I';  M= -2,-27,-23,-34,-27, -2,-32,-27, 36,-25, 15, 15,-20,-21,-20,-25,-13, -5, 28,-23, -4,-26;
/M: SY='A';  M= 38, -9,-10,-16, -9,-20,  3,-18,-12,-11,-14,-12, -6,-11, -9,-18, 14,  2, -3,-24,-20, -9;
/M: SY='H';  M= -9, -8,-22,-11, -5, -8,-19,  5, -7, -6, -2,  5, -5,-20,  0, -2, -9, -7, -9,-18,  2, -4;
/M: SY='R';  M= -8,  3,-22,  2,  6,-21,-15, -3,-18,  7,-14, -6,  4,-15,  7, 11, -1, -4,-16,-27,-13,  5;
/M: SY='C';  M= -4,-22, 10,-26,-23, -1,-26,-17,  2,-20,  1, -2,-20,-29,-21,-20,-13, -7,  8,-13,  2,-23;
/M: SY='G';  M= -1,-10,-29,-10,-18,-27, 62,-18,-38,-18,-28,-19,  0,-20,-18,-17,  0,-19,-29,-20,-27,-18;
/M: SY='F';  M=-18,-27,-24,-33,-26, 52,-31, -8,  6,-23,  9,  3,-20,-29,-27,-18,-20,-10,  1, 12, 42,-26;
/M: SY='S';  M=  0,  3,-21,  4,  1,-20, -2, -8,-21, -7,-20,-15,  4, -9, -4, -8,  8,  0,-16,-28,-16, -2;
/I:         I=-10; MI=-35; MD=-35; IM=-35;
/M: SY='D';  M= -4, 15,-19, 20,  7,-24, -6,  7,-26, -6,-27,-19, 13,-11,  2, -8, 19,  5,-19,-37,-14,  4; D=-6;
/I:         DM=-35;
/M: SY='Q';  M= -1, -6,-21, -8,  0,-20,-14, -9,-12, -6,-12, -7, -4, -3,  6, -6,  5,  5,-11,-28,-14,  2;
/M: SY='S';  M=  6, -3,-18, -6, -4,-17,  2,-10,-17,-10,-19,-13,  5,-11, -1,-11, 15,  4,-14,-29,-16, -2;
/M: SY='Y';  M= -9,-10,-25,-12,-10,  3,-20, 15,-12, -4, -9, -5, -7,-22, -3,  0, -6, -2,-13, -2, 31,-10;
/M: SY='F';  M=-19,-29,-20,-38,-28, 69,-30,-19,  2,-29, 14,  3,-21,-30,-36,-19,-21,-10,  1,  7, 27,-28;
/M: SY='S';  M=  7,-10, -8,-15,-12,-12,-15,-16, -3,-14,-11, -8, -4,-15, -9,-15, 13, 11,  1,-28,-10,-12;
/M: SY='R';  M= -9, -2,-23, -3,  3,-21,-16, -4,-22, 14,-19,-10,  2,-16,  6, 23, -1, -2,-15,-25,-10,  2;
/M: SY='V';  M=  2,-10,-17,-12, -5,-11,-16,-14, -2,-10, -3, -3, -9,-18,-10,-11, -3, -2,  4,-26,-12, -8;
/M: SY='F';  M=-17,-28,-20,-35,-28, 62,-30,-13,  2,-26,  8,  1,-20,-29,-32,-19,-19,-10,  0, 10, 35,-28;
/M: SY='R';  M=-12,  0,-28, -2,  5,-25,-17, -6,-28, 33,-25,-11,  3,-13,  8, 35, -6, -7,-19,-22,-12,  5;
/M: SY='R';  M= -9,  0,-27, -1,  8,-25,-17, -3,-26, 24,-23,-11,  2,-13, 12, 27, -2, -5,-20,-23,-11,  9;
/M: SY='Y';  M=-11,-10,-20,-13, -6, -6,-23,  5,-10, -2, -7, -3, -7,-20, -2,  2, -8, -3, -9,-13, 10, -6;
/M: SY='F';  M=-13,-21,-21,-27,-20, 35,-27,-11,  2,-20,  8,  2,-17,-25,-22,-15,-13, -1,  0, -1, 25,-20;
/M: SY='G';  M= -2, -1,-28, -3,-13,-29, 51,-14,-36,-14,-29,-20,  9,-19,-14,-15,  3,-15,-29,-24,-27,-14;
/M: SY='M';  M= -6,-16,-13,-19, -8, -4,-24,-11,  3,-11,  1,  7,-15,-20, -7,-11,-10, -5,  5,-17, -1, -8;
/M: SY='T';  M=  5, -3,-12, -9, -7,-13,-13,-16,-11,-11,-12,-11,  0, -9, -7,-11, 19, 28, -4,-32,-14, -7;
/M: SY='P';  M= -7,-20,-38,-11, -1,-28,-19,-20,-18,-10,-27,-18,-19, 80,-10,-19, -9, -9,-27,-29,-29,-10;
/M: SY='S';  M=  3, -4,-17, -5, -2,-20, -5, -8,-19,  1,-22,-12,  3,-13,  1,  2, 17,  8,-12,-31,-15, -1;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-27, 11, 22,-28,-16,  1,-24,  7,-19,-12,  1,-10, 19,  4, -1, -8,-23,-26,-12, 20;
/M: SY='Y';  M=-14,-19,-23,-23,-20, 29,-27, -6,  0,-17,  3, -1,-17,-25,-19,-15,-13, -1, -3, 10, 35,-20;
/M: SY='R';  M=-13,-14,-25,-15, -6, -9,-21, -7,-13,  8, -3, -2, -7,-21,  0, 32,-11, -8, -9,-20, -6, -6;
/M: SY='R';  M= -4, -4,-24, -6,  2,-20,-16, -1,-17,  9,-14, -6, -1,-15,  7, 11, -3, -4,-14,-22, -9,  3;
/M: SY='R';  M= -9, -7,-26, -8, -3,-17,-10, -2,-13,  0,-12, -4, -2,-17,  3,  5, -4, -5,-12,-21, -6, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2025_03 which contains 573'661 sequence entries.

Total number of hits	268 in 268 different sequences
Number of true positive hits	266 in 266 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	99.25 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	K_Hofmann
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

266 sequences

AARP_PROST  (P43463), ADAA_BACSU  (P19219), ADA_ECOLI   (P06134),

ADA_SALTY   (P26189), ADIY_ECOLI  (P33234), AGGR_ECOLX  (P43464), 
ALKA_MYCTO  (P9WJW2), ALKA_MYCTU  (P9WJW3), ALKR_ACIAD  (O31249), 
ANDR_BURCE  (Q84BZ4), APPY_ECOLI  (P05052), ARACL_STRAT (Q03320), 
ARACL_STRLI (P35319), ARAC_CITFR  (P11765), ARAC_DICCH  (P07642), 
ARAC_ECO57  (P0A9E1), ARAC_ECOLI  (P0A9E0), ARAC_SALTY  (P03022), 
ARGR_PSEAE  (G3XCU2), BTR_BACSU   (P40408), CAF1R_YERPE (P26950), 
CDHR_PSEAE  (Q9HTH5), CFAD_ECOLX  (P25393), CHBR_ECOLI  (P17410), 
CSVR_ECOLX  (P43460), ENVY_ECOLI  (P10805), EUTR_ECOLI  (P36547), 
EUTR_SALTY  (Q9ZFU7), EXSA_PSEAE  (P26993), FAPR_ECOLX  (P23774), 
FEAR_ECOLI  (Q47129), GADW_ECO57  (P63202), GADW_ECOL6  (Q8FCI7), 
GADW_ECOLI  (P63201), GADW_SHIFL  (P63203), GADX_ECO27  (Q9EYV5), 
GADX_ECO57  (P58230), GADX_ECOL6  (Q8FCI6), GADX_ECOLI  (P37639), 
GADX_SHIFL  (Q83PR0), GBDR_PSEAB  (A0A0H2ZIC3), GBDR_PSEAE  (Q9HTI4), 
GLXA_RHIME  (O87389), HILD_SALTS  (E1WAC0), HILD_SALTY  (P0CL08), 
HPTR_STAA3  (Q2FK47), HPTR_STAA8  (Q2G1E1), HPTR_STAAB  (Q2YV56), 
HPTR_STAAC  (Q5HJF7), HPTR_STAAM  (Q99X00), HPTR_STAAN  (Q7A7X9), 
HPTR_STAAR  (Q6GK93), HPTR_STAAS  (Q6GCQ3), HPTR_STAAW  (Q8NYJ9), 
HRPB_RALN1  (P31778), INVF_SALTI  (P69342), INVF_SALTY  (P69343), 
LACR_STAXY  (O33813), LCRF_YERPE  (P28808), LUMQ_PHOLE  (Q51872), 
MARA_ECO57  (P0ACH6), MARA_ECOLI  (P0ACH5), MARA_SALEN  (P0A2S6), 
MARA_SALTI  (P0A2S5), MARA_SALTY  (P0A2S4), MARA_SHIFL  (P0ACH7), 
MELR_ECOL6  (P0ACH9), MELR_ECOLI  (P0ACH8), MMSR_PSEAE  (P28809), 
MSMR_STRMU  (Q00753), MTRA_NEIGO  (Q9WW32), MXIE_SHIFL  (P0A2S7), 
MXIE_SHISO  (P0A2S8), NIMR_ECOLI  (P76241), NPHR_RHOSO  (B1Q2A8), 
ORUR_PSEAE  (P72171), PCHR_PSEAE  (P40883), PERA_ECO27  (P43459), 
PLH4_FORAG  (T2KMF4), POCR_SALTY  (Q05587), PQRA_PROVU  (Q52620), 
RAFR_PEDPE  (P43465), RAMA_ENTCL  (P55922), RAMA_KLEPH  (A0A0H3GPK2), 
RAMA_KLEPN  (Q48413), RAMA_SALTY  (H9L484), RCLR_ECOLI  (P77379), 
RHAR_CROS8  (A7ML57), RHAR_ECO24  (A7ZUB8), RHAR_ECO57  (Q8X7B3), 
RHAR_ECOBW  (C5A074), RHAR_ECOHS  (A8A710), RHAR_ECOK1  (A1AI83), 
RHAR_ECOL5  (Q0TAF7), RHAR_ECOL6  (Q8FBD7), RHAR_ECOLI  (P09378), 
RHAR_ECOUT  (Q1R413), RHAR_ENT38  (A4WG90), RHAR_KLEP7  (A6TGB0), 
RHAR_MANSM  (Q65Q30), RHAR_PECAS  (Q6DA21), RHAR_PECCP  (C6DJR5), 
RHAR_SALA4  (B5F0N0), RHAR_SALAR  (A9MI63), RHAR_SALCH  (Q57HG7), 
RHAR_SALDC  (B5FPP6), RHAR_SALEP  (B5QWY5), RHAR_SALHS  (B4TBY4), 
RHAR_SALNS  (B4SZZ4), RHAR_SALPA  (Q5PKG1), RHAR_SALPB  (A9MZC9), 
RHAR_SALPK  (B5BJG9), RHAR_SALSV  (B4TPR0), RHAR_SALTI  (Q8Z2V5), 
RHAR_SALTY  (P40865), RHAR_SHIBS  (Q31U83), RHAR_SHIDS  (Q32A71), 
RHAR_SHIF8  (Q0SZ96), RHAR_SHIFL  (Q83PD9), RHAR_YERP3  (A7FN79), 
RHAR_YERPA  (Q1C0W2), RHAR_YERPB  (B2K1W6), RHAR_YERPE  (Q8ZIZ9), 
RHAR_YERPG  (A9QYR6), RHAR_YERPN  (Q1CEB6), RHAR_YERPP  (A4TRS7), 
RHAR_YERPS  (Q66FF1), RHAR_YERPY  (B1JNC4), RHAS_CITK8  (A8AL27), 
RHAS_ECO24  (A7ZUB7), RHAS_ECO27  (B7UNM6), RHAS_ECO45  (B7MI37), 
RHAS_ECO55  (B7L9G1), RHAS_ECO57  (Q8X897), RHAS_ECO5E  (B5YZ43), 
RHAS_ECO7I  (B7NUA1), RHAS_ECO81  (B7N2P7), RHAS_ECO8A  (B7M6V7), 
RHAS_ECOBW  (C5A073), RHAS_ECODH  (B1XB72), RHAS_ECOHS  (A8A709), 
RHAS_ECOK1  (A1AI82), RHAS_ECOL5  (Q0TAF8), RHAS_ECOL6  (Q8CXW5), 
RHAS_ECOLC  (B1IVH3), RHAS_ECOLI  (P09377), RHAS_ECOLU  (B7NFK3), 
RHAS_ECOSE  (B6I4P8), RHAS_ECOSM  (B1LMU6), RHAS_ECOUT  (Q1R414), 
RHAS_ENT38  (A4WG91), RHAS_ESCF3  (B7LVD8), RHAS_KLEP3  (B5XZ49), 
RHAS_KLEP7  (A6TGA9), RHAS_MANSM  (Q65Q31), RHAS_PECAS  (Q6DA22), 
RHAS_PECCP  (C6DJR4), RHAS_SALA4  (B5F0M9), RHAS_SALAR  (A9MI64), 
RHAS_SALCH  (Q57HG8), RHAS_SALDC  (B5FPP5), RHAS_SALEP  (B5QWY4), 
RHAS_SALG2  (B5RFC3), RHAS_SALHS  (B4TBY3), RHAS_SALNS  (B4SZZ3), 
RHAS_SALPA  (Q5PKG2), RHAS_SALPB  (A9MZC8), RHAS_SALPC  (C0Q3L4), 
RHAS_SALPK  (B5BJG8), RHAS_SALSV  (B4TPQ9), RHAS_SALTI  (P0A2T0), 
RHAS_SALTY  (P0A2S9), RHAS_SHIB3  (B2TVP7), RHAS_SHIBS  (Q31U84), 
RHAS_SHIDS  (Q32A70), RHAS_SHIF8  (Q0SZ95), RHAS_SHIFL  (Q83PE0), 
RHAS_SHISS  (Q3YV71), RHAS_YERP3  (A7FN80), RHAS_YERPA  (Q1C0W1), 
RHAS_YERPB  (B2K1W5), RHAS_YERPE  (Q8ZJ00), RHAS_YERPG  (A9QYR8), 
RHAS_YERPN  (Q1CEB5), RHAS_YERPP  (A4TRS8), RHAS_YERPS  (Q66FF2), 
RHAS_YERPY  (B1JNC5), RHRA_RHIME  (Q9Z3Q6), RIPA_CORDI  (Q6NI56), 
RIPA_COREF  (Q8FQS2), RIPA_CORGL  (Q8NRR3), RNS_ECOLX   (P16114), 
ROB_ECO57   (P0ACI1), ROB_ECOLI   (P0ACI0), ROB_SALTY   (Q8ZJU7), 
ROB_SHIFL   (P0ACI2), SIRC_SALTI  (Q8Z4A6), SIRC_SALTS  (E1WAB2), 
SIRC_SALTY  (P0CL09), SOXS_ECO57  (P0A9E4), SOXS_ECOL6  (P0A9E3), 
SOXS_ECOLI  (P0A9E2), SOXS_SALTY  (Q56143), TCPN_VIBC3  (A5F384), 
TCPN_VIBCH  (P0C6D6), TETD_ECOLX  (P28816), THCR_RHOER  (P43462), 
URER_ECOLX  (P32326), URER_PROMH  (Q02458), VIRF_SHIDY  (P0A2T2), 
VIRF_SHIFL  (P0A2T1), VIRF_SHISO  (P0A2T3), VIRF_YERE8  (A1JU91), 
VIRF_YEREN  (P0C2V5), VIRS_MYCTO  (P9WMJ2), VIRS_MYCTU  (P9WMJ3), 
VQSM_PSEAE  (Q9I1P2), XYLR_ECO57  (P0ACI5), XYLR_ECOL6  (P0ACI4), 
XYLR_ECOLI  (P0ACI3), XYLR_HAEIN  (P45043), XYLS1_PSEPU (Q04710), 
XYLS2_PSEPU (Q05092), XYLS3_PSEPU (Q05335), XYLS4_PSEPU (Q04713), 
XYLS_PSEPU  (P07859), Y077_STAAW  (Q8NYT6), Y078_STAAS  (Q6GD21), 
Y084_STAAC  (Q5HJR8), Y097_STAAN  (Q7A882), Y101_STAAM  (Q99XB1), 
Y1052_HAEIN (P45008), Y107_STAAR  (Q6GKK1), Y1395_MYCTO (P9WMJ0), 
Y1395_MYCTU (P9WMJ1), Y1430_MYCBO (P68912), Y165_STAES  (Q8CQE3), 
Y1931_MYCTU (P95283), Y2406_STAEQ (Q5HKE0), Y3175_SALTY (Q8ZM00), 
Y4FK_SINFN  (P55449), YBCM_ECOLI  (P77634), YBFI_BACSU  (O31449), 
YBFP_BACSU  (O31456), YCGK_PSEVC  (P43461), YDEC_BACSU  (P96660), 
YDEE_BACSU  (P96662), YDEO_ECO57  (Q8X4Z9), YDEO_ECOL6  (Q8FHG0), 
YDEO_ECOLI  (P76135), YDEO_SHIFL  (Q83RF4), YDIP_ECOLI  (P77402), 
YESN_BACSU  (O31517), YESS_BACSU  (O31522), YFIF_BACSU  (P54722), 
YHTH1_STAAU (Q936F1), YIDL_ECOLI  (P31449), YIJO_ECOLI  (P32677), 
YISR_BACSU  (P40331), YKGA_ECOLI  (P77601), YMCR_STRLA  (P43458), 
YNEL_ECOLI  (P76138), YOBQ_BACSU  (O34901), YPDC_ECOLI  (P77396), 
YQHC_ECOLI  (Q46855), YTDP_BACSU  (O32071)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences

2 sequences

ETR1_CANGA  (Q6FXN7), GLNE_RHILO  (Q985F6)

PDB
[Detailed view]

22 PDB

1BL0; 1D5Y; 1U8B; 1WPK; 1XS9; 1ZGW; 2K9S; 3GBG; 3MKL; 4FE4; 4FE7; 5SUW;
» more